Publikace ASEP
0618185 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Damiani, Tito - Smith, Joshua - Hebra, Téo - Perković, Milana - Čičak, Marijo - Kadlecová, Alžběta - Rybka, V. - Dračínský, Martin - Pluskal, Tomáš
Computational metabolomics reveals overlooked chemodiversity of alkaloid scaffolds in Piper fimbriulatum.
Plant Journal. Roč. 121, č. 5 (2025), č. článku e70086. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-11563M; GA MŠMT(CZ) EH22_010/0002733
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Piper fimbriulatum * Piperaceae * alkaloids * mass spectrometry * computational metabolomics * Wikidata * angiosperms * technical advance
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/tpj.70086
Pluskal, Tomáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365077
0586544 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Heuckeroth, S. - Damiani, Tito - Smirnov, A. - Mokshyna, Olena - Brungs, Corinna - Korf, Ansgar - Smith, Joshua David - Stincone, P. - Dreolin, N. - Nothias, L.-F. - Hyötyläinen, T. - Orešič, M. - Karst, U. - Dorrestein, P. C. - Petras, D. - Du, X. - van der Hooft, J. J. J. - Schmid, Robin - Pluskal, Tomáš
Reproducible mass spectrometry data processing and compound annotation in MZmine 3.
Nature Protocols. Roč. 19, č. 9 (2024), s. 2597-2641. ISSN 1754-2189. E-ISSN 1750-2799
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-11563M; GA MŠMT(CZ) EH22_010/0002733
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: metabolomics data * spectra * repository
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16, rok: 2024 ; AIS: 7.426, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1038/s41596-024-00996-y
Schmid, Robin
- Pluskal, Tomáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0354007
0642428 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pokorná, Jana - Hadzima, Martin - Křenková, Alena - Smith, Joshua David - Šubr, Vladimír - Kryštůfek, Robin - Hubálek, Martin - Starková, Jana - Šrámková, Karolína - Etrych, Tomáš - Kostka, Libor - Sedlák, František - Konvalinka, Jan - Šácha, Pavel
Uncovering the glutamate carboxypeptidase II microenvironment using a multi-labeling proteomic approach.
Scientific Reports. Roč. 15, November (2025), č. článku 45461. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05642S; GA MŠMT LX22NPO5102; GA MZd(CZ) NU22-03-00318
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61389013
Klíčová slova: PSMA * protein proximity labeling * iBody * HRP * µMap * riboflavin
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Polymer science (UMCH-V)
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.029, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-025-28826-5
Konvalinka, Jan
- Šácha, Pavel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0372342
0635650 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Smith, Joshua David - Tvrdoňová Stillerová, Vendula - Dračínský, Martin - Popr, Martin - Angermeier Gaustad, H. L. - Lorenzi, Quentin - Smrčková, Helena - Reinhardt, J. K. - Liénard, M. A. - Bednárová, Lucie - Šácha, Pavel - Pluskal, Tomáš
Discovery and isolation of novel capsaicinoids and their TRPV1-related activity.
European Journal of Pharmacology. Roč. 999, July (2025), č. článku 177700. ISSN 0014-2999. E-ISSN 1879-0712
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-11563M
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Výzkumná infrastruktura: CZ-OPENSCREEN IV - 90252
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: natural products * vanilloids * capsaicin * MS/MS spectrometry * calcium imaging * TRPV1 * metabolomics
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.879, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejphar.2025.177700
Pluskal, Tomáš
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0366686
0563157 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vavřina, Zdeněk - Perlíková, Pavla - Milisavljevič, Nemanja - Chevrier, Florian - Smola, Miroslav - Smith, Joshua - Dejmek, Milan - Havlíček, Vojtěch - Buděšínský, Miloš - Liboska, Radek - Vaneková, Lenka - Brynda, Jiří - Bouřa, Evžen - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal - Birkuš, Gabriel
Design, Synthesis, and Biochemical and Biological Evaluation of Novel 7-Deazapurine Cyclic Dinucleotide Analogues as STING Receptor Agonists.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 65, č. 20 (2022), s. 14082-14103. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: GMP-AMP synthase * interferon genes * adapter protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022 ; AIS: 1.587, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c01305
Perlíková, Pavla
- Birkuš, Gabriel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335201