Nencka Radim

0639422 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brungs, Corinna - Schmid, Robin - Heuckeroth, S. - Mazumdar, Aninda - Drexler, Matúš - Šácha, Pavel - Dorrestein, P. C. - Petras, D. - Nothias, L.-F. - Veverka, Václav - Nencka, Radim - Kameník, Zdeněk - Pluskal, Tomáš
MSnLib: efficient generation of open multi-stage fragmentation mass spectral libraries.
Nature Methods. Roč. 22, č. 10 (2025), s. 2028-2031. ISSN 1548-7091. E-ISSN 1548-7105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597; GA ČR(CZ) GM21-11563M
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: trees * spectrometry
Obor OECD: Biochemical research methods; Analytical chemistry (MBU-M)
Impakt faktor: 32.1, rok: 2024 ; AIS: 26.419, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41592-025-02813-0
Schmid, Robin
- Pluskal, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369868

0574366 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Břehová, Petra - Řezníčková, E. - Škach, Kryštof - Jorda, R. - Dejmek, Milan - Vojáčková, V. - Šála, Michal - Kovalová, M. - Dračínský, Martin - Dolníková, A. - Strmeň, Timotej - Kinnertová, M. - Chalupský, Karel - Dvořáková, Alexandra - Gucký, T. - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Klener, P. - Nencka, Radim - Kryštof, V.
Inhibition of FLT3-ITD Kinase in Acute Myeloid Leukemia by New Imidazo[1,2-b]pyridazine Derivatives Identified by Scaffold Hopping.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 66, č. 16 (2023), s. 11133-11157. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: gene expression * highly potent
Obor OECD: Oncology
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.652, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.3c00575
Nencka, Radim
- Kryštof, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344703

0580756 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cermakova, K. - Tao, L. - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Montierth, M. D. - Chan, Y. S. - Patel, I. - Chambers, C. - Loeza Cabrera, M. - Hoffman, D. - Parchem, R. J. - Wang, W. - Nencka, Radim - Barbieri, E. - Hodges, H. C.
Reactivation of the G1 enhancer landscape underlies core circuitry addiction to SWI/SNF.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 1 (2024), s. 4-21. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: neuroblastoma * differentiation * transcription
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkad1081
Hodges, H. C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349518

0559980 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dejmek, Milan - Šála, Michal - Brázdová, Andrea - Vaneková, Lenka - Smola, Miroslav - Klíma, Martin - Břehová, Petra - Buděšínský, Miloš - Dračínský, Martin - Procházková, Eliška - Zavřel, Martin - Šimák, Ondřej - Páv, Ondřej - Bouřa, Evžen - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim
Discovery of isonucleotidic CDNs as potent STING agonists with immunomodulatory potential.
Structure. Roč. 30, č. 8 (2022), s. 1146-1156. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic dinucleotides * prodrugs * STING agonists * isonucleosides * cytokines * cancer
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022 ; AIS: 2.249, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2022.05.012
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333087

0574383 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dejmek, Milan - Brázdová, Andrea - Otava, Tomáš - Pimková Polidarová, Markéta - Klíma, Martin - Smola, Miroslav - Vavřina, Zdeněk - Buděšínský, Miloš - Dračínský, Martin - Liboska, Radek - Bouřa, Evžen - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim
Vinylphosphonate-based cyclic dinucleotides enhance STING-mediated cancer immunotherapy.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 259, November (2023), č. článku 115685. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Výzkumná infrastruktura: CCP II - 90126
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic dinucleotides * STING * cancer * intratumoral administration * immunotherapy
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6, rok: 2023 ; AIS: 0.979, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2023.115685
Birkuš, Gabriel
- Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344716

0616504 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dušek, J. - Mejdrová, Ivana - Dohnalová, Klára - Smutný, T. - Chalupský, Karel - Krutáková, M. - Škoda, J. - Rashidian, A. - Pavková, I. - Škach, Kryštof - Hricová, Jana - Chocholoušková, M. - Smutná, L. - Kamaraj, R. - Hroch, M. - Leníček, M. - Mičuda, S. - Pijnenburg, D. - van Beuningen, R. - Holčapek, M. - Vítek, L. - Ingelman-Sundberg, M. - Burk, O. - Kronenberger, T. - Nencka, Radim - Pávek, P.
The hypolipidemic effect of MI-883, the combined CAR agonist/ PXR antagonist, in diet-induced hypercholesterolemia model.
Nature Communications. Roč. 16, February (2025), č. článku 1418. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000109; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607; GA ČR GA22-05167S; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008189; GA MŠMT EF18_046/0015861; GA MŠMT LM2023036
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: pregnane X receptor * constitutive androstane receptor * bile acid
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-56642-y
Nencka, Radim
- Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363510

0639711 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Havlíková, Jana - Dejmek, Milan - Hušková, Andrea - Allan, A. - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim - Šilhán, Jan
Mechanistic insights into alcohol-induced DNA crosslink repair by Slx4-Xpf-Ercc1 nuclease complex in the Fanconi anaemia pathway.
Communications Biology. Roč. 8, September (2025), č. článku 1374. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-12306S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: endogenous aldehydes * replication * acetaldehyde
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-025-08769-3
Šilhán, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370157

0571238 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Chambers, C. - Cermakova, K. - Chan, Y. S. - Kurtz, K. - Wohlan, K. - Lewis, A. H. - Wang, C. - Pham, A. - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Loeza Cabrera, M. - Aguilar, R. - Nencka, Radim - Lacorazza, H. D. - Rau, R. E. - Hodges, H. C.
SWI/SNF Blockade Disrupts PU.1-Directed Enhancer Programs in Normal Hematopoietic Cells and Acute Myeloid Leukemia.
Cancer Research. Roč. 83, č. 7 (2023), s. 983-996. ISSN 0008-5472. E-ISSN 1538-7445
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: chromatin-remodeling complexes * pioneer transcription factors * ATPase subunit
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 12.5, rok: 2023 ; AIS: 3.809, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-22-2129
Rau, R. E.
- Hodges, H. C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342509

0576137 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Inniss, N. L. - Kozic, Ján - Li, F. - Rosas-Lemus, M. - Minasov, G. - Rybáček, Jiří - Zhu, Y. - Pohl, Radek - Shuvalova, L. - Rulíšek, Lubomír - Brunzelle, J. S. - Bednárová, Lucie - Štefek, Milan - Kormaník, Ján Michael - Andris, Erik - Šebestík, Jaroslav - Li, A. S. M. - Brown, P. J. - Schmitz, U. - Saikatendu, K. - Chang, E. - Nencka, Radim - Vedadi, M. - Satchell, K. J. F.
Discovery of a Druggable, Cryptic Pocket in SARS-CoV-2 nsp16 Using Allosteric Inhibitors.
ACS Infectious Diseases. Roč. 9, č. 10 (2023), s. 1918-1931. ISSN 2373-8227
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: coronavirus * NSP16 methyltransferase * covalent inhibitors * structural biology * antiviral
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 1.084, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.3c00203
Chang, E.
- Nencka, Radim
- Vedadi, M.
- Satchell, K. J. F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345731

0601208 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Kamaraj, R. - Nencka, Radim - Pávek, P.
Computational strategies for the design of proteolysis targeting chimera degraders: Artificial intelligence enabled PROTAC design.
PROTAC and Similar Technologies. London: Academic Press, 2024 - (Nencka, R.), s. 1-37. Annual Reports in Medicinal Chemistry, 63. ISBN 978-0-443-29584-3
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: AI * computational models * drug discovery * PROTAC * target protein degradation * ternary complex prediction
Obor OECD: Medicinal chemistry
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/bs.armc.2024.10.002
Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358418

0637607 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kamaraj, R. - Mejdrová, Ivana - Krutáková, M. - Smutný, T. - Škach, Kryštof - Dohnalová, Klára - Smutná, L. - Nellore, D. S. S. - Dušek, J. - Chalupský, Karel - Hricová, Jana - Kronenberger, T. - Stahl, A. - Templin, M. - Braeuning, A. - Nencka, Radim - Pávek, P.
Discovery of PXR Antagonist MI891 and PXR Degrader MI1013 and Their Roles in Hepatic Gene Regulation.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 68, č. 14 (2025), s. 14271-14299. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607; GA ČR(CZ) GA24-11114S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: pregnane X receptor * analogs
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c03134
Nencka, Radim
- Pávek, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368439

0583190 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klíma, Martin - Dejmek, Milan - Duchoslav, Vojtěch - Eisenreichová, Andrea - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Chalupská, Dominika - Novotná, Barbora - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Fluorinated cGAMP analogs, which act as STING agonists and are not cleavable by poxins: Structural basis of their function.
Structure. Roč. 32, č. 4 (2024), s. 433-439. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic GMP-AMP * binding * design
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.01.008
Nencka, Radim
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351191

0644829 - ÚOCHB 2027 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Knejzlík, Zdeněk - Bulvas, Ondřej - Dedola, Matteo - Štefek, Milan - Nencka, Radim - Pichová, Iva
Substrate cooperativity shapes competitive inhibitor responses in mycobacterial inosine 5′-monophosphate dehydrogenase.
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. Roč. 41, č. 1 (2026), č. článku 2598479. ISSN 1475-6366. E-ISSN 1475-6374
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: IMPDH * cooperativity * inhibitors * mycobacteria
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 0.725, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/14756366.2025.2598479
Pichová, Iva
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374702

0598137 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Dvořáková, Alexandra - Zgarbová, Michala - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Krafčíková, Petra - Otava, Tomáš - Drexler, Matúš - Procházková, Eliška - Klepetářová, Blanka - Štefek, Milan - Kozic, Ján - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Bouřa, Evžen - Weber, Jan - Nencka, Radim
Discovery of highly potent SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase inhibitors based on adenosine 5′-carboxamides.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 15, č. 10 (2024), s. 3469-3476. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: system * RNA
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4MD00422A
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355869

0569356 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mejdrová, Ivana - Dušek, J. - Škach, Kryštof - Štefela, A. - Škoda, J. - Chalupský, Karel - Dohnalová, K. - Pavková, I. - Kronenberger, T. - Rashidian, A. - Smutná, L. - Duchoslav, Vojtěch - Smutný, T. - Pávek, P. - Nencka, Radim
Discovery of Novel Human Constitutive Androstane Receptor Agonists with the Imidazo[1,2-a]pyridine Structure.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 66, č. 4 (2023), s. 2422-2456. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN01000013
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: pregnane X receptor * CAR * activation
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.652, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c01140
Pávek, P.
- Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340675

0579447 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Šála, Michal - Matoušová, Marika - Hercík, Kamil - Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Chaloupecká, Ema - Hájek, Miroslav - Bouřa, Evžen - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Design, synthesis and evaluation of novel thieno[2,3d]pyrimidine derivatives as potent and specific RIPK2 inhibitors.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 97, January (2024), č. článku 129567. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: kinase inhibitor * thieno [2,3d] pyrimidine derivative * receptor-interacting protein kinase 2 * RIPK2 * NOD
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2023.129567
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348249

0574898 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Matoušová, Marika - Dvořáková, Alexandra - Hercík, Kamil - Škach, Kryštof - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Hájek, Miroslav - Bouřa, Evžen - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Exploring positions 6 and 7 of a quinazoline-based scaffold leads to changes in selectivity and potency towards RIPK2/3 kinases.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 260, November (2023), č. článku 115717. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: kinase inhibitor * quinazoline derivatives * RIPK2 * NOD * inflammation * RIPK3
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6, rok: 2023 ; AIS: 0.979, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2023.115717
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344824

0562658 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Klíma, Martin - Matoušová, Marika - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Structure-based design and modular synthesis of novel PI4K class II inhibitors bearing a 4-aminoquinazoline scaffold.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 76, November (2022), č. článku 129010. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phosphatidylinositol 4-kinase class II * PI4K2A inhibitor * quinazoline derivative * SAR investigation * ATP-binding site
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2022 ; AIS: 0.437, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2022.129010
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0334914

0555984 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nencka, Radim - Šilhán, Jan - Klíma, Martin - Otava, Tomáš - Kocek, Hugo - Krafčíková, Petra - Bouřa, Evžen
Coronaviral RNA-methyltransferases: function, structure and inhibition.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 2 (2022), s. 635-650. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-25280S; GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: structure guided design * SARS coronavirus * SARS-CoV-2 replication
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkab1279

Nencka, Radim Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330958

0586496 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nigam, A. - Hurley, M. F. D. - Li, F. - Konkoľová, Eva - Klíma, Martin - Trylčová, Jana - Pollice, R. - Cinaroglu, S. S. - Levin-Konigsberg, R. - Handjaya, J. - Schapira, M. - Chau, I. - Perveen, S. - Ng, H.-L. - Kaniskan, H. U. - Han, Y. - Singh, S. - Gorgulla, C. - Kundaje, A. - Jin, J. - Voelz, V. A. - Weber, Jan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen - Vedadi, M. - Aspuru-Guzik, A.
Application of established computational techniques to identify potential SARS-CoV-2 Nsp14-MTase inhibitors in low data regimes.
Digital Discovery. Roč. 3, č. 7 (2024), s. 1327-1341. E-ISSN 2635-098X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: docking * accuracy
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2024 ; AIS: 1.478, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4DD00006D
Vedadi, M.
- Aspuru-Guzik, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353965

0569689 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nuta, G. C. - Gilad, Y. - Goldberg, N. - Meril, S. - Bahlsen, M. - Carvalho, S. - Kozer, N. - Barr, H. - Sirkis, Y. F. - Hercík, Kamil - Břehová, Petra - Nencka, Radim - Bialik, S. - Eisenstein, M. - Kimchi, A.
Identifying a selective inhibitor of autophagy that targets ATG12-ATG3 protein-protein interaction.
Autophagy. Roč. 19, č. 8 (2023), s. 2372-2385. ISSN 1554-8627. E-ISSN 1554-8635
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: autophagy inhibition * cancer * drug screen * LC3B * pancreatic cancer * protein-fragment complementation assay * small molecules
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 14.6, rok: 2023 ; AIS: 4.347, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/15548627.2023.2178159
Kimchi, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0341063

0643069 - ÚOCHB 2027 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Otava, Tomáš - Drexler, Matúš - Krafčíková, Petra - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Veverka, Václav - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Exploring advanced methodologies for NS5 methyltransferase targeted drug discovery.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 303, February (2026), č. článku 118388. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 0.998, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2025.118388
Veverka, Václav
- Bouřa, Evžen
- Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372936

0571446 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šilhán, Jan - Klíma, Martin - Otava, Tomáš - Škvára, Petr - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Kozic, Ján - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Discovery and structural characterization of monkeypox virus methyltransferase VP39 inhibitors reveal similarities to SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase.
Nature Communications. Roč. 14, April (2023), č. článku 2259. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: messenger RNA * recognition * binding
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 14.7, rok: 2023 ; AIS: 5.66, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-023-38019-1
Nencka, Radim
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342665

0598057 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Škach, Kryštof - Böserle, Jiří - Nuta, G. C. - Břehová, Petra - Bialik, S. - Carvalho, S. - Kozer, N. - Barr, H. - Chaloupecká, Ema - Kimchi, A. - Nencka, Radim
Structure-activity relationship study of small-molecule inhibitor of Atg12-Atg3 protein-protein interaction.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 112, November (2024), č. článku 129939. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: autophagy * autophagy inhibition * small molecule * protein–protein interaction
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2024.129939
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355823

0644936 - ÚOCHB 2027 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Štefek, Milan - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Nencka, Radim
C7-Sulfonamide functionalization of 7-deazaadenosines: sangivamycin analogues with Haspin inhibitory activity.
Chemical Communications. (2026), č. článku 9610838. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: potential purine antagonists * in-vivo antitumor * nucleoside analog
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.775, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D5CC06746D
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374770

0574244 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Štefek, Milan - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Zgarbová, Michala - Dvořáková, Alexandra - Krafčíková, Petra - Li, A. S. M. - Šála, Michal - Dejmek, Milan - Otava, Tomáš - Chaloupecká, Ema - Kozák, Jaroslav - Kozic, Ján - Vedadi, M. - Weber, Jan - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Rational Design of Highly Potent SARS-CoV-2 nsp14 Methyltransferase Inhibitors.
ACS Omega. Roč. 8, č. 30 (2023), s. 27410-27418. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * genetics * inhibitors
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 0.639, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsomega.3c02815
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344580

0586203 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tóth, Luca Julianna - Krejčová, Kateřina - Dejmek, Milan - Žilecká, Eva - Klepetářová, Blanka - Poštová Slavětínská, Lenka - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Novel analogues of a nonnucleoside SARS-CoV-2 RdRp inhibitor as potential antivirotics.
Beilstein Journal of Organic Chemistry. Roč. 20, May (2024), s. 1029-1036. ISSN 1860-5397. E-ISSN 1860-5397
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antivirotics * nonnucleotide inhibitor * RNA-dependent RNA polymerase * SARS-CoV-2
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 2.1, rok: 2024 ; AIS: 0.432, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3762/bjoc.20.91
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353790

0576080 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, Michala - Otava, Tomáš - Šilhán, Jan - Nencka, Radim - Weber, Jan - Bouřa, Evžen
Inhibitors of mpox VP39 2′-O methyltransferase efficiently inhibit the monkeypox virus.
Antiviral Research. Roč. 218, October (2023), č. článku 105714. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: structural basis
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.276, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2023.105714
Weber, Jan
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345703

0588104 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Žilecká, Eva - Klíma, Martin - Štefek, Milan - Dejmek, Milan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Structure of SARS-CoV-2 MTase nsp14 with the inhibitor STM957 reveals inhibition mechanism that is shared with a poxviral MTase VP39.
Journal of Structural Biology: X. Roč. 10, December (2024), č. článku 100109. ISSN 2590-1524. E-ISSN 2590-1524
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: methyltransferase * inhibitor * crystal structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.25, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2024.100109
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355136