Publikace ASEP
0643219 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Černayová, D. - Súkeník, M. - Obruča, S. - Smilek, J. - Kalina, M. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Sedláček, P.
Self-entrapment of Azotobacter vinelandii cultures by gelation of their exopolysaccharides: A way towards next-generation bioinoculants.
Carbohydrate Polymers. Roč. 360, 15 July (2025), č. článku 123607. ISSN 0144-8617. E-ISSN 1879-1344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
AV ČR(CZ) MSM100652102
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Azotobacter vinelandii * Alginate * Polyhydroxyalkanoates * Hydrogels * Bioinoculants
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 1.433, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0144861725003881
Sedláček, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373079
0588336 - ÚPT 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Fleischhacker-Daffert, C. - Zerobin, A. - Hummel, F. - Slaninová, E. - Kroupová, Z. - Obruča, S. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Nebesářová, Jana - Ludwig, K. - Fritz, I.
A Comparison of the Effects of Continuous Illumination and Day/Night Regimes on PHB Accumulation in Synechocystis Cells.
Life. Roč. 14, č. 7 (2024), č. článku 907. E-ISSN 2075-1729
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: poly-beta-hydroxybutyrate * Synechocystis * continuous illumination * day/night cycle * PHB * glycogen * cell size
Obor OECD: Microbiology; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.719, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2075-1729/14/7/907
Ludwig, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355244
0587565 - ÚPT 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Jurečková, K. - Nykrýnová, M. - Slaninová, E. - Fleuriot-Blitman, H. - Amstutz, V. - Heřmánková, K. - Bezdíček, M. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Zinn, M. - Obruča, S. - Sedlář, K.
Cultivation driven transcriptomic changes in the wild-type and mutant strains of Rhodospirillum rubrum.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 23, December (2024), s. 2681-2694. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Rhodospirillum rubrum * RNA-Seq * Transcriptome * Genome * Depolymerase knock-out * Gene ontology * Metabolism * Fructose * Acetate * Polyhydroxyalkanoates
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 1.423, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037024002204
Sedlář, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0354812
0643191 - ÚPT 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kroupová, Z. - Slaninová, E. - Mrázová, Kateřina - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila - Fritz, I. - Obruča, S.
Evaluating stress resilience of cyanobacteria through flow cytometry and fluorescent viability assessment.
Folia Microbiologica. Roč. 70, č. 1 (2025), s. 205-223. ISSN 0015-5632. E-ISSN 1874-9356
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Biotechnology * Cyanobacteria * Flow cytometry * Fluorescent viability probes * Stress resistance * Viability assessment
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.504, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s12223-024-01212-w
Kroupová, Z.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373062
0635880 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Láznička, Tomáš - Kizovský, Martin - Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Mrázová, Kateřina - Obruča, S. - Samek, Ota - Krzyžánek, Vladislav
Assembly for semi-correlation analysis of samples using cryogenic scanning electron microscopy and cryogenic Raman micro-spectroscopy.
Measurement Science and Technology. Roč. 36, č. 5 (2025), č. článku 055903. ISSN 0957-0233. E-ISSN 1361-6501
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo assembly * cryogenic Raman micro-spectroscopy * cryogenic scanning electron microscopy * semi-correlative imaging
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.452, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6501/adc94a
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368139
0564714 - ÚPT 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Meixner, K. - Daffert, C. - Dalnodar, D. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Nebesářová, Jana - Samek, Ota - Šedrlová, Z. - Slaninová, E. - Sedláček, P. - Obruča, S. - Fritz, I.
Glycogen, poly(3-hydroxybutyrate) and pigment accumulation in three Synechocystis strains when exposed to a stepwise increasing salt stress.
Journal of Applied Phycology. Roč. 34, č. 3 (2022), s. 1227-1241. ISSN 0921-8971. E-ISSN 1573-5176
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Salt stress * Synechocystis sp * Poly(3-hydroxybutyrate) * Glycogen * Pigments
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.492, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s10811-022-02693-3
Meixner, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336344
0604118 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Mrázová, Kateřina - Havlíčková, A. - Černayová, D. - Hrubanová, Kamila - Sedláček, P. - Krzyžánek, Vladislav
Cryo-EM as a tool for observing alginate-based hydrogels.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 28018. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA TA ČR(CZ) TN02000020
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: hydrogel * alginate * bacteria * freeze-fracture * cryo-SEM
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_28018/bioconf_emc2024_28018.html
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361469
0638974 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mrázová, Kateřina - Černayová, D. - Havlíčková, Anna - Hrubanová, Kamila - Obruča, S. - Sedláček, P. - Krzyžánek, Vladislav
Enhanced electron microscopy imaging for a detailed structural study of alginate hydrogel containing the encapsulated cells.
Carbohydrate Polymers. Roč. 368, č. 2 (2025), č. článku 124239. ISSN 0144-8617. E-ISSN 1879-1344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06757S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Alginate * Azotobacter vinelandii * electron microscopy * Encapsulation
Obor OECD: Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 1.433, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0144861725010240
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0372850
0572170 - ÚPT 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Mrázová, Kateřina - Bačovský, J. - Šedrlová, Z. - Slaninová, E. - Obruča, S. - Fritz, I. - Krzyžánek, Vladislav
Urany-Less Low Voltage Transmission Electron Microscopy: A Powerful Tool for Ultrastructural Studying of Cyanobacterial Cells.
Microorganisms. Roč. 11, č. 4 (2023), č. článku 888. ISSN 2076-2607. E-ISSN 2076-2607
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: low voltage electron microscopy * uranyl acetate * contrasting agents * transmission electron microscopy * Synechocystis * polyhydroxyalkanoates
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.87, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/11/4/888
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348036
0558021 - ÚPT 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Nováčková, I. - Kouřilová, X. - Mrázová, Kateřina - Sedláček, P. - Kalina, M. - Krzyžánek, Vladislav - Koller, M. - Obruča, S.
Combination of Hypotonic Lysis and Application of Detergent for Isolation of Polyhydroxyalkanoates from Extremophiles.
Polymers. Roč. 14, č. 9 (2022), č. článku 1761. ISSN 2073-4360. E-ISSN 2073-4360
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: polyhydroxyalkanoate (PHA) * sodium dodecyl sulfate (SDS) * PHA isolation * extremophiles * halophiles * thermophiles * Halomonas halophila * Schlegelella thermodepolymerans
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 5, rok: 2022 ; AIS: 0.606, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4360/14/9/1761
Obruča, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333404
0565356 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nováčková, I. - Hrabalová, V. - Slaninová, E. - Sedláček, P. - Samek, Ota - Koller, M. - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Nebesářová, Jana - Obruča, S.
The role of polyhydroxyalkanoates in adaptation of Cupriavidus necator to osmotic pressure and high concentration of copper ions.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 206, 1 May (2022), s. 977-989. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-20697S; GA MŠMT(CZ) LM2015062
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Adaptation * Cupriavidus necator * Heavy metals * Osmotic stress * Polyhydroxyalkanoates * Stress conditions
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 8.2, rok: 2022 ; AIS: 0.92, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813022005712
Obruča, S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336908
0640852 - ÚPT 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Plichta, Tomáš - Mrázová, Kateřina - Richterová, Veronika - Khýrová, Markéta - Lukeš, J. - Šepitka, J.
Multiscale analysis of mechanical and structural properties of agarose-silk fibroin hydrogels.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 330, č. 3 (2025), č. článku 148133. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000020; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Agarose-fibroin hydrogels * Mechanical properties and internal structure * Oscillatory rheometry * Nanoindentation * Atomic force microscopy * Scanning transmission electron microscopy
Impakt faktor: 8.5, rok: 2024 ; AIS: 1.013, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813025086908
Plichta, Tomáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0372849
0579321 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Skoupý, Radim - Boltje, D. B. - Šlouf, Miroslav - Mrázová, Kateřina - Láznička, Tomáš - Taisne, C. M. - Krzyžánek, Vladislav - Hoogenboom, J. P. - Jakobi, A. J.
Robust Local Thickness Estimation of Sub-Micrometer Specimen by 4D-STEM.
Small Methods. Roč. 7, č. 9 (2023), č. článku 2300258. ISSN 2366-9608. E-ISSN 2366-9608
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-13541S; GA TA ČR(CZ) TN01000008
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:61389013
Klíčová slova: 4D-STEM * cryo-ET * FIB milling * TEM analysis
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect) (UMCH-V)
Impakt faktor: 10.7, rok: 2023 ; AIS: 2.444, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/smtd.202300258
Krzyžánek, Vladislav
- Hoogenboom, J. P.
- Jakobi, A. J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348160
0571764 - ÚPT 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Szabová, J. - Mišík, O. - Fučík, J. - Mrázová, Kateřina - Mravcová, L. - Elcner, J. - Lízal, F. - Krzyžánek, Vladislav - Mravec, F.
Liposomal form of erlotinib for local inhalation administration and efficiency of its transport to the lungs.
International Journal of Pharmaceutics. Roč. 634, 5 March (2023), č. článku 122695. ISSN 0378-5173. E-ISSN 1873-3476
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Liposome * Non-small-cell lung cancer * Nebulization * Encapsulation * Aerodynamic particle size * Numerical simulations
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 5.3, rok: 2023 ; AIS: 0.748, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378517323001151
Szabová, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344846
0618871 - ÚPT 2025 RIV CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Trudičová, M. - Zahrádka, J. - Smilek, J. - Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Sedláček, P. - Pekař, M.
Evaulation of the applicability of various porosimetry methods in investigation of the ultrastructure of hydrogels.
NANOCON Conference Proceedings. In: NANOCON 2022 Conference Proceedings. Ostrava: Tanger Ltd., 2023, s. 284-289. ISBN 978-80-88365-09-9. ISSN 2694-930X.
[International Conference on Nanomaterials - Research & Application /14./ NANOCON. Brno (CZ), 19.10.2022-21.10.2022]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Hydrogel * polyvinyl alcohol * structural analysis
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.confer.cz/nanocon/2022/4619-evaluation-of-the-applicability-of-various-porosimetry-methods-in-investigation-of-the-ultrastructure-of-hydrogels
Trudičová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365642