Publikace ASEP
0603248 - ÚPT 2026 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Hrtoňová, Valentina - Nejedlý, Petr - Trávníček, Vojtěch - Cimbálník, J. - Matoušková, Barbora - Pail, M. - Peter-Derex, L. - Grova, C. - Gotman, J. - Halámek, Josef - Jurák, Pavel - Brázdil, M. - Klimeš, Petr - Frauscher, B.
Metrics for evaluation of automatic epileptogenic zone localization in intracranial electrophysiology.
Clinical Neurophysiology. Roč. 169, January (2025), s. 33-46. ISSN 1388-2457. E-ISSN 1872-8952
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107; GA ČR(CZ) GA22-28784S; GA MZd(CZ) NU22-08-00278
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Epilepsy * Epileptogenic zone * Seizure onset zone * Epileptogenic tissue localization * Intracranial electroencephalography * Machine learning * Binary classification * Evaluation metrics * Class imbalance
Obor OECD: Clinical neurology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.376, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1388245724003304
Klimeš, Petr
- Frauscher, B.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368300
0637184 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hrtoňová, Valentina - Jaber, K. - Nejedlý, Petr - Blackwood, E. R. - Klimeš, Petr - Frauscher, B.
The class imbalance problem in automatic localization of the epileptogenic zone for epilepsy surgery: a systematic review.
Journal of Neural Engineering. Roč. 22, č. 3 (2025), č. článku 031002. ISSN 1741-2560. E-ISSN 1741-2552
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107; GA MZd(CZ) NW25-08-00212
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: epileptogenic zone * seizure-onset zone * epilepsy surgery * intracranial electrophysiology * machine learning * class imbalance * cost-sensitive learning
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.174, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1741-2552/ade28c
Frauscher, B.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368116
0602818 - ÚPT 2025 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Chybowski, B. - Klimeš, Petr - Cimbálník, J. - Trávníček, Vojtěch - Nejedlý, Petr - Pail, Martin - Peter-Derex, L. - Hall, J. - Jurák, Pavel - Brázdil, M. - Frauscher, B.
Timing matters for accurate identification of the epileptogenic zone.
Clinical Neurophysiology. Roč. 161, May (2024), s. 1-9. ISSN 1388-2457. E-ISSN 1872-8952
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107; GA ČR(CZ) GA22-28784S; GA MZd(CZ) NU22-08-00278
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: iEEG * Epilepsy * Seizure
Obor OECD: Clinical neurology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.376, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1388245724000312
Frauscher, B.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0360143
0559662 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ivora, Adam - Viščor, Ivo - Nejedlý, Petr - Smíšek, Radovan - Koščová, Zuzana - Bulková, V. - Halámek, Josef - Jurák, Pavel - Plešinger, Filip
QRS detection and classification in Holter ECG data in one inference step.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 12641. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) FW01010305
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: ECG * Machine learning * Deep learning * QRS detection * QRS classification
Obor OECD: Medical engineering
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022 ; AIS: 1.132, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-022-16517-4
Plešinger, Filip
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335256
0597841 - ÚPT 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klimeš, Petr - Nejedlý, Petr - Hrtoňová, Valentina - Cimbálník, J. - Trávníček, Vojtěch - Pail, Martin - Peter-Derex, L. - Hall, J. - Pana, R. - Halámek, Josef - Jurák, Pavel - Brázdil, M. - Frauscher, B.
Interictal stereo-electroencephalography features below 45 Hz are sufficient for correct localization of the epileptogenic zone and postsurgical outcome prediction.
Epilepsia. Roč. 65, č. 10 (2024), s. 2935-2945. ISSN 0013-9580. E-ISSN 1528-1167
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-28784S; GA MZd(CZ) NU22-08-00278; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: EEG * epilepsy * high-frequency oscillations * interictal epileptoform discharges * machine learning
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 6.6, rok: 2024 ; AIS: 1.962, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/epi.18081
Klimeš, Petr
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355663
0583012 - ÚPT 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Koščová, Zuzana - Smíšek, Radovan - Nejedlý, Petr - Halámek, Josef - Jurák, Pavel - Leinveber, P. - Čurila, K. - Plešinger, Filip
Ultra-High Frequency ECG Deep-Learning Beat Detector Delivering QRS Onsets and Offsets.
2022 Computing in Cardiology (CinC). New York: IEEE, 2022, 2022-eptember (2022), č. článku 230. ISBN 979-8-3503-0097-0. ISSN 2325-8861. E-ISSN 2325-887X.
[Computing in Cardiology 2022 /49./. Tampere (FI), 04.09.2022-07.09.2022]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: QRS duration * ultra-high-frequency ECG * deep learning
Obor OECD: Medical engineering
https://ieeexplore.ieee.org/document/10081715
https://www.cinc.org/archives/2022/pdf/CinC2022-230.pdf
Koščová, Zuzana
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351424
0554373 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mívalt, F. - Křemen, V. - Sladký, V. - Balzekas, I. - Nejedlý, Petr - Gregg, N. M. - Lundstrom, B. N. - Lepková, K. - Přidalová, T. - Brinkmann, B. H. - Jurák, Pavel - Van Gompel, J. J. - Miller, K. - Denison, T. - St Louis, E. K. - Worrell, G. A.
Electrical brain stimulation and continuous behavioral state tracking in ambulatory humans.
Journal of Neural Engineering. Roč. 19, č. 1 (2022), č. článku 016019. ISSN 1741-2560. E-ISSN 1741-2552
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: electrical brain stimulation * deep brain stimulation * implantable devices * automated sleep scoring * ambulatory intracranial EEG * epilepsy
Obor OECD: Medical engineering
Impakt faktor: 4, rok: 2022 ; AIS: 1.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1741-2552/ac4bfd
Křemen, V.
- Worrell, G. A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333660
0557480 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nejedlý, Petr - Ivora, Adam - Viščor, Ivo - Koščová, Zuzana - Smíšek, Radovan - Jurák, Pavel - Plešinger, Filip
Classification of ECG using ensemble of residual CNNs with or without attention mechanism.
Physiological Measurement. Roč. 43, č. 4 (2022), č. článku 044001. ISSN 0967-3334. E-ISSN 1361-6579
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) FW01010305
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: ECG * classification * deep learning * PhysioNet challenge 2021 * attention mechanism
Obor OECD: Medical engineering
Impakt faktor: 3.2, rok: 2022 ; AIS: 0.646, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6579/ac647c
Nejedlý, Petr
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333433
0643250 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nejedlý, Petr - Hrtoňová, Valentina - Pail, Martin - Cimbálník, J. - Daniel, P. - Trávníček, Vojtěch - Doležalová, I. - Mívalt, F. - Křemen, V. - Jurák, Pavel - Worrell, G. A. - Frauscher, B. - Klimeš, Petr - Brázdil, M.
Leveraging interictal multimodal features and graph neural networks for automated planning of epilepsy surgery.
Brain communications. Roč. 7, č. 3 (2025), č. článku fcaf140. E-ISSN 2632-1297
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-08-00278; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: epilepsy * surgery * graph neural networks * iEEG * MRI
Obor OECD: Clinical neurology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.751, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/braincomms/article/7/3/fcaf140/8114735
Nejedlý, Petr
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373177
0583010 - ÚPT 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Nejedlý, Petr - Pavlus, Ján - Smíšek, Radovan - Vargová, Enikö - Koščová, Zuzana - Viščor, Ivo - Jurák, Pavel - Plešinger, Filip
Utilization of Deep Learning and Expert Feature Classifier for Detection of Heart Murmurs.
2022 Computing in Cardiology (CinC). New York: IEEE, 2022, 2022-eptember (2022), č. článku 041. ISBN 979-8-3503-0097-0. ISSN 2325-8861. E-ISSN 2325-887X.
[Computing in Cardiology 2022 /49./. Tampere (FI), 04.09.2022-07.09.2022]
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) FW01010305
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: heart murmurs * deep learning * classification
Obor OECD: Medical engineering
https://ieeexplore.ieee.org/document/10081763
https://www.cinc.org/archives/2022/pdf/CinC2022-041.pdf
Nejedlý, Petr
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351652
0571948 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nejedlý, Petr - Křemen, V. - Lepková, K. - Mívalt, F. - Sladký, V. - Přidalová, Tereza - Plešinger, Filip - Jurák, Pavel - Pail, Martin - Brázdil, M. - Klimeš, Petr - Worrell, G. A.
Utilization of temporal autoencoder for semi-supervised intracranial EEG clustering and classification.
Scientific Reports. Roč. 13, č. 1 (2023), č. článku 744. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-08-00278; GA MZd(CZ) NV19-04-00343
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: temporal autoencoder * EEG
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023 ; AIS: 1.061, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-023-27978-6
Nejedlý, Petr Křemen, V.
- Worrell, G. A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345011
0582514 - ÚPT 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Pavlus, Ján - Pijáčková, Kristýna - Koščová, Zuzana - Smíšek, Radovan - Viščor, Ivo - Trávníček, Vojtěch - Nejedlý, Petr - Plešinger, Filip
Using Embedding Extractor and Transformer Encoder for Predicting Neurological Recovery from Coma After Cardiac Arrest.
2023 Computing in Cardiology (CinC). New York: IEEE, 2023. ISBN 979-8-3503-8252-5. ISSN 2325-8861. E-ISSN 2325-887X.
[Computing in Cardiology 2023 /50./. Atlanta (US), 01.10.2023-04.10.2023]
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) FW06010766
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Deep learning * Pipelines * Cardiac arrest * Medical services * Predictive models * Electrocardiography * Brain modeling
Obor OECD: Medical engineering
https://www.cinc.org/archives/2023/pdf/CinC2023-054.pdf
https://ieeexplore.ieee.org/document/10364171
Pavlus, Ján
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0350908
0577393 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pijáčková, Kristýna - Nejedlý, Petr - Křemen, V. - Plešinger, Filip - Mívalt, F. - Lepková, K. - Pail, Martin - Jurák, Pavel - Worrell, G. A. - Brázdil, M. - Klimeš, Petr
Genetic algorithm designed for optimization of neural network architectures for intracranial EEG recordings analysis.
Journal of Neural Engineering. Roč. 20, č. 3 (2023), č. článku 036034. ISSN 1741-2560. E-ISSN 1741-2552
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU22-08-00278; GA ČR(CZ) GA22-28784S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: intracranial EEG * genetic algorithms * optimization * neural network * deep learning
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 1.233, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1741-2552/acdc54
Pijáčková, Kristýna
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348045
0604706 - ÚPT 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Plešinger, Filip - Hassouna, S. - Čarná, Z. - Veselá, J. - Smíšek, Radovan - Vargová, Enikö - Sobota, V. - Koščová, Zuzana - Nejedlý, Petr - Viščor, Ivo - Prinzen, F. W. - Jurák, Pavel - Halámek, Josef - Osmančík, P.
Automatically optimized vectorcardiographic features are associated with recurrence of atrial fibrillation after electrical cardioversion.
Scientific Reports. Roč. 15, č. 1 (2025), č. článku 1257. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: ECG * VCG * Cardioversion * Signal processing * Atrial fibrillation
Obor OECD: Medical engineering
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-025-85340-4
Plešinger, Filip
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368164
0565476 - ÚPT 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Plešinger, Filip - Nejedlý, Petr - Koščová, Zuzana - Rohr, M. - Viščor, Ivo - Smíšek, Radovan - Ivora, Adam - Leinveber, P. - Čurila, K. - Antink, C. H.
DeepPlayer: An open-source SignalPlant plugin for deep learning inference.
Software-Practice & Experience. Roč. 53, č. 2 (2023), s. 455-464. ISSN 0038-0644. E-ISSN 1097-024X
AV ČR(CZ) StrategieAV21/26
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: artificial intelligence * deep learning * signal processing * SignalPlant * software
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 2.6, rok: 2023 ; AIS: 0.451, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/spe.3159
Plešinger, Filip
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0337016
0583011 - ÚPT 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Plešinger, Filip - Ivora, Adam - Vargová, Enikö - Smíšek, Radovan - Pavlus, Ján - Koščová, Zuzana - Nejedlý, Petr - Bulková, V. - Kozubík, R. - Halámek, Josef - Jurák, Pavel
Scalable, Multiplatform, and Autonomous ECG Processor Supported by AI for Telemedicine Center.
2022 Computing in Cardiology (CinC). New York: IEEE, 2022, 2022-eptember (2022), č. článku 052. ISBN 979-8-3503-0097-0. ISSN 2325-8861. E-ISSN 2325-887X.
[Computing in Cardiology 2022 /49./. Tampere (FI), 04.09.2022-07.09.2022]
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) FW01010305
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: software * AI * ECG * analysis
Obor OECD: Medical engineering
https://ieeexplore.ieee.org/document/10081823
https://www.cinc.org/archives/2022/pdf/CinC2022-052.pdf
Plešinger, Filip
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351425
0558868 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Sladký, V. - Nejedlý, Petr - Mívalt, F. - Brinkmann, B. H. - Kim, I. - St Louis, E. K. - Gregg, N. M. - Lundstrom, B. N. - Crowe, C. M. - Attia, T. P. - Crepeau, D. - Balzekas, I. - Marks, V. S. - Wheeler, L. P. - Cimbálník, J. - Cook, M. - Janča, R. - Sturges, B. K. - Leyde, K. - Miller, K. J. - Van Gompel, J. J. - Denison, T. - Worrell, G. A. - Křemen, V.
Distributed brain co-processor for tracking spikes, seizures and behaviour during electrical brain stimulation.
Brain communications. Roč. 4, č. 3 (2022), č. článku fcac115. E-ISSN 2632-1297
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18056
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: epilepsy * seizures * electrophysiology * machine learning
Obor OECD: Medical engineering
Impakt faktor: 4.8, rok: 2022 ; AIS: 1.574, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/braincomms/article/4/3/fcac115/6581724
Worrell, G. A.
- Křemen, V.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333248