Nápověda

Samek Ota

Publikace ASEP

RIV ID 7619456
Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 25

0643166 - ÚPT 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Adhvaryu, S. - Kisková, J. - Piknová, M. - Malinicová, L. - Beck, T. - Buchtíková, I. - Kouřilová, X. - Kizovský, Martin - Samek, Ota - Obruča, S. - Pristas, P.
The characterization of halophilic polyhydroxyalkanoate-producing bacteria from brine in Solivar near Prešov (Slovakia).
World Journal of Microbiology and Biotechnology. Roč. 41, č. 12 (2025), č. článku 505. ISSN 0959-3993. E-ISSN 1573-0972
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023050
AV ČR(CZ) StrategieAV21/27
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: PHA * Brine * Halophilic bacteria * Halomonadaceae family * Raman spectroscopy
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2024 ; AIS: 0.747, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007/s11274-025-04737-5
Kisková, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373024

0618022 - ÚPT 2025 RIV CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Benešová, Markéta - Bernatová, Silvie - Pilát, Zdeněk - Motlová, Tereza - Pokorná, Zuzana - Mika, Filip - Ježek, Jan - Kizovský, Martin - Mikulová, Adéla - Samek, Ota
Analysis of bacteria using surface-enhanced Raman scattering.
LA64. Sborník příspěvků multioborové konference LASER64. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2024 - (Mikel, B.), s. 7-11. ISBN 978-80-87441-34-3.
[LASER64. Třešť (CZ), 13.11.2024-15.11.2024]
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * diagnostics * SERS * single-cell detection
Obor OECD: Analytical chemistry
Benešová, Markéta
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364854

0570271 - ÚPT 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Benešová, Markéta - Bernatová, Silvie - Mika, Filip - Pokorná, Zuzana - Ježek, Jan - Šiler, Martin - Samek, Ota - Růžička, F. - Rebrošová, K. - Zemánek, Pavel - Pilát, Zdeněk
SERS-Tags: Selective Immobilization and Detection of Bacteria by Strain-Specific Antibodies and Surface-Enhanced Raman Scattering.
Biosensors. Roč. 13, č. 2 (2023), č. článku 182. E-ISSN 2079-6374
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341
AV ČR(CZ) MSM100652101
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: SERS-tag * Escherichia coli * sandwich immunoassay * single-cell detection
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2023 ; AIS: 0.765, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2079-6374/13/2/182
Samek, Ota
- Pilát, Zdeněk
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344482

0583656 - ÚPT 2024 RIV CZ cze C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Benešová, Markéta - Bernatová, Silvie - Samek, Ota - Pokorná, Zuzana - Mika, Filip - Kizovský, Martin - Pilát, Zdeněk
SERS-TAGS: Selektivní imobilizace a detekce bakterií pomocí specifických protilátek a povrchově zesíleného Ramanova rozptylu.
[SERS-TAGS: Selective immobilization and detection of bacteria using specific antibodies and surface-enhanced Raman scattering.]
LA63. Sborník příspěvků multioborové konference LASER63. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2023 - (Mikel, B.), s. 9-12. ISBN 978-80-87441-32-9.
[LASER63. Třešť (CZ), 18.10.2023-20.10.2023]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * SERS * diagnostcs * SERS-labels
Obor OECD: Analytical chemistry
Benešová, Markéta
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351680

0567619 - ÚPT 2023 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Bernatová, Silvie - Kizovský, Martin - Donato, M. G. - Foti, A. - Zemánek, Pavel - Samek, Ota - Marago, O. M. - Ježek, Jan - Gucciardi, P. G. … celkem 10 autorů
Detection of Plastic Nanoparticles in Aqueous Enviroment Based on Optical Manipulation in Combination with Raman Spectroscopy.
2022 IEEE International Workshop on Metrology for the Sea, Learning to Measure Sea Health Parameters (MetroSea). Proceedings. New York: IEEE, 2022, (2022), s. 349-352. ISBN 978-1-6654-9942-2.
[2022 IEEE International Workshop on Metrology for the Sea. Milazzo (IT), 03.10.2022-05.10.2022]
AV ČR(CZ) MSM100652101
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: microplastics * nanoplastics * plasmonics * Surface Enhanced Raman Spectroscopy * thermoplasmonics
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://ieeexplore.ieee.org/document/9950839
Bernatová, Silvie
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0338854

0568149 - ÚPT 2023 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Bernatová, Silvie - Kizovský, Martin - Donato, M. G. - Foti, A. - Samek, Ota - Ježek, Jan - Maragò, O. M. - Zemánek, Pavel - Gucciardi, P. G.
Optical force aggregation of gold nanoparticles as a tool to fabrication a multifunctional sensor.
22nd Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics. Bellingham: SPIE, 2022 - (Masajada, J.; Urbańczyk, W.), č. článku 125020U. Proceedings of SPIE, 12502. ISBN 978-1-5106-6112-7. ISSN 0277-786X. E-ISSN 1996-756X.
[Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics /22./. Wojanów (PL), 05.09.2022-09.09.2022]
AV ČR(CZ) MSM100652101
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: nanoplastics * optical printing * optical pushing * sensor * surface enhanced Raman spectroscopy
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12502/2664176/Optical-force-aggregation-of-gold-nanoparticles-as-a-tool-to/10.1117/12.2664176.short

Bernatová, Silvie Gucciardi, P. G.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339490

0618026 - ÚPT 2025 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Faruzelová, A. - Holub, D. - Parobková, V. - Vrlíková, L. - Štembírek, Jan - Buchtová, Marcela - Kizovský, Martin - Samek, Ota - Zikmund, T. - Pořízka, P. - Kaiser, J.
Correlative imaging for the characterisation of human teeth ankylosis.
LA64. Sborník příspěvků multioborové konference LASER64. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2024 - (Mikel, B.), s. 22-23. ISBN 978-80-87441-34-3.
[LASER64. Třešť (CZ), 13.11.2024-15.11.2024]
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:67985904
Klíčová slova: laser-induced breakdown spectroscopy * Raman spectroscopy * micro-computed tomography * histology
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Faruzelová, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364856

0638398 - ÚPT 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Ghazalová, Mona - Modlitbová, Pavlína - Samek, Ota - Rebrošová, K. - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Pilát, Zdeněk
Surface-Enhanced Raman Spectroscopy for Adenine Detection in Five Selected Bacterial Strains Under Stress Conditions.
Sensors. Roč. 25, č. 15 (2025), č. článku 4629. ISSN 1424-8220. E-ISSN 1424-8220
GRANT EU: European Commission(XE) 101135175 - uCAIR
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: SERS * Ag-NPs * Au-NPs * phenylalanine * Escherichia coli * Staphylococcus aureus
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 0.618, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1424-8220/25/15/4629
Samek, Ota
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369067

0560125 - ÚPT 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Holub, D. - Pořízka, P. - Kizovský, Martin - Procházka, D. - Samek, Ota - Kaiser, J.
The potential of combining laser-induced breakdown spectroscopy and Raman spectroscopy data for the analysis of wood samples.
Spectrochimica Acta Part B: Atomic Spectroscopy. Roč. 195, September (2022), č. článku 106487. ISSN 0584-8547. E-ISSN 1873-3565
AV ČR(CZ) StrategieAV21/3
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Laser-induced breakdown spectroscopy * Raman spectroscopy * Data correlation * Wood samples * Tissues analysis * Lignin * Cellulose * Nutrition elements
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.542, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0584854722001318
Samek, Ota
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333615

0587448 - ÚPT 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Khan, A. - Qadeer, A. - Wajid, A. - Ullah, Q. - Rahman, S. U. - Ullah, K. - Safi, S. Z. - Tichá, L. - Skaličková, S. - Chilala, P. - Bernatová, Silvie - Samek, Ota - Horký, P.
Microplastics in animal nutrition: Occurrence, spread, and hazard in animals.
Journal of Agriculture and Food Research. Roč. 17, September (2024), č. článku 101258. ISSN 2666-1543. E-ISSN 2666-1543
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) SS06020224
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Microplastic * Environmental contaminant * Gastrointestinal tract * Hazard
Obor OECD: Agricultural biotechnology and food biotechnology
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 0.823, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666154324002953
Qadeer, A.
- Horký, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354645

0635880 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Láznička, Tomáš - Kizovský, Martin - Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Mrázová, Kateřina - Obruča, S. - Samek, Ota - Krzyžánek, Vladislav
Assembly for semi-correlation analysis of samples using cryogenic scanning electron microscopy and cryogenic Raman micro-spectroscopy.
Measurement Science and Technology. Roč. 36, č. 5 (2025), č. článku 055903. ISSN 0957-0233. E-ISSN 1361-6501
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo assembly * cryogenic Raman micro-spectroscopy * cryogenic scanning electron microscopy * semi-correlative imaging
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.452, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6501/adc94a
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368139

0588338 - ÚPT 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Lee, K. S. - Landry, Z. - Athar, A. - Alcolombri, U. - Ayutthaya, P. P. N. - Berry, D. - de Bettignies, P. - Cheng, J.-X. - Csucs, G. - Cui, L. - Deckert, V. - Dieing, T. - Dionne, J. - Doskočil, Ondřej - D'Souza, G. - Garcia-Timermans, C. - Gierlinger, N. - Goda, K. - Hatzenpichler, R. - Henshaw, R. J. - Huang, W. E. - Iermak, I. - Ivleva, N. P. - Kneipp, J. - Kubryk, P. - Pilát, Zdeněk - Plešinger, Filip - Samek, Ota … celkem 61 autorů
MicrobioRaman: an open-access web repository for microbiological Raman spectroscopy data.
Nature Microbiology. Roč. 9, č. 5 (2024), s. 1152-1156. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: repository * open-access * Raman spectra * microbiology
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 19.4, rok: 2024 ; AIS: 8.208, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41564-024-01656-3
Lee, K. S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355368

0564714 - ÚPT 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Meixner, K. - Daffert, C. - Dalnodar, D. - Mrázová, Kateřina - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav - Nebesářová, Jana - Samek, Ota - Šedrlová, Z. - Slaninová, E. - Sedláček, P. - Obruča, S. - Fritz, I.
Glycogen, poly(3-hydroxybutyrate) and pigment accumulation in three Synechocystis strains when exposed to a stepwise increasing salt stress.
Journal of Applied Phycology. Roč. 34, č. 3 (2022), s. 1227-1241. ISSN 0921-8971. E-ISSN 1573-5176
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF19-29651L; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Salt stress * Synechocystis sp * Poly(3-hydroxybutyrate) * Glycogen * Pigments
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.492, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s10811-022-02693-3
Meixner, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0336344

0584387 - ÚPT 2024 RIV CZ cze C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Mikulová, Adéla - Petříčková, K. - Bobek, J. - Chroňáková, Alica - Samek, Ota - Pilát, Zdeněk
Analýza sekundárních metabolitů streptomycet Ramanovou spektroskopií in vivo.
[Analysis of secondary metabolites from Streptomyces by Raman spectroscopy in vivo.]
LA63. Sborník příspěvků multioborové konference LASER63. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2023 - (Mikel, B.), s. 57-60. ISBN 978-80-87441-32-9.
[LASER63. Třešť (CZ), 18.10.2023-20.10.2023]
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341; GA MZd(CZ) NV17-30091A
AV ČR(CZ) StrategieAV21/26; AV ČR(CZ) StrategieAV21/21
StrategieAV; StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Raman spectroscopy * microbiology * Streptomyces * antibiotics
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics); Biochemical research methods (BC-A)
Mikulová, Adéla
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0352301

0618093 - ÚPT 2025 RIV CZ cze C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Mikulová, Adéla - Petříčková, K. - Bobek, J. - Chroňáková, Alica - Szczeblewski, P. - Borzyszkowska-Bukowska, J. - Samek, Ota - Pilát, Zdeněk
In vivo detekce sekundárních metabolitů u bakterií rodu Streptomyces pomocí Ramanovy mikrospektroskopie.
[In vivo detection of secondary metabolites in bacteria of the genus Streptomyces by Raman microspectroscopy.]
LA64. Sborník příspěvků multioborové konference LASER64. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2024 - (Mikel, B.), s. 59-63. ISBN 978-80-87441-34-3.
[LASER64. Třešť (CZ), 13.11.2024-15.11.2024]
AV ČR(CZ) StrategieAV21/21
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Raman spectroscopy * Streptomyces * secondary metabolites
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics); Microbiology (BC-A)
Mikulová, Adéla
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364952

0565356 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nováčková, I. - Hrabalová, V. - Slaninová, E. - Sedláček, P. - Samek, Ota - Koller, M. - Krzyžánek, Vladislav - Hrubanová, Kamila - Mrázová, Kateřina - Nebesářová, Jana - Obruča, S.
The role of polyhydroxyalkanoates in adaptation of Cupriavidus necator to osmotic pressure and high concentration of copper ions.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 206, 1 May (2022), s. 977-989. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-20697S; GA MŠMT(CZ) LM2015062
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Adaptation * Cupriavidus necator * Heavy metals * Osmotic stress * Polyhydroxyalkanoates * Stress conditions
Obor OECD: Electrical and electronic engineering; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 8.2, rok: 2022 ; AIS: 0.92, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813022005712
Obruča, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0336908

0598506 - ÚPT 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Parobková, V. - Holub, D. - Kizovský, Martin - Kalčíková, G. - Rozman, U. - Urík, M. - Novotný, K. - Samek, Ota - Zikmund, T. - Pořízka, P. - Kaiser, J.
Raman microspectroscopy and laser-induced breakdown spectroscopy for the analysis of polyethylene microplastics in human soft tissues.
Heliyon. Roč. 10, č. 18 (2024), č. článku e37844. ISSN 2405-8440. E-ISSN 2405-8440
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) SS06020224
AV ČR(CZ) StrategieAV21/27
StrategieAV
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Health hazards * Exposure * Plastic pollution * Polyethylene * Microplastics * Tissue analysis * Human tonsils * Raman spectroscopy * Laser-induced breakdown spectroscopy * LIBS
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.613, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2405844024138753
Pořízka, P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356168

0636182 - ÚPT 2026 RIV NL eng M - Část monografie knihy
Pořízka, P. - Holub, D. - Kizovský, Martin - Samek, Ota - Kaiser, J. - Kalčikova, G.
Hyphenated Raman and laser spectroscopy for the characterization of microplastics in tissues.
Applied Raman Spectroscopy. Concepts, Instrumentation, Chemometrics, and Life Science Applications. Amsterdam: Elsevier, 2025 - (Singh, V.), s. 441-451. ISBN 978-0-443-21834-7
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * laser-induced breakdown spectroscopy * hyphenated methods * laser-based techniques * microplastics * model organisms * soft tissues * chemical analysis * elemental analysis
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/B9780443218347000268
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367177

0565479 - ÚPT 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pořízka, P. - Brunnbauer, L. - Porkert, M. - Rozman, U. - Marolt, G. - Holub, D. - Kizovský, Martin - Benešová, Markéta - Samek, Ota - Limbeck, A. - Kaiser, J. - Kalčíková, G.
Laser-based techniques: Novel tools for the identification and characterization of aged microplastics with developed biofilm.
Chemosphere. Roč. 313, February (2023), č. článku 137373. ISSN 0045-6535. E-ISSN 1879-1298
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Ageing * Biofilm * Detection * Microplastics * Spectroscopic methods
Obor OECD: Environmental sciences (social aspects to be 5.7)
Impakt faktor: 8.1, rok: 2023 ; AIS: 1.217, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0045653522038668
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0337019

0565445 - ÚPT 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Rebrošová, K. - Samek, Ota - Kizovský, Martin - Bernatová, Silvie - Holá, V. - Růžička, F.
Raman Spectroscopy - A Novel Method for Identification and Characterization of Microbes on a Single-Cell Level in Clinical Settings.
Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. Roč. 12, 22 April (2022), č. článku 866463. ISSN 2235-2988. E-ISSN 2235-2988
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * Raman tweezers * identification of microorganisms * antimicrobial resistance * microfluidic devices * magnetic beads * diagnostics
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022 ; AIS: 1.191, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2022.866463/full
Holá, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0336976

0553555 - ÚPT 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Rebrošová, K. - Bernatová, Silvie - Šiler, Martin - Uhlířová, M. - Samek, Ota - Ježek, Jan - Holá, V. - Růžička, F. - Zemánek, Pavel
Raman spectroscopy - a tool for rapid differentiation among microbes causing urinary tract infections.
Analytica Chimica Acta. Roč. 1191, 25 January (2022), č. článku 339292. ISSN 0003-2670. E-ISSN 1873-4324
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341; GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * Urinary tract infections * Raman tweezers * Optical trapping * Bacteria
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 6.2, rok: 2022 ; AIS: 0.936, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003267021011181
Rebrošová, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333541

0574930 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rebrošová, K. - Bernatová, Silvie - Šiler, Martin - Mašek, Jan - Samek, Ota - Ježek, Jan - Kizovský, Martin - Holá, V. - Zemánek, Pavel - Růžička, F.
Rapid Identification of Pathogens Causing Bloodstream Infections by Raman Spectroscopy and Raman Tweezers.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, č. 3 (2023), č. článku e0002823. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341; GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:68081707
Klíčová slova: Raman spectroscopy * bloodstream infections * diagnostics * sepsis * bacteria * Candida * Raman tweezers
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics); Microbiology (BFU-R)
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 1.02, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.00028-23

Rebrošová, K. Růžička, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344987

0577394 - ÚPT 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Siems, K. - Runzheimer, K. - Rebrošová, K. - Etzbach, L. - Auerhammer, A. - Rehm, A. - Schwengers, O. - Šiler, Martin - Samek, Ota - Růžička, F. - Moeller, R.
Identification of staphyloxanthin and derivates in yellow-pigmented Staphylococcus capitis subsp. capitis.
Frontiers in Microbiology. Roč. 14, 29 September (2023), č. článku 1272734. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Staphylococcus capitis * staphyloxanthin * coagulase-negative staphylococci (CoNS) * carotenoids * bacterial pigments
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4, rok: 2023 ; AIS: 1.049, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2023.1272734/full
Moeller, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348042

0579195 - ÚPT 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Tarbajová, V. - Koláčková, M. - Chaloupsky, P. - Dobešová, M. - Cápal, Petr - Pilát, Zdeněk - Samek, Ota - Zemánek, Pavel - Švec, P. - Skopalová Štěrbová, D. - Vaculovičová, M. - Richtera, L. - Pérez-de-Mora, A. - Adam, V. - Húska, D.
Physiological and transcriptome profiling of Chlorella sorokiniana: A study on azo dye wastewater decolorization.
Journal of Hazardous Materials. Roč. 460, 15 October (2023), č. článku 132450. ISSN 0304-3894. E-ISSN 1873-3336
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:61389030
Klíčová slova: pigment * Microalgae * bioremediation * RNA-seq * Raman micro-spectroscopy * Fourier transform infrared spectroscopy
Obor OECD: Analytical chemistry; Environmental sciences (social aspects to be 5.7) (UEB-Q)
Impakt faktor: 12.2, rok: 2023 ; AIS: 1.947, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304389423017338
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348044

0579192 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vaculík, Ondřej - Bernatová, Silvie - Rebrošová, K. - Samek, Ota - Šilhan, Lukáš - Růžička, F. - Šerý, Mojmír - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Zemánek, Pavel
Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods.
Biomedical Optics Express. Roč. 14, č. 12 (2023), s. 6410-6421. ISSN 2156-7085. E-ISSN 2156-7085
Grant CEP: GA MPO(CZ) FV40455; GA TA ČR(CZ) FW06010453; GA MZd(CZ) NU21-05-00341
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman tweezers * blood serum * Raman spectroscopy * bloodstream infections * diagnostics * sepsis
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2023 ; AIS: 0.719, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/boe/fulltext.cfm?uri=boe-14-12-6410&id=542842
Vaculík, Ondřej
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348043