Publikace ASEP
0643219 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Černayová, D. - Súkeník, M. - Obruča, S. - Smilek, J. - Kalina, M. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Sedláček, P.
Self-entrapment of Azotobacter vinelandii cultures by gelation of their exopolysaccharides: A way towards next-generation bioinoculants.
Carbohydrate Polymers. Roč. 360, 15 July (2025), č. článku 123607. ISSN 0144-8617. E-ISSN 1879-1344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
AV ČR(CZ) MSM100652102
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Azotobacter vinelandii * Alginate * Polyhydroxyalkanoates * Hydrogels * Bioinoculants
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 1.433, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0144861725003881
Sedláček, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373079
0588336 - ÚPT 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Fleischhacker-Daffert, C. - Zerobin, A. - Hummel, F. - Slaninová, E. - Kroupová, Z. - Obruča, S. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Nebesářová, Jana - Ludwig, K. - Fritz, I.
A Comparison of the Effects of Continuous Illumination and Day/Night Regimes on PHB Accumulation in Synechocystis Cells.
Life. Roč. 14, č. 7 (2024), č. článku 907. E-ISSN 2075-1729
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: poly-beta-hydroxybutyrate * Synechocystis * continuous illumination * day/night cycle * PHB * glycogen * cell size
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.719, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2075-1729/14/7/907
Ludwig, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355244
0605302 - ÚPT 2025 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Hrubanová, Kamila - Pilát, Zdeněk - Benešová, Markéta - Avbelj, M. - Žnidaršič, N. - Kostanjšek, R. - Petković, H. - Krzyžánek, Vladislav
Studium geneticky upravených mikroorganismů pomocí elektronové mikroskopie a Ramanovy spektroskopie.
[Study of genetically modified microorganisms using electron microscopy and Raman spectroscopy.]
Jemná mechanika a optika. Roč. 69, č. 2 (2024), s. 33-35. ISSN 0447-6441
AV ČR(CZ) MSM100652102
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo-SEM * TEM * Actinobacteria * Raman spectroscopy
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Způsob publikování: Omezený přístup
https://jmo.fzu.cz/sites/jmo.fzu.cz/files/oldweb/2024/2024-02/jmo_24_02_obsah.pdf
Hrubanová, Kamila
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362957
0587565 - ÚPT 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Jurečková, K. - Nykrýnová, M. - Slaninová, E. - Fleuriot-Blitman, H. - Amstutz, V. - Heřmánková, K. - Bezdíček, M. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Zinn, M. - Obruča, S. - Sedlář, K.
Cultivation driven transcriptomic changes in the wild-type and mutant strains of Rhodospirillum rubrum.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 23, December (2024), s. 2681-2694. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Rhodospirillum rubrum * RNA-Seq * Transcriptome * Genome * Depolymerase knock-out * Gene ontology * Metabolism * Fructose * Acetate * Polyhydroxyalkanoates
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 1.423, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037024002204
Sedlář, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0354812
0643191 - ÚPT 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kroupová, Z. - Slaninová, E. - Mrázová, Kateřina - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila - Fritz, I. - Obruča, S.
Evaluating stress resilience of cyanobacteria through flow cytometry and fluorescent viability assessment.
Folia Microbiologica. Roč. 70, č. 1 (2025), s. 205-223. ISSN 0015-5632. E-ISSN 1874-9356
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Biotechnology * Cyanobacteria * Flow cytometry * Fluorescent viability probes * Stress resistance * Viability assessment
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.504, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s12223-024-01212-w
Kroupová, Z.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373062
0635880 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Láznička, Tomáš - Kizovský, Martin - Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Mrázová, Kateřina - Obruča, S. - Samek, Ota - Krzyžánek, Vladislav
Assembly for semi-correlation analysis of samples using cryogenic scanning electron microscopy and cryogenic Raman micro-spectroscopy.
Measurement Science and Technology. Roč. 36, č. 5 (2025), č. článku 055903. ISSN 0957-0233. E-ISSN 1361-6501
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo assembly * cryogenic Raman micro-spectroscopy * cryogenic scanning electron microscopy * semi-correlative imaging
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.452, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6501/adc94a
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368139
0604059 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Láznička, Tomáš - Ježek, Jan - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav
Innovative Microfluidic chip for Raman spectroscopy and advanced electron microscopy techniques.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 03017. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA TA ČR(CZ) TN02000020; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: microfluidic chip * electron microscopy * HPF
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_03017/bioconf_emc2024_03017.html
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361391
0564714 - ÚPT 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Meixner, K. - Daffert, C. - Dalnodar, D. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Nebesářová, Jana - Samek, Ota - Šedrlová, Z. - Slaninová, E. - Sedláček, P. - Obruča, S. - Fritz, I.
Glycogen, poly(3-hydroxybutyrate) and pigment accumulation in three Synechocystis strains when exposed to a stepwise increasing salt stress.
Journal of Applied Phycology. Roč. 34, č. 3 (2022), s. 1227-1241. ISSN 0921-8971. E-ISSN 1573-5176
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Salt stress * Synechocystis sp * Poly(3-hydroxybutyrate) * Glycogen * Pigments
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.492, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s10811-022-02693-3
Meixner, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336344
0604118 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Mrázová, Kateřina - Havlíčková, A. - Černayová, D. - Hrubanová, Kamila - Sedláček, P. - Krzyžánek, Vladislav
Cryo-EM as a tool for observing alginate-based hydrogels.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 28018. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA TA ČR(CZ) TN02000020
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: hydrogel * alginate * bacteria * freeze-fracture * cryo-SEM
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_28018/bioconf_emc2024_28018.html
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361469
0638974 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mrázová, Kateřina - Černayová, D. - Havlíčková, Anna - Hrubanová, Kamila - Obruča, S. - Sedláček, P. - Krzyžánek, Vladislav
Enhanced electron microscopy imaging for a detailed structural study of alginate hydrogel containing the encapsulated cells.
Carbohydrate Polymers. Roč. 368, č. 2 (2025), č. článku 124239. ISSN 0144-8617. E-ISSN 1879-1344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Alginate * Azotobacter vinelandii * electron microscopy * Encapsulation
Obor OECD: Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 1.433, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0144861725010240
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0372850
0565356 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nováčková, I. - Hrabalová, V. - Slaninová, E. - Sedláček, P. - Samek, Ota - Koller, M. - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Nebesářová, Jana - Obruča, S.
The role of polyhydroxyalkanoates in adaptation of Cupriavidus necator to osmotic pressure and high concentration of copper ions.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 206, 1 May (2022), s. 977-989. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-20697S; GA MŠMT(CZ) LM2015062
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Adaptation * Cupriavidus necator * Heavy metals * Osmotic stress * Polyhydroxyalkanoates * Stress conditions
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 8.2, rok: 2022 ; AIS: 0.92, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813022005712
Obruča, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336908
0618871 - ÚPT 2025 RIV CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Trudičová, M. - Zahrádka, J. - Smilek, J. - Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Sedláček, P. - Pekař, M.
Evaulation of the applicability of various porosimetry methods in investigation of the ultrastructure of hydrogels.
NANOCON Conference Proceedings. In: NANOCON 2022 Conference Proceedings. Ostrava: Tanger Ltd., 2023, s. 284-289. ISBN 978-80-88365-09-9. ISSN 2694-930X.
[International Conference on Nanomaterials - Research & Application /14./ NANOCON. Brno (CZ), 19.10.2022-21.10.2022]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Hydrogel * polyvinyl alcohol * structural analysis
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.confer.cz/nanocon/2022/4619-evaluation-of-the-applicability-of-various-porosimetry-methods-in-investigation-of-the-ultrastructure-of-hydrogels
Trudičová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365642
0602484 - ÚPT 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Turánek, J. - Turánek Knötigová, P. - Kulich, P. - Skoupý, Radim - Hrubanová, Kamila - Vaškovicová, N. - Fekete, Ladislav - Kaňa, A. - Mikulík, R. - Raška, M.
Preparation and Complex Characterisation of Stabilised Gold Nanoparticles: Biodistribution and Application for High Resolution In Vivo Imaging.
Pharmaceuticals. Roč. 17, č. 11 (2024), č. článku 1479. E-ISSN 1424-8247
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004596
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:68378271
Klíčová slova: gold nanoparticles * in vivo imaging * microcomputer tomography * biodistribution * nanotoxicology
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.) (FZU-D)
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.872, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1424-8247/17/11/1479
Turánek, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0359674