Tomasch Jurgen

0571850 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Alpers, K. - Vatareck, E. - Groebe, L. - Muesken, M. - Scharfe, M. - Haeussler, S. - Tomasch, Jurgen
Transcriptome Dynamics of Pseudomonas aeruginosa during Transition from Overlapping To Non-Overlapping Cell Cycles.
mSystems. Roč. 8, č. 2 (2023), č. článku 01130-22. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_053/0017705
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cell cycle * DNA replication * Pseudomonas aeruginosa * transcription
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5, rok: 2023 ; AIS: 1.843, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01130-22
Haeussler, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342762

0565420 - MBÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kopejtka, Karel - Tomasch, Jurgen - Kaftan, David - Gardiner, Alastair T. - Bína, David - Gardian, Zdenko - Bellas, Ch. - Dröge, A. - Geffers, R. - Sommaruga, R. - Koblížek, Michal
A bacterium from a mountain lake harvests light using both proton-pumping xanthorhodopsins and bacteriochlorophyll-based photosystems.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 119, č. 50 (2022), č. článku e2211018119. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT(CZ) EF18_053/0017705; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: anoxygenic photosynthesis * bacteriochlorophyll a * dual phototrophy * light energy * xanthorhodopsin
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 11.1, rok: 2022 ; AIS: 4.488, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2211018119
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0336944

0598836 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kopejtka, Karel - Tomasch, Jurgen - Shivaramu, Sahana - Saini, Mohit Kumar - Kaftan, David - Koblížek, Michal
Minimal transcriptional regulation of horizontally transferred photosynthesis genes in phototrophic bacterium Gemmatimonas phototrophica.
mSystems. Roč. 9, č. 9 (2024), č. článku e00706-24. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * bacteriochlorophyll * growth * light * expression * state * Gemmatimonadota * anoxygenic photosynthesis * bacteriochlorophyll * horizontal gene transfer * transcriptomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.653, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.00706-24
Koblížek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356425

0603817 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Koppenhofer, S. - Tomasch, Jurgen - Lang, A. S.
Shared properties of gene transfer agent and core genes revealed by comparative genomics of Alphaproteobacteria.
Microbial Genomics. Roč. 8, č. 11 (2022), č. článku 000890. ISSN 2057-5858. E-ISSN 2057-5858
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: gc skew * bacterial * dna * evolution * repeats * transcription * organization * replication * expression * plasticity * codon usage * GC skew * genome plasticity * inversion * methylation * repetitive elements
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 1.478, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.000890
Lang, A. S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361115

0560767 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Koppenhofer, S. - Tomasch, Jurgen - Ringel, V. - Birmes, L. - Brinkmann, H. - Sproeer, C. - Jarek, M. - Wang, H. - Pradella, S. - Wagner-Doebler, I. - Petersen, J.
The Sixth Element: a 102-kb RepABC Plasmid of Xenologous Origin Modulates Chromosomal Gene Expression in Dinoroseobacter shibae.
mSystems. Roč. 7, č. 4 (2022), č. článku 00264-22. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Roseobacteraceae * plasmid stability * transcriptomics * denitrification * heavy metal resistance * CtrA regulon
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.4, rok: 2022 ; AIS: 1.988, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/msystems.00264-22
Petersen, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333935

0601983 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Leinberger, J. - Koteska, D. - Boldt, J. - Petersen, J. - Shivaramu, Sahana - Tomasch, Jurgen - Schulz, S. - Brinkhoff, T.
Chemical quantification of N-acyl alanine methyl ester (NAME) production and impact on temporal gene expression patterns in Roseovarius tolerans EL-164.
BMC Microbiology. Roč. 24, November 21 (2024), č. článku 489. ISSN 1471-2180. E-ISSN 1471-2180
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Antibiosis * Differential gene expression * Growth phases * Quantification * Roseobacter * Secondary metabolites * Signaling * Time course * Transcriptomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.98, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://bmcmicrobiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12866-024-03624-7
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359207

0584830 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mansky, J. - Wang, H. - Wagner-Doebler, I. - Tomasch, Jurgen
The effect of site-specific recombinases XerCD on the removal of over-replicated chromosomal DNA through outer membrane vesicles in bacteria.
Microbiology Spectrum. Roč. 12, č. 3 (2024), č. článku 0234323. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: ftsk * activation * transformation * biogenesis * DNA replication * DNA repair * outer membrane vesicles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.022, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02343-23
Tomasch, Jurgen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0352662

0555877 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Mansky, J. - Wang, H. - Ebert, M. - Haertig, E. - Jahn, D. - Tomasch, Jurgen - Wagner-Doebler, I.
The Influence of Genes on the ´Killer Plasmid´ of Dinoroseobacter shibae on Its Symbiosis With the Dinoflagellate Prorocentrum minimum.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, JAN 28 2022 (2022), č. článku 804767. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cell-death * biotin * phytoplankton * bacteria * colonization * transporters * genomics * ecology * need * type 4 secretion system (T4SS) * biotin * Jekyll and Hyde * dinoflagellates * phytoplankton-bacteria interactions * Roseobacter group * B12 auxotrophy
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022 ; AIS: 1.159, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.804767/full
Wagner-Doebler, I.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330334

0557996 - MBÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Neffe, L. - Abendroth, L. - Bautsch, W. - Haeussler, S. - Tomasch, Jurgen
High plasmidome diversity of extended-spectrum beta-lactam-resistant Escherichia coli isolates collected during one year in one community hospital.
Genomics. Roč. 114, č. 3 (2022), č. článku 110368. ISSN 0888-7543. E-ISSN 1089-8646
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: sequence type 131 * dissemination * gene * mobility * c1-m27 * spread * clone * Escherichia coli * Plasmids * Horizontal gene transfer * Antimicrobial resistance * Sequencing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022 ; AIS: 0.762, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754322001136?via%3Dihub
Haeussler, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0332690

0571792 - MBÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Shivaramu, Sahana - Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Nupur, Nupur - Saini, Mohit Kumar - Bokhari, Syed Nadeem Hussain - Küpper, Hendrik - Koblížek, Michal
The Influence of Calcium on the Growth, Morphology and Gene Regulation in Gemmatimonas phototrophica.
Microorganisms. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 27. ISSN 2076-2607. E-ISSN 2076-2607
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT EF15_003/0000336
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Gemmatimonas phototrophica * anoxygenic phototrophic bacteria * horizontal gene transfer * calcium * transcriptomics
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.87, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/11/1/27
Koblížek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342691

0585431 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Bílý, Tomáš - Gardiner, Alastair T. - Gardian, Zdenko - Shivaramu, Sahana - Koblížek, Michal - Kaftan, David
A photoheterotrophic bacterium from Iceland has adapted its photosynthetic machinery to the long days of polar summer.
mSystems. Roč. 9, č. 3 (2024), č. článku e0131123. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * light * database * carotenoids * stress * growth * oxygen * image * aap * gene expression * light adaptation * photosynthesis * Proteobacteria * Sediminicoccus
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.653, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.01311-23
Kaftan, David
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353141

0557609 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Ringel, V. - Wang, H. - Freese, H. - Bartling, P. - Brinkmann, H. - Vollmers, J. - Jarek, M. - Wagner-Doebler, I. - Petersen, J.
Fatal affairs - conjugational transfer of a dinoflagellate- killing plasmid between marine Rhodobacterales.
Microbial Genomics. Roč. 8, č. 3 (2022), č. článku 000787. ISSN 2057-5858. E-ISSN 2057-5858
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: phaeobacter-gallaeciensis * dinoroseobacter-shibae * tropodithietic acid * gen. nov. * roseobacter * genome * phytoplankton * adaptation * bacteria * agent * bacteria-algae interaction * conjugation * horizontal gene transfer * Roseobacter
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 1.478, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.000787
Petersen, J.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331597

0587212 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Kopejtka, Karel - Shivaramu, Sahana - Mujakić, Izabela - Koblížek, Michal
On the evolution of chromosomal regions with high gene strand bias in bacteria.
mBio. Roč. 15, č. 6 (2024), č. článku mbio.00602-24. ISSN 2150-7511. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: replication * genome * organization * repeats * genome organization * genome evolution * gene order * strand bias * Gemmatimonadota
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 1.855, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/epub/10.1128/mbio.00602-24
Tomasch, Jurgen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354468

0638383 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomasch, Jurgen - Bartling, P. - Vollmers, J. - Woehlbrand, L. - Jarek, M. - Rohde, M. - Brinkmann, H. - Freese, H. M. - Rabus, R. - Petersen, J.
Structural and regulatory determinants of flagellar motility in .Rhodobacterales-the archetypal flagellum of Phaeobacter inhibens DSM 17395.
mSystems. Roč. 10, č. 8 (2025), č. článku e0041925. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cell-division * plasmids * expression * bacteria * protein * sphaeroides * pathway * set * flagellar motility * flagellar gene regulation * CtrA phosphorelay * Rhodobacterales * evolution
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 1.653, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.00419-25

Tomasch, Jurgen Petersen, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369065

0637719 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vatareck, E. - Rick, T. - Gomez, N. O. - Bandyopadhyay, A. - Krämer, J. - Strunin, D. - Erdmann, J. - Hartmann, O. - Alpers, K. - Boedeker, C. - Steffen, A. - Sieben, C. - Zhao, G. - Tomasch, Jurgen - Haeussler, S.
Epigenetic cellular memory in Pseudomonas aeruginosa generates phenotypic variation in response to host environments.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 122, č. 27 (2025), č. článku e2415345122. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: stochastic gene-expression * glycerol metabolism * noise * sequence * glpd * epigenetic memory * GlpD * Pseudomonas aeruginosa * glycerol metabolism * single-cell
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.1, rok: 2024 ; AIS: 4.117, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.pnas.org/doi/abs/10.1073/pnas.2415345122
Haeussler, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368575