0579682 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Ackermann-Gaumann, R. - Brechet, A. - Smetana, J. - Salát, Jiří - Lienhard, R. - Croxatto, A. - Polcarova, P. - Chlibek, R. - Růžek, Daniel
Vaccination against tick-borne encephalitis elicits a detectable NS1 IgG antibody response.
Journal of Virological Methods. Roč. 322, DEC (2023), č. článku 114831. ISSN 0166-0934. E-ISSN 1879-0984
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-05-00659; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: nonstructural protein * virus * prevention * Tickborne encephalitis * Antibody * Non-structural protein 1 * ns1 * Vaccination * Flavivirus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2023 ; AIS: 0.402, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166093423001568?via%3Dihub
Ackermann-Gaumann, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348495

0598543 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bae, J. - Bednář, P. - Zhu, R. - Bong, C. - Bak, M.S. - Stainer, S. - Kim, K. - Lee, J. - Yoon, C. - Lee, Y. - Ojowa, O.T. - Lehner, M. - Hinterdorfer, P. - Růžek, Daniel - Park, S. - Oh, Y.J.
Mechanisms of Plasma Ozone and UV-C Sterilization of SARS-CoV-2 Explored through Atomic Force Microscopy.
ACS Applied Materials and Interfaces. Roč. 16, č. 37 (2024), s. 49176-49185. ISSN 1944-8244. E-ISSN 1944-8252
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: sterilization mechanisms * infectivity test * topographical characteristics * structural characteristics * binding activity
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 8.2, rok: 2024 ; AIS: 1.432, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsami.4c11057
Park, S.
- Oh, Y.J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356319

0616754 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Beránková, Michaela - Holoubek, Jiří - Hönig, Václav - Matúšová, Zuzana - Palus, Martin - Salát, Jiří - Krayem, Imtissal - Vojtíšková, Jarmila - Svoboda, P. - Prančlová, Veronika - Valihrach, Lukáš - Demant, P. - Lipoldová, Marie - Růžek, Daniel
Genotype-driven sensitivity of mice to tick-borne encephalitis virus correlates with differential host responses in peripheral macrophages and brain.
Journal of Neuroinflammation. Roč. 22, č. 1 (2025), č. článku 22. ISSN 1742-2094. E-ISSN 1742-2094
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07160S; GA ČR(CZ) GA23-08039S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:86652036 ; RVO:68378050
Klíčová slova: single nucleotide polymorphism * recombinant congenic strains * human predisposition * severe forms * gene * infection * pathogenesis * immunopathology * association * expression * Tick-borne encephalitis * Tick-borne encephalitis virus * Mouse model * Neuroinflammation * Genetics * Transcriptomics * Macrophages
Obor OECD: Virology; Neurosciences (including psychophysiology (BTO-N); Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 10.1, rok: 2024 ; AIS: 2.574, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12974-025-03354-1
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365076

0572379 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bianchini, F. - Crivelli, V. - Abernathy, M. R. - Guerra, C. - Palus, Martin - Muri, J. - Marcotte, H. - Piralla, A. - Pedotti, M. - De Gasparo, R. - Simonelli, L. - Matkovic, M. - Toscano, C. - Biggiogero, M. - Calvaruso, V. - Svoboda, Pavel - Rincon, T. C. - Fava, T. - Podesvova, L. - Shanbhag, A. A. - Celoria, A. - Sgrignani, J. - Štefánik, M. - Hönig, Václav - Prančlová, Veronika - Michalčíková, Tereza - Procházka, Jan - Guerrini, G. - Mehn, D. - Clabbattini, A. - Sedláček, Radislav - Růžek, Daniel … celkem 46 autorů
Human neutralizing antibodies to cold linear epitopes and subdomain 1 of the SARS-CoV-2 spike glycoprotein.
SCI IMMUNOL. Roč. 8, č. 81 (2023), č. článku eade0958. ISSN 2470-9468. E-ISSN 2470-9468
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GF21-05445L; GA ČR GF22-17139K; GA MŠMT(CZ) LM2018126
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * glycoprotein * epitopes
Obor OECD: Virology; Immunology (UMG-J)
Impakt faktor: 17.8, rok: 2023 ; AIS: 9.304, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.science.org/doi/10.1126/sciimmunol.ade0958
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343705

0574468 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brzuska, G. - Zimna, M. - Baranska, K. - Szewczyk, B. - Straková, Petra - Růžek, Daniel - Król, E.
The Influence of Adjuvant Type on the Immunogenicity of RBD/N Cocktail Antigens as a Vaccine Candidate against SARS-CoV-2 Virus.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, MAY (2023), č. článku 3. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * adjuvants * antigen specificity * vaccines
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 1.02, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/spectrum.02564-22
Król, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345240

0637878 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
De Clercq, E. - Zhang, Y. - Li, G. - Deng, Y. - Khouri, R. - Růžek, Daniel - Król, E. - Tan, L.
Lenacapavir: A capsid inhibitor for HIV-1 treatment and prevention.
Biochemical Pharmacology. Roč. 240, JUL (2025), č. článku 117125. ISSN 0006-2952. E-ISSN 1873-2968
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: therapy * protein * Lenacapavir * HIV-1 therapy * Pre-exposure prophylaxis * Drug combination * Drug resistance
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2024 ; AIS: 1.219, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bcp.2025.117125
Tan, L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368726

0645063 - ÚMG 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dvořák, M. - Arbon, Dominik - Salát, Jiří - Fořtová, Andrea - Reguera, David Pajuelo - Frčková, T. - Holoubek, Jiří - Balounová, Jana - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Růžek, Daniel
Sex-dependent impairment of antibody responses to tick-borne encephalitis virus vaccination and infection in obese mice.
Journal of General Virology. Roč. 106, č. 10 (2025), č. článku 002161. ISSN 0022-1317. E-ISSN 1465-2099
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07160S
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:60077344
Klíčová slova: immune response * obesity * tick-borne encephalitis * tick-borne encephalitis virus * vaccination
Obor OECD: Virology; Virology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.975, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1099/jgv.0.002161
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374909

0572867 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Eyer, Luděk - Seley-Radtke, K. - Růžek, Daniel
New directions in the experimental therapy of tick-borne encephalitis.
Antiviral Research. Roč. 210, JAN (2023), č. článku 105504. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-05445L; GA ČR(CZ) GA20-14325S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Tick-borne encephalitis * Tick-borne encephalitis virus * Antivirals * Monoclonal antibodies * Immunotherapy
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.276, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S016635422200273X?via%3Dihub
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343708

0585660 - ÚFCH JH 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Fialová, T. - Vaculovičová, M. - Štefánik, M. - Mravec, F. - Burešová, M. - Vodová, M. - Rypar, T. - Růžek, Daniel - Hynek, D. - Číhalová, K. - Bačovský, J. - Ferus, Martin - Nejdl, Lukáš
Light-triggered reactions in a new “light” of nanoparticles engineering.
Journal of Photochemistry and Photobiology A-Chemistry. Roč. 454, SEP 2024 (2024), č. článku 115667. ISSN 1010-6030. E-ISSN 1873-2666
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF24-12656K
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Antimicrobial substance * Interferometry * mrsa * Nanoparticles * Nanoreactors * Nanozymes * Ultraviolet radiation
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (BC-A)
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.518, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1010603024002119?via%3Dihub
Nejdl, Lukáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353338

0582958 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fořtová, A. - Barkhash, A. - Pychova, M. - Krbková, L. - Palus, Martin - Salát, Jiří - Růžek, Daniel
Genetic polymorphisms in innate immunity genes influence predisposition to tick-borne encephalitis.
Journal of Neurovirology. Roč. 29, č. 6 (2023), s. 699-705. ISSN 1355-0284. E-ISSN 1538-2443
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-05-00659; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: single nucleotide polymorphism * promoter region * clinical forms * il10 gene * virus * association * epidemiology * replication * inapparent * infection * Tick-borne encephalitis * Genetics * Immunity genes * Single-nucleotide polymorphism * Predisposition
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.3, rok: 2023 ; AIS: 0.599, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s13365-023-01182-8
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350999

0569304 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Fořtová, A. - Hönig, Václav - Salát, Jiří - Palus, Martin - Pychova, M. - Krbková, L. - Barkhash, A. - Kříha, M.F. - Chrdle, A. - Lipoldová, Marie - Růžek, Daniel
Serum matrix metalloproteinase-9 (MMP-9) as a biomarker in paediatric and adult tick-borne encephalitis patients.
Virus Research. Roč. 324, JAN (2023), č. článku 199020. ISSN 0168-1702. E-ISSN 1872-7492
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14325S; GA ČR(CZ) GA20-30500S; GA MZd NV19-05-00457
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: Tick-borne encephalitis * Neuroinfection * Matrix matalloproteinase * Cerebrospinal fluid
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2023 ; AIS: 0.679, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168170222003495?via%3Dihub
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344192

0598819 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gervais, A. - Marchal, A. - Fořtová, Andrea - Beránková, Michaela - Krbková, L. - Pychova, M. - Salát, Jiří - Zhao, S. - Kerrouche, N. - Le Voyer, T. - Stiasny, K. - Raffl, S. - Schieber Pachart, A. - Fafi-Kremer, S. - Gravier, S. - Robbiani, D.F. - Abel, L. - MacDonald, M.R. - Rice, C.M. - Weissmann, G. - Kamal Eldin, T. - Robatscher, E. - Erne, E.M. - Pagani, E. - Borghesi, A. - Puel, A. - Bastard, P. - Velay, A. - Martinot, M. - Hansmann, Y. - Aberle, J.H. - Růžek, Daniel - Cobat, A. - Zhang, S. - Casanova, J.
Autoantibodies neutralizing type I IFNs underlie severe tick-borne encephalitis in ∼10% of patients.
Journal of Experimental Medicine. Roč. 221, č. 10 (2024), č. článku e20240637. ISSN 0022-1007. E-ISSN 1540-9538
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-05-00659; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: virus * antibodies * ns5
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 10.6, rok: 2024 ; AIS: 5.81, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1084/jem.20240637
Casanova, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361566

0557410 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Holoubek, Jiří - Bednářová, Klára - Haviernik, Jan - Huvarová, I. - Dvořáková, Zuzana - Černý, J. - Outlá, Martina - Salát, Jiří - Konkoľová, Eva - Bouřa, Evžen - Růžek, Daniel - Vorlíčková, Michaela - Eyer, Luděk - Renčiuk, Daniel
Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 8 (2022), s. 4574-4600. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-20229S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: intercalator displacement assay * forming sequences * small-molecule * binding * dna * fluorescence * zika * identification * pyridostatin * inactivation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (BFU-R); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/50/8/4574/6568495?login=true
Eyer, Luděk
- Renčiuk, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339132

0567976 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hönig, Václav - Kamiš, Jan - Maršíková, A. - Matějková, T. - Stopka, P. - Mácová, A. - Růžek, Daniel - Kvičerová, J.
Orthohantaviruses in Reservoir and Atypical Hosts in the Czech Republic: Spillover Infection and Indication of Virus-Specific Tissue Tropism.
Microbiology Spectrum. Roč. 10, č. 5 (2022), č. článku e01306-22. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Kurkino virus * Tula virus * Seewis virus * Asikkala virus * rodents * Eulipotyphla * phylogeny * host specificity * tissue specificity * zoonoses * zoonosis
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022 ; AIS: 1.439, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.01306-22
Hönig, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339286

0576093 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Chiffi, G. - Grandgirard, D. - Leib, S.L. - Chrdle, A. - Růžek, Daniel
Tick-borne encephalitis: A comprehensive review of the epidemiology, virology, and clinical picture.
Reviews in Medical Virology. Roč. 33, SEPT (2023), č. článku 5. ISSN 1052-9276. E-ISSN 1099-1654
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14325S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: epidemiology * immune response * molecular pathogenesis * neurological sequela * tick-borne encephalitis * tick-borne encephalitis virus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 9, rok: 2023 ; AIS: 2.037, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/rmv.2470
Chiffi, G.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0346043

0574489 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kakuk, B. - Dormo, A. - Csabai, Z. - Kemenesi, G. - Holoubek, Jiří - Růžek, Daniel - Prazsak, I. - Dani, V.É. - Denes, B. - Torma, G. - Jakab, F. - Tóth, G. - Foldes, F.V. - Zana, B. - Lanszki, Z. - Harangozo, A. - Fülöp, A. - Gulyas, G. - Mizik, M. - Kiss, A. A. - Tombacz, D. - Boldogkoi, Z.
In-depth Temporal Transcriptome Profiling of Monkeypox and Host Cells using Nanopore Sequencing.
Scientific Data. Roč. 10, č. 1 (2023), č. článku 262. ISSN 2052-4463. E-ISSN 2052-4463
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Transcriptome * Monkeypox * Host Cells
Obor OECD: Polymer science
Impakt faktor: 5.8, rok: 2023 ; AIS: 2.857, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41597-023-02149-4
Boldogkoi, Z.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345553

0571902 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Kevély, Á. - Prančlová, Veronika - Slávikova, M. - Haviernik, Jan - Hönig, Václav - Nováková, E. - Palus, Martin - Růžek, Daniel - Klempa, B. - Kočí, J.
Fitness of mCherry Reporter Tick-Borne Encephalitis Virus in Tick Experimental Models.
Viruses. Roč. 14, č. 12 (2022), č. článku 2673. ISSN 1999-4915. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14325S; GA ČR(CZ) GA20-30500S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: tick-borne encephalitis virus * tbev * mCherry reporter * viral reverse genetics * Ixodes ricinus * ticks * tick cell culture
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2022 ; AIS: 1.096, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/14/12/2673
Kočí, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342792

0574469 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kobayashi, S. - Fukuda, Y. - Yoshii, K. - Thammahakin, P. - Maezono, K. - Eyer, Luděk - Růžek, Daniel - Kariwa, H.
Development of recombinant West Nile virus expressing mCherry reporter protein.
Journal of Virological Methods. Roč. 317, APR (2023), č. článku 114744. ISSN 0166-0934. E-ISSN 1879-0984
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: West Nile virus * Reporter protein * Production of reporter virus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2023 ; AIS: 0.402, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166093423000691?via%3Dihub
Kobayashi, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345586

0557966 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kováčech, B. - Fialova, L. - Filipčík, P. - Skrabana, R. - Zilkova, M. - Paulenka-Ivanovova, N. - Kovac, A. - Palova, D. - Rolkova, G. - Tomková, K. - Csokova, N. - Markova, K. - Skrabanova, M. - Sinska, K. - Basheer, N. - Majerova, P. - Hanes, J. - Parrak, V. - Prcina, M. - Cehlar, O. - Cente, M. - Piešťanský, J. - Fresser, M. - Novak, M. - Slávikova, M. - Borsova, K. - Čabanová, V. - Brejová, B. - Vinař, T. - Nosek, J. - Eyer, Luděk - Hönig, Václav - Palus, Martin - Růžek, Daniel - Vyhlídalová, Tereza - Straková, Petra - Mrázková, Blanka - Zudová, Dagmar - Koubková, Gizela - Novosadová, Vendula - Procházka, Jan - Sedláček, Radislav - Žilka, N. - Kontseková, E. … celkem 45 autorů
Monoclonal antibodies targeting two immunodominant epitopes on the Spike protein neutralize emerging SARS-CoV-2 variants of concern.
EBioMedicine. Roč. 76, FEB 2022 (2022), č. článku 103818. ISSN 2352-3964. E-ISSN 2352-3964
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * covid-19 * Neutralizing antibodies * Escape mutation * Variants of concern
Obor OECD: Virology; Virology (UMG-J)
Impakt faktor: 11.1, rok: 2022 ; AIS: 2.586, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235239642200007X?via%3Dihub
Kováčech, B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0334892

0619444 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kříha, Michal - Kamiš, Jan - Dvořáková, Markéta - Tardy, Luc Maxime - Elsterová, Jana - Teislerova, D. - Chrdle, A. - Palus, Martin - Růžek, Daniel - Hönig, Václav
Detection of tick-borne encephalitis virus RNA in patient samples at different stages of infection.
Journal of Infection. Roč. 90, č. 5 (2025), č. článku 106481. ISSN 0163-4453. E-ISSN 1532-2742
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA23-08039S; GA MZd(CZ) NU22-05-00659; GA MŠMT(CZ) LUC23151
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: clinical specimens * cross-reactivity * prevalence * diagnosis * disease * viremia * Tick-borne encephalitis * RNA detection * Molecular diagnostics * RT-qPCR * Patient samples
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 11.9, rok: 2024 ; AIS: 2.864, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.jinf.2025.106481
Růžek, Daniel
- Hönig, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369588

0639190 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kuňka, A. - Hříbková, H. - Váňová, T. - Pospíšilová, V. - Havlasek, M. - Haviernik, J. - Růžek, Daniel - Damborský, J. - Bohaciaková, D. - Prokop, Z.
Modulation of Amyloid-β Aggregation by Surface Proteins from Pathogens Associated with Alzheimer's Disease.
ACS Chemical Neuroscience. Roč. 16, č. 18 (2025), s. 3554-3566. ISSN 1948-7193. E-ISSN 1948-7193
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: herpes-simplex-virus * borrelia-burgdorferi * crystal-structure * glycoprotein b * secondary nucleation * cerebrospinal-fluid * fibril formation * peptides * ospa * mechanisms * Alzheimer'sdisease * amyloids * neuroinflammation * pathogen * virus * amyloid-beta
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 0.91, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acschemneuro.5c00444
Bohaciaková, D.
- Prokop, Z.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370823

0644098 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Macháček, M. - Beránková, Michaela - Salát, Jiří - Růžek, Daniel
Milk Modulates the Gastrointestinal Stability of Tick-Borne Encephalitis Virus: Implications for Alimentary Transmission.
Journal of Medical Virology. Roč. 98, č. 1 (2025), č. článku e70778. ISSN 0146-6615. E-ISSN 1096-9071
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07160S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: in-vitro * whey proteins * bile-salts * digestion * casein * bovine * acids * inactivation * replication * physiology
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.104, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/jmv.70778
Růžek, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374471

0605150 - BC 2026 US eng J - Článek v odborném periodiku
Maryewski, X.A. - Krasilnikov, M.S. - Straková, P. - Holoubek, Jiří - Frckova, T. - Panina, I.S. - Krylov, N. A. - Gvozdev, D.A. - Denisov, V.S. - Semenov, A.N. - Lotosh, N.Y. - Selishcheva, A.A. - Chistov, A.A. - Gulyak, E.L. - Kozhemyakin, G.L. - Korshun, V.A. - Efremov, R. G. - Ustinov, A.V. - Růžek, Daniel - Eyer, Luděk - Alferova, V.A.
Membrane-Active Singlet Oxygen Photogenerators as a Paradigm for Broad-Spectrum Antivirals: The Case of Halogenated (BOron)-DIPYrromethenes.
ACS Applied Materials and Interfaces. Roč. 17, č. 3 (2025), s. 4502-4528. ISSN 1944-8244. E-ISSN 1944-8252
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: amphipathic fusion inhibitors * linear constraint solver * hepatitis-c virus * photodynamic therapy * bodipy dyes * force-field * derivatives * reproduction * photosensitizers * fluorescence * enveloped viruses * bodipy * membrane-targetingphotosensitizer * singlet oxygen photogeneration * virus-inactivating activity
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 8.2, rok: 2024 ; AIS: 1.432, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acsami.4c17482
Eyer, Luděk
- Alferova, V.A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362724

0557058 - BC 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Migne, C. - Hönig, Václav - Bonnet, S. - Palus, Martin - Rakotobe, S. - Galon, C. - Heckmann, A. - Výletová, Eva - Devillers, E. - Attoui, H. - Růžek, Daniel - Moutailler, S.
Evaluation of two artificial infection methods of live ticks as tools for studying interactions between tick-borne viruses and their tick vectors.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 491. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14325S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ixodes-persulcatus ticks * encephalitis-virus * kemerovo virus * ricinus ticks * aedes-aegypti * transmission * mice * competence * variants * survival
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022 ; AIS: 1.132, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-021-04498-9
Moutailler, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340122

0571503 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mulgaonkar, N. - Wang, H. - Mallawarachchi, S. - Růžek, Daniel - Martina, B. - Fernando, S.
In silico and in vitro evaluation of imatinib as an inhibitor for SARS-CoV-2.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Roč. 41, č. 7 (2023), s. 3052-3061. ISSN 0739-1102. E-ISSN 1538-0254
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * covid-19 * betacoronavirus * acute respiratory disease * Wuhan * ace2 * surface structural spike glycoprotein * molecular docking * Bcr-Abl tyrosine kinase inhibitor * imatinib
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2023 ; AIS: 0.419, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/07391102.2022.2045221?journalCode=tbsd20
Fernando, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343719