RIV - aktuální sběr
0598836 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kopejtka, Karel - Tomasch, Jurgen - Shivaramu, Sahana - Saini, Mohit Kumar - Kaftan, David - Koblížek, Michal
Minimal transcriptional regulation of horizontally transferred photosynthesis genes in phototrophic bacterium Gemmatimonas phototrophica.
mSystems. Roč. 9, č. 9 (2024), č. článku e00706-24. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * bacteriochlorophyll * growth * light * expression * state * Gemmatimonadota * anoxygenic photosynthesis * bacteriochlorophyll * horizontal gene transfer * transcriptomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.653, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.00706-24
Koblížek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0356425
0603817 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Koppenhofer, S. - Tomasch, Jurgen - Lang, A. S.
Shared properties of gene transfer agent and core genes revealed by comparative genomics of Alphaproteobacteria.
Microbial Genomics. Roč. 8, č. 11 (2022), č. článku 000890. ISSN 2057-5858. E-ISSN 2057-5858
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: gc skew * bacterial * dna * evolution * repeats * transcription * organization * replication * expression * plasticity * codon usage * GC skew * genome plasticity * inversion * methylation * repetitive elements
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 1.478, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.000890
Lang, A. S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361115
0601983 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Leinberger, J. - Koteska, D. - Boldt, J. - Petersen, J. - Shivaramu, Sahana - Tomasch, Jurgen - Schulz, S. - Brinkhoff, T.
Chemical quantification of N-acyl alanine methyl ester (NAME) production and impact on temporal gene expression patterns in Roseovarius tolerans EL-164.
BMC Microbiology. Roč. 24, November 21 (2024), č. článku 489. ISSN 1471-2180. E-ISSN 1471-2180
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Antibiosis * Differential gene expression * Growth phases * Quantification * Roseobacter * Secondary metabolites * Signaling * Time course * Transcriptomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.98, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://bmcmicrobiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12866-024-03624-7
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0359207
0584830 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mansky, J. - Wang, H. - Wagner-Doebler, I. - Tomasch, Jurgen
The effect of site-specific recombinases XerCD on the removal of over-replicated chromosomal DNA through outer membrane vesicles in bacteria.
Microbiology Spectrum. Roč. 12, č. 3 (2024), č. článku 0234323. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: ftsk * activation * transformation * biogenesis * DNA replication * DNA repair * outer membrane vesicles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.022, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02343-23
Tomasch, Jurgen
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0352662
0585431 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Bílý, Tomáš - Gardiner, Alastair T. - Gardian, Zdenko - Shivaramu, Sahana - Koblížek, Michal - Kaftan, David
A photoheterotrophic bacterium from Iceland has adapted its photosynthetic machinery to the long days of polar summer.
mSystems. Roč. 9, č. 3 (2024), č. článku e0131123. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * light * database * carotenoids * stress * growth * oxygen * image * aap * gene expression * light adaptation * photosynthesis * Proteobacteria * Sediminicoccus
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.653, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01311-23
Kaftan, David
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353141
0587212 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Shivaramu, Sahana - Mujakić, Izabela - Koblížek, Michal
On the evolution of chromosomal regions with high gene strand bias in bacteria.
mBio. Roč. 15, č. 6 (2024), č. článku mbio.00602-24. ISSN 2150-7511. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: replication * genome * organization * repeats * genome organization * genome evolution * gene order * strand bias * Gemmatimonadota
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.855, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/mbio.00602-24
Tomasch, Jurgen
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0354468