Publikace ASEP
0598593 - ÚOCHB 2025 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Barati, V. - Hruzíková, Anna - Procházková, Eliška - Zavřel, Martin - Kozák, Jaroslav - Trylčová, Jana - Rejman, Dominik - Weber, Jan - Bogdanová, K. - Kolář, M. - Baszczyňski, Ondřej
Delivery of N-heterocyclic drugs, acids, phenols, and thiols via Tailor−made Self−immolative linkers.
European Journal of Medicinal Chemistry Reports. Roč. 12, December (2024), č. článku 100216. ISSN 2772-4174. E-ISSN 2772-4174
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: prodrug * heterocyclic drugs * self-emolative linker
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 0.537, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmcr.2024.100216
Baszczyňski, Ondřej
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0356203
0583888 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Baudys, M. - Sopha, H. - Hodek, Jan - Rusek, J. - Bartková, H. - Ulrychová, Lucie - Macák, J. M. - Weber, Jan - Krýsa, J.
Inactivation of influenza virus as representative of enveloped RNA viruses on photocatalytically active nanoparticle and nanotubular TiO2 surfaces.
Catalysis Today. Roč. 430, March (2024), č. článku 114511. ISSN 0920-5861. E-ISSN 1873-4308
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAIZ19017
Výzkumná infrastruktura: CEMNAT III - 90237
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: TiO2 * photocatalysis * nanotubular layer * porosity * virucidal * influenza virus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 0.788, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.cattod.2024.114511
Krýsa, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351876
0563497 - ÚOCHB 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bege, M. - Kiss, A. - Bereczki, I. - Hodek, Jan - Polyák, L. - Szemán-Nagy, G. - Naesens, L. - Weber, Jan - Borbás, A.
Synthesis and Anticancer and Antiviral Activities of C-2'-Branched Arabinonucleosides.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 20 (2022), č. článku 12566. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: photocatalytic thiol-ene reaction * nucleoside analogue * anti-tumor * time-lapse imaging * antiviral * coronavirus * SARS-CoV-2
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022 ; AIS: 1.03, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms232012566
Borbás, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335456
0605618 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bege, M. - Lovas, M. - Priksz, D. - Bernát, B. - Bereczki, I. - Kattoub, R. G. - Kajtár, R. - Eskeif, S. - Novák, L. - Hodek, Jan - Weber, Jan - Herczegh, P. - Lekli, I. - Borbás, A.
Synthesis, H2S releasing properties, antiviral and antioxidant activities and acute cardiac effects of nucleoside 5′-dithioacetates.
Scientific Reports. Roč. 15, January (2025), č. článku 2876. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleoside * dithioacetate * H2S donor * H2S release kinetics * antioxidant * antiviral * SARS-CoV-2
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-025-85351-1
Bege, M. Borbás, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0363281
0619387 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Bege, M. - Leiner, K. - Lovas, M. - Pető, R. - Bereczki, I. - Hodek, Jan - Weber, Jan - Kuczmog, A. - Borbás, A.
Synthesis of 3′-modified xylofuranosyl nucleosides bearing 5′-silyl or -butyryl groups and their antiviral effect against RNA viruses.
European Journal of Pharmaceutical Sciences. Roč. 209, June (2025), č. článku 107107. ISSN 0928-0987. E-ISSN 1879-0720
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV-2) * Chikungunya virus (CHIKV) * Sindbis virus (SINV) * nucleoside analogue antivirals * photochemical thiol-ene reaction
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.718, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejps.2025.107107
Borbás, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0366122
0585901 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Benoni, Barbora - Potužník, Jiří František - Škríba, Anton - Benoni, Roberto - Trylčová, Jana - Tulpa, Matouš - Spustová, Kristina - Grab, K. - Mititelu, Maria Bianca - Pačes, Jan - Weber, Jan - Staněk, David - Kowalska, J. - Bednárová, Lucie - Kečkéšová, Zuzana - Vopálenský, Pavel - Gahurová, Lenka - Cahová, Hana
HIV-1 Infection Reduces NAD Capping of Host Cell snRNA and snoRNA.
ACS Chemical Biology. Roč. 19, č. 6 (2024), s. 1243-1249. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1603; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA24-11157S
GRANT EU: European Commission(XE) 101041374 - StressRNaction
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: messenger RNA * nicotinamide * identification
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.337, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acschembio.4c00151
Cahová, Hana
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353546
0564352 - MBÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Bereczki, I. - Vimberg, Vladimír - Lorincz, E. - Papp, H. - Nagy, L. - Keki, S. - Batta, G. - Mitrović, A. - Kos, J. - Zsigmond, A. - Hajdú, I. - Lőrincz, Z. - Bajusz, D. - Petri, L. - Hodek, Jan - Jakab, F. - Keserű, G. M. - Weber, Jan - Naesens, L. - Herczegh, P. - Borbas, A.
Semisynthetic teicoplanin derivatives with dual antimicrobial activity against SARS-CoV-2 and multiresistant bacteria.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 16001. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: glycopeptide * virus * inhibitors * pseudoaglycon * dimerization * vancomycin * protease * binding
Obor OECD: Microbiology; Virology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022 ; AIS: 1.132, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-022-20182-y
Naesens, L.
- Borbas, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336026
0616545 - ÚEB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bildziukevich, Uladzimir - Černá, L. - Trylčová, Jana - Kvasnicová, Marie - Rárová, Lucie - Šaman, David - Lovecká, P. - Weber, Jan - Wimmer, Zdeněk
Amides of moronic acid and morolic acid with the tripeptides MAG and GAM targeting antimicrobial, antiviral and cytotoxic effects.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 16, č. 2 (2025), s. 801-811. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MPO(CZ) FV10599; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388963
Klíčová slova: betulinic acid * triterpene * cell proliferation
Obor OECD: Organic chemistry; Virology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/d4md00742e
Wimmer, Zdeněk
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0364154
0600506 - ÚOCHB 2025 RIV SG eng J - Článek v odborném periodiku
Bouazizi, A. - Obrová, K. - Vaňková, E. - Machková, A. - Khun, J. - Hadravová, Romana - Hodek, Jan - Ulrychová, Lucie - Trabelsi, A. - Weber, Jan - Zampieri, L. - Avino, F. - Furno, I. - Scholtz, V. - Lion, T.
3D-printed devices for optimized generation of cold atmospheric plasma to improve decontamination of surfaces from respiratory pathogens.
International Journal of Bioprinting. Roč. 10, č. 5 (2024), s. 444-461. ISSN 2424-7723. E-ISSN 2424-8002
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 3D-printed devices * adenovirus * disinfection * influenza A * Pseudomonas aeruginosa * reactive oxygen species * rhinovirus * SARS-CoV-2
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 6, rok: 2024 ; AIS: 0.93, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.36922/ijb.3679
Scholtz, V.
- Lion, T.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357830
0587983 - ÚEB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Černá, L. - Bildziukevich, Uladzimir - Rárová, Lucie - Trylčová, Jana - Šaman, David - Weber, Jan - Lovecká, P. - Wimmer, Zdeněk
Oxime derivatives of betulonic acid and platanic acid as novel cytotoxic or antiviral agents.
Reaction Chemistry & Engineering. Roč. 9, č. 5 (2024), s. 1087-1095. ISSN 2058-9883. E-ISSN 2058-9883
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Antiviral agents * Cell culture * Cytotoxicity
Obor OECD: Organic chemistry; Virology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.657, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/d4re00032c
Wimmer, Zdeněk
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355055
0588525 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gong, J. - Or, C. - Sze, E. T. - Man-Ngai Chan, S. - Wu, P. - Poon, P. M. - Law, A. K. Y. - Ulrychová, Lucie - Hodek, Jan - Weber, Jan - Ouyang, H. - Yang, M. - Eilts, S. M. - Torremorell, M. - Knobloch, Y. - Hogan, C. J. - Atallah, C. - Davies, J. - Winkler, J. - Gordon, R. - Zarghanishiraz, R. - Zabihi, M. - Christianson, C. - Taylor, D. - Rabinowitz, A. - Baylis, J. - Brinkerhoff, J. - Little, J. P. - Li, R. - Moldenhauer, J. - Mansour, M. K.
Effect of multifunctional cationic polymer coatings on mitigation of broad microbial pathogens.
Microbiology Spectrum. Roč. 12, č. 9 (2024), č. článku e04097-23. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAIZ19017
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cationic polymer * SARS-CoV-2 * Gram-positive * Gram-negative
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.022, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/spectrum.04097-23
Mansour, M. K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355398
0564609 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Guryev, A. - Schuster, F. - Herrmann, L. - Hahn, F. - Wangen, C. - Hodek, Jan - Weber, Jan - Marschall, M. - Tsogoeva, S. B.
Light-Driven Catalyst-Free Access to Phthalazines: Entry to Antiviral Model Drugs by Merging Domino Reactions.
European Journal of Organic Chemistry. Roč. 26, č. 5 (2023), č. článku e202200994. ISSN 1434-193X. E-ISSN 1099-0690
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Diels-Alder reaction * light-driven domino reaction * one-pot reaction * photoenolization * phthalazines
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2023 ; AIS: 0.517, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/ejoc.202200994
Tsogoeva, S. B.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336273
0575183 - ÚOCHB 2024 RIV CA eng J - Článek v odborném periodiku
Haas, M. - Fürhacker, P. - Hodek, Jan - Stangl, P. - Alon, I. - Kainz, K. - Fajgelj, V. - Mädel, C. - Dotzler, S. - Götzinger, F. - Ulrychová, Lucie - Preuner, S. - Fortschegger, M. - Schinnerl, D. - Walter, C. - Obrová, K. - Weber, Jan - Zacharasiewicz, A. - Lion, T.
Detection of viable SARS-CoV-2 on the hands of hospitalized children with COVID-19.
Clinical Microbiology and Infection. Roč. 29, č. 9 (2023), s. 1211-1213. ISSN 1198-743X. E-ISSN 1469-0691
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hand hygiene * infectivity * paediatric * palmar hand swab * respiratory virus * smear infection
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 10.9, rok: 2023 ; AIS: 2.843, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.cmi.2023.06.012
Lion, T.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345012
0581694 - ÚOCHB 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Herczeg, M. - Demeter, F. - Nagy, T. - Rusznyák, A. - Hodek, Jan - Sipos, E. - Lekli, I. - Fenyvesi, F. - Weber, Jan - Kéki, S. - Borbás, A.
Block Synthesis and Step-Growth Polymerization of C-6-Sulfonatomethyl-Containing Sulfated Malto-Oligosaccharides and Their Biological Profiling.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 677. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: malto-oligomers * sulfonic acid * polymerization * glycosylation * anti-inflammatory effect
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2024 ; AIS: 1.121, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms25010677
Herczeg, M. Borbás, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0349883
0556680 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Herrmann, L. - Yaremenko, I. A. - Çapci, A. - Struwe, J. - Tailor, D. - Dheeraj, A. - Hodek, Jan - Belyakova, Y. Y. - Radulov, P. S. - Weber, Jan - Malhotra, S. V. - Terent'ev, A. O. - Ackermann, L. - Tsogoeva, S. B.
Synthesis and in vitro Study of Artemisinin/Synthetic Peroxide-Based Hybrid Compounds against SARS-CoV-2 and Cancer.
ChemMedChem. Roč. 17, č. 9 (2022), č. článku e202200005. ISSN 1860-7179. E-ISSN 1860-7187
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: artemisinin based hybrids * anti-SARS-CoV-2 compounds * anti-cancer compounds * anti-leukemia agents
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.4, rok: 2022 ; AIS: 0.647, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cmdc.202200005
Terent'ev, A. O.
- Ackermann, L.
- Tsogoeva, S. B.
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0330800
0597800 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Chayka, Artem - Danda, M. - Dostálková, A. - Spiwok, V. - Klimešová, A. - Kapisheva, M. - Zgarbová, Michala - Weber, Jan - Ruml, T. - Rumlová, M. - Janeba, Zlatko
Developing Allosteric Inhibitors of SARS-CoV-2 RNA-Dependent RNA Polymerase.
ChemMedChem. Roč. 19, č. 23 (2024), č. článku e202400367. ISSN 1860-7179. E-ISSN 1860-7187
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17118S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: allosteric inhibitor * SARS-CoV-2 * RdRp * remdesivir * SAR study * scaffold hopping
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.626, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cmdc.202400367
Rumlová, M.
- Janeba, Zlatko
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355614
0642738 - ÚOCHB 2027 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Chayka, Artem - Danda, M. - Dostálková, A. - Spiwok, V. - Zijadic, L. - Klimešová, A. - Kapisheva, M. - Zgarbová, Michala - Weber, Jan - Ruml, T. - Rumlová, M. - Janeba, Zlatko
Allosteric Inhibitors of SARS-CoV-2 RNA-Dependent RNA Polymerase Based on N,N′-Diphenylurea.
ChemMedChem. Roč. 21, č. 1 (2026), č. článku e202500644. ISSN 1860-7179. E-ISSN 1860-7187
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17118S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: allosteric inhibitor * kinetic solubility * RdRp * SARS-CoV-2
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.626, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cmdc.202500644
Rumlová, M.
- Janeba, Zlatko
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0372599
0577594 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Klocperk, A. - Bloomfield, M. - Paráčková, Z. - Aillot, Ludovic - Fremuth, J. - Šašek, L. - David, J. - Fencl, F. - Skotnicová, A. - Rejlová, K. - Magner, M. - Hrušák, O. - Šedivá, A.
B cell phenotype and serum levels of interferons, BAFF, and APRIL in multisystem inflammatory syndrome in children associated with COVID-19 (MIS-C).
Molecular and Cellular Pediatrics. Roč. 10, č. 1 (2023), č. článku 15. ISSN 2194-7791. E-ISSN 2194-7791
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: PIMS-TS * MIS-C * COVID-19 * interferon * BAFF * APRIL * SLE
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.4, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40348-023-00169-z
Klocperk, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0346730
0598137 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Dvořáková, Alexandra - Zgarbová, Michala - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Krafčíková, Petra - Otava, Tomáš - Drexler, Matúš - Procházková, Eliška - Klepetářová, Blanka - Štefek, Milan - Kozic, Ján - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Bouřa, Evžen - Weber, Jan - Nencka, Radim
Discovery of highly potent SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase inhibitors based on adenosine 5′-carboxamides.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 15, č. 10 (2024), s. 3469-3476. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: system * RNA
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4MD00422A
Nencka, Radim
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355869
0556963 - ÚOCHB 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Konkoľová, Eva - Krejčová, Kateřina - Eyer, L. - Hodek, Jan - Zgarbová, Michala - Fořtová, A. - Jirásek, Michael - Teplý, Filip - Reyes Gutierrez, Paul Eduardo - Růžek, Daniel - Weber, Jan - Bouřa, Evžen
A Helquat-like Compound as a Potent Inhibitor of Flaviviral and Coronaviral Polymerases.
Molecules. Roč. 27, č. 6 (2022), č. článku 1894. ISSN 1420-3049. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-25280S; GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LTAUSA18016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: helquat-like compound * RNA-dependent RNA-polymerase * SARS-CoV-2 * flaviruses * antiviral agents
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022 ; AIS: 0.66, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/molecules27061894
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0331081
0640719 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Král, Michal - Das, A. - Kotačka, Tomáš - Blahošová, Anna - Liščáková, Veronika - Hodek, Jan - Konvalinka, Jan - Demo, G. - Kožíšek, Milan
Targeting the Rift Valley Fever Virus Polymerase: Resistance Mechanisms and Structural Insights.
ACS Infectious Diseases. Roč. 11, č. 11 (2025), s. 3364-3376. ISSN 2373-8227
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Rift Valley fever virus * L protein * antivirals * polymerase inhibitors * resistance mutations * structural insights
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.942, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.5c00832
Demo, G.
- Kožíšek, Milan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371080
0578610 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lőrincz, E. B. - Tóth, G. - Spolárics, J. - Herczeg, M. - Hodek, Jan - Zupkó, I. - Minorics, R. - Ádám, D. - Oláh, A. - Zouboulis, C. C. - Weber, Jan - Nagy, L. - Ostorházi, E. - Bácskay, I. - Borbás, A. - Herczegh, P. - Bereczki, I.
Mannich-type modifications of (−)-cannabidiol and (−)-cannabigerol leading to new, bioactive derivatives.
Scientific Reports. Roč. 13, November (2023), č. článku 19618. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phytocannabinoids * inflammation * activation
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023 ; AIS: 1.061, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-023-45565-7
Borbás, A.
- Bereczki, I.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0347569
0640457 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Lubyová, Barbora - Tikalová, Eva - Janovec, Václav - Ryabchenko, B. - Krulová, Kristýna - Kropáček, Václav - Huérfano, S. - Hirsch, Ivan - Weber, Jan
UBE2O, a host ubiquitin-conjugating enzyme, is a key regulator of hepatitis B virus maturation and egress.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 301, č. 11 (2025), č. článku 110750. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hepatitis B virus * HBV core protein * HBV capsid * UBE2O * monoubiquitination * virion maturation * multivesicular bodies * virion egress
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.458, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.jbc.2025.110750
Weber, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370870
0585790 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Nguyenová, H. Y. - Hubálek Kalbáčová, M. - Dendisová, M. - Sikorová, M. - Jarolímková, J. - Kolská, Z. - Ulrychová, Lucie - Weber, Jan - Řezníčková, A.
Stability and biological response of PEGylated gold nanoparticles.
Heliyon. Roč. 10, č. 9 (2024), č. článku e30601. ISSN 2405-8440. E-ISSN 2405-8440
Grant CEP: GA MŠMT EH22_008/0004558; GA MŠMT(CZ) LTAIZ19017
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nanoparticle * gold * polyethylene glycol * stability * cytotoxicity * antiviral activity
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.613, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e30601
Nguyenová, H. Y.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353468
0586496 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nigam, A. - Hurley, M. F. D. - Li, F. - Konkoľová, Eva - Klíma, Martin - Trylčová, Jana - Pollice, R. - Cinaroglu, S. S. - Levin-Konigsberg, R. - Handjaya, J. - Schapira, M. - Chau, I. - Perveen, S. - Ng, H.-L. - Kaniskan, H. U. - Han, Y. - Singh, S. - Gorgulla, C. - Kundaje, A. - Jin, J. - Voelz, V. A. - Weber, Jan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen - Vedadi, M. - Aspuru-Guzik, A.
Application of established computational techniques to identify potential SARS-CoV-2 Nsp14-MTase inhibitors in low data regimes.
Digital Discovery. Roč. 3, č. 7 (2024), s. 1327-1341. E-ISSN 2635-098X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: docking * accuracy
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2024 ; AIS: 1.478, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4DD00006D
Vedadi, M.
- Aspuru-Guzik, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353965
0604028 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Novotný, Pavel - Humpolíčková, Jana - Nováková, Veronika - Stanchev, Stancho - Stříšovský, Kvido - Zgarbová, Michala - Weber, Jan - Kryštůfek, Robin - Starková, Jana - Hradilek, Martin - Moravcová, Adéla - Günterová, Jana - Bach, Kathrin - Majer, Pavel - Konvalinka, Jan - Majerová, Taťána
The zymogenic form of SARS-CoV-2 main protease: A discrete target for drug discovery.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 301, č. 1 (2025), č. článku 108079. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) LUC23180
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * protease * autoprocessing * virus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.458, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.108079
Majerová, Taťána
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361353
0556563 - ÚOCHB 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Obrová, K. - Vaňková, E. - Sláma, M. - Hodek, Jan - Khun, J. - Ulrychová, Lucie - Nogueira, F. - Laos, T. - Sponseiler, I. - Kašparová, P. - Machková, A. - Weber, Jan - Scholtz, V. - Lion, T.
Decontamination of High-Efficiency Mask Filters From Respiratory Pathogens Including SARS-CoV-2 by Non-thermal Plasma.
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology. Roč. 10, February (2022), č. článku 815393. ISSN 2296-4185. E-ISSN 2296-4185
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAIZ19017
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: human respiratory viruses * influenza A * Rhinovirus * Adenovirus * Pseudomonas aerguinosa * particle filter * protective equipment * cold plasma
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022 ; AIS: 1.007, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fbioe.2022.815393
Obrová, K. Lion, T.
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0330720
0571224 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pávová, Marcela - Reyes Gutierrez, Paul Eduardo - Kozák, Jaroslav - Dobiaš, Juraj - Yurenko, Yevgen - Lepšík, Martin - Teplý, Filip - Weber, Jan
Helquat dyes targeting G-quadruplexes as a new class of anti-HIV-1 inhibitors.
Scientific Reports. Roč. 13, April (2023), č. článku 6096. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: long terminal repeat * promoter * binding
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023 ; AIS: 1.061, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-023-33263-3
Weber, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342496
0563164 - ÚOCHB 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Radilová, Kateřina - Zima, Václav - Král, Michal - Machara, Aleš - Majer, Pavel - Hodek, Jan - Weber, Jan - Brynda, Jiří - Strmeň, Timotej - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan
Thermodynamic and structural characterization of an optimized peptide-based inhibitor of the influenza polymerase PA-PB1 subunit interaction.
Antiviral Research. Roč. 208, December (2022), č. článku 105449. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antiviral peptides * influenza A polymerase * protein-protein interaction * AlphaScreen * isothermal titration calorimetry
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.6, rok: 2022 ; AIS: 1.345, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2022.105449
Machara, Aleš
- Kožíšek, Milan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335206
0641862 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Štaflová, Karolína - Clarová, Kamila - Doležal, Michal - Hubálek, Martin - Křenková, Alena - Hodek, Jan - Pichová, Iva - Zábranský, Aleš
Hepatitis B virus is a stealth virus that minimizes proteomic and secretomic changes in primary human hepatocytes.
Journal of General Virology. Roč. 106, č. 11 (2025), č. článku 002170. ISSN 0022-1317. E-ISSN 1465-2099
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: bulevirtide * hepatitis B virus * host factor * proteomics * reticulocalbin-2 * secretome * virus–host interaction
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.975, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1099/jgv.0.002170
Pichová, Iva
- Zábranský, Aleš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371877
0574244 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Štefek, Milan - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Zgarbová, Michala - Dvořáková, Alexandra - Krafčíková, Petra - Li, A. S. M. - Šála, Michal - Dejmek, Milan - Otava, Tomáš - Chaloupecká, Ema - Kozák, Jaroslav - Kozic, Ján - Vedadi, M. - Weber, Jan - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Rational Design of Highly Potent SARS-CoV-2 nsp14 Methyltransferase Inhibitors.
ACS Omega. Roč. 8, č. 30 (2023), s. 27410-27418. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * genetics * inhibitors
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 0.639, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsomega.3c02815
Nencka, Radim
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344580
0640344 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková, E. - Obrová, K. - Hodek, Jan - Machková, A. - Kašparová, P. - Khun, J. - Lokajová, E. - Ulrychová, Lucie - Fürhacker, P. - Sláma, M. - Přikryl, R. - Kalina, L. - Krobot, Š. - Lion, T. - Weber, Jan - Scholtz, V.
Scaled-up non-thermal plasma-generating device Plasmatico enables effective and harmless disinfection of personal protective equipment.
Scientific Reports. Roč. 15, October (2025), č. článku 35631. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cold atmospheric plasma * disinfection * MRSA * SARS-CoV-2 * virus inactivation
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-025-19520-7
Vaňková, E.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370746
0555722 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zábranská, Helena - Zábranský, Aleš - Lubyová, Barbora - Hodek, Jan - Křenková, Alena - Hubálek, Martin - Weber, Jan - Pichová, Iva
Biogenesis of hepatitis B virus e antigen is driven by translocon-associated protein complex and regulated by conserved cysteine residues within its signal peptide sequence.
FEBS Journal. Roč. 289, č. 10 (2022), s. 2895-2914. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: HBe * TRAP complex * hepatitis B virus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022 ; AIS: 1.41, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/febs.16304
Pichová, Iva
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0330180
0576080 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, Michala - Otava, Tomáš - Šilhán, Jan - Nencka, Radim - Weber, Jan - Bouřa, Evžen
Inhibitors of mpox VP39 2′-O methyltransferase efficiently inhibit the monkeypox virus.
Antiviral Research. Roč. 218, October (2023), č. článku 105714. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: structural basis
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.276, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2023.105714
Weber, Jan
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345703
0573031 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zmudzinski, M. - Rut, W. - Olech, K. - Granda, J. - Giurg, M. - Burda-Grabowska, M. - Kaleta, R. - Zgarbová, Michala - Kasprzyk, R. - Zhang, L. - Sun, X. - Lv, Z. - Nayak, D. - Kesik-Brodacka, M. - Olsen, S. K. - Weber, Jan - Hilgenfeld, R. - Jemielity, J. - Drag, M.
Ebselen derivatives inhibit SARS-CoV-2 replication by inhibition of its essential proteins: PLpro and Mpro proteases, and nsp14 guanine N7-methyltransferase.
Scientific Reports. Roč. 13, June (2023), č. článku 9161. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: organoselenium compounds * synthetic methodology * SARS
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023 ; AIS: 1.061, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-023-35907-w
Zmudzinski, M. Drag, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0343565
0586412 - ÚOCHB 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Žáčková, Sandra - Pávová, Marcela - Trylčová, Jana - Chalupová, Jitka - Priss, Anastasiia - Lukšan, Ondřej - Weber, Jan
Upregulation of mRNA Expression of ADGRD1/GPR133 and ADGRG7/GPR128 in SARS-CoV-2-Infected Lung Adenocarcinoma Calu-3 Cells.
Cells. Roč. 13, č. 10 (2024), č. článku 791. ISSN 2073-4409. E-ISSN 2073-4409
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTC20065; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: adhesion GPCR * mRNA expression * ADGRD1 * GPR133 * ADGRG7 * GPR128 * SARS-CoV-2 * Calu-3 * Caco-2
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2024 ; AIS: 1.421, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/cells13100791
Weber, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353947