Faltejsková Kateřina

0579941 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Faltejsková, Kateřina - Vondrášek, Jiří
PAPerFly: Partial Assembly-based Peak Finder for ab initio binding site reconstruction.
BMC Bioinformatics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 487. ISSN 1471-2105. E-ISSN 1471-2105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ChIP-seq * DNA recognition * transcription factor * peak analysis * algorithm * graph theory
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2023 ; AIS: 1.324, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12859-023-05613-5

Faltejsková, Kateřina Vondrášek, Jiří
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348738

0599343 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kribelbauer-Swietek, J. F. - Pushkarev, O. - Gardeux, V. - Faltejsková, Kateřina - Russeil, J. - van Mierlo, G. - Deplancke, B.
Context transcription factors establish cooperative environments and mediate enhancer communication.
Nature Genetics. Roč. 56, October (2024), s. 2199-2212. ISSN 1061-4036. E-ISSN 1546-1718
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: super-enhancers * cell identity * organization
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 29, rok: 2024 ; AIS: 19.053, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41588-024-01892-7

Kribelbauer-Swietek, J. F. Deplancke, B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356817

0636655 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Modrák, Martin - Moon, A. H. - Kim, S. - Buerkner, P. - Huurre, N. - Faltejsková, Kateřina - Gelman, A. - Vehtari, A.
Simulation-Based Calibration Checking for Bayesian Computation: The Choice of Test Quantities Shapes Sensitivity.
Bayesian Analysis. Roč. 20, č. 2 (2025), s. 461-488. ISSN 1931-6690. E-ISSN 1936-0975
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: models * calibration * probabilistic programming * software testing
Obor OECD: Microbiology; Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8) (UOCHB-X)
Impakt faktor: 2.5, rok: 2024 ; AIS: 2.334, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://projecteuclid.org/journals/bayesian-analysis/volume-20/issue-2/Simulation-Based-Calibration-Checking-for-Bayesian-Computation--The-Choice/10.1214/23-BA1404.full
Modrák, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367617

0641713 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vorontsov, I. E. - Kozin, I. - Abramov, S. - Boytsov, A. - Jolma, A. - Albu, M. - Ambrosini, G. - Faltejsková, Kateřina - Gralak, A. J. - Gryzunov, N. - Inukai, S. - Kolmykov, S. - Kravchenko, P. - Kribelbauer-Swietek, J. F. - Laverty, K. U. - Nozdrin, V. - Patel, Z. M. - Penzar, D. - Plescher, M. L. - Pour, S. E. - Razavi, R. - Yang, A. W. H. - Yevshin, I. - Zinkevich, A. - Weirauch, M. T. … celkem 34 autorů
Cross-platform motif discovery and benchmarking to explore binding specificities of poorly studied human transcription factors.
Communications Biology. Roč. 8, November (2025), č. článku 1545. E-ISSN 2399-3642
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: sites * collection * HOCOMOCO
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-025-08909-9
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371768