Nápověda

Yesylevskyy Semen

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 11

0603005 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Allemand, F. - Yesylevskyy, Semen - Lagoutte-Renosi, J. - Davani, S. - Ramseyer, C.
Nanodomains enriched in arachidonic acid promote P2Y12 receptor oligomerization in the platelet plasma membrane.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1867, č. 1 (2025), č. článku 184402. ISSN 0005-2736. E-ISSN 1879-2642
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: blood platelets * purinergic receptor P2Y12 * arachidonic acid * protein multimerization * protein-lipid interaction * molecular dynamics simulation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.5, rok: 2024 ; AIS: 0.778, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bbamem.2024.184402
Allemand, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360279

0585609 - ÚOCHB 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Boutanquoi, P. M. - Khan, A. S. - Cabeza, L. - Jantzen, L. - Gautier, T. - Yesylevskyy, Semen - Ramseyer, C. - Masson, D. - Van Waes, V. - Hichami, A. - Khan, N. A.
A novel fatty acid analogue triggers CD36-GPR120 interaction and exerts anti-inflammatory action in endotoxemia.
Cellular and Molecular Life Sciences. Roč. 81, č. 1 (2024), č. článku 176. ISSN 1420-682X. E-ISSN 1420-9071
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: fat * lipids * lipopolysaccharide * taste buds * inflammation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 2.055, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00018-024-05207-1
Khan, N. A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353283

0637601 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Cherednichenko, A. - Afonin, S. - Babii, O. - Voitsitskyi, T. - Stratiichuk, R. - Koleiev, I. - Vozniak, V. - Shevchuk, N. - Ostrovsky, Z. - Yesylevskyy, Semen - Nafiiev, A. - Starosyla, S. - Ulrich, A. S. - Jirgensons, A. - Komarov, I. V.
Neural Network Models for Prediction of Biological Activity using Molecular Dynamics Data: A Case of Photoswitchable Peptides.
Molecular Informatics. Roč. 44, č. 7 (2025), č. článku e70001. ISSN 1868-1743. E-ISSN 1868-1751
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: biological activity * diarylethenes * molecular dynamics * neuronal network models * photoswitchable peptides
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.739, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/minf.70001
Komarov, I. V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368432

0566824 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Lirussi, F. - Pyrshev, K. - Yesylevskyy, Semen - Rivel, T. - Lopez, T. - Coppens, E. - Mura, S. - Couvreur, P. - Ramseyer, C.
Plasma membrane lipid bilayer is druggable: Selective delivery of gemcitabine-squalene nano-medicine to cancer cells.
Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular Basis of Disease. Roč. 1869, č. 2 (2023), č. článku 166614. ISSN 0925-4439. E-ISSN 1879-260X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: gemcitabine-squalene * nanomedicine * lipid composition * selective delivery * plasma membrane * cancer targeting
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.2, rok: 2023 ; AIS: 1.273, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bbadis.2022.166614
Lirussi, F.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0338101

0587986 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pyrshev, K. - Allemand, F. - Rabani, V. - Yesylevskyy, Semen - Davani, S. - Ramseyer, C. - Lagoutte-Renosi, J.
Ticagrelor increases its own potency at the P2Y12 receptor by directly changing the plasma membrane lipid order in platelets.
British Journal of Pharmacology. Roč. 181, č. 21 (2024), s. 4369-4380. ISSN 0007-1188. E-ISSN 1476-5381
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antiplatelet drug * lipid order * P2Y12 * plasma membrane * platelet
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 7.7, rok: 2024 ; AIS: 1.652, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1111/bph.16500

Pyrshev, K. Lagoutte-Renosi, J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355058

0638496 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Stratiichuk, R. - Melnychenko, M. - Koleiev, I. - Voitsitskyi, T. - Husak, V. - Shevchuk, N. - Ostrovsky, Z. - Bdzhola, V. - Yesylevskyy, Semen - Starosyla, S. - Nafiiev, A.
Leveraging large language models for literature-driven prioritization of protein binding pockets.
Bioinformatics. Roč. 41, č. 8 (2025), č. článku btaf449. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1367-4811
Institucionální podpora: RVO:61388963
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 2.831, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaf449
Melnychenko, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369156

0640288 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stratiichuk, R. - Kyrylenko, R. - Koleiev, I. - Savchenko, I. - Voitsitskyi, T. - Husak, V. - Yesylevskyy, Semen - Starosyla, S. - Nafiiev, A.
Sampling and Ranking of Protein Conformations Using Machine Learning Techniques Do Not Improve the Quality of Rigid Protein-Protein Docking.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 65, č. 19 (2025), s. 10167-10179. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 1.526, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c01765
Kyrylenko, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370694

0571080 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Voitsitskyi, T. - Stratiichuk, R. - Koleiev, I. - Popryho, L. - Ostrovsky, Z. - Henitsoi, P. - Khropachov, I. - Vozniak, V. - Zhytar, R. - Nechepurenko, D. - Yesylevskyy, Semen - Nafiiev, A. - Starosyla, S.
3DProtDTA: a deep learning model for drug-target affinity prediction based on residue-level protein graphs.
RSC Advances. Roč. 13, č. 15 (2023), s. 10261-10272. ISSN 2046-2069. E-ISSN 2046-2069
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: drug-target affinity prediction * protein structure
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.9, rok: 2023 ; AIS: 0.598, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D3RA00281K
Voitsitskyi, T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342384

0581097 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Voitsitskyi, T. - Bdzhola, V. - Stratiichuk, R. - Koleiev, I. - Ostrovsky, Z. - Vozniak, V. - Khropachov, I. - Henitsoi, P. - Popryho, L. - Zhytar, R. - Yesylevskyy, Semen - Nafiiev, A. - Starosyla, S.
Augmenting a training dataset of the generative diffusion model for molecular docking with artificial binding pockets.
RSC Advances. Roč. 14, č. 2 (2024), s. 1341-1353. ISSN 2046-2069. E-ISSN 2046-2069
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: database * collection
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 0.622, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D3RA08147H
Voitsitskyi, T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349647

0572574 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yesylevskyy, Semen - Martinez-Seara, Hector - Jungwirth, Pavel
Curvature Matters: Modeling Calcium Binding to Neutral and Anionic Phospholipid Bilayers.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 127, č. 20 (2023), s. 4523-4531. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-26854X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulation * membrane curvature * lipid bilayers
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.8, rok: 2023 ; AIS: 0.678, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.3c01962
Yesylevskyy, Semen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343219

0603081 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yesylevskyy, Semen
MolAR: Memory-Safe Library for Analysis of MD Simulations Written in Rust.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 46, č. 1 (2025), č. článku e27536. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: library * memory safety * molecular analysis * molecular dynamics simulations * Rust
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.923, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/jcc.27536
Yesylevskyy, Semen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360367