Publikace ASEP
0618022 - ÚPT 2025 RIV CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Benešová, Markéta - Bernatová, Silvie - Pilát, Zdeněk - Motlová, Tereza - Pokorná, Zuzana - Mika, Filip - Ježek, Jan - Kizovský, Martin - Mikulová, Adéla - Samek, Ota
Analysis of bacteria using surface-enhanced Raman scattering.
LA64. Sborník příspěvků multioborové konference LASER64. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2024 - (Mikel, B.), s. 7-11. ISBN 978-80-87441-34-3.
[LASER64. Třešť (CZ), 13.11.2024-15.11.2024]
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * diagnostics * SERS * single-cell detection
Obor OECD: Analytical chemistry
Benešová, Markéta
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0364854
0570271 - ÚPT 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Benešová, Markéta - Bernatová, Silvie - Mika, Filip - Pokorná, Zuzana - Ježek, Jan - Šiler, Martin - Samek, Ota - Růžička, F. - Rebrošová, K. - Zemánek, Pavel - Pilát, Zdeněk
SERS-Tags: Selective Immobilization and Detection of Bacteria by Strain-Specific Antibodies and Surface-Enhanced Raman Scattering.
Biosensors. Roč. 13, č. 2 (2023), č. článku 182. E-ISSN 2079-6374
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341
AV ČR(CZ) MSM100652101
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: SERS-tag * Escherichia coli * sandwich immunoassay * single-cell detection
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2023 ; AIS: 0.765, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2079-6374/13/2/182
Samek, Ota
- Pilát, Zdeněk
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344482
0604142 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Bernatová, Silvie - Foti, A. - Kizovský, Martin - Donato, M. - Marago, O. - Magazzu, A. - Ježek, Jan - Zemánek, Pavel - Gucciardi, P. G.
Detection of microplastics and nanoplastics: Are Raman tweezers and enhanced Raman methods the solution for sub 20 µm particles?
EPJ Web of Conferences. Vol. 309. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (De Stefano, L.; Velotta, R.; Descrovi, E.), č. článku 10001. ISSN 2101-6275.
[EOS Annual Meeting (EOSAM 2024). Naples (IT), 09.09.2024-13.09.2024]
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: microplastics * nanoplastics * plasmonics * Surface Enhanced Raman Spectroscopy
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.epj-conferences.org/articles/epjconf/abs/2024/19/epjconf_eosam2024_10001/epjconf_eosam2024_10001.html
Bernatová, Silvie
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0363456
0567619 - ÚPT 2023 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Bernatová, Silvie - Kizovský, Martin - Donato, M. G. - Foti, A. - Zemánek, Pavel - Samek, Ota - Marago, O. M. - Ježek, Jan - Gucciardi, P. G. … celkem 10 autorů
Detection of Plastic Nanoparticles in Aqueous Enviroment Based on Optical Manipulation in Combination with Raman Spectroscopy.
2022 IEEE International Workshop on Metrology for the Sea, Learning to Measure Sea Health Parameters (MetroSea). Proceedings. New York: IEEE, 2022, (2022), s. 349-352. ISBN 978-1-6654-9942-2.
[2022 IEEE International Workshop on Metrology for the Sea. Milazzo (IT), 03.10.2022-05.10.2022]
AV ČR(CZ) MSM100652101
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: microplastics * nanoplastics * plasmonics * Surface Enhanced Raman Spectroscopy * thermoplasmonics
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://ieeexplore.ieee.org/document/9950839
Bernatová, Silvie
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0338854
0568149 - ÚPT 2023 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Bernatová, Silvie - Kizovský, Martin - Donato, M. G. - Foti, A. - Samek, Ota - Ježek, Jan - Maragò, O. M. - Zemánek, Pavel - Gucciardi, P. G.
Optical force aggregation of gold nanoparticles as a tool to fabrication a multifunctional sensor.
22nd Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics. Bellingham: SPIE, 2022 - (Masajada, J.; Urbańczyk, W.), č. článku 125020U. Proceedings of SPIE, 12502. ISBN 978-1-5106-6112-7. ISSN 0277-786X. E-ISSN 1996-756X.
[Polish-Slovak-Czech Optical Conference on Wave and Quantum Aspects of Contemporary Optics /22./. Wojanów (PL), 05.09.2022-09.09.2022]
AV ČR(CZ) MSM100652101
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: nanoplastics * optical printing * optical pushing * sensor * surface enhanced Raman spectroscopy
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12502/2664176/Optical-force-aggregation-of-gold-nanoparticles-as-a-tool-to/10.1117/12.2664176.short
Bernatová, Silvie Gucciardi, P. G.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0339490
0579366 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brzobohatý, Oto - Duchaň, Martin - Jákl, Petr - Ježek, Jan - Šiler, Martin - Zemánek, Pavel - Simpson, Stephen Hugh
Synchronization of spin-driven limit cycle oscillators optically levitated in vacuum.
Nature Communications. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 5441. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-19245K; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008460
AV ČR(CZ) AP2002
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: optical levitation * optical binding * synchronization
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 14.7, rok: 2023 ; AIS: 5.66, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-023-41129-5
Brzobohatý, Oto
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348201
0638398 - ÚPT 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Ghazalová, Mona - Modlitbová, Pavlína - Samek, Ota - Rebrošová, K. - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Pilát, Zdeněk
Surface-Enhanced Raman Spectroscopy for Adenine Detection in Five Selected Bacterial Strains Under Stress Conditions.
Sensors. Roč. 25, č. 15 (2025), č. článku 4629. ISSN 1424-8220. E-ISSN 1424-8220
GRANT EU: European Commission(XE) 101135175 - uCAIR
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: SERS * Ag-NPs * Au-NPs * phenylalanine * Escherichia coli * Staphylococcus aureus
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 0.618, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1424-8220/25/15/4629
Samek, Ota
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0369067
0552078 - ÚPT 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Jákl, Petr - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Cifuentes, Angel S. - Traegaardh, Johanna - Zemánek, Pavel - Čižmár, Tomáš
Endoscopic Imaging Using a Multimode Optical Fibre Calibrated with Multiple Internal References.
Photonics. Roč. 9, č. 1 (2022), č. článku 37. E-ISSN 2304-6732
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: fibre endoscopy * spatial light modulator * transmission matrix
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022 ; AIS: 0.426, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2304-6732/9/1/37
Jákl, Petr
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0327230
0559871 - ÚPT 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Karalko, A. - Keša, P. - Jelínek, F. - Šefc, L. - Ježek, Jan - Zemánek, Pavel - Grus, T.
In Vivo Contrast Imaging of Rat Heart with Carbon Dioxide Foam.
Sensors. Roč. 22, č. 14 (2022), č. článku 5124. ISSN 1424-8220. E-ISSN 1424-8220
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging - 90062
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: carbon dioxide foam * angiography * contrast-enhanced ultrasound imaging * preclinical imaging
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 0.608, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1424-8220/22/14/5124
Keša, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333354
0635880 - ÚPT 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Láznička, Tomáš - Kizovský, Martin - Hrubanová, Kamila - Ježek, Jan - Mrázová, Kateřina - Obruča, S. - Samek, Ota - Krzyžánek, Vladislav
Assembly for semi-correlation analysis of samples using cryogenic scanning electron microscopy and cryogenic Raman micro-spectroscopy.
Measurement Science and Technology. Roč. 36, č. 5 (2025), č. článku 055903. ISSN 0957-0233. E-ISSN 1361-6501
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: cryo assembly * cryogenic Raman micro-spectroscopy * cryogenic scanning electron microscopy * semi-correlative imaging
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.452, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1361-6501/adc94a
Krzyžánek, Vladislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368139
0604059 - ÚPT 2025 RIV FR eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Láznička, Tomáš - Ježek, Jan - Hrubanová, Kamila - Krzyžánek, Vladislav
Innovative Microfluidic chip for Raman spectroscopy and advanced electron microscopy techniques.
BIO Web of Conferences. Vol. 129. Les Ulis: EDP Sciences, 2024 - (Qvortrup, K.; Weede, K.), č. článku 03017. E-ISSN 2117-4458.
[EMC 2024. European Microscopy Congress /17./. Copenhagen (DK), 25.08.2024-30.08.2024]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07962S; GA TA ČR(CZ) TN02000020; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: microfluidic chip * electron microscopy * HPF
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
https://www.bio-conferences.org/articles/bioconf/abs/2024/48/bioconf_emc2024_03017/bioconf_emc2024_03017.html
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361391
0579379 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Liška, Vojtěch - Zemánková, Tereza - Svak, Vojtěch - Jákl, Petr - Ježek, Jan - Bránecký, Martin - Simpson, Stephen Hugh - Zemánek, Pavel - Brzobohatý, Oto
Cold damping of levitated optically coupled nanoparticles.
Optica. Roč. 10, č. 9 (2023), s. 1203-1209. ISSN 2334-2536. E-ISSN 2334-2536
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-19245K; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008460
AV ČR(CZ) AP2002
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: optical binding * nanoparticles * optical levitation
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 8.4, rok: 2023 ; AIS: 3.522, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/optica/fulltext.cfm?uri=optica-10-9-1203&id=537233
Brzobohatý, Oto
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348207
0553555 - ÚPT 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Rebrošová, K. - Bernatová, Silvie - Šiler, Martin - Uhlířová, M. - Samek, Ota - Ježek, Jan - Holá, V. - Růžička, F. - Zemánek, Pavel
Raman spectroscopy - a tool for rapid differentiation among microbes causing urinary tract infections.
Analytica Chimica Acta. Roč. 1191, 25 January (2022), č. článku 339292. ISSN 0003-2670. E-ISSN 1873-4324
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341; GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman spectroscopy * Urinary tract infections * Raman tweezers * Optical trapping * Bacteria
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 6.2, rok: 2022 ; AIS: 0.936, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0003267021011181
Rebrošová, K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333541
0574930 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rebrošová, K. - Bernatová, Silvie - Šiler, Martin - Mašek, Jan - Samek, Ota - Ježek, Jan - Kizovský, Martin - Holá, V. - Zemánek, Pavel - Růžička, F.
Rapid Identification of Pathogens Causing Bloodstream Infections by Raman Spectroscopy and Raman Tweezers.
Microbiology Spectrum. Roč. 11, č. 3 (2023), č. článku e0002823. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU21-05-00341; GA MŠMT EF15_003/0000476; GA MŠMT(CZ) LO1212; GA MŠMT ED0017/01/01
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:68081731 ; RVO:68081707
Klíčová slova: Raman spectroscopy * bloodstream infections * diagnostics * sepsis * bacteria * Candida * Raman tweezers
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics); Microbiology (BFU-R)
Impakt faktor: 3.7, rok: 2023 ; AIS: 1.02, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.00028-23
Rebrošová, K. Růžička, F.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344987
0617414 - ÚPT 2025 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Šilhan, Lukáš - Novotný, Jan - Plichta, Tomáš - Ježek, Jan - Vaculík, Ondřej - Šerý, Mojmír
Design of Setup for Laser Induced Plasma Etching.
International Vacuum Nanoelectronics Conference. In: 2024 37th International Vacuum Nanoelectronics Conference, IVNC 2024. New York: IEEE, 2024, s. 44-45. ISBN 979-8-3503-7977-8. ISSN 2164-2370.
[International Vacuum Nanoelectronics Conference (IVNC) /37./. Brno (CZ), 15.07.2024-19.07.2024]
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000020
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: vacuum chamber * plasma etching * femtosecond laser * micromachining * three-dimensional displays * lithography * electronics industry * surface emitting lasers * ignition
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://ieeexplore.ieee.org/document/10652276
Šilhan, Lukáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0364348
0579192 - ÚPT 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vaculík, Ondřej - Bernatová, Silvie - Rebrošová, K. - Samek, Ota - Šilhan, Lukáš - Růžička, F. - Šerý, Mojmír - Šiler, Martin - Ježek, Jan - Zemánek, Pavel
Rapid identification of pathogens in blood serum via Raman tweezers in combination with advanced processing methods.
Biomedical Optics Express. Roč. 14, č. 12 (2023), s. 6410-6421. ISSN 2156-7085. E-ISSN 2156-7085
Grant CEP: GA MPO(CZ) FV40455; GA TA ČR(CZ) FW06010453; GA MZd(CZ) NU21-05-00341
Institucionální podpora: RVO:68081731
Klíčová slova: Raman tweezers * blood serum * Raman spectroscopy * bloodstream infections * diagnostics * sepsis
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2023 ; AIS: 0.719, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/boe/fulltext.cfm?uri=boe-14-12-6410&id=542842
Vaculík, Ondřej
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348043