0599752 - BC 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Holoubek, Jiří - Bouřa, Evžen - Růžek, Daniel - Renčiuk, Daniel - Eyer, Luděk
Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, č. 6 (2024), s. 215-215, č. článku L-07. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024: The Third Annual Meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Guanine quadruplexes * encephalitis * tick
Obor OECD: Virology; Virology (BFU-R); Virology (UOCHB-X)
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48
Eyer, Luděk
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357175
Uložit do RIV jako O

0602828 - BC 2025 RIV GB eng A - Abstrakt
Holoubek, Jiří - Salát, Jiří - Matkovic, M. - Bednář, Petr - Novotný, Pavel - Hradilek, Martin - Majerová, Taťána - Rosendal, E. - Eyer, Luděk - Fořtová, Andrea - Dušková, Michaela - Bell-Sakyi, L. - Överby, A.K. - Cavalli, A. - Růžek, Daniel
Divergent Infectivity Dynamics of Immature Tick-Borne and Mosquito-Borne Flaviviruses: A Paradigm Shift in prM-Containing Particle Infectivity Mechanisms.
HCV-Flavi 2024. Oxford: University of Oxford, 2024.
[30th International Symposium on Hepatitis C Virus, Flaviviruses, and Related Viruses. 25.09.2024-28.09.2024, Oxford]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Tick-Borne * Mosquito-Borne * Flaviviruses
Obor OECD: Virology; Virology (UOCHB-X)
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360150
Uložit do RIV jako O

0599755 - BC 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Kříha, Michal - Kamiš, Jan - Dvořáková, Markéta - Elsterová, Jana - Chrdle, A. - Slavíková, Veronika - Růžek, Daniel - Palus, Martin - Hönig, Václav
Detection of tick-borne encephalits virus RNA in patient samples across different infection stages.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, SEPTEMBER (2024), s. 199-276, č. článku P-16. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024: The Third Annual Meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Tick-borne encephalitis (TBE) * virus * blood
Obor OECD: Virology
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357180
Uložit do RIV jako O

0599761 - BC 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Tardy, Luc Maxime - Hönig, Václav - Kamiš, Jan - Růžek, Daniel - Palus, Martin
Quasispecies in tick-borne encephalitis virus - utilising long-read next-generation sequencing to determine population diversity and genomic plasticity in viral evolution.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, SEPTEMBER (2024), s. 199-276, č. článku P-17. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024: The Third Annual Meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Quasispecies * Encephalitis * RNA viruses
Obor OECD: Virology
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357185
Uložit do RIV jako O

0598543 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bae, J. - Bednář, P. - Zhu, R. - Bong, C. - Bak, M.S. - Stainer, S. - Kim, K. - Lee, J. - Yoon, C. - Lee, Y. - Ojowa, O.T. - Lehner, M. - Hinterdorfer, P. - Růžek, Daniel - Park, S. - Oh, Y.J.
Mechanisms of Plasma Ozone and UV-C Sterilization of SARS-CoV-2 Explored through Atomic Force Microscopy.
ACS Applied Materials and Interfaces. Roč. 16, č. 37 (2024), s. 49176-49185. ISSN 1944-8244. E-ISSN 1944-8252
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: sterilization mechanisms * infectivity test * topographical characteristics * structural characteristics * binding activity
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 8.2, rok: 2024 ; AIS: 1.432, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsami.4c11057
Park, S.
- Oh, Y.J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356319

0585660 - ÚFCH JH 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Fialová, T. - Vaculovičová, M. - Štefánik, M. - Mravec, F. - Burešová, M. - Vodová, M. - Rypar, T. - Růžek, Daniel - Hynek, D. - Číhalová, K. - Bačovský, J. - Ferus, Martin - Nejdl, Lukáš
Light-triggered reactions in a new “light” of nanoparticles engineering.
Journal of Photochemistry and Photobiology A-Chemistry. Roč. 454, SEP 2024 (2024), č. článku 115667. ISSN 1010-6030. E-ISSN 1873-2666
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF24-12656K
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Antimicrobial substance * Interferometry * mrsa * Nanoparticles * Nanoreactors * Nanozymes * Ultraviolet radiation
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (BC-A)
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.518, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1010603024002119?via%3Dihub
Nejdl, Lukáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353338

0598819 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gervais, A. - Marchal, A. - Fořtová, Andrea - Beránková, Michaela - Krbková, L. - Pychova, M. - Salát, Jiří - Zhao, S. - Kerrouche, N. - Le Voyer, T. - Stiasny, K. - Raffl, S. - Schieber Pachart, A. - Fafi-Kremer, S. - Gravier, S. - Robbiani, D.F. - Abel, L. - MacDonald, M.R. - Rice, C.M. - Weissmann, G. - Kamal Eldin, T. - Robatscher, E. - Erne, E.M. - Pagani, E. - Borghesi, A. - Puel, A. - Bastard, P. - Velay, A. - Martinot, M. - Hansmann, Y. - Aberle, J.H. - Růžek, Daniel - Cobat, A. - Zhang, S. - Casanova, J.
Autoantibodies neutralizing type I IFNs underlie severe tick-borne encephalitis in ∼10% of patients.
Journal of Experimental Medicine. Roč. 221, č. 10 (2024), č. článku e20240637. ISSN 0022-1007. E-ISSN 1540-9538
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-05-00659; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: virus * antibodies * ns5
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 10.6, rok: 2024 ; AIS: 5.81, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1084/jem.20240637
Casanova, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361566

0598826 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nagy, G.A. - Tombacz, D. - Prazsak, I. - Csabai, Z. - Dormo, A. - Gulyas, G. - Kemenesi, G. - Toth, G.E. - Holoubek, Jiří - Růžek, Daniel - Kakuk, B. - Boldogkoi, Z.
Exploring the transcriptomic profile of human monkeypox virus via CAGE and native RNA sequencing approaches.
mSphere. Roč. 9, č. 9 (2024), č. článku e0035624. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: messenger-rnas * nucleotide-sequence * polymerase gene * vaccinia * genome * ends * termination * initiation * expression * regions * monkeypox virus * CAGE-Seq * nanopore sequencing * long-read sequencing * transcriptome * poxvirus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 1.156, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/msphere.00356-24
Boldogkoi, Z.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362090

0588218 - BC 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Prančlová, Veronika - Hönig, Václav - Zemanová, Marta - Růžek, Daniel - Palus, Martin
Robust CXCL10/IP-10 and CCL5/RANTES Production Induced by Tick-Borne Encephalitis Virus in Human Brain Pericytes Despite Weak Infection.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 25, č. 14 (2024), č. článku 7892. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-30500S; GA ČR(CZ) GA23-08039S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: cerebrospinal-fluid * gene-expression * chemokines * cxcl11 * tick-borne encephalitis virus * human pericytes * infection * chemokine * flavivirus * cxcl10 * ccl5 * inflammation
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2024 ; AIS: 1.121, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms25147892
Růžek, Daniel
- Palus, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360083

0598235 - BC 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Růžek, Daniel - Kaucká, Kristýna
A brief tale of two pioneering moments: Europe's first discovery of Tick-Borne Encephalitis (TBE) virus beyond the Soviet Union and the largest alimentary TBE outbreak in history.
Ticks and Tick-borne Diseases. Roč. 15, č. 3 (2024), č. článku 102314. ISSN 1877-959X. E-ISSN 1877-9603
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA23-07160S
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:67985921
Klíčová slova: slovakia * region * Tickborne encephalitis * Tickborne encephalitis virus * History * Alimentary infection * Virus discovery
Obor OECD: Virology; History (history of science and technology to be 6.3, history of specific sciences to be under the respective headings) (MSUA-W)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.817, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ttbdis.2024.102314
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355961

0604841 - BC 2025 RIV NZ eng J - Článek v odborném periodiku
Vojníková, M. - Sukupova, M. - Štefánik, M. - Straková, Petra - Haviernik, J. - Kapolkova, K. - Gruberova, E. - Rašková, K. - Michalkova, H. - Švec, P. - Kudlickova, M.P. - Huvarová, I. - Růžek, Daniel - Salát, Jiří - Pekařík, V. - Eyer, Luděk - Heger, Z.
Nanoformulation of the Broad-Spectrum Hydrophobic Antiviral Vacuolar ATPase Inhibitor Diphyllin in Human Recombinant H-ferritin.
International Journal of Nanomedicine. Roč. 19, APR (2024), s. 3907-3917. ISSN 1178-2013. E-ISSN 1178-2013
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: delivery * apoferritin * nanoparticles * nanocage * channels * agents * drug delivery * SARS-CoV-2 * tbev * wnv * Zika virus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 6.5, rok: 2024 ; AIS: 1.141, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.2147/IJN.S452119
Heger, Z.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362352

0602826 - BC 2025 RIV CZ cze K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Kamiš, Jan - Kříha, Michal - Dvořáková, Markéta - Tardy, Luc Maxime - Elsterová, Jana - Chrdle, A. - Teislerová, D. - Růžek, Daniel - Palus, Martin - Kybicová, K. - Kulma, M. - Nigsch, A. - Hönig, Václav
Klíšťaty přenášené virové patogeny u klíšťat a pacientů v Jihočeském kraji.
[Tick-borne viral pathogens in ticks and patients in the South Bohemia Region.]
31. Pečenkovy epidemiologické dny 2024. Plzeň: Společnost pro epidemiologii a mikrobiologii České lékařské společnosti Jana Evangelisty Purkyně,Univerzita Karlova, Lékařská fakulta v Plzni, 2024, s. 33-33. ISBN 978-80-88120-36-0.
[31. Pečenkovy epidemiologické dny 2024. Plzeň (CZ), 11.09.2024-13.09.2024]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: patogen * klíšťata * pacient
Obor OECD: Virology
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360148
Uložit do RIV jako O