Čižmár Tomáš

Publikace ASEP

RIV ID 5681421

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 17

0557832 - ÚPT 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Abdelfattah, A. S. - Ahuja, S. - Akkin, T. - Allu, S. R. - Brake, J. - Boas, D. A. - Buckley, E. M. - Campbell, R. E. - Chen, A. I. - Cheng, X. - Čižmár, Tomáš - Costantini, I. - De Vittorio, M. - Devor, A. - Doran, P. R. - El Khatib, M. - Emiliani, V. - Fomin-Thunemann, N. - Fainman, Y. - Fernandez-Alfonso, T. - Ferri, C. G. L. - Gilad, A. - Han, X. - Harris, A. - Hillman, E. M. C. - Hochgeschwender, U. - Holt, M. G. - Ji, N. - Ondráčková, Petra - Uhlířová, Hana … celkem 71 autorů
Neurophotonic tools for microscopic measurements and manipulation: status report.
Neurophotonics. Roč. 9, S1 (2022), č. článku 013001. ISSN 2329-423X. E-ISSN 2329-4248
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
GRANT EU: European Commission(XE) 101016787 - DEEPER
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: optical imaging * molecular sensors * optogenetics * fluorescence * label free * blood flow * multimodal
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 5.3, rok: 2022 ; AIS: 1.113, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.spiedigitallibrary.org/journals/neurophotonics/volume-9/issue-S1/013001/Neurophotonic-Tools-for-Microscopic-Measurements-and-Manipulation-Status-Report/10.1117/1.NPh.9.S1.013001.full
Devor, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335301

0566874 - ÚPT 2023 RIV CN eng J - Článek v odborném periodiku
Būtaitė, U. G. - Kupianskyi, H. - Čižmár, Tomáš - Phillips, D. B.
How to Build the “Optical Inverse” of a Multimode Fibre.
Intelligent Computing. Roč. 2022, 17 November (2022), č. článku 9816026. E-ISSN 2771-5892
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: multimode optical fibres
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Způsob publikování: Open access
https://spj.science.org/doi/10.34133/2022/9816026

Būtaitė, U. G. Phillips, D. B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0338142

0574149 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cao, H. - Čižmár, Tomáš - Turtaev, S. - Tyc, Tomáš - Rotter, S.
Controlling light propagation in multimode fibers for imaging, spectroscopy, and beyond.
Advances in Optics and Photonics. Roč. 15, č. 2 (2023), s. 524-612. ISSN 1943-8206
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
GRANT EU: European Commission(XE) 101016787 - DEEPER; European Commission(XE) 101082088 - StrokeGATE
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: multimode fibers * light transport
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 25.2, rok: 2023 ; AIS: 7.984, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/aop/abstract.cfm?URI=aop-15-2-524
https://arxiv.org/pdf/2305.09623

Cao, H. Čižmár, Tomáš
- Rotter, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344713

0598854 - ÚPT 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Du, Y. - Dylda, E. - Stibůrek, Miroslav - Gomes, A. D. - Turtaev, S. - Pakan, J. M. P. - Čižmár, Tomáš
Advancing the path to in-vivo imaging in freely moving mice via multimode-multicore fiber based holographic endoscopy.
Neurophotonics. Roč. 11, S1 (2024), č. článku S11506. ISSN 2329-423X. E-ISSN 2329-4248
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
GRANT EU: European Commission(XE) 101082088 - StrokeGATE
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: optogenetics * microscopy * multimode fiber * multicore fiber * in-vivo imaging * freely moving * fiber connection * holographic endoscopy
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.287, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.spiedigitallibrary.org/journals/neurophotonics/volume-11/issue-S1/S11506/Advancing-the-path-to-in-vivo-imaging-in-freely-moving/10.1117/1.NPh.11.S1.S11506.full
Du, Y.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358108

0564722 - ÚPT 2023 RIV CN eng J - Článek v odborném periodiku
Du, Y. - Turtaev, S. - Leite, I. T. - Lorenz, A. - Kobelke, J. - Wondraczek, K. - Čižmár, Tomáš
Hybrid multimode - multicore fibre based holographic endoscope for deep-tissue neurophotonics.
Light: Advanced Manufacturing. Roč. 3, č. 3 (2022), č. článku 29. ISSN 2689-9620
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Multimode fibre * Multicore fibre * Fibre-based imaging * Microendoscopy * Endomicroscopy * Holographic endoscopy
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Způsob publikování: Open access
https://www.light-am.com/article/doi/10.37188/lam.2022.029
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0336346

0560342 - ÚPT 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gigan, S. - Katz, O. - de Aguiar, H. B. - Andresen, E. R. - Aubry, A. - Bertolotti, J. - Bossy, E. - Bouchet, D. - Brake, J. - Brasselet, S. - Bromberg, Y. - Cao, H. - Chaigne, T. - Cheng, Z. - Choi, W. - Čižmár, Tomáš - Cui, M. - Curtis, V. R. - Defienne, H. - Hofer, M. - Horisaki, R. - Horstmeyer, R. - Ji, N. - LaViolette, A. K. - Mertz, J. - Moser, C. - Mosk, A. P. - Pegard, N. C. - Piestun, R. - Popoff, S. … celkem 45 autorů
Roadmap on wavefront shaping and deep imaging in complex media.
Journal of Physics: Photonics. Roč. 4, č. 4 (2022), č. článku 042501. ISSN 2515-7647. E-ISSN 2515-7647
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: wavefront shaping * microscopy * imaging * multimode fibers * adaptive optics * mesoscopic physics * scattering
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022 ; AIS: 0.981, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/2515-7647/ac76f9

Gigan, S. Katz, O.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333309

0557106 - ÚPT 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gomes, A. D. - Turtaev, S. - Du, Y. - Čižmár, Tomáš
Near perfect focusing through multimode fibres.
Optics Express. Roč. 30, č. 7 (2022), s. 10645-10663. ISSN 1094-4087
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
GRANT EU: European Commission(XE) 101016787 - DEEPER
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: scattering medium * transmission * light
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022 ; AIS: 0.781, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/oe/fulltext.cfm?uri=oe-30-7-10645&id=470425
Gomes, A. D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333538

0552078 - ÚPT 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Jákl, Petr - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Cifuentes, Angel S. - Traegaardh, Johanna - Zemánek, Pavel - Čižmár, Tomáš
Endoscopic Imaging Using a Multimode Optical Fibre Calibrated with Multiple Internal References.
Photonics. Roč. 9, č. 1 (2022), č. článku 37. E-ISSN 2304-6732
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: fibre endoscopy * spatial light modulator * transmission matrix
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022 ; AIS: 0.426, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2304-6732/9/1/37
Jákl, Petr
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0327230

0587927 - ÚPT 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Michálková, Ivana - Colombel, S. - Gomes, A. D. - Čižmár, Tomáš
Generating Airy beams through multimode fibres.
Optics Express. Roč. 32, č. 5 (2024), s. 6838-6847. ISSN 1094-4087
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
GRANT EU: European Commission(XE) 101016787 - DEEPER; European Commission(XE) 101082088 - StrokeGATE
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: light-sheet microscopy * confocal microscopy * resolution * transmission
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.3, rok: 2024 ; AIS: 0.654, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/oe/fulltext.cfm?uri=oe-32-5-6838&id=546513
Gomes, A. D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355001

0572453 - ÚPT 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Phillips, D. B. - Li, S. - Būtaitė, U. G. - Kupianskyi, H. - Horsley, S. A. R. - Čižmár, Tomáš
New ways to look through multimode optical fibres.
Adaptive Optics and Wavefront Control for Biological Systems IX. Bellingham: SPIE, 2023 - (Bifano, T.; Ji, N.; Tian, L.), (2023), č. článku 123880E. Proceedings of SPIE, Progress in Biomedical Optics and Imaging, 12388. ISBN 9781510658813. ISSN 1605-7422.
[SPIE BiOS. San Francisco (US), 29.01.2023-30.01.2023]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: multimode optical fibre
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12388/2668358/New-ways-to-look-through-multimode-optical-fibres/10.1117/12.2668358.short
Phillips, D. B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343125

0553554 - ÚPT 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pikálek, Tomáš - Stibůrek, Miroslav - Simpson, Stephen Hugh - Čižmár, Tomáš - Traegaardh, Johanna
Suppression of the non-linear background in a multimode fibre CARS endoscope.
Biomedical Optics Express. Roč. 13, č. 2 (2022), s. 862-874, č. článku 450375. ISSN 2156-7085. E-ISSN 2156-7085
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: resolution * microscopy * probe * myelin * light
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2022 ; AIS: 0.842, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/boe/fulltext.cfm?uri=boe-13-2-862&id=468619
Traegaardh, Johanna
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333682

0559664 - ÚPT 2023 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Stellinga, D. - Phillips, D. B. - Mekhail, S. P. - Selyem, A. - Turtaev, S. - Čižmár, Tomáš - Padgett, M. J. … celkem 9 autorů
3D imaging through a single optical fiber.
Proceedings of SPIE. In: Optical and Quantum Sensing and Precision Metrology II. Bellingham: SPIE, 2022 - (Scheuer, J.; Shahriar, S.), Roč. 12016 (2022), č. článku 120160M. Proceedings of SPIE, 12016. ISBN 978-1-5106-4903-3. ISSN 0277-786X.
[Optical and Quantum Sensing and Precision Metrology II. online (US), 20.02.2022-24.02.2022]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: single fiber imaging * endoscope
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12016/2616915/3D-imaging-through-a-single-optical-fiber/10.1117/12.2616915.short
Stellinga, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0341041

0571074 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stibůrek, Miroslav - Ondráčková, Petra - Tučková, Tereza - Turtaev, S. - Šiler, Martin - Pikálek, Tomáš - Jákl, Petr - Gomes, A. D. - Krejčí, Jana - Kolbábková, Petra - Uhlířová, Hana - Čižmár, Tomáš
110 μm thin endo-microscope for deep-brain in vivo observations of neuronal connectivity, activity and blood flow dynamics.
Nature Communications. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 1897. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
GRANT EU: European Commission(XE) 101016787 - DEEPER
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:68081707
Klíčová slova: holographic endoscopy * multi-mode fibre * in vivo * imaging * brain * mouse * calcium imaging * blood flow
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics); 1.7 Other natural sciences (BFU-R)
Impakt faktor: 14.7, rok: 2023 ; AIS: 5.66, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-023-36889-z
Uhlířová, Hana
- Čižmár, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342381

0568082 - ÚPT 2023 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Stibůrek, Miroslav - Jákl, Petr - Pikálek, Tomáš - Ondráčková, Petra - Čižmár, Tomáš
Custom: terminated multimode fibre probe for holographic micro-endoscopy.
22nd Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics. Bellingham: SPIE, 2022 - (Masajada, J.; Urbańczyk, W.), Roč. 12502 (2022), č. článku 1250211. Proceedings of SPIE, 12502. ISBN 978-1-5106-6112-7. ISSN 0277-786X. E-ISSN 1996-756X.
[Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics /22./. Wojanów (PL), 05.09.2022-09.09.2022]
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: etching * holographic endoscopy * imaging * micro-endoscope * optical fibre * polishing * thin layer deposition
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12502/2664219/Custom-terminated-multimode-fibre-probe-for-holographic-micro-endoscopy/10.1117/12.2664219.short
Stibůrek, Miroslav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339487

0582468 - ÚPT 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Turtaev, S. - Hofbrucker, J. - Čižmárová, H. - Westermann, P. - Gomes, A. D. - Čižmár, Tomáš … celkem 7 autorů
Live Demonstration: Holographic Fibre Endoscope for In-Vivo Deep Tissue Imaging.
IEEE Sensors. In: 2023 IEEE SENSORS. New York: IEEE, 2023, (2023). ISBN 979-8-3503-0387-2. ISSN 1930-0395.
[IEEE SENSORS 2023 /22./. Vienna (AT), 29.10.2023-01.11.2023]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: wavefront shaping * multimode fibre * in-vivo neuroscience * fluorescence microscopy
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://ieeexplore.ieee.org/document/10325084
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350587

0580582 - ÚPT 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tyc, Tomáš - Čižmár, Tomáš
Optical Coriolis force guides light along Trojan beams.
Nature Physics. Roč. 20, č. 1 (2024), s. 10-11. ISSN 1745-2473. E-ISSN 1745-2481
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: light transport * Coriolis force * Trojan beams * optical waveguide
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 16, rok: 2024 ; AIS: 7.426, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41567-023-02251-9
Tyc, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353357

0588514 - ÚPT 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Uhlířová, Hana - Stibůrek, Miroslav - Pikálek, Tomáš - Gomes, A. - Turtaev, S. - Kolbábková, Petra - Čižmár, Tomáš
“There’s plenty of room at the bottom”: deep brain imaging with holographic endo-microscopy.
Neurophotonics. Roč. 11, S1 (2024), č. článku S11504. ISSN 2329-423X. E-ISSN 2329-4248
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
GRANT EU: European Commission(XE) 101082088 - StrokeGATE; European Commission(XE) 101016787 - DEEPER
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129; Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: complex media photonics * wavefront shaping * endoscope * multimode fiber * in-vivo imaging * deep brain imaging
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.287, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.spiedigitallibrary.org/journals/neurophotonics/volume-11/issue-S1/S11504/Theres-plenty-of-room-at-the-bottom--deep-brain/10.1117/1.NPh.11.S1.S11504.full#_=_
Uhlířová, Hana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355382