0604118 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Mrázová, Kateřina - Havlíčková, A. - Černayová, D. - Hrubanová, Kamila - Sedláček, P. - Krzyžánek, Vladislav
Cryo-EM as a tool for observing alginate-based hydrogels.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 28018. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA TA ČR(CZ) TN02000020
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: hydrogel * alginate * bacteria * freeze-fracture * cryo-SEM
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_28018/bioconf_emc2024_28018.html
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361469

0588336 - ÚPT 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Fleischhacker-Daffert, C. - Zerobin, A. - Hummel, F. - Slaninová, E. - Kroupová, Z. - Obruča, S. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Nebesářová, Jana - Ludwig, K. - Fritz, I.
A Comparison of the Effects of Continuous Illumination and Day/Night Regimes on PHB Accumulation in Synechocystis Cells.
Life. Roč. 14, č. 7 (2024), č. článku 907. E-ISSN 2075-1729
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: poly-beta-hydroxybutyrate * Synechocystis * continuous illumination * day/night cycle * PHB * glycogen * cell size
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.719, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2075-1729/14/7/907
Ludwig, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355244

0587565 - ÚPT 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Jurečková, K. - Nykrýnová, M. - Slaninová, E. - Fleuriot-Blitman, H. - Amstutz, V. - Heřmánková, K. - Bezdíček, M. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Zinn, M. - Obruča, S. - Sedlář, K.
Cultivation driven transcriptomic changes in the wild-type and mutant strains of Rhodospirillum rubrum.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 23, December (2024), s. 2681-2694. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Rhodospirillum rubrum * RNA-Seq * Transcriptome * Genome * Depolymerase knock-out * Gene ontology * Metabolism * Fructose * Acetate * Polyhydroxyalkanoates
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 1.423, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037024002204
Sedlář, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354812

0604051 - ÚPT 2025 RIV CZ cze L - Prototyp, funkční vzorek
Láznička, Tomáš - Krzyžánek, Vladislav - Urban, Pavel - Krutil, Vojtěch - Hrubanová, Kamila
Kryo-stolek pro kvantitativní zobrazování.
[Cryo-table for quantitative imaging.]
Interní kód: APL-2024-26 ; 2024
Technické parametry: Technické řešení zahrnuje několik klíčových komponent. Kryogenní stolek je kompatibilní se systémem držáku vzorků Leica Microsystems. Ten je termálně izolovaný od mikroskopického posuvného mechanismu pomocí distančních členů s minimálním tepelným přenosem. Dále je flexibilně spojen k teplovodivému palci, což umožní pohyb stolku ve všech třech osách, naklápění a omezenou rotaci. Flexibilně je také k teplovodivému palci připojen anti-kontaminační štít, který obklopuje držák vzorku umístěný na kryogenním stolku a slouží k minimalizaci kontaminace dopadající na povrch daného vzorku. Teplovodivý palec je na druhé straně připojen k Dewarově nádobě, která slouží jako reservoár kapalného dusíku pro chlazení celého systému a která je připojena k vakuové komoře mikroskopu. Kryo stolek, anti-kontaminační štít, teplovodivý palec i dno Dewarovy nádoby jsou vybaveny teplotními senzory (a odporovým tělesem pro vyhřívání v případě kryo stolku), které umožňují přesnou kontrolu teploty během celého procesu.
Ekonomické parametry: Funkční vzorek realizovaný při řešení grantu, s předpokladem smluvního využití s vědeckým a ekonomickým přínosem i po jeho ukončení. Kontakt: Ing. Vladislav Krzyžánek, Ph.D., krzyzanek@isibrno.cz.
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000020
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo-table * electron microscopy * FIB-SEM * cryo-FIB-SEM
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361385