0604059 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Láznička, Tomáš - Ježek, Jan - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav
Innovative Microfluidic chip for Raman spectroscopy and advanced electron microscopy techniques.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 03017. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA TA ČR(CZ) TN02000020; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: microfluidic chip * electron microscopy * HPF
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_03017/bioconf_emc2024_03017.html
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361391

0604112 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Sikorová, Pavlína - Šlouf, Miroslav - Skoupý, Radim - Pavlova, Ewa - Krzyžánek, Vladislav
U-NET Enhanced 4D-STEM/PNBD: Advancing Microscopy Image Reconstruction.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 10045. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000020; GA ČR(CZ) GA21-13541S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:61389013
Klíčová slova: 4D-STEM-in-SEM * U-NET * 4D-STEM/PNBD * diffraction * denoising
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Polymer science (UMCH-V)
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_10045/bioconf_emc2024_10045.html
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361458

0617075 - ÚPT 2025 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Fialová, D. - Brzobohatá, K. - Drozdová, E. - Skoupý, Radim - Chocholová, E. - Krzyžánek, Vladislav - Světlík, Ivo - Miranda, D. D. - Fernandez, M. G. - Rivero, A. R. - Begerock, A.-M.
New insights to reveal the possible Guanche origin of the Cuban mummy of the “Peruvian Miner”.
Anthropologie. Roč. 62, č. 2 (2024), s. 97-110. ISSN 0323-1119. E-ISSN 2570-9127
Grant CEP: GA MŠMT EF16_019/0000728
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:61389005
Klíčová slova: Mummy of “Peruvian Miner” * Museo Montané * Cuba * aDNA * mtDNA * Electron microscopy * Radiocarbon dating * SEM-EDX detector
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect) (UJF-V)
Impakt faktor: 0.2, rok: 2024 ; AIS: 0.061, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
http://puvodni.mzm.cz/Anthropologie/article.php?ID=2414
Drozdová, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364084

0605302 - ÚPT 2025 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Hrubanová, Kamila - Pilát, Zdeněk - Benešová, Markéta - Avbelj, M. - Žnidaršič, N. - Kostanjšek, R. - Petković, H. - Krzyžánek, Vladislav
Studium geneticky upravených mikroorganismů pomocí elektronové mikroskopie a Ramanovy spektroskopie.
[Study of genetically modified microorganisms using electron microscopy and Raman spectroscopy.]
Jemná mechanika a optika. Roč. 69, č. 2 (2024), s. 33-35. ISSN 0447-6441
AV ČR(CZ) MSM100652102
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo-SEM * TEM * Actinobacteria * Raman spectroscopy
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Způsob publikování: Omezený přístup
https://jmo.fzu.cz/sites/jmo.fzu.cz/files/oldweb/2024/2024-02/jmo_24_02_obsah.pdf
Hrubanová, Kamila
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362957

0588191 - ÚMCH 2025 RIV CZ eng L4 - Software
Šlouf, Miroslav - Krzyžánek, Vladislav
Program package BGROUND.
Interní kód: BGROUND ; 2024
Technické parametry: Programový balík BGROUND je doplněk programového vybavení rastrovacích elektronových mikroskopů (SEM) související s odečítáním pozadí při zpracování 4D-STEM dat. Je distribuován jako standardizovaný rozšiřující balík s otevřeným zdrojovým kódem ve volně šiřitelném programovacím jazyce Python. Kompletní technický popis výsledku je uveden přímo na oficiálních www-stránkách balíku (Python Package Index, https://pypi.org/project/bground). WWW-stránky obsahují mj. stručný popis programu, pokyny pro instalaci a odkazy na další volně stažitelné materiály (ukázkové příklady včetně testovacích dat, podrobnější dokumentaci i detailní popis jednotlivých funkcí). Vše s dodržením obvyklých standardů, takže každý uživatel elektronového mikroskopu si může balík stáhnout a okamžitě použít.
Ekonomické parametry: Programový balík BGROUND rozšiřuje možnosti rastrovacích elektronových mikroskopů. BGROUND navazuje na dříve vyvinutý balík STEMDIFF. Balík STEMDIFF převádí čtyřrozměrné datasety (4D-STEM-in-SEM datasets) na dvojrozměrné práškové difraktogramy (2D powder electron diffraction patterns), které jinými metodami SEM mikroskopie nelze získat. Balík BGROUND usnadňuje následné zpracování 2D práškových difraktogramů ze SEM mikroskopů tak, že zajišťuje semi-automatické odečítání pozadí, které je v tomto případě poměrně specifické. Tím se zpracování 4D-STEM-in-SEM datasetů dále zjednodušuje a zpřístupňuje širšímu okruhu uživatelů.
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000020
Institucionální podpora: RVO:61389013 ; RVO:68081731
Klíčová slova: 4D-STEM-in-SEM * powder electron diffraction in SEM * background subtraction
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8); Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8) (UPT-D)
https://pypi.org/project/bground
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355201