Nápověda

Culka Martin

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 7

0552067 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bím, Daniel - Navrátil, Michal - Gutten, Ondrej - Konvalinka, Jan - Kutil, Zsófia - Culka, Martin - Navrátil, Václav - Alexandrova, A. N. - Bařinka, Cyril - Rulíšek, Lubomír
Predicting Effects of Site-Directed Mutagenesis on Enzyme Kinetics by QM/MM and QM Calculations: A Case of Glutamate Carboxypeptidase II.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 126, č. 1 (2022), s. 132-143. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19148; GA ČR(CZ) GA18-14167S; GA ČR(CZ) GJ19-22269Y
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: monoamine-oxidase B * reaction mechanism * membrane antigen
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.705, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c09240
Bařinka, Cyril
- Rulíšek, Lubomír
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0327224

0560534 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kalvoda, Tadeáš - Culka, Martin - Rulíšek, Lubomír - Andris, Erik
Exhaustive Mapping of the Conformational Space of Natural Dipeptides by the DFT-D3//COSMO-RS Method.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 126, č. 32 (2022), s. 5949-5958. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-08772S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: protein structure * alanine * energy
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.705, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.2c02861
Rulíšek, Lubomír
- Andris, Erik
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333407

0556188 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kipouros, I. - Stanczak, Agnieszka - Culka, Martin - Andris, Erik - Machonkin, T. R. - Rulíšek, Lubomír - Solomon, E. I.
Evidence for H-bonding interactions to the μ-η2:η2-peroxide of oxy-tyrosinase that activate its coupled binuclear copper site.
Chemical Communications. Roč. 58, č. 24 (2022), s. 3913-3916. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19148
Výzkumná infrastruktura: IT4Innovations - 90070
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: absorption fine structure * hemocyanins * spectroscopy * binding
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022 ; AIS: 1.033, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2CC00750A
Rulíšek, Lubomír
- Solomon, E. I.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331028

0619174 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kormaník, Ján Michael - Herman, Daniel - Andris, Erik - Culka, Martin - Gutten, Ondrej - Kožíšek, Milan - Bednárová, Lucie - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Rulíšek, Lubomír
Design of Zn-Binding Peptide(s) from Protein Fragments.
Chembiochem. Roč. 26, č. 7 (2025), č. článku e202401014. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05940S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: zinc(II) * metal-binding peptide * computer design * isothermal calorimetry * NMR * QM modeling
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.765, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cbic.202401014
Rulíšek, Lubomír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365914

0580275 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Osifová, Zuzana - Kalvoda, Tadeáš - Galgonek, Jakub - Culka, Martin - Vondrášek, Jiří - Bouř, Petr - Bednárová, Lucie - Andrushchenko, Valery - Dračínský, Martin - Rulíšek, Lubomír
What are the minimal folding seeds in proteins? Experimental and theoretical assessment of secondary structure propensities of small peptide fragments.
Chemical Science. Roč. 15, č. 2 (2024), s. 594-608. ISSN 2041-6520. E-ISSN 2041-6539
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05940S; GA ČR(CZ) GA22-33060S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: vibrational circular dichroism * spin coupling constants * conformational propensities
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 7.4, rok: 2024 ; AIS: 1.819, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D3SC04960D
Kalvoda, Tadeáš
- Bednárová, Lucie
- Andrushchenko, Valery
- Dračínský, Martin
- Rulíšek, Lubomír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349025

0556929 - ÚOCHB 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Tupec, Michal - Culka, Martin - Machara, Aleš - Macháček, Stanislav - Bím, Daniel - Svatoš, Aleš - Rulíšek, Lubomír - Pichová, Iva
Understanding desaturation/hydroxylation activity of castor stearoyl Δ9-Desaturase through rational mutagenesis.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, March (2022), s. 1378-1388. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19148; GA MŠMT(CZ) LM2015064; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Δ9 desaturase * methane monooxygenase * reaction mechanism * proton transfer * desaturation * hydroxylation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6, rok: 2022 ; AIS: 1.411, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.03.010
Rulíšek, Lubomír
- Pichová, Iva
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331046

0588381 - ÚFCH JH 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Wojdyla, Zuzanna Marta - Maldonado-Domínguez, Mauricio - Bharadwaz, Priyam - Culka, Martin - Srnec, Martin
Elucidation of factors shaping reactivity of 5′-deoxyadenosyl - a prominent organic radical in biology.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 26, č. 30 (2024), s. 20280-20295. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004617; GA ČR(CZ) GA24-11247S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: coupled electron-transfer * hydrogen-atom transfer * pyruvate formate-lyase * s-adenosylmethionine * lysine 2,3-aminomutase * structural basis * free-energy * enzyme * solvation * mechanism
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2024 ; AIS: 0.592, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
Srnec, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355282