Publikace ASEP
0600677 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gracias, Filip - Pohl, Radek - Sýkorová, Veronika - Hocek, Michal
Bacteriophage-related epigenetic natural and non-natural pyrimidine nucleotides and their influence on transcription with T7 RNA polymerase.
Communications Chemistry. Roč. 7, November (2024), č. článku 256. ISSN 2399-3669. E-ISSN 2399-3669
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: major groove * deoxyribonucleic acid * modified base
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 1.568, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42004-024-01354-5
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357989
0559506 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gracias, Filip - Ruiz-Larrabeiti, Olatz - Vaňková Hausnerová, Viola - Pohl, Radek - Klepetářová, Blanka - Sýkorová, Veronika - Krásný, Libor - Hocek, Michal
Homologues of epigenetic pyrimidines: 5-alkyl-, 5-hydroxyalkyl and 5-acyluracil andcytosine nucleotides: synthesis, enzymatic incorporation into DNA and effect on transcription with bacterial RNA polymerase.
RSC Chemical Biology. Roč. 3, č. 8 (2022), s. 1069-1075. ISSN 2633-0679. E-ISSN 2633-0679
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA ČR(CZ) GA22-12023S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: major-groove * 5-formylcytosine * 5-hydroxymethylcytosine
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 4.1, rok: 2022 ; AIS: 1.186, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2CB00133K
Krásný, Libor
- Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0332783
0636785 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Kaiser, Lukáš - Ondruš, Marek - Poštová Slavětínská, Lenka - Raindlová, Veronika - Hocek, Michal
Polymerase Synthesis of Hypermodified DNA Displaying a Combination of Thiol, Hydroxyl, Carboxylate, and Imidazole Functional Groups in the Major Groove.
Chemistry - A European Journal. Roč. 31, č. 34 (2025), č. článku e202501034. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA * enzymatic syntheses * nucleotides * polymerases
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 0.762, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202501034
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0367776
0574341 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kodr, David - Ortiz, M. - Sýkorová, Veronika - Yenice, C. P. - Lesnikowski, Z. J. - O’Sullivan, C. K. - Hocek, Michal
Normalized Multipotential Redox Coding of DNA Bases for Determination of Total Nucleotide Composition.
Analytical Chemistry. Roč. 95, č. 34 (2023), s. 12586-12589. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-11252S; GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: direct electrochemical detection * nucleoside triphosphates * aromatic groups
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.8, rok: 2023 ; AIS: 1.224, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c02023
O’Sullivan, C. K.
- Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344683
0577106 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kuprikova, Natalia - Ondruš, Marek - Bednárová, Lucie - Riopedre Fernández, Miguel - Poštová Slavětínská, Lenka - Sýkorová, Veronika - Hocek, Michal
Superanionic DNA: enzymatic synthesis of hypermodified DNA bearing four different anionic substituents at all four nucleobases.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 21 (2023), s. 11428-11438. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: polymerase-catalyzed incorporation * functionalized DNA * primer extension
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkad893
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0346356
0618183 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kuprikova, Natalia - Ondruš, Marek - Bednárová, Lucie - Kraus, Tomáš - Poštová Slavětínská, Lenka - Sýkorová, Veronika - Hocek, Michal
Zwitterionic DNA: enzymatic synthesis of hypermodified DNA bearing four different cationic substituents at all four nucleobases.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 5 (2025), č. článku gkaf155. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: catalytic repertoire * primer extension * nucleic acids
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf155
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365078
0556689 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Leone, Denise Liu - Pohl, Radek - Hubálek, Martin - Kadeřábková, Marta - Krömer, Matouš - Sýkorová, Veronika - Hocek, Michal
Glyoxal-Linked Nucleotides and DNA for Bioconjugations and Crosslinking with Arginine-Containing Peptides and Proteins.
Chemistry - A European Journal. Roč. 28, č. 14 (2022), č. článku e202104208. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-03305S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
AV ČR(CZ) AP1501
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: bioconjugations * crosslinking * DNA * glyoxal * nucleotides
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2022 ; AIS: 0.918, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/chem.202104208
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0330810
0571293 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mulholland, Catherine - Jestřábová, Ivana - Sett, Arghya - Ondruš, Marek - Sýkorová, Veronika - Manzanares, Carmen Lorena - Šimončík, O. - Muller, P. - Hocek, Michal
The selection of a hydrophobic 7-phenylbutyl-7-deazaadenine-modified DNA aptamer with high binding affinity for the Heat Shock Protein 70.
Communications Chemistry. Roč. 6, April (2023), č. článku 65. ISSN 2399-3669. E-ISSN 2399-3669
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cell-SELEX * nucleotide * evolution
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.9, rok: 2023 ; AIS: 1.585, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42004-023-00862-0
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342552
0561972 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ondruš, Marek - Sýkorová, Veronika - Hocek, Michal
Traceless enzymatic synthesis of monodispersed hypermodified oligodeoxyribonucleotide polymers from RNA templates.
Chemical Communications. Roč. 58, č. 80 (2022), s. 11248-11251. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: exponential enrichment * reverse transcriptase * systematic evolution
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022 ; AIS: 1.033, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2CC03588J
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0334407
0558957 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pospíšil, Šimon - Panattoni, Alessandro - Gracias, Filip - Sýkorová, Veronika - Vaňková Hausnerová, Viola - Vítovská, Dragana - Šanderová, Hana - Krásný, Libor - Hocek, Michal
Epigenetic Pyrimidine Nucleotides in Competition with Natural dNTPs as Substrates for Diverse DNA Polymerases.
ACS Chemical Biology. Roč. 17, č. 10 (2022), s. 2781-2788. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA22-12023S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: gene * cleavage * 5-hydroxymethyl
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022 ; AIS: 1.375, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acschembio.2c00342
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0332438
0637921 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Raindlová, Veronika - Viktorinová, Klára - Tichý, Michal - Bednárová, Lucie - Srb, Pavel - Riopedre Fernández, Miguel - Hocek, Michal
Milligram-Scale Enzymatic Synthesis of Base-Modified DNA through Primer Extension: Polymerase Synthesis and NMR Structures of DNA Containing Phenyl-Substituted Nucleobases.
ChemistryEurope. Roč. 3, č. 6 (2025), č. článku e202500186. ISSN 2751-4765
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA polymerases * NMR spectroscopy * nucleoside triphosphates * nucleotides * oligonucleotides
Obor OECD: Organic chemistry
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/ceur.202500186
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368682
0641497 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sánchez Quirante, Tania - Kužmová, Erika - Riopedre Fernández, Miguel - Golojuch, S. - Vopálenský, Pavel - Raindlová, Veronika - El-Sagheer, A. H. - Brown, T. - Hocek, Michal
Enzymatic Synthesis of Modified RNA Containing 5-Methyl- or 5-Ethylpyrimidines or Substituted 7-Deazapurines and Influence of the Modifications on Stability, Translation, and CRISPR-Cas9 Cleavage.
ACS Chemical Biology. Roč. 20, č. 11 (2025), s. 2755-2767. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 861381 - NATURE-ETN
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: messenger RNA * guide RNA * Cas9
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 1.337, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acschembio.5c00692
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371639
0587190 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Spampinato, Ambra - Leone, Denise Liu - Pohl, Radek - Tarábek, Ján - Šoltysová, Markéta - Polák, Marek - Kádek, Alan - Sýkorová, Veronika - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal
ABNOH-Linked Nucleotides and DNA for Bioconjugation and Cross-linking with Tryptophan-Containing Peptides and Proteins.
Chemistry - A European Journal. Roč. 30, č. 49 (2024), č. článku e202402151. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: bioconjugation * DNA * proteins * nucleotides * oligonucleotides * peptides * N-oxyl radicals
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 0.762, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202402151
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0354457
0570750 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Spampinato, Ambra - Kužmová, Erika - Pohl, Radek - Sýkorová, Veronika - Vrábel, Milan - Kraus, Tomáš - Hocek, Michal
trans-Cyclooctene- and Bicyclononyne-Linked Nucleotides for Click Modification of DNA with Fluorogenic Tetrazines and Live Cell Metabolic Labeling and Imaging.
Bioconjugate Chemistry. Roč. 34, č. 4 (2023), s. 772-780. ISSN 1043-1802. E-ISSN 1520-4812
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: triphosphates
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 4, rok: 2023 ; AIS: 0.9, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.bioconjchem.3c00064
Vrábel, Milan
- Kraus, Tomáš
- Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342087
0552855 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Sýkorová, Veronika - Tichý, Michal - Hocek, Michal
Polymerase Synthesis of DNA Containing Iodinated Pyrimidine or 7-Deazapurine Nucleobases and Their Post-synthetic Modifications through the Suzuki-Miyaura Cross-Coupling Reactions.
Chembiochem. Roč. 23, č. 3 (2022), č. článku e202100608. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-03305S
AV ČR(CZ) AP1501
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleotides * DNA * oligonucleotides * bioconjugations * cross-coupling reactions
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 3.2, rok: 2022 ; AIS: 0.766, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/cbic.202100608
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0327950
0635671 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šinkevičiūtė, Ugnė - Sánchez Quirante, Tania - Rožánková, Samanta - Poštová Slavětínská, Lenka - Raindlová, Veronika - Hocek, Michal
Synthesis of 2-Substituted Adenosine Triphosphate Derivatives and their use in Enzymatic Synthesis and Postsynthetic Labelling of RNA.
Chembiochem. Roč. 26, č. 12 (2025), č. článku e202500241. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 861381 - NATURE-ETN
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: click reactions * DNA polymerases * nucleosides triphosphates * nucleotides * polyA polymerase * RNA polymerases * thiol-ene addition
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.765, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cbic.202500241
Hocek, Michal
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0366704