Nencka Radim

RIV - aktuální sběr

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 12

Abstrakt

0604155 - ÚOCHB 2025 RIV eng A3 - Přednáška/prezentace nepublikovaná
Nencka, Radim
Exploring Viral RNA Methyltransferases for Antiviral Drug Design.
[ICAR2024. International Conference on Antiviral Research /37./. Surfers Paradise, 20.05.2024-24.05.2024]
Způsob prezentace: Přednáška
Pořadatel akce: ISAR
URL akce: https://www.isar-icar.com/event-5505063 
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: methyltransferases * SARS-CoV-2 * antivirals * drug design
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361495
Uložit do RIV jako O

0599886 - ÚOCHB 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Otava, Tomáš - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Štefek, Milan - Kocek, Hugo - Hřebabecký, Hubert - Nencka, Radim
Inhibitors of SARS-CoV-2, Dengue, and Mpox methyltransferases.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, č. 6 (2024), s. 204, č. článku L-04. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024. Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology /3./. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: viral methyltransferases * inhibitors * antiviral agents
Obor OECD: Virology
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48/87

Otava, Tomáš Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357309
Uložit do RIV jako O

Článek v odborném periodiku

0580756 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cermakova, K. - Tao, L. - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Montierth, M. D. - Chan, Y. S. - Patel, I. - Chambers, C. - Loeza Cabrera, M. - Hoffman, D. - Parchem, R. J. - Wang, W. - Nencka, Radim - Barbieri, E. - Hodges, H. C.
Reactivation of the G1 enhancer landscape underlies core circuitry addiction to SWI/SNF.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 1 (2024), s. 4-21. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: neuroblastoma * differentiation * transcription
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkad1081
Hodges, H. C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349518

0583190 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klíma, Martin - Dejmek, Milan - Duchoslav, Vojtěch - Eisenreichová, Andrea - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Chalupská, Dominika - Novotná, Barbora - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Fluorinated cGAMP analogs, which act as STING agonists and are not cleavable by poxins: Structural basis of their function.
Structure. Roč. 32, č. 4 (2024), s. 433-439. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic GMP-AMP * binding * design
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.01.008
Nencka, Radim
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351191

0598137 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Dvořáková, Alexandra - Zgarbová, Michala - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Krafčíková, Petra - Otava, Tomáš - Drexler, Matúš - Procházková, Eliška - Klepetářová, Blanka - Štefek, Milan - Kozic, Ján - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Bouřa, Evžen - Weber, Jan - Nencka, Radim
Discovery of highly potent SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase inhibitors based on adenosine 5′-carboxamides.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 15, č. 10 (2024), s. 3469-3476. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: system * RNA
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4MD00422A
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355869

0579447 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Šála, Michal - Matoušová, Marika - Hercík, Kamil - Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Chaloupecká, Ema - Hájek, Miroslav - Bouřa, Evžen - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Design, synthesis and evaluation of novel thieno[2,3d]pyrimidine derivatives as potent and specific RIPK2 inhibitors.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 97, January (2024), č. článku 129567. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: kinase inhibitor * thieno [2,3d] pyrimidine derivative * receptor-interacting protein kinase 2 * RIPK2 * NOD
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2023.129567
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348249

0586496 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nigam, A. - Hurley, M. F. D. - Li, F. - Konkoľová, Eva - Klíma, Martin - Trylčová, Jana - Pollice, R. - Cinaroglu, S. S. - Levin-Konigsberg, R. - Handjaya, J. - Schapira, M. - Chau, I. - Perveen, S. - Ng, H.-L. - Kaniskan, H. U. - Han, Y. - Singh, S. - Gorgulla, C. - Kundaje, A. - Jin, J. - Voelz, V. A. - Weber, Jan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen - Vedadi, M. - Aspuru-Guzik, A.
Application of established computational techniques to identify potential SARS-CoV-2 Nsp14-MTase inhibitors in low data regimes.
Digital Discovery. Roč. 3, č. 7 (2024), s. 1327-1341. E-ISSN 2635-098X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: docking * accuracy
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2024 ; AIS: 1.478, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4DD00006D
Vedadi, M.
- Aspuru-Guzik, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353965

0598057 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Škach, Kryštof - Böserle, Jiří - Nuta, G. C. - Břehová, Petra - Bialik, S. - Carvalho, S. - Kozer, N. - Barr, H. - Chaloupecká, Ema - Kimchi, A. - Nencka, Radim
Structure-activity relationship study of small-molecule inhibitor of Atg12-Atg3 protein-protein interaction.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 112, November (2024), č. článku 129939. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: autophagy * autophagy inhibition * small molecule * protein–protein interaction
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2024.129939
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355823

0586203 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tóth, Luca Julianna - Krejčová, Kateřina - Dejmek, Milan - Žilecká, Eva - Klepetářová, Blanka - Poštová Slavětínská, Lenka - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Novel analogues of a nonnucleoside SARS-CoV-2 RdRp inhibitor as potential antivirotics.
Beilstein Journal of Organic Chemistry. Roč. 20, May (2024), s. 1029-1036. ISSN 1860-5397. E-ISSN 1860-5397
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antivirotics * nonnucleotide inhibitor * RNA-dependent RNA polymerase * SARS-CoV-2
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 2.1, rok: 2024 ; AIS: 0.432, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3762/bjoc.20.91
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353790

0588104 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Žilecká, Eva - Klíma, Martin - Štefek, Milan - Dejmek, Milan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Structure of SARS-CoV-2 MTase nsp14 with the inhibitor STM957 reveals inhibition mechanism that is shared with a poxviral MTase VP39.
Journal of Structural Biology: X. Roč. 10, December (2024), č. článku 100109. ISSN 2590-1524. E-ISSN 2590-1524
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: methyltransferase * inhibitor * crystal structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.25, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2024.100109
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355136

Kapitola v monografii

0601208 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Kamaraj, R. - Nencka, Radim - Pávek, P.
Computational strategies for the design of proteolysis targeting chimera degraders: Artificial intelligence enabled PROTAC design.
PROTAC and Similar Technologies. London: Academic Press, 2024 - (Nencka, R.), s. 1-37. Annual Reports in Medicinal Chemistry, 63. ISBN 978-0-443-29584-3
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: AI * computational models * drug discovery * PROTAC * target protein degradation * ternary complex prediction
Obor OECD: Medicinal chemistry
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/bs.armc.2024.10.002
Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358418

Patent

0604905 - ÚOCHB 2025 RIV eng P - Patentový dokument
Nencka, Radim - Mejdrová, Ivana - Pávek, P. - Dušek, J.
Selective ligands of human constitutive androstane receptor.
2024. Vlastník: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. - Univerzita Karlova. Datum udělení patentu: 04.09.2024. Číslo patentu: EP3962915. : evropský patent podle Evropské patentové úmluvy ,mezinárodní patentová ochrana dle Smlouvy o patentové spolupráci,evropský patent s jednotným účinkem .
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nuclear receptors * constitutive androstane receptor * agonist
Obor OECD: Medicinal chemistry
https://worldwide.espacenet.com/patent/search/family/070464788/publication/EP3962915B1?q=EP3962915B1
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362433