RIV - aktuální sběr
0601694 - MBÚ 2025 RIV US eng A - Abstrakt
Kovaľ, Tomáš - Nabajyoti, Borah - Brezovská, Barbora - Wiedermannová, Jana - Šanderová, Hana - Sudzinová, Petra - Schwarz, Marek - Hubálek, Martin - Dohnálek, Jan - Krásný, Libor
RNA polymerase recycling by mycobacterial HelD: an alternative, HelD-protected pathway of transcription initiation.
22nd International Conference on Bacilli & Gram-positive Bacteria. Bloomington: Indiana University, USA, 2024. s. 24-24.
[22nd International Conference on Bacilli & Gram-positive Bacteria. 18.06.2024-21.06.2024, Bloomington]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Rifampicin * resistance * HelD * gene expression regulation
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BTO-N); Analytical chemistry (UOCHB-X)
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0359018
Uložit do RIV jako O
0599889 - ÚOCHB 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Pávová, Marcela - Rajmonová, Anežka - Priss, Anastasiia - Křenková, Alena - Hubálek, Martin - Weber, Jan
HIV-1 uncoating and beyond.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, č. 6 (2024), s. 206, č. článku L-06. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024. Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology /3./. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: HIV-1 * cellular helicases
Obor OECD: Virology
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48/87
Pávová, Marcela Weber, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357313
Uložit do RIV jako O
0601699 - MBÚ 2025 RIV NL eng A - Abstrakt
Pospíšil, Jiří - Kočárková, Veronika - Schwarz, Marek - Hubálek, Martin - Brázdovič, Filip - Valášek, Leoš Shivaya - Nováček, J. - Krásný, Libor
Sublancin 168 and its potential targets in Gram‐positive bacteria.
BACELL2024. Groningen, 2024 - (Maarten van Dijl, J.). s. 19-19
[BACELL 2024. 02.05.2024-03.05.2024, Dubrovnik]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Antibiotics * Gram-positive bacteria * intercellular competition
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UOCHB-X)
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0359028
Uložit do RIV jako O
0601012 - MBÚ 2025 RIV US eng A - Abstrakt
Pospíšil, Jiří - Kočárková, Veronika - Schwarz, Marek - Hubálek, Martin - Krásný, Libor
Sublancin and its potential targets in Gram-positive bacteria.
22nd International Conference on Bacilli & Gram-positive Bacteria. Bloomington: Indiana University, USA, 2024. s. 39-39.
[22nd International Conference on Bacilli & Gram-positive Bacteria. 18.06.2024-21.06.2024, Bloomington]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: bacteria * gram-positive * bacillus
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UOCHB-X)
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0358242
Uložit do RIV jako O
0599868 - ÚOCHB 2025 RIV CZ eng A - Abstrakt
Štaflová, Karolína - Zábranský, Aleš - Clarová, Kamila - Hubálek, Martin - Křenková, Alena - Hodek, Jan - Doležal, Michal - Pichová, Iva
Host-pathogen interaction during hepatitis B virus infection.
Czech Chemical Society Symposium Series. Roč. 22, č. 6 (2024), s. 202, č. článku L-02. ISSN 2336-7202.
[NIVB Meeting 2024. Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology /3./. 30.09.2024-02.10.2024, Kutná Hora]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hepatitis B virus * SCAMP proteins
Obor OECD: Virology
http://www.ccsss.cz/index.php/ccsss/issue/view/48/87
Štaflová, Karolína Pichová, Iva
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357292
Uložit do RIV jako O
0580617 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bouyssié, D. - Altiner, P. - Capella-Gutierrez, S. - Fernandez, J. M. - Hagemeijer, Y. P. - Horvatovich, P. - Hubálek, Martin - Levander, F. - Mauri, P. - Palmblad, M. - Raffelsberger, W. - Rodriguez-Navas, L. - Di Silvestre, D. - Kunkli, B. T. - Uszkoreit, J. - Vandenbrouck, Y. - Vizcaíno, J. A. - Winkelhardt, D. - Schwämmle, V.
WOMBAT-P: Benchmarking Label-Free Proteomics Data Analysis Workflows.
Journal of Proteome Research. Roč. 23, č. 1 (2024), s. 418-429. ISSN 1535-3893. E-ISSN 1535-3907
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: workflow * data analysis * benchmarking * label-free proteomics * quality metrics
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.223, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jproteome.3c00636
Schwämmle, V.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0349387
0603767 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brezovská, Barbora - Narasimhan, S. - Šiková, Michaela - Šanderová, Hana - Kovaľ, Tomáš - Borah, Nabajyoti - Shoman, Mahmoud - Pospíšilová, Debora - Hausnerová Vaňková, Viola - Tužinčin, D. - Černý, M. - Komárek, J. - Janoušková, Martina - Kambová, Milada - Halada, Petr - Křenková, Alena - Hubálek, Martin - Trundová, Mária - Dohnálek, Jan - Hnilicová, Jarmila - Zídek, L. - Krásný, Libor
MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σ A in Mycobacterium smegmatis.
Journal of Bacteriology. Roč. 206, č. 12 (2024), č. článku e00066-24. ISSN 0021-9193. E-ISSN 1098-5530
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-12956S; GA ČR(CZ) GA22-12023S; GA ČR(CZ) GA23-05622S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT LM2023042; GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: escherichia-coli regulator * rna-polymerase * bacillus-subtilis * crystal-structure * stress-response * differential expression * stationary-phase * larger proteins * tuberculosis * molybdenum * MoaB2 * sigma(A) * mycobacteria * RNA polymerase * transcription
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3, rok: 2024 ; AIS: 1.052, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/jb.00066-24
Hnilicová, Jarmila
- Zídek, L.
- Krásný, Libor
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361080
0585463 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Častorálová, M. - Sýs, Jakub - Prchal, J. - Pavlů, A. - Prokopová, L. - Briki, Z. - Hubálek, Martin - Ruml, T.
A myristoyl switch at the plasma membrane triggers cleavage and oligomerization of Mason-Pfizer monkey virus matrix protein.
eLife. Roč. 13, March (2024), č. článku e93489. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA22-19250S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: HIV-1 Gag * type 1 Gag * myristoyl switch * betaretrovirus * matrix protein * protease * maturation
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: nepřidělen/n.a., rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.7554/eLife.93489
Ruml, T.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353250
0600304 - BTÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kovaľ, Tomáš - Borah, Nabajyoti - Sudzinová, Petra - Brezovská, Barbora - Šanderová, Hana - Hausnerová Vaňková, Viola - Křenková, Alena - Hubálek, Martin - Trundová, Mária - Adámková, Kristýna - Dušková, Jarmila - Schwarz, Marek - Wiedermannová, Jana - Dohnálek, Jan - Krásný, Libor - Kouba, Tomáš
Mycobacterial HelD connects RNA polymerase recycling with transcription initiation.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 8740. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008205; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA23-06295S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; CIISB II - 90127; ELIXIR CZ III - 90255; Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: bacterial transcription * gene-expression * factor HelD * cryo-EM * transcription initiation * Mycobacterium smegmatis * rifampicin resistance
Obor OECD: Biophysics; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-024-52891-5
Dohnálek, Jan
- Krásný, Libor
- Kouba, Tomáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357992
0580571 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pospíšil, Jiří - Schwarz, Marek - Ziková, Alice - Vítovská, Dragana - Hradilová, Miluše - Kolář, Michal - Křenková, Alena - Hubálek, Martin - Krásný, Libor - Vohradský, Jiří
σE of Streptomyces coelicolor can function both as a direct activator or repressor of transcription.
Communications Biology. Roč. 7, January 6 (2024), č. článku 46. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF22-06342K; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050 ; RVO:61388963
Klíčová slova: σ factors * proteins * Streptomyces coelicolor * gene expression
Obor OECD: Microbiology; Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s42003-023-05716-y
Pospíšil, Jiří Vohradský, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0349344
0588107 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pospíšil, Jiří - Sax, Alice - Hubálek, Martin - Krásný, Libor - Vohradský, Jiří
Whole proteome analysis of germinating and outgrowing Bacillus subtilis 168.
Proteomics. Roč. 24, č. 17 (2024), č. článku 2400031. ISSN 1615-9853. E-ISSN 1615-9861
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA ČR(CZ) GF22-06342K; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: database * spores * KEGG pathways analysis * protein functional analysis * time series of protein expression
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.038, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://analyticalsciencejournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/pmic.202400031
Vohradský, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355139
0583294 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vetýšková, Veronika - Hubálek, Martin - Šulc, Josef - Procházka, Jan - Vondrášek, Jiří - Vydra Boušová, Kristýna
Proteolytic profiles of two isoforms of human AMBN expressed in E. coli by MMP-20 and KLK-4 proteases.
Heliyon. Roč. 10, č. 2 (2024), č. článku e24564. ISSN 2405-8440. E-ISSN 2405-8440
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: ameloblastin * proteolytic analysis * MMP-20 * KLK-4 * enzymatic cleavage products
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.613, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2024.e24564
Vondrášek, Jiří
- Vydra Boušová, Kristýna
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351295