Publikace ASEP
0638778 - BFÚ 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Martin-Gomez, J. - Lorenzo, Jose Luis Rodriguez - Espinosa-Roldan, F. E. - Cabello Saenz de Santamaria, F. - Munoz-Organero, G. - Tocino, A. - Cervantes, E.
Morphometric Analysis Reveals New Data in the History of Vitis Cultivars.
Plants. Roč. 14, č. 16 (2025), č. článku 2481. ISSN 2223-7747. E-ISSN 2223-7747
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: vinifera l. * linkage map * geometric analysis * grapevine * shape * domestication * origins * curvature * grape diversity * morphometric geometry * shape analysis * solidity *
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 0.665, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2223-7747/14/16/2481
Cervantes, E.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371669
0635841 - BFÚ 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Martin-Gomez, J. - Rodriguez Lorenzo, José Luis - Espinosa-Roldan, F. E. - de Santamaria, F. C. S. - Munoz-Organero, G. - Tocino, A. - Cervantes, E.
Seed Morphometry Reveals Two Major Groups in Spanish Grapevine Cultivars.
Plants. Roč. 14, č. 10 (2025), č. článku 1522. ISSN 2223-7747. E-ISSN 2223-7747
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: vitis-vinifera l. * genetic diversity * outline analysis * identification * origins * shape * wild * grape diversity * morphometric geometry * shape analysis
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 0.665, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2223-7747/14/10/1522
Cervantes, E.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368434
0644629 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mastrangelo, A. M. - Roncallo, P. - Matny, O. - Čegan, Radim - Steffenson, B. J. - Echenique, V. - Šafář, J. - Battaglia, R. - Barabaschi, D. - Cattivelli, L. - Özkan, H. - Mazzucotelli, E.
A new wild emmer wheat panel allows to map new loci associated with resistance to stem rust at seedling stage.
Plant Genome. Roč. 18, č. 1 (2025). ISSN 1940-3372. E-ISSN 1940-3372
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-00204S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: f-sp tritici * puccinia-graminis * dicoccoides population * linkage disequilibrium * common wheat * race ttksk * leaf rust * gene * domestication * diversity
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.906, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://acsess.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/tpg2.20413?getft_integrator=clarivate&src=getftr&utm_source=clarivate
Mazzucotelli, E.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374480
0642111 - BFÚ 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Matonohova, J. - Simek, M. - Berka, V. - Bystronova, L. - Lzicarova, I. - Rubanová, Daniela - Kubala, Lukáš - Velebný, V. - Nešporová, K.
Novel Insights into Systemic Hyaluronic Acid Therapy in Dogs with Osteoarthritis from an Exploratory Postmarketing Study: Clinical Improvements Linked to Biomarker Changes.
Animals. Roč. 15, č. 21 (2025), č. článku 3140. ISSN 2076-2615. E-ISSN 2076-2615
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: sodium hyaluronate * synovial-fluid * serum * plasma * hydroxyproline * horses * level * osteoarthritis
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2024 ; AIS: 0.547, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2615/15/21/3140
Nešporová, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374076
0619092 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mcquail, J. - Krepl, Miroslav - Katsuya-Gaviria, K. - Tabib-Salazar, A. - Burchell, L. - Bischler, T. - Graefenhan, T. - Brear, P. - Šponer, Jiří - Luisi, B. - Wigneshweraraj, S.
Transcriptome-scale analysis uncovers conserved residues in the hydrophobic core of the bacterial RNA chaperone Hfq required for small regulatory RNA stability.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 3 (2025), č. článku gkaf019. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05639S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: interaction surfaces * molecular-dynamics * crystal-structure * coli hfq * binding * protein * refinement * parameters * complex
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/53/3/gkaf019/7983884?login=true
Luisi, B.
- Wigneshweraraj, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365855
0644608 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mlýnský, Vojtech - Kührová, Petra - Pykal, M. - Krepl, Miroslav - Stadlbauer, Petr - Otyepka, M. - Banáš, Pavel - Šponer, Jiří
Can We Ever Develop an Ideal RNA Force Field? Lessons Learned from Simulations of the UUCG RNA Tetraloop and Other Systems.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 8 (2025), s. 4183-4202. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05639S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * particle mesh ewald * protein interactions * ribosomal-subunit * crystal-structure * replica exchange * monovalent ions * base stacking * parameters * water
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.4c01357
Mlýnský, Vojtech Šponer, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374453
0636859 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Moraga, C. - Branco, C. - Rougemont, Q. - Jedlička, Pavel - Mendoza-Galindo, E. - Veltsos, P. - Hanique, M. - Rodriguez de la Vega, Ricardo C. - Tannier, E. - Liu, X. - Lemaitre-Guillier, C. - Fields, P. D. - Cruaud, C. - Labadie, K. - Belser, C. - Briolay, J. - Santoni, S. - Čegan, Radim - Linheiro, R. - Adam, G. - El Filali, A. - Mossion, V. - Boualem, A. - Tavares, R. - Chebbi, A. - Cordaux, R. - Fruchard, C. - Prentout, D. - Velt, A. - Spataro, B. - Delmotte, S. - Weingartner, L. - Toegelová, Helena - Tulpová, Zuzana - Cápal, Petr - Šimková, Hana - Štorchová, Helena - Krüger, Manuela - Abeyawardana, Oushadee A.J. - Taylor, D.R. - Olson, M. - Sloan, D.B. - Karrenberg, S. - Delph, L.F. - Charlesworth, D. - Muyle, A. - Giraud, T. - Bendahmane, A. - Di Genova, A. - Madoui, M.-A. - Hobza, Roman - Marais, G.A.B.
The Silene latifolia genome and its giant Y chromosome.
Science. Roč. 387, č. 6734 (2025), s. 630-636. ISSN 0036-8075. E-ISSN 1095-9203
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S; GA ČR(CZ) GA22-00364S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: sex-chromosomes * evolutionary history * dosage compensation * white campion * model * degeneration * dimorphism * reveals * gene
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 45.8, rok: 2024 ; AIS: 20.329, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adj7430
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0367814
0635565 - BFÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Muchova, M. - Münster, L. - Valaskova, K. - Lovecká, L. - Víchová, Z. - Osicka, J. - Kašpárková, V. - Humpolíček, P. - Vašíček, Ondřej - Vícha, J.
One-step fabrication of chitosan/dialdehyde cellulose/polypyrrole composite nanofibers with antibacterial, antioxidant, and immunomodulatory effects.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 308, č. 1 (2025), č. článku 142105. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: cross-linked chitosan * biomedical applications * conducting polymers * alcohol) hydrogels * polypyrrole * glutaraldehyde * chitin * Nanofibers * Chitosan * Polypyrrole
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.5, rok: 2024 ; AIS: 1.013, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813025026571?via%3Dihub
Vašíček, Ondřej
- Vícha, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368431
0605573 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nedelnikova, A. - Stadlbauer, Petr - Otyepka, M. - Kührová, P. - Paloncýová, M.
Atomistic Insights Into Interaction of Doxorubicin With DNA: From Duplex to Nucleosome.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 46, č. 3 (2025), č. článku e70035. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: amber force-field * g-quadruplex * nucleic-acids * molecular recognition * dynamics * torsion * conformation * adriamycin * parameters * complexes
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.923, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/jcc.70035
Kührová, P.
- Paloncýová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368346
0638130 - BFÚ 2026 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Novohradský, Vojtěch - Babu, T. - Kostrhunová, Hana - Plaskow, M. - Marková, Lenka - Acharya, S. - Gibson, D. - Brabec, Viktor
Cisplatin-eugenol Pt(IV) prodrugs target colon cancer stem cells: A novel strategy for enhanced anticancer efficacy.
Biomedicine & Pharmacotherapy. Roč. 183, 2025 Feb (2025), č. článku 117854. ISSN 0753-3322. E-ISSN 1950-6007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06307S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Cancer stem cells * Cisplatin * Eugenol * Platinum(IV) * Spheroids
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 7.5, rok: 2024 ; AIS: 1.325, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0753332225000484?via%3Dihub
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368872
0637549 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Novohradský, Vojtěch - Marco, A. - Svitelova, M. - Cutillas, N. - Ruiz, J. - Brabec, Viktor
Photoactivatable Cyclometalated Ir(III) Compound Penetrates the Blood-Brain Barrier in 3D Spheroidal and Advanced 3D Organoid Models of Inherently Resistant and Aggressive Brain Tumors.
ACS Pharmacology & Translational Science. Roč. 8, č. 7 (2025), s. 2033-2047. E-ISSN 2575-9108
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06307S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: iridium complexes * human brain glioblastoma * 3D spheroids * blood-brainbarrier penetration * ROS-mediated cytotoxicity * photodynamic therapy
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.164, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsptsci.5c00145
Ruiz, J.
- Brabec, Viktor
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368851
0642479 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Petrovic, M. - Bartas, M. - Garratt, A.N. - Pečinka, P. - Dobrovolná, Michaela - Konarikova, Klara - Trenz, O. - Brázda, Václav - Šťastný, J.
Z-DNA Hunter tool for straightforward detection of Z-DNA forming regions and a case study in Drosophila.
NAR Genomics and Bioinformatics. Roč. 7, č. 4 (2025), č. článku lqaf166. E-ISSN 2631-9268
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S; GA MŠMT(CZ) LUAKR25078
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: b-z transition * handed z-dna * binding * identification * promoter
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 2.536, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nargab/article/7/4/lqaf166/8332371?login=true
Brázda, Václav
- Šťastný, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374183
0639192 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pokorná, Pavlína - Mlýnský, Vojtech - Šponer, Jiří - Stadlbauer, Petr
RNA G-quadruplexes emerge from a compacted coil-like ensemble via multiple pathways.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 17 (2025), č. článku gkaf872. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * repeat-containing rna * folding pathways * force-field * energy landscape * nucleic-acids * g-triplex * dna * binding * sequence
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
chrome-extension://efaidnbmnnnibpcajpcglclefindmkaj/https://watermark02.silverchair.com/gkaf872.pdf?token=AQECAHi208BE49Ooan9kkhW_Ercy7Dm3ZL_9Cf3qfKAc485ysgAAA2owggNmBgkqhkiG9w0BBwagggNXMIIDUwIBADCCA0wGCSqGSIb3DQEHATAeBglghkgBZQMEAS4wEQQMvOFkEJVXG3s9DRMdAgEQgIIDHV565pCHZhZVkhEtRQ5YrIITDw_lJp2mqoz_s-CtnePOOx1Lh24Q50Sn7DEpQzY4VZraYI1TztW3uGkg676SWw1dY43CjvuH0q_xMuGzah4UMdJg4Kk_QCF0MggpP68FtNubTgCaQep8j9x1Wlo6BdnJ1JWoP4bQ_UD0ldFr4uX-EJsKBl_Ow5TOM6CKiZ_clmVtkFm8frCy3KWOs6e41Kzp4JlsOusDU46IWn23QVNBLMe5bCUO3E4VrOvmKaHCTj1nhCpq7vaOm3wDZ7Q4gD8VLeXc_CngpBo0Igf9NahqCUVf8KSCO-2PUxgciKm3XAo5IjxZyrxVT8qW-TNwEsM0CdITTrvScq_VBCnIPkEsbXNWYzHkkvZ5sY1HxB79mgMmftK5jKDYp0hjPiwqbK8AhFRFD0LVk25oDHPzpOtXIxpM5Nq0W4xbDw2F_beKE8S4M4cMw8BMmMjydUgzOzRtR8PCndkRr_L0m3y90Whamt28W1yM_uhU8d5GiOQ3llSo1LqjQ2ZhmgbJ0jnKOwG_ifiKOoTvs4fAwvvp3jy0CFsfBdU2gXNm2lcLdZ7Y7P7CbRVVkbX5XmAZNi28CjGYs8EIh2beAxKQ3fXq16_Iff6ASDA73mGy42BoexqSxzX38YtLtx7iB242tGaltLTFsMmQl01s17K_vcfLqikJYmULP7fY8GnNSHGyl9CRb8R2efyFGfIqhYklAEvLU_XbutWCMTM4Ty-jrpVpg6qLPKmfLyBgEGXGiIzzNn8pfXpvKCtpv28V7noop7tf3-5cerszWOyszqtFrlTP8nkXOt7ytnma-eMLWDXk13ewWCP7bJo3PW-NbJ_1z4m6VFNDb1rfyiFe23mk3dQkG9kd-fPbODdTariznYBxSLqu3UiY99SZDoprDL253W3EDKK5_pnZ81FXJuH0VNX4z8r8HiyT7HoDuKdEz_lo0BnM1XoLpaMpd6v0W0rmeWBjqrjdYlxfCmGZOLWoQCGeDUdw_Dr4evK2iId3K8wn0qBIs8XWVeZdn1OR0dpbb0JR6maV8I8s0dOsK36-BaWH
Pokorná, Pavlína Stadlbauer, Petr
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371414
0639904 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rodriguez Lorenzo, José Luis - Janoušek, Bohuslav - Cervantes, E.
Viticulture: History, Breeding Systems and Recent Developments.
Phyton-international journal of experimental botany. Roč. 94, č. 9 (2025), s. 2649-2667. ISSN 0031-9457. E-ISSN 1851-5657
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: vitis-vinifera l. * linkage map * sex-determination * genome * grape * seed * berry * wild
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 1.2, rok: 2024 ; AIS: 0.172, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.techscience.com/phyton/v94n9/63928
Cervantes, E.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374185
0636642 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rout, S.K. - Wunnava, S. - Krepl, Miroslav - Cassone, G. - Šponer, Judit E. - Mast, C.B. - Powner, M.W. - Braun, D.
Amino acids catalyse RNA formation under ambient alkaline conditions.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 5193. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-25057S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: prebiotic formation * adenosine * polymerization * pyrimidine * protein * origin * nucleobases * precursors
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-025-60359-3
Braun, D.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368436
0617107 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Sharkawy, Sofia - Hernandez-Garcia, A. - Kostrhunová, Hana - Bautista, D. - Marková, Lenka - Santana, M.D. - Kašpárková, Jana - Brabec, Viktor - Ruiz, J.
A novel benzothiazole-1,2,3-triazole-based arene osmium(
Inorganic Chemistry Frontiers. Roč. 12, č. 4 (2025), s. 1693-1715. ISSN 2052-1553. E-ISSN 2052-1553
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06316S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: osmium * cancer stem cells * chemotherapy * binding * ruthenium(ii) * antitumor * inhibition
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry
Impakt faktor: 6.4, rok: 2024 ; AIS: 0.915, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2025/qi/d4qi02737j
Brabec, Viktor
- Ruiz, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368348
0642480 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sharkawy, Sofia - Acharya, S. - Kostrhunová, Hana - Maji, M. - Marková, Lenka - Novohradský, Vojtěch - Gibson, D. - Brabec, V.
Crizotinib- or Ceritinib-Conjugated Platinum(IV) Prodrugs As Potent Multiaction Agents Inducing Antiproliferative Effects in 2D and 3D Cancer Cell Models.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 68, č. 22 (2025), s. 24094-24107. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06307S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: calreticulin exposure * 1st-line treatment * lung-cancer * oxaliplatin * cisplatin
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.5c01858
Gibson, D.
- Brabec, V.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374169
0636644 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shi, H. - Kašpárková, Jana - Ponte, F. - Kostrhunová, Hana - Clarkson, G.J. - Sicilia, E. - Brabec, Viktor - Sadler, P.J.
Excited-State Cis and Trans Pt(IV) Diamine Anticancer Complexes.
Inorganic Chemistry. Roč. 64, č. 22 (2025), s. 11301-11311. ISSN 0020-1669. E-ISSN 1520-510X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06316S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: platinum * photoactivation * cancer * dna * cisplatin * reduction
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.668, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.inorgchem.5c01882
Shi, H. Sicilia, E.
- Brabec, Viktor
- Sadler, P.J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368632
0639448 - BFÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Simek, M. - Šínová, R. - Berka, V. - Lehka, K. - Nešporová, K. - Dolečková, I. - Bajerová, Martina - Pavlík, V. - Kubala, Lukáš
Alleviating UV-induced photoaging with oral hyaluronic acid: insights from a hairless mouse model.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 321, č. 2 (2025), č. článku 146340. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: chondroitin sulfate * skin * antiobesity * expression * collagen * mice * Photoaging * Hyaluronan * Metabolomics
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.5, rok: 2024 ; AIS: 1.013, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813025068977?pes=vor&utm_source=clarivate&getft_integrator=clarivate
Simek, M. Kubala, Lukáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371662
0618789 - BFÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Simek, M. - Rubanová, Daniela - Nešporová, K. - Skoroplyas, Svitlana - Lehka, K. - Raptová, Petra - Velebný, V. - Kubala, Lukáš
Pharmacokinetics of the systemic application of hyaluronic acid for joint arthritis treatment.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 307, may 2025 (2025), č. článku 141937. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: sodium hyaluronate * synovial-fluid * molecular-weight * osteoarthritis * glycocalyx * glucosamine * cartilage * efficacy * horses * Hyaluronan * Rheumatoid arthritis * Pharmacokinetics
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.5, rok: 2024 ; AIS: 1.013, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813025024882?via%3Dihub
Simek, M. Kubala, Lukáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0366253
0619305 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Smeds, L. - Kamali, K. - Kejnovská, Iva - Kejnovský, Eduard - Chiaromonte, F. - Makova, K.D.
Non-canonical DNA in human and other ape telomere-to-telomere genomes.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 7 (2025), č. článku gkaf298. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: g-quadruplex structures * cenp-b * polymerases * elements * damage
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/53/7/gkaf298/8113172?login=true
Makova, K.D.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0366244
0644597 - BFÚ 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Sochorová, Jana - Lukášová, Emilie - Polanská, Eva - Řehůřková, Kateřina - Kovařík, Aleš
Fragmentation of nucleoli in senescent cancer cells is associated with increased levels of polyadenylated transcripts derived from noncoding regions of rDNA units.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters. Roč. 54, č. 8 (2025), s. 613-623. ISSN 0175-7571. E-ISSN 1432-1017
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: ribosomal-rna * gene-expression * stress * dna * repair * Irradiation
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.4, rok: 2024 ; AIS: 0.567, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12678568/
Kovařík, Aleš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374439
0605153 - BFÚ 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Solar, P. - Brázda, Václav - Bareš, M. - Zamani, A. - Emamiaref, P. - Joukal, A. - Kubíčková, L. - Krocka, E. - Hasanova, K. - Joukal, M.
Inflammatory changes in the choroid plexus following subarachnoid hemorrhage: the role of innate immune receptors and inflammatory molecules.
Frontiers in Cellular Neuroscience. Roč. 18, JAN 7 2025 (2025), č. článku 1525415. ISSN 1662-5102. E-ISSN 1662-5102
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: chemoattractant protein-1 mcp-1 * cerebral blood-flow * rat-brain * monocytes * cells * expression * epithelium * vasospasm * relevance * cx(3)cr1 * subarachnoid hemorrhage * stroke * choroid plexus
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 1.364, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/journals/cellular-neuroscience/articles/10.3389/fncel.2024.1525415/full
Joukal, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368340
0619089 - BFÚ 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Staroňová, Tatiana - Holčáková, J. - Voňka, P. - Hrstka, R. - Ostatná, Veronika
Impact of galectin-1's redox state on its lectin activity and monomer-dimer equilibrium. Focusing on oxidized Gal-1.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 295, MAR 2025 (2025), č. článku 139452. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-26590S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Galectin-1 * Constant current chronopotentiometric stripping * Lectin activity of reduced and oxidized form
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.5, rok: 2024 ; AIS: 1.013, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813025000017?via%3Dihub
Ostatná, Veronika
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365856
0644099 - BFÚ 2027 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Šislerová, Lucie - Petrovic, M. - Dobrovolná, Michaela - Šťastný, J. - Rozmaric, T. - Dworak, H. - Kratochvilová, Libuše - Vesela, Lenka - Schadl, B. - Gruber, F. - Grillari, J. - Freystatter, C. - Ogrodnik, M. - Brázda, Václav
G-quadruplex motifs prediction and visualization in Sus scrofa genome.
Genomics. Roč. 118, č. 1 (2026), č. článku 111168. ISSN 0888-7543. E-ISSN 1089-8646
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna secondary structures * identification * G-quadruplexes * Sus scrofa * Homo sapiens * Targeted therapies
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3, rok: 2024 ; AIS: 0.723, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754325001843?pes=vor&utm_source=clarivate&getft_integrator=clarivate
Brázda, Václav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374143
0641436 - BFÚ 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Školáková, Petra - Kejnovská, Iva - Renčiuk, Daniel
Spectroscopic studies of sequence-dependent conformational transitions in asymmetric G/C rich double-stranded DNA.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters. (2025). ISSN 0175-7571. E-ISSN 1432-1017
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-29738S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Circular dichroism spectroscopy * Guanine quadruplex * Cytosine i-motif * Conformation equilibrium
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.4, rok: 2024 ; AIS: 0.567, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s00249-025-01767-7?utm_source=getftr&utm_medium=getftr&utm_campaign=getftr_pilot&getft_integrator=clarivate
Renčiuk, Daniel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371584
0644601 - BFÚ 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Toufar, Jiří - Toufarová, Lucie - Falková, Iva - Bačíková, Alena - Falk, Martin
From survival of irradiated mice to modern molecular insights: a seventy-year journey in radiobiology at the institute of biophysics, Czech academy of sciences.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters. Roč. 54, č. 8 (2025), s. 547-572. ISSN 0175-7571. E-ISSN 1432-1017
Grant CEP: GA ČR GC20-04109J
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: double-strand breaks * alternative splicing variant * induced genomic instability * complex cell responses * dna-damage * chromatin-structure * ionizing-radiation * homologous recombination * nanoscopy techniques
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.4, rok: 2024 ; AIS: 0.567, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s00249-025-01765-9?utm_source=getftr&utm_medium=getftr&utm_campaign=getftr_pilot&getft_integrator=clarivate
Falk, Martin
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374447
0603308 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Trefulka, Mojmír - Černocká, Hana - Staroňová, Tatiana - Ostatná, Veronika
Voltammetric analysis of glycoproteins containing sialylated and neutral glycans at pyrolytic graphite electrode.
Bioelectrochemistry. Roč. 163, jun 2025 (2025), č. článku 108851. ISSN 1567-5394. E-ISSN 1878-562X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-26590S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Sialoglycoproteins * osmium(VI) complexes * electrochemical analysis * nonconjugated proteins * oligosaccharides * Chemical modification of carbohydrates * N-acetyl neuraminic acid
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 0.754, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567539424002135?via%3Dihub
Ostatná, Veronika
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0360527
0636643 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vícha, J. - Münster, L. - Latecka, F. - Martínková, M. - Víchová, Z. - Vašíček, Ondřej - Humpolíček, P.
Dialdehyde Polysaccharides as Templates for Green Synthesis of Polypyrrole-Based Materials without Oxidative Polymerization.
ACS Sustainable Chemistry & Engineering. Roč. 13, č. 22 (2025), s. 8435-8446. ISSN 2168-0485. E-ISSN 2168-0485
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: cellulose * cytotoxicity * polypyrrole * dialdehydepolysaccharides * conductivepolymer * copolymer * composite
Obor OECD: Polymer science
Impakt faktor: 7.3, rok: 2024 ; AIS: 1.287, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssuschemeng.5c02711
Vícha, J. Vašíček, Ondřej
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368631
0637712 - BFÚ 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vlková, M. - Štíchová, J. - Sura, K. - Dvořáková, K. - Kuncicky, V. - Papatheodorou, I. - Blazkova, G. - Tomasikova, Z. - Bendíčková, K. - Dohnalkova, L. - Mytnikova, A. - Žák, J. - Kovařík, J. - Krtička, M. - Tomas, T. - Šrámek, V. - Helan, M. - Kocurková, Anna - Frič, J. - Hortova-Kohoutkova, M.
Pro-inflammatory role of neutrophils populations in trauma patients: monitoring neutrophil populations.
Frontiers in Immunology. Roč. 16, JUL 8 2025 (2025), č. článku 1565606. ISSN 1664-3224. E-ISSN 1664-3224
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: responses * subset * trauma * neutrophils * sirs * lactate * creatine kinase * triss * iss
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 1.666, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/journals/immunology/articles/10.3389/fimmu.2025.1565606/full
Vlková, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368858
0643357 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Xia, J. - Zhou, J.H. - Zhuang, X. - Ju, H. - Monchaud, D. - Ch., Jonathan B. - Šponer, Jiří - Mergny, J.-L. - Zhou, J.
Deciphering the intermolecular interactions between G-quadruplex (G4)-forming sequences.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 22 (2025), č. článku gkaf1288. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: intermolecular interactions * G-quadruplex * (G4)-forming sequences
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://watermark02.silverchair.com/gkaf1288.pdf?token=AQECAHi208BE49Ooan9kkhW_Ercy7Dm3ZL_9Cf3qfKAc485ysgAAA2wwggNoBgkqhkiG9w0BBwagggNZMIIDVQIBADCCA04GCSqGSIb3DQEHATAeBglghkgBZQMEAS4wEQQM3lVSawnpAi4xg5pZAgEQgIIDH9GGPehrdnBDt6EWuK_SYc3kuSavTwHy4J9R2SaMojRWVIMAm_jJ4mMgGiBK0sJteYUC9zRhRViHY1qhQbFW106BcX-0EfGn7wDlH2UImU5_KPFDc4mOETrTKmcSvCG3W4tCcMlfLNsn4CoMpt0fsEfbdZM51H4t4f4_t3hBotXupatNpa-08iQUGmUIRfMffr3xLN-xx87sLDtfdOMtZiKxXudgBozlJD_lyfZxklVa9NhDYlislvHwYVMmmKqX5eVS3NOdZgomUxGiMZ3X63Lx9AxgAEEYv7JsQD7rmBxOdLhKi2w-CglD59lEvo55dTRV7P-CT6hG2nOve5iz-5kke2ZTJ7KenODPFkqCVyQIVXMz9hyyWJSbkCWBsoq4H_0Rly-me3F_n7q8Wenn5CLUhrLZL4m72_3-nAl-86s9ehI3lUdb0s2w0V3xdfqRm3RqbLryCc29flhYGuYSENjg-4g8asK3qcQPyqtjOsS8c3RCXOypg8Okd8EGLUWMrKXhMpuVA-xiFkLmyLZEfcVyC10TgszDBOioLNyQzxcU8M5QOmiTEzm36OPgHZ70yLcIIscLyiFHeM7cE2qdbkXnONn5JDg4aGt4Mbt5FOvTiEHLUlcVX6xd1grXXsvwQY0UlP_2NcrFLbP6R9BB0xvIaa2TVodEE8sYyeTt9SksJ4wTGmMe3_92eXGSZNO6TrzZ8B1gzRl3fiTUS8nUxw57kl-jhLK9BJ6pcIyKDbwbGO20GLQInlFxKYNdK8N4hcoeetMzGf5IRZGqkVt2qnYxmc0MTfLPSsMWnWF0UQIia6RCZ5JmVDaE0mXW-8ZfzRffEigBICuQZ_QwdGtBAgKeKo4o70-dgWjenpMBdnrSPl3zw3_6huO6hnzFaDRsy8R5BmhVYGLwTa2NyUhAsEom3S5aZ1OQ_FAH3X2-qzaGCidu42i_42iKkMF1NT2cDhMSI_5GoS5q_w_QHI_IdgPHy9MauYNq_k5_Tqlf067fWk_o3IZb-BWbanetXedAsEUzpWx2ijMZUOSBU6J736MYgnOLSzf7caco62Ze6d4
Zhou, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374071
0637714 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yadav, Anoop Kumar - Jadhav, A.S. - Szczepanik, P. M. - Fagherazzi, Paolo - Kabelka, I. - Vácha, R. - Svenda, J. - Polášek-Sedláčková, Hana
A biotin-HaloTag ligand enables efficient affinity capture of protein variants from live cells.
Journal of Cell Biology. Roč. 224, č. 8 (2025), č. článku e202410025. ISSN 0021-9525. E-ISSN 1540-8140
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM22-20303M
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: general-method * fluorogenic probes * technology * strategy
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 6.4, rok: 2024 ; AIS: 3.167, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rupress.org/jcb/article-abstract/224/8/e202410025/278122/A-biotin-HaloTag-ligand-enables-efficient-affinity?redirectedFrom=fulltext
Svenda, J.
- Polášek-Sedláčková, Hana
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368855
0641301 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Yadav, Anoop Kumar - Abdirov, Alikhan - Ondrušková, Katarina - Negi, Simran - Jamrichova, Kristina - Kolářová, Karolína - Dibus, Nikol - Krejčí, Jana - Polášek-Sedláčková, Hana - Čermák, Lukáš
CRL4DCAF12 regulation of MCMBP ensures optimal licensing of DNA replication.
Nature Communications. Roč. 16, č. 1 (2025), č. článku 9391. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM22-20303M; GA ČR(CZ) GA25-18085S; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008205; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:68378050
Klíčová slova: s-phase * replisome * architecture * proteins * complex
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-025-64258-5
Polášek-Sedláčková, Hana
- Čermák, Lukáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371563
0605574 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, M. - Šponer, Jiří - Jurečka, P.
Refinement of the Sugar Puckering Torsion Potential in the AMBER DNA Force Field.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 2 (2025), s. 833-846. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * basis-set convergence * rna hybrid duplex * nucleic-acids * current state * dodecamer * nmr * recognition * stabilization * visualization
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.4c01100
Jurečka, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368347
0618580 - BFÚ 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zuvalova, I. - Vyhlidalova, B. - Ondrová, K. - Nadvornik, P. - Hrubý, J. - Illes, P. - Soural, M. - Sebela, M. - Šindlerová, Lenka - Kubala, Lukáš - Mani, S. - Dvořák, Z.
Decoding structural determinants of aryl hydrocarbon receptor antagonism by monoterpenoids.
Bioorganic Chemistry. Roč. 157, APR 2025 (2025), č. článku 108265. ISSN 0045-2068. E-ISSN 1090-2120
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: ligand * identification * inhibitor * Monoterpenoids * Aryl hydrocarbon receptor * Allosteric binding * Therapeutic targeting
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.66, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0045206825001452?via%3Dihub
Zuvalova, I. Dvořák, Z.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368411