0599752 - BC 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Holoubek, Jiří - Bouřa, Evžen - Růžek, Daniel - Renčiuk, Daniel - Eyer, Luděk
Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, č. 6 (2024), s. 215-215, č. článku L-07. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024: The Third Annual Meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Guanine quadruplexes * encephalitis * tick
Obor OECD: Virology; Virology (BFU-R); Virology (UOCHB-X)
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48
Eyer, Luděk
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357175
Uložit do RIV jako O

0597668 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Adámik, Matěj - Soldanova, Z. - Drotárová, Magdaléna - Breckova, K. - Petr, Marek - Helma, Robert - Jenner, Leon - Vorlíčková, Michaela - Sýkorová, Eva - Brázdová, Marie
Human ARMC6 binds in vitro to both cancer genes and telomeric RNA, favoring G-quadruplex structure recognition.
Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms. Roč. 1867, č. 3 (2024), č. článku 195050. ISSN 1874-9399. E-ISSN 1876-4320
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-15168S; GA ČR(CZ) GA21-28265S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: c-myc * drosophila neuroblast * protein interactions * repeat proteins * beta-catenin * localization * expression * promoter * motif
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 1.297, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874939924000464?via%3Dihub
Brázdová, Marie
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358014

0604124 - BFÚ 2025 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Cerven, J. - Valková, Natalia - Volna, A. - Dobrovolná, Michaela - Šislerová, Lucie - Baldvinsson, H. - Pečinka, P. - Brázda, Václav
RNA analysis of the longest living vertebrate Greenland shark revealed an abundance of LINE-like elements in its transcriptome.
Czech Polar Reports. Roč. 13, č. 2 (2023), s. 210-227. ISSN 1805-0689. E-ISSN 1805-0697
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: somniosus-microcephalus * reverse-transcriptase * protein * cancer * prediction * alignment * accurate * database * search * Greenland shark * transcriptome * bioinformatics * line1 * longevity research * Somniosus microcephalus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 0.5, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.muni.cz/CPR/article/view/38141

Bartas, M. Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361474

0602185 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Basu, Pritha - Kejnovská, Iva - Gajarský, M. - Šubert, Denis - Mikešová, Tereza - Renčiuk, Daniel - Trantírek, L. - Mergny, Jean-Louis - Vorlíčková, Michaela
RNA G-quadruplex formation in biologically important transcribed regions: can two-tetrad intramolecular RNA quadruplexes be formed?
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 21 (2024), s. 13224-13242. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-29738S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: circular dichroism * DNA * stacking
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/52/21/13224/7874850?login=true#google_vignette
Mergny, Jean-Louis
- Vorlíčková, Michaela
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360476

0603745 - BFÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Besse, A. - Sedlarikova, L. - Buechler, L. - Kraus, M. - Yang, C. - Straková, Nicol - Souček, Karel - Navrátil, J. - Svoboda, M. - Welm, Alana L. - Joerger, M. - Driessen, C. - Besse, L.
HIV-protease inhibitors potentiate the activity of carfilzomib in triple-negative breast cancer.
British Journal of Cancer. Roč. 5, Č. 131 (2024), s. 918-930. ISSN 0007-0920. E-ISSN 1532-1827
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-08-00023
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: endoplasmic-reticulum * er stress * nelfinavir * bortezomib * cells * resistance * lopinavir * overcome * myeloma * sites
Obor OECD: Oncology
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 2.742, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41416-024-02774-9#citeas
Besse, L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361052

0582767 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Bozdechova, L. - Havlová, K. - Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
Analysis of Telomerase RNA Structure in Physcomitrium patens Indicates Functionally Relevant Transitions Between OPEN and CLOSED Conformations.
Journal of Molecular Biology. Roč. 436, č. 4 (2024), č. článku 168417. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: shape * architecture * template * models * yeast * core * map * telomerase RNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002228362300534X?via%3Dihub
Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0352992

0582377 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Valková, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis
Abundance of G-Quadruplex Forming Sequences in the Hepatitis Delta Virus Genomes.
ACS Omega. Roč. 9, č. 3 (2024), s. 4096-4101. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna g-quadruplex * dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c09288
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0352960

0601725 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bussi, G. - Bonomi, M. - Gkeka, P. - Sattler, M. - Al-Hashimi, H. M. - Auffinger, P. - Duca, M. - Foricher, Y. - Incarnato, D. - Jones, A. N. - Kirmizialtin, S. - Krepl, Miroslav - Orozco, M. - Palermo, G. - Pasquali, S. - Salmon, L. - Schwalbe, H. - Westhof, E. - Zacharias, M.
RNA dynamics from experimental and computational approaches.
Structure. Roč. 32, č. 9 (2024), s. 1281-1287. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: simulations
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S096921262400282X?via%3Dihub

Bussi, G. Bonomi, M.
- Gkeka, P.
- Sattler, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359039

0587346 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Červinka, Jakub - Hernandez-Garcia, A. - Bautista, D. - Marková, Lenka - Kostrhunová, Hana - Malina, Jaroslav - Kašpárková, Jana - Santana, M.D. - Brabec, Viktor - Ruiz, J.
New cyclometalated Ru(II) polypyridyl photosensitizers trigger oncosis in cancer cells by inducing damage to cellular membranes.
Inorganic Chemistry Frontiers. Roč. 11, č. 13 (2024), s. 3855-3876. ISSN 2052-1553. E-ISSN 2052-1553
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06316S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: complexes * apoptosis * stability * therapy * ligands * agents
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry
Impakt faktor: 6.4, rok: 2024 ; AIS: 0.915, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/qi/d4qi00732h
Brabec, Viktor
- Ruiz, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355430

0618136 - BFÚ 2025 RIV PL eng J - Článek v odborném periodiku
Divis, P. - Pořízka, J. - Gross, M. - Fojt, Lukáš - Vítová, E.
AUTHENTICITY OF WINES PRODUCED FROM 'FRANKOVKA' GRAPE VARIETY ORIGINATING IN THE MODRÉ HORY REGION (CZECH REPUBLIC).
Acta Scientiarum Polonorum-Technologia Alimentaria. Roč. 23, č. 4 (2024), s. 477-489. ISSN 1644-0730. E-ISSN 1898-9594
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: red wines * multivariate-analysis * phenolic-compounds * icp-ms * classification * differentiation * spectrometry * profiles
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 0.8, rok: 2024 ; AIS: 0.172, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.food.actapol.net/pub/7_4_2024.pdf
Divis, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364984

0603749 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Drápela, Stanislav - Kvokačková, Barbora - Slabáková, Eva - Kotrbová, A. - Goemoeryova, K. - Fedr, Radek - Kurfuerstova, D. - Eliáš, M. - Student Jr, V. - Lencesova, F. - Ranjani, G.S. - Pospíchalová, V. - Bryja, V. - van Weerden, W. - Puhr, M. - Culig, Z. - Bouchal, J. - Souček, Karel
Pre-existing cell subpopulations in primary prostate cancer tumors display surface fingerprints of docetaxel-resistant cells.
Cellular Oncology. neuveden, 20 August 2024 (2024). ISSN 2211-3428. E-ISSN 2211-3436
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-11585S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: to-mesenchymal transition * cd59 protein expression * nf-kappa-b * embryonic antigen-4 * taxane resistance * heterogeneity * chemotherapy * mitoxantrone * mechanisms * therapy * Prostate cancer * Docetaxel resistance * Intratumoral heterogeneity * Plasticity * CD95/Fas * ssea-4
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 1.177, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s13402-024-00982-2
Souček, Karel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361056

0598679 - ÚMCH 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Frejková, Markéta - Běhalová, Kateřina - Rubanová, Daniela - De Sanctis, J. B. - Kubala, Lukáš - Chytil, Petr - Šimonová, A. - Křížek, T. - Randárová, Eva - Gunár, Kristýna - Etrych, Tomáš
Polymer nanotherapeutics with the controlled release of acetylsalicylic acid and its derivatives inhibiting cyclooxygenase isoforms and reducing the production of pro-inflammatory mediators.
International Journal of Pharmaceutics. Roč. 665, 15 November (2024), č. článku 124742. ISSN 0378-5173. E-ISSN 1873-3476
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-08-00255
Institucionální podpora: RVO:61389013 ; RVO:68081707
Klíčová slova: drug delivery * HPMA * nanotherapeutics
Obor OECD: Polymer science; Biochemistry and molecular biology (BFU-R)
Impakt faktor: 5.2, rok: 2024 ; AIS: 0.763, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517324009761?via%3Dihub
Etrych, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356537

0600747 - BFÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Gajarský, M. - Stadlbauer, Petr - Šponer, Jiří - Cucchiarini, A. - Dobrovolná, Michaela - Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis - Trantírek, L. - Zivkovic, M.L.
DNA Quadruplex Structure with a Unique Cation Dependency.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 63, č. 7 (2024), č. článku e202313226. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * amber force-field * center-dot-g * molecular-dynamics * nucleic-acids * k+ solution * simulations * insights * reveals
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 16.9, rok: 2024 ; AIS: 3.51, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202313226
Trantírek, L.
- Zivkovic, M.L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358042

0597867 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Guneri, D. - Alexandrou, E. - El Omari, K. - Dvořáková, Zuzana - Chikhale, Rupesh V. - Pike, Daniel T. S. - Waudby, Christopher A. - Morris, Ch. - Haider, S. - Parkinson, G. - Waller, Z.A.E.
Structural insights into i-motif DNA structures in sequences from the insulin-linked polymorphic region.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 7119. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: g-quadruplex * variable number * tandem repeats * gene * minisatellite * susceptibility * stability
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-024-50553-0
Morris, Ch.
- Haider, S.
- Parkinson, G.
- Waller, Z.A.E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357979

0599696 - ÚCHP 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hamala, Vojtěch - Kurfiřt, Martin - Červenková Šťastná, Lucie - Hujerová, Hedvika - Bernášková, Jana - Parkan, Kamil - Kaminský, Jakub - Habanová, Nina - Kozák, Jaroslav - Magdolenová, Alžbeta - Zavřel, Martin - Staroňová, Tatiana - Ostatná, Veronika - Žaloudková, Lucie - Daňhel, Aleš - Holčáková, J. - Voňka, P. - Hrstka, R. - Karban, Jindřich
Ferrocene- and ruthenium arene-containing glycomimetics as selective inhibitors of human galectin-1 and -3.
Inorganic Chemistry Frontiers. Roč. 11, č. 21 (2024), s. 7588-7609. ISSN 2052-1553. E-ISSN 2052-1553
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06115S; GA MŠMT LX22NPO5102
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254; ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:67985858 ; RVO:61388963 ; RVO:68081707
Klíčová slova: digit NM affinity * therapeutic targer * crystal-structure * ligant * derivatives
Obor OECD: Inorganic and nuclear chemistry; Physical chemistry (UOCHB-X); Inorganic and nuclear chemistry (BFU-R)
Impakt faktor: 6.4, rok: 2024 ; AIS: 0.915, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.rsc.org/en/content/articlepdf/2024/qi/d4qi01555j
Hrstka, R.
- Karban, Jindřich
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357144

0618564 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hermanová, Monika - Soldanová, Zuzana - Hrušková, Marcela - Havran, Luděk - Fojta, Miroslav
Detection of thymine stretches in DNA oligonucleotides at the surface of hanging mercury drop electrode using thymine-mercury base pair formation.
Electrochimica acta. Roč. 512, FEB 1 2025 (2024), č. článku 145498. ISSN 0013-4686. E-ISSN 1873-3859
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-46325L; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: label-free detection * electrochemical detection * ions * binding * voltammetry * derivatives * biosensor * purine
Obor OECD: Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
Impakt faktor: 5.6, rok: 2024 ; AIS: 0.825, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0013468624017341?via%3Dihub

Hermanová, Monika Fojta, Miroslav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365445

0604894 - BFÚ 2025 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Hofer, Michal
Trendy ve farmakologické stimulaci regenerace ionizujícím zářením poškozeného savčího organismu.
[Trends in pharmacological stimulation of regeneration of ionizing radiation-damaged mammalian organism.]
Časopis lékařů českých. Roč. 159, 7-8 (2020), s. 275-280. ISSN 0008-7335
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Hematopoiesis * acute radiation syndrome * haematopoiesis
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.prolekare.cz/casopisy/casopis-lekaru-ceskych/2020-7-8-1/trendy-ve-farmakologicke-stimulaci-regenerace-ionizujicim-zarenim-poskozeneho-savciho-organismu-125506
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362426

0603217 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Horváth, J. - Jedlička, Pavel - Krátká, Marie - Kubát, Zdeněk - Kejnovský, Eduard - Lexa, M.
Detection and classification of long terminal repeat sequences in plant LTR-retrotransposons and their analysis using explainable machine learning.
BioData Mining. Roč. 17, č. 1 (2024), č. článku 57. ISSN 1756-0381. E-ISSN 1756-0381
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S; GA ČR(CZ) GA22-00364S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581; GA ČR(CZ) GA24-11400S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: genome-wide analysis * transposable elements * transcription * evolution * transposition * specificity * pathway
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.1, rok: 2024 ; AIS: 1.274, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://biodatamining.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13040-024-00410-z

Horváth, J. Lexa, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360634

0599220 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hubinský, Marcel - Hobza, Roman - Starczak, M. - Gackowski, D. - Kubát, Zdeněk - Janíček, Tomáš - Horáková, Lucie - Lorenzo, Jose Luis Rodriguez
Non-canonical bases differentially represented in the sex chromosomes of the dioecious plant Silene latifolia.
Journal of Experimental Botany. Roč. 75, č. 13 (2024), s. 3849-3861. ISSN 0022-0957. E-ISSN 1460-2431
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-00364S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: y-chromosome * transposable elements * repetitive dna * histone h3 * 5-hydroxymethylcytosine * methylation * 5-methylcytosine * 5-formylcytosine
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.479, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/jxb/article/75/13/3849/7656699
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356736

0599113 - BFÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Chrenkova, E. - Studentová, H. - Holá, K. - Kahounová, Zuzana - Hendrychova, R. - Souček, Karel - Bouchal, J.
Castration-resistant prostate cancer monitoring by cell-free circulating biomarkers.
Frontiers in Oncology. Roč. 14, SEP 10 2024 (2024), č. článku 1394292. ISSN 2234-943X. E-ISSN 2234-943X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: c-reactive protein * androgen deprivation therapy * receptor splice variant * peripheral whole-blood * long noncoding rnas * tumor-cells * liquid biopsies * free dna
Obor OECD: Oncology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2024 ; AIS: 0.912, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/journals/oncology/articles/10.3389/fonc.2024.1394292/full
Bouchal, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357948

0604180 - BFÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Juan, A. - Martin-Gomez, J. - Lorenzo, Jose Luis Rodriguez - Janoušek, Bohuslav - Cervantes, E.
New Techniques for Seed Shape Description in Silene Species.
TAXONOMY. Roč. 2, č. 1 (2022), s. 1-19. E-ISSN 2673-6500
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: reveals differences * caryophyllaceae * morphology * l. * cardioid * geometry * models * morphology * seed shape * Silene
Obor OECD: Plant sciences, botany
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2673-6500/2/1/1
Cervantes, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361549

0585258 - BFÚ 2025 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Kašpárková, J. - Novohradský, Vojtěch - Ruiz, J. - Brabec, V.
Photoactivatable, mitochondria targeting dppz iridium(III) complex selectively interacts and damages mitochondrial DNA in cancer cells.
Chemico-Biological Interactions. Roč. 392, FEB 2024 (2024), č. článku 110921. ISSN 0009-2797. E-ISSN 1872-7786
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06307S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: binding * ruthenium(ii) * intercalation * therapy * ligands * agents
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 0.843, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S000927972400067X?via%3Dihub
Brabec, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355195

0597520 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Knappeová, Barbora - Mlýnský, Vojtech - Pykal, M. - Šponer, Jiří - Banáš, P. - Otyepka, M. - Krepl, Miroslav
Comprehensive Assessment of Force-Field Performance in Molecular Dynamics Simulations of DNA/RNA Hybrid Duplexes.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 20, č. 15 (2024), s. 6917-6929. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05639S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: monovalent ion parameters * particle mesh ewald * rna-dna hybrid * crystal-structure * polypurine tract * rna/dna hybrid * water * conformation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.4c00601
Krepl, Miroslav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355641

0584088 - BFÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Kosutova, N. - Lorencova, L. - Hires, M. - Jane, E. - Orovcik, L. - Kollár, J. - Kozics, K. - Gábelová, A. - Ukraintsev, E. - Rezek, B. - Kasák, P. - Černocká, Hana - Ostatná, Veronika - Blahutova, J. - Vikartovská, A. - Bertok, T. - Tkac, J.
Negative Charge-Carrying Glycans Attached to Exosomes as Novel Liquid Biopsy Marker.
Sensors. Roč. 24, č. 4 (2024), č. článku 1128. ISSN 1424-8220. E-ISSN 1424-8220
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-26590S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: exosomes * prostate cancer * self-assembled monolayer * cancer * stability * protein * exosomes * prostate cancer
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 0.618, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1424-8220/24/4/1128
Bertok, T.
- Tkac, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355217

0600749 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kufner, C. L. - Crucilla, S. - Ding, D. - Stadlbauer, Petr - Šponer, Jiří - Szostak, J. W. - Sasselov, D.D. - Szabla, R.
Photoinduced charge separation and DNA self-repair depend on sequence directionality and stacking pattern.
Chemical Science. Roč. 15, č. 6 (2024), s. 2158-2166. ISSN 2041-6520. E-ISSN 2041-6539
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: excited-state dynamics * electron-transfer mechanisms * thymine dimer * uv environment * pyrimidine * delocalization * photochemistry * dimerization * lesions * light
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 7.4, rok: 2024 ; AIS: 1.819, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2024/sc/d3sc04971j
Szabla, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358044