Publikace ASEP
0568888 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Andris, Erik - Straka, Michal - Vrána, J. - Růžička, A. - Roithová, J. - Rulíšek, Lubomír
Can Copper(I) and Silver(I) be Hydrogen Bond Acceptors?
Chemistry - A European Journal. Roč. 29, č. 26 (2023), č. článku e202203769. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: copper * density functional calculations * gold * hydrogen bond * ion spectroscopy * IR spectroscopy * silver
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.9, rok: 2023 ; AIS: 0.89, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202203769
Andris, Erik Roithová, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340164
0643661 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Andris, Erik - Straka, Michal - Dračínský, Martin - Yang, Qin - Roithová, J. - Rulíšek, Lubomír
Can Silver(I) Act as a Hydrogen-Bond Acceptor? Spectroscopic and Computational Exploration of the Ag···H+ Bonds in the Gas Phase and in Solvent.
Inorganic Chemistry. Roč. 64, č. 50 (2025), s. 24411-24422. ISSN 0020-1669. E-ISSN 1520-510X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA25-15887S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: correlated molecular calculations * consistent basis sets * Gaussian basis sets
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.668, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.inorgchem.5c03415
Andris, Erik
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373566
0576490 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Antal, R. - Staś, Monika - Perdomo, S. M. - Štemberová, M. - Brůža, Z. - Matouš, P. - Kratochvíl, J. - Růžička, A. - Rulíšek, Lubomír - Kuneš, J. - Kočovský, P. - Andris, Erik - Pour, M.
Synthesis of highly polarized [3]dendralenes and their Diels-Alder reactions.
Organic Chemistry Frontiers. Roč. 10, č. 22 (2023), s. 5568-5578. ISSN 2052-4129. E-ISSN 2052-4129
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cross-coupling reactions * dendralenes * generation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.6, rok: 2023 ; AIS: 0.816, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D3QO01221B
Andris, Erik
- Pour, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0346045
0640447 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Degač, M. - Reininger, L. - Schardax, H. - Andris, Erik - Rulíšek, Lubomír - Císařová, I. - Rinner, U. - Cadart, T. - Kotora, M.
Synthesis of m,n-Diaza[n]helicenes via Skeletal Editing of Indeno[2,1-c]fluorene-5,8-diols.
JACS Au. Roč. 5, č. 10 (2025), s. 4788-4798. E-ISSN 2691-3704
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: skeletal editing * Schmidt reaction * diazahelicene * enantioselectivity * reaction mechanism
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 8.7, rok: 2024 ; AIS: 2.428, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/jacsau.5c00729
Andris, Erik
- Kotora, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370860
0576137 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Inniss, N. L. - Kozic, Ján - Li, F. - Rosas-Lemus, M. - Minasov, G. - Rybáček, Jiří - Zhu, Y. - Pohl, Radek - Shuvalova, L. - Rulíšek, Lubomír - Brunzelle, J. S. - Bednárová, Lucie - Štefek, Milan - Kormaník, Ján Michael - Andris, Erik - Šebestík, Jaroslav - Li, A. S. M. - Brown, P. J. - Schmitz, U. - Saikatendu, K. - Chang, E. - Nencka, Radim - Vedadi, M. - Satchell, K. J. F.
Discovery of a Druggable, Cryptic Pocket in SARS-CoV-2 nsp16 Using Allosteric Inhibitors.
ACS Infectious Diseases. Roč. 9, č. 10 (2023), s. 1918-1931. ISSN 2373-8227
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: coronavirus * NSP16 methyltransferase * covalent inhibitors * structural biology * antiviral
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 1.084, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.3c00203
Chang, E.
- Nencka, Radim
- Vedadi, M.
- Satchell, K. J. F.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0345731
0603162 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kadaník, M. - Frantsuzova, E. - Matouš, P. - Nováková, L. - Kuneš, J. - Bonsignore, M. - Andris, Erik - Růžičková, Z. - Pour, M.
Vicinal Bis(methylene) Heterocyclic Diene in Natural Product Synthesis: A Convergent Biomimetic Total Synthesis of Prunolactone A.
Organic Letters. Roč. 26, č. 50 (2024), s. 11080-11084. ISSN 1523-7060. E-ISSN 1523-7052
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: palladium * cycloaddition
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5, rok: 2024 ; AIS: 0.848, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.orglett.4c04378
Pour, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0360398
0560534 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kalvoda, Tadeáš - Culka, Martin - Rulíšek, Lubomír - Andris, Erik
Exhaustive Mapping of the Conformational Space of Natural Dipeptides by the DFT-D3//COSMO-RS Method.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 126, č. 32 (2022), s. 5949-5958. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-08772S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: protein structure * alanine * energy
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.705, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c02861
Rulíšek, Lubomír
- Andris, Erik
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333407
0556188 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kipouros, I. - Stanczak, Agnieszka - Culka, Martin - Andris, Erik - Machonkin, T. R. - Rulíšek, Lubomír - Solomon, E. I.
Evidence for H-bonding interactions to the μ-η2:η2-peroxide of oxy-tyrosinase that activate its coupled binuclear copper site.
Chemical Communications. Roč. 58, č. 24 (2022), s. 3913-3916. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19148
Výzkumná infrastruktura: IT4Innovations - 90070
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: absorption fine structure * hemocyanins * spectroscopy * binding
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022 ; AIS: 1.033, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2CC00750A
Rulíšek, Lubomír
- Solomon, E. I.
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0331028
0619174 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kormaník, Ján Michael - Herman, Daniel - Andris, Erik - Culka, Martin - Gutten, Ondrej - Kožíšek, Milan - Bednárová, Lucie - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Rulíšek, Lubomír
Design of Zn-Binding Peptide(s) from Protein Fragments.
Chembiochem. Roč. 26, č. 7 (2025), č. článku e202401014. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05940S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: zinc(II) * metal-binding peptide * computer design * isothermal calorimetry * NMR * QM modeling
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.765, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cbic.202401014
Rulíšek, Lubomír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365914
0640180 - ÚFCH JH 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kovář, Jan - Andris, Erik - Wojdyla, Zuzanna Marta - Gopinath, Jishnu Sai - Klinkovský, J. - Fučík, R. - Srnec, Martin
Marcus cross relation in the space of H-atom abstraction reactions boosted through off-diagonal thermodynamics.
Journal of Chemical Physics. Roč. 163, č. 14 (2025), č. článku 144105. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-11247S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004617
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: H-atom transfer * Marcus equation * Free radical reactions
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.907, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.aip.org/aip/jcp/article/163/14/144105/3366960/Marcus-cross-relation-in-the-space-of-H-atom
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370604
0574532 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Motlová, Lucia - Šnajdr, Ivan - Kutil, Zsófia - Andris, Erik - Ptáček, Jakub - Novotná, Adéla - Nováková, Zora - Havlínová, Barbora - Tueckmantel, W. - Dráberová, Helena - Majer, Pavel - Schutkowski, M. - Kozikowski, A. - Rulíšek, Lubomír - Bařinka, Cyril
Comprehensive Mechanistic View of the Hydrolysis of Oxadiazole-Based Inhibitors by Histone Deacetylase 6 (HDAC6).
ACS Chemical Biology. Roč. 18, č. 7 (2023), s. 1594-1610. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S; GA ČR(CZ) GA23-05940S; GA MŠMT(CZ) LUAUS23247
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; EATRIS-CZ IV - 90253
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: BASIS-SETS * COSMO * ENERGY * REFINEMENT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2023 ; AIS: 1.31, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.3c00212
Rulíšek, Lubomír
- Bařinka, Cyril
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0347139
0645059 - ÚOCHB 2027 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Perdomo, S. M. - Kratochvíl, O. - Antal, R. - Kadaník, M. - Matouš, P. - Kuneš, J. - Růžička, A. - Kurčina, Adam - Rulíšek, Lubomír - Andris, Erik - Kočovský, Pavel - Pour, M.
Generating Molecular Diversity via Addition of Nucleophiles to Electron-Deficient [3]Dendralenes: An Exploratory Study.
Journal of Organic Chemistry. (2026). ISSN 0022-3263. E-ISSN 1520-6904
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: michael addition * halogen * cycloadditions
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.566, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.joc.5c02397
Andris, Erik
- Kočovský, Pavel
- Pour, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374906
0583095 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Štěpánová, Sille - Andris, Erik - Gutten, Ondrej - Buděšínský, Miloš - Dejmek, Milan - Břehová, Petra - Rulíšek, Lubomír - Kašička, Václav
Acidity constants and protonation sites of cyclic dinucleotides determined by capillary electrophoresis, quantum chemical calculations, and NMR spectroscopy.
Electrophoresis. Roč. 45, 7/8 (2024), s. 687-705. ISSN 0173-0835. E-ISSN 1522-2683
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-03899S; GA ČR(CZ) GA23-05940S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: acidity constant * capillary electrophoresis * cyclic dinucleotides * DFT calculations * NMR spectroscopy
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 2.5, rok: 2024 ; AIS: 0.416, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/elps.202300232
Rulíšek, Lubomír
- Kašička, Václav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351092
0562057 - ÚEB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, M. - Özdemir, Zülal - Kim, H. - Nah, S. - Andris, Erik - Li, X. - Wimmer, Zdeněk - Yoon, J.-N.
Acid-Responsive Nanoporphyrin Evolution for Near-Infrared Fluorescence-Guided Photo-Ablation of Biofilm.
Advanced Healthcare Materials. Roč. 11, č. 14 (2022), č. článku 2200529. ISSN 2192-2640. E-ISSN 2192-2659
Grant CEP: GA MPO(CZ) FV10599; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
AVČR(CZ) VAJVA-19-48
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388963
Klíčová slova: acid-responsive nanoporphyrin * MRSA biofilms * NIR fluorescence * phototherapy * structural evolution
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 10, rok: 2022 ; AIS: 1.79, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/adhm.202200529
Li, X.
- Wimmer, Zdeněk
- Yoon, J.-N.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0334475