Nápověda

Záhonová Kristýna

Publikace ASEP

Další varianty jména: Pašuthová, Kristýna
Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 24

0603909 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Afonin, D.A. - Gerasimov, E. S. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Záhonová, Kristýna - Gahura, Ondřej - Albanaz, A.T.S. - Myšková, Eva - Byková, A. - Paris, Zdeněk - Lukeš, Julius - Opperdoes, F. R. - Horváth, A. - Zimmer, S.L. - Yurchenko, V.
Blastocrithidia nonstop mitochondrial genome and its expression are remarkably insulated from nuclear codon reassignment.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 7 (2024), s. 3870-3885. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-01026S; GA ČR(CZ) GF23-08669L; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: transfer-rna * leishmania-tarentolae * complex-i * phytomonas-serpens * trypanosoma-brucei * minicircle genome * kinetoplast dna * alignment * import * genes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae168
Zimmer, S.L.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361206

0575164 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Albanaz, A.T.S. - Carrington, M. - Frolov, A. - Ganyukova, A.I. - Gerasimov, E. S. - Kostygov, A.Y. - Lukeš, Julius - Malysheva, M. N. - Votýpka, Jan - Zakharova, A. - Záhonová, Kristýna - Zimmer, S.L. - Yurchenko, V. - Butenko, Anzhelika
Shining the spotlight on the neglected: new high-quality genome assemblies as a gateway to understanding the evolution of Trypanosomatidae.
BMC Genomics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 471. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Trypanosomatids * Genome assembly * Whole-genome sequencing * Monoxenous * Dixenous * Parasite * Protist
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2023 ; AIS: 1.116, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09591-z
Yurchenko, V.
- Butenko, Anzhelika
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345274

0570576 - BC 2023 RIV US eng M - Část monografie knihy
Barlow, L.D. - Maciejowski, W. - More, K. - Terry, K. - Vargová, R. - Záhonová, Kristýna - Dacks, J.B.
Comparative Genomics for Evolutionary Cell Biology Using AMOEBAE: Understanding the Golgi and Beyond.
Golgi. Vol. 2557. New York: Humana, 2022 - (Wang, Y.; Lupashin, V.; Graham, T.), s. 431-452. Methods in Molecular Biology, XVII. ISBN 978-1-0716-2638-2
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Adaptin * Basidiomycete * blast * Comparative genomics * Computational pipeline * Evolutionary Cell Biology * Golgi * Homology searching * Molecular evolution * Workflow
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-2639-9_26
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0341877

0574461 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Faktorová, Drahomíra - Záhonová, Kristýna - Benz, Corinna - Dacks, Joel Bryan - Field, Mark Christian - Lukeš, Julius
Functional differentiation of Sec13 paralogues in the euglenozoan protists.
Open Biology. Roč. 13, č. 6 (2023), č. článku 220364. ISSN 2046-2441. E-ISSN 2046-2441
Grant CEP: GA MŠMT LM2023042; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA MŠMT(CZ) LM2018129
GRANT EU: Wellcome Trust(GB) 204697/Z/16/Z
Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Diplonema * coatomer * membrane trafficking * nuclear pore complex * sea * GATOR complex * paralogue expansion
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.954, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rsob.220364

Faktorová, Drahomíra Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345418

0636806 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Galan, A. - Kraeva, N. - Záhonová, Kristýna - Butenko, Anzhelika - Kostygov, A. Y. - Paris, Zdeněk - Pergner, J. - Bianchi, C. - Fakih, Fadel - Saura, A. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
Converting Blastocrithidia Nonstop, a Trypanosomatid With Non-Canonical Genetic Code, Into a Genetically-Tractable Model.
Molecular Microbiology. Roč. 123, č. 6 (2025), s. 586-592. ISSN 0950-382X. E-ISSN 1365-2958
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GF23-08669L
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: metabolism * diversity * genomics * parasite * codon reassignment * CRISPR-Cas9 * genetic code * model organism * trypanosomatids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.6, rok: 2024 ; AIS: 1.101, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/mmi.15365
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367799

0586440 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Grybchuk, D. - Galan, A. - Klocek, D. - Macedo, D.H. - Wolf, A. - Votýpka, Jan - Butenko, Anzhelika - Lukeš, Julius - Neri, U. - Záhonová, Kristýna - Kostygov, A. Y. - Koonin, E. - Yurchenko, V.
Identification of diverse RNA viruses in Obscuromonas flagellates (Euglenozoa: Trypanosomatidae: Blastocrithidiinae).
Virus Evolution. Roč. 10, č. 1 (2024), č. článku veae037. E-ISSN 2057-1577
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-14356S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genetic-code * alignment * sequence * evolution * genomics * codons * fungus * genus * Obscuromonas * Blastocrithidia * dsRNA viruses * Narnaviridae * Mitoviridae * Qin-like virus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 1.628, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/ve/veae037
Koonin, E.
- Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361583

0584660 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Chmelova, L. - Záhonová, Kristýna - Albanaz, A.T.S. - Hrebenyk, L. - Horváth, A. - Yurchenko, V. - Škodová-Sveráková, Ingrid
Distribution and Functional Analysis of Isocitrate Dehydrogenases across Kinetoplastids.
Genome Biology and Evolution. Roč. 16, č. 3 (2024), č. článku evae042. ISSN 1759-6653. E-ISSN 1759-6653
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: procyclic trypanosoma-brucei * tricarboxylic-acid cycle * krebs cycle * enzyme-activities * model selection * blood-stream * metabolism * evolution * phosphorylation * mitochondrion * TCA cycle * Krebs cycle * isocitrate dehydrogenase * nadp(+) * nad(+) * cofactor preference
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 1.197, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/gbe/evae042
Yurchenko, V.
- Škodová-Sveráková, Ingrid
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361611

0601789 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jerlstrom-Hultqvist, J. - Gallot-Lavallee, L. - Salas-Leiva, D.E. - Curtis, B.A. - Záhonová, Kristýna - Čepička, I. - Stairs, C.W. - Pipaliya, S. - Dacks, Joel Bryan - Archibald, J.M. - Roger, A.J.
A unique symbiosome in an anaerobic single-celled eukaryote.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 9726. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: horizontal gene-transfer * desulfovibrio trichonymphae * genome * bacterial * alignment * vitamin-b-12 * evolution * sequence * identification * algorithm
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-024-54102-7

Jerlstrom-Hultqvist, J. Roger, A.J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361680

0571500 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kachale, Ambar - Pavlíková, Z. - Nenarokova, Anna - Roithova, A. - Durante, Ignacio Miguel - Miletinova, P. - Záhonová, Kristýna - Nenarokov, Serafim - Votýpka, Jan - Horáková, Eva - Ross, R.L. - Yurchenko, V. - Beznosková, P. - Paris, Zdeněk - Valášek, L. S. - Lukeš, Julius
Short tRNA anticodon stem and mutant eRF1 allow stop codon reassignment.
Nature. Roč. 613, č. 7945 (2023), s. 751-+. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA20-11585S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: tRNA * eRF1 * codon
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 50.5, rok: 2023 ; AIS: 24.765, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05584-2
Paris, Zdeněk
- Valášek, L. S.
- Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343713

0604889 - BC 2025 RIV CH eng M - Část monografie knihy
Konupková, A. - Tomečková, L. - Záhonová, Kristýna - Oborník, Miroslav - Füssy, Z.
Easier Lost than Found? What We Know about Plastid Genome Reduction.
Endosymbiotic Organelle Acquisition. Cham: Springer Cham, 2024 - (Schwartzbach, S.; Kroth, P.; Oborník, M.), (2024), s. 147-181. Solutions to the Problem of Protein Localization and Membrane Passage. ISBN 978-3-031-57444-3
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA21-03224S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Comparative genomics * Complete plastid loss * Endosymbiotic gene transfer * Horizontal gene transfer * Intron expansion * Minicircles * Nonphotosynthetic plastids * Plastid genome topology * Reductive evolution * Repeat expansion * Serial endosymbiosis
Obor OECD: Microbiology
https://doi.org/10.1007/978-3-031-57446-7_5
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362421

0576302 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Macedo, D. H. - Grybchuk, D. - Reznarova, J. - Votýpka, Jan - Klocek, D. - Yurchenko, T. - Ševčík, J. - Magri, A. - Dolinska, M.U. - Záhonová, Kristýna - Lukeš, Julius - Servienė, E. - Jászayová, A. - Serva, S. - Malysheva, M. N. - Frolov, A. O. - Yurchenko, V. - Kostygov, A.Y.
Diversity of RNA viruses in the cosmopolitan monoxenous trypanosomatid Leptomonas pyrrhocoris.
BMC Biology. Roč. 21, č. 1 (2023), č. článku 191. ISSN 1741-7007. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Tombus-like viruses * Ostravirus * Leishbuviridae * Qinviridae * Pyrrhocoris apterus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2023 ; AIS: 1.909, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-023-01687-y
Yurchenko, V.
- Kostygov, A.Y.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345989

0599967 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, J. - Treitli, S.C. - Füssy, Z. - Záhonová, Kristýna - Hamplová, B. - Hrdá, Š. - Hampl, V.
V9 Hypervariable Region Metabarcoding Primers for Euglenozoa and Metamonada.
Environmental DNA. Roč. 6, č. 5 (2024), č. článku e70022. E-ISSN 2637-4943
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ribosomal-rna gene * diversity * communities * eukaryotes * program * bias * tool * v4 * 18s-v9 * Euglenozoa * freshwater diversity * metabarcoding * Metamonada
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/edn3.70022

Novák, J. Hampl, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362094

0583676 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Opperdoes, F. R. - Záhonová, Kristýna - Škodová-Sveráková, Ingrid - Bučková, B. - Chmelova, L. - Lukeš, Julius - Yurchenko, V.
In silico prediction of the metabolism of Blastocrithidia nonstop, a trypanosomatid with non-canonical genetic code.
BMC Genomics. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 184. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-14356S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: leishmania-major * serine hydroxymethyltransferase * biosynthetic-pathway * alternative oxidase * fumarate reductase * bodo-saltans * fatty-acids * life-cycle * complex-i * brucei * Blastocrithidia * In silico * Metabolic predictions * Trypanosomatid * Non-canonical genetic code
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.031, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12864-024-10094-8
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362096

0619033 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pavlíková Čapková, Zuzana - Miletínová, Petra - Roithová, Adriana - Pospíšilová, Klára - Záhonová, Kristýna - Kachale, Ambar - Becker, T. - Durante, Ignacio Miguel - Lukeš, Julius - Paris, Zdeněk - Beznosková, Petra - Valášek, Leoš Shivaya
Ribosomal A-site interactions with near-cognate tRNAs drive stop codon readthrough.
Nature Structural & Molecular Biology. Roč. 32, January 13 (2025), s. 662-674. ISSN 1545-9993. E-ISSN 1545-9985
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-00579S; GA ČR(CZ) GA20-11585S; GA ČR(CZ) GF23-08669L
AV ČR(CZ) Premium Academiae of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: translation termination * genetic-code * nonsense * complex * recognition * downstream * elongation * eukaryotes * mechanism * insights
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 10.1, rok: 2024 ; AIS: 6.839, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41594-024-01450-z
Valášek, Leoš Shivaya
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365807

0574455 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sheikh, Shaghayegh - Panek, T. - Gahura, Ondřej - Týč, Jiří - Záhonová, Kristýna - Lukeš, Julius - Eliaš, M. - Hashimi, Hassan
A Novel Group of Dynamin-Related Proteins Shared by Eukaryotes and Giant Viruses Is Able to Remodel Mitochondria From Within the Matrix.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 40, č. 6 (2023), č. článku msad134. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA20-23513S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dynamin superfamily * Mgm1 * mitochondria * Nucleocytoviricota * Opa1 * protists
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 11, rok: 2023 ; AIS: 5.284, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/mbe/article/40/6/msad134/7190697?login=true
Eliaš, M.
- Hashimi, Hassan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345920

0558788 - BC 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tashyreva, Daria - Simpson, A.G.B. - Prokopchuk, Galina - Škodová-Sveráková, Ingrid - Butenko, Anzhelika - Hammond, Michael John - George, E.E. - Flegontova, Olga - Záhonová, Kristýna - Faktorová, Drahomíra - Yabuki, A. - Horák, Aleš - Keeling, P.J. - Lukeš, Julius
Diplonemids-A Review on New Flagellates on the Oceanic Block.
Protist. Roč. 173, č. 2 (2022), č. článku 125868. ISSN 1434-4610. E-ISSN 1618-0941
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-23787S; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ambulator larsen * phylogenetic position * microbial eukaryotes * euglena-gracilis * diversity * sea * patterson * protozoa * light * gene * Protists * taxonomic revision * ultrastructure * Euglenozoa * ecology * marine flagellates
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2022 ; AIS: 0.644, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S143446102200013X?via%3Dihub

Tashyreva, Daria Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340424

0555513 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Treitli, S.C. - Le, T. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Hanousková, P. - Čepička, I. - Tachezy, J. - Hampl, V.
Anaerobic derivates of mitochondria and peroxisomes in the free-living amoeba Pelomyxa schiedti revealed by single-cell genomics.
BMC Biology. Roč. 20, č. 1 (2022), č. článku 56. ISSN 1741-7007. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA19-19297S; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protein import * rna-seq * alignment * evolution * mechanism * system * origin * dehydrogenases * organelles * eukaryote * Pelomyxa * Mitochondrion-related organelle * Hydrogenosome * Anaerobic peroxisome * Anaerobiosis * FeS cluster assembly * Single-cell genomics
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022 ; AIS: 2.473, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01247-w

Záhonová, Kristýna Hampl, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340550

0586305 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Füssy, Z. - Stairs, C.W. - Leger, M.M. - Tachezy, J. - Čepička, I. - Roger, A.J. - Hampl, V.
Comparative analysis of mitochondrion- related organelles in anaerobic amoebozoans.
Microbial Genomics. Roč. 9, č. 11 (2023), č. článku 001143. ISSN 2057-5858. E-ISSN 2057-5858
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: glycine cleavage system * molecular evidence * reaction-mechanism * carrier family * l-threonine * protein * archamoebae * entamoeba * evolution * diversity * reductive evolution * mitochondrion-related organelles * anaerobiosis * comparative genomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4, rok: 2023 ; AIS: 1.413, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.001143

Záhonová, Kristýna Hampl, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353858

0604688 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Kaur, H. - Furgason, C. C. - Smirnova, A. V. - Dunfield, P. F. - Dacks, Joel Bryan
Comparative Analysis of Protist Communities in Oilsands Tailings Using Amplicon Sequencing and Metagenomics.
Environmental Microbiology. Roč. 27, č. 1 (2025), č. článku e70029. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: naphthenic acids * v9 regions * oil * diversity * alignment * phytoplankton * water * tool * biogeography * performance * amplicon * diversity * metagenome * mitochondrial genome * oilsands * protist
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 1.274, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/1462-2920.70029
Dacks, Joel Bryan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365072

0636641 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Füssy, Z. - Albanaz, A.T.S. - Butenko, Anzhelika - Kachale, Ambar - Kraeva, N. - Galan, A. - Zakharova, A. - Stojanova, B. - Votýpka, Jan - Kostygov, A.Y. - Spodareva, V. - Malysheva, M. N. - Frolov, A. O. - Rogozin, I.B. - Paris, Zdeněk - Valášek, Leoš Shivaya - Yurchenko, V. - Lukeš, Julius
Comparative genomic analysis of trypanosomatid protists illuminates an extensive change in the nuclear genetic code.
mBio. Roč. 16, č. 6 (2025), č. článku e0088525. ISSN 2150-7511. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA23-07695S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GF23-08669L
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: transfer-rna genes * divergence times * molecular-basis * evolution * identification * alignment * mutation * erf1 * recognition * insertion * AT-rich genomes * nuclear genetic code * reassigned codon * tRNA structure * eukaryotic release factors * termination of translation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Cell biology (MBU-M)
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.855, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/mbio.00885-25
Yurchenko, V.
- Lukeš, Julius
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368250

0619121 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Lukeš, Julius - Dacks, Joel Bryan
Diplonemid protists possess exotic endomembrane machinery, impacting models of membrane trafficking in modern and ancient eukaryotes.
Current Biology. Roč. 35, APR 2025 (2025), č. článku 7. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA22-01026S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genome * complex * classification * conservation * endocytosis * reveals * origins * protein * tool
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.5, rok: 2024 ; AIS: 3.993, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.cub.2025.02.032

Záhonová, Kristýna Dacks, Joel Bryan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373472

0574496 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Low, R. S. - Warren, C.J. - Cantoni, D. - Herman, E.K. - Yiangou, L. - Ribeiro, C.A. - Phanprasert, Y. - Brown, I.R. - Rueckert, S. - Baker, N.L. - Tachezy, J. - Betts, E.L. - Gentekaki, E. - van der Giezen, M. - Clark, C.G. - Jackson, A.P. - Dacks, Joel Bryan - Tsaousis, A.D.
Evolutionary analysis of cellular reduction and anaerobicity in the hyper-prevalent gut microbe Blastocystis.
Current Biology. Roč. 33, č. 12 (2023), s. 2449-+. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: peroxisome * comparative genomics * flagella
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.1, rok: 2023 ; AIS: 4.385, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982223006206?via%3Dihub
Dacks, Joel Bryan
- Tsaousis, A.D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345307

0575407 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Valach, M. - Tripathi, Pragya - Benz, Corinna - Opperdoes, F. R. - Baráth, P. - Lukáčová, V. - Danchenko, M. - Faktorová, Drahomíra - Horváth, A. - Burger, G. - Lukeš, Julius - Škodová-Sveráková, Ingrid
Subunit composition of mitochondrial dehydrogenase complexes in diplonemid flagellates.
Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. Roč. 1867, č. 9 (2023), č. článku 130419. ISSN 0304-4165. E-ISSN 1872-8006
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Dehydrogenase complexes * Evolution * Diplonema papillatum * Diplonemids * Protist * Mitochondrion
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2023 ; AIS: 0.704, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304416523001174?via%3Dihub
Lukeš, Julius
- Škodová-Sveráková, Ingrid
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345272

0553054 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zimmann, N. - Rada, P. - Žárský, V. - Smutná, T. - Záhonová, Kristýna - Dacks, Joel Bryan - Harant, K. - Hrdý, I. - Tachezy, J.
p Proteomic Analysis of Trichomonas vaginalis Phagolysosome, Lysosomal Targeting, and Unconventional Secretion of Cysteine Peptidases.
Molecular & Cellular Proteomics. Roč. 21, č. 1 (2022), č. článku 100174. ISSN 1535-9476. E-ISSN 1535-9484
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: key role * protein * maturation * cells * receptor * complex * identification * reveals * binding * hydrogenosomes
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7, rok: 2022 ; AIS: 2.131, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1535947621001468?via%3Dihub
Tachezy, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340572