Biriukov Denys

RIV - aktuální sběr

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 3

Článek v odborném periodiku

0597799 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nencini, Ricky - Tempra, Carmelo - Biriukov, Denys - Riopedre Fernández, Miguel - Cruces Chamorro, Victor - Polák, J. - Mason, Philip E. - Ondo, D. - Heyda, J. - Ollila, O. H. S. - Jungwirth, Pavel - Javanainen, Matti - Martinez-Seara, Hector
Effective Inclusion of Electronic Polarization Improves the Description of Electrostatic Interactions: The prosECCo75 Biomolecular Force Field.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 20, č. 17 (2024), s. 7546-7559. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-19561S
GRANT EU: European Commission(XE) 101095957 - Q-SCALING
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * solute-solute interactions * linear constraint solver
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.4c00743
Martinez-Seara, Hector
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355613

0598061 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Riopedre Fernández, Miguel - Košťál, Vojtěch - Martinek, Tomáš - Martinez-Seara, Hector - Biriukov, Denys
Developing and Benchmarking Sulfate and Sulfamate Force Field Parameters via Ab Initio Molecular Dynamics Simulations To Accurately Model Glycosaminoglycan Electrostatic Interactions.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 64, č. 18 (2024), s. 7122-7134. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: generalized gradient approximation * solute-solute interactions * linear constraint solver
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 1.526, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.4c00981
Martinez-Seara, Hector
- Biriukov, Denys
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355827

0578077 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Riopedre Fernández, Miguel - Biriukov, Denys - Dračínský, Martin - Martinez-Seara, Hector
Hyaluronan-arginine enhanced and dynamic interaction emerges from distinctive molecular signature due to electrostatics and side-chain specificity.
Carbohydrate Polymers. Roč. 325, February (2024), č. článku 121568. ISSN 0144-8617. E-ISSN 1879-1344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-19561S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hyaluronan * arginine * molecular dynamics * NMR * sugar–peptide interactions
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 1.433, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.carbpol.2023.121568
Martinez-Seara, Hector
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0347110