Publikace ASEP
0638779 - BTÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Campbell, Jana - Vošahlíková, Miroslava - Ismail, S. - Volníková, Margareta - Motlová, Lucia - Kudláčová, Julia - Ustinova, Kseniya - Šnajdr, Ivan - Nováková, Zora - Basta, Miroslav - Gutsche, I. - Moutin, M. - Desfosses, A. - Bařinka, Cyril
Mechanistic insights into TTLL11 polyglutamylase-mediated primary tubulin chain elongation.
Science Advances. Roč. 11, č. 34 (2025), č. článku eadw1561. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07149S; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974; GA MŠMT(CZ) EH23_015/0008175; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; EATRIS-CZ IV - 90253
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: posttranslational modifications * polymerization-depolymerization * alpha-tubulin * glutamylation * code * microtubules * purification * tyrosination * transport * enzymes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 12.5, rok: 2024 ; AIS: 4.859, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2409-9279/8/4/95
Bařinka, Cyril
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0369841
0566024 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jedličková, L. - Peterková, K. - Boateng, E. M. - Ulrychová, Lenka - Vacek, V. - Kutil, Zsófia - Jiang, Z. - Nováková, Zora - Šnajdr, Ivan - Kim, J. - O’Donoghue, A. J. - Bařinka, Cyril - Dvořák, Jan
Characterization of glutamate carboxypeptidase 2 orthologs in trematodes.
Parasites & Vectors. Roč. 15, č. 1 (2022), č. článku 480. ISSN 1756-3305. E-ISSN 1756-3305
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14167S; GA ČR(CZ) GJ19-22269Y
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: platyhelminth * M28B metalloproteases * prostate specific-membrane antigen * Schistosoma mansoni * Fasciola hepatica * RNA in situ hybridization * folate hydrolase * immunohistochemistry * NAALADase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2022 ; AIS: 0.797, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s13071-022-05556-5
Dvořák, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0337467
0617027 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lee, C. B. - Šnajdr, Ivan - Tenora, Lukáš - Alt, J. - Gori, S. - Krečmerová, Marcela - Maragakis, R. M. - Paule, J. - Tiwari, S. - Iyer, J. - Talwar, R. - Garza, L. - Majer, Pavel - Slusher, B. S. - Rais, R.
Discovery of Orally Available Prodrugs of Itaconate and Derivatives.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 68, č. 3 (2025), s. 3433-3444. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023053
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: growth in vitro * alopecia areata * inhibition
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c02646
Majer, Pavel
- Slusher, B. S.
- Rais, R.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0364036
0574532 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Motlová, Lucia - Šnajdr, Ivan - Kutil, Zsófia - Andris, Erik - Ptáček, Jakub - Novotná, Adéla - Nováková, Zora - Havlínová, Barbora - Tueckmantel, W. - Dráberová, Helena - Majer, Pavel - Schutkowski, M. - Kozikowski, A. - Rulíšek, Lubomír - Bařinka, Cyril
Comprehensive Mechanistic View of the Hydrolysis of Oxadiazole-Based Inhibitors by Histone Deacetylase 6 (HDAC6).
ACS Chemical Biology. Roč. 18, č. 7 (2023), s. 1594-1610. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S; GA ČR(CZ) GA23-05940S; GA MŠMT(CZ) LUAUS23247
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; EATRIS-CZ IV - 90253
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: BASIS-SETS * COSMO * ENERGY * REFINEMENT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2023 ; AIS: 1.31, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.3c00212
Rulíšek, Lubomír
- Bařinka, Cyril
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0347139
0578510 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Novotná, Kateřina - Tenora, Lukáš - Prchalová, E. - Paule, J. - Alt, J. - Veeravalli, V. - Lam, J. - Wu, Y. - Šnajdr, Ivan - Gori, S. - Mettu, V. S. - Tsukamoto, T. - Majer, Pavel - Slusher, B. S. - Rais, R.
Discovery of tert-Butyl Ester Based 6-Diazo-5-oxo-L-norleucine Prodrugs for Enhanced Metabolic Stability and Tumor Delivery.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 66, č. 22 (2023), s. 15493-15510. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT LTAUSA18166; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phase-I * 6-diazo-5-oxo-l-norleucine DON * clinical pharmacology
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.652, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.3c01681
Majer, Pavel
- Slusher, B. S.
- Rais, R.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0347498
0574388 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Peters, D. E. - Norris, L. D. - Tenora, Lukáš - Šnajdr, Ivan - Ponti, A. K. - Zhu, X. - Sakamoto, S. - Veeravalli, V. - Pradhan, M. - Alt, J. - Thomas, A. G. - Majer, Pavel - Rais, R. - McDonald, C. - Slusher, B. S.
A gut-restricted glutamate carboxypeptidase II inhibitor reduces monocytic inflammation and improves preclinical colitis.
Science Translational Medicine. Roč. 15, č. 708 (2023), č. článku eabn7491. ISSN 1946-6234. E-ISSN 1946-6242
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018133
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: gene expression profiles * dextran sulfate sodium * membrane antigen PSMA
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 15.8, rok: 2023 ; AIS: 6.967, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1126/scitranslmed.abn7491
Rais, R.
- McDonald, C.
- Slusher, B. S.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344718
0571548 - BTÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Ptáček, Jakub - Šnajdr, Ivan - Schimer, Jiří - Kutil, Zsófia - Mikesova, Jana - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Tueckmantel, W. - Majer, Pavel - Kozikowski, A. - Bařinka, Cyril
Selectivity of Hydroxamate- and Difluoromethyloxadiazole-Based Inhibitors of Histone Deacetylase 6 In Vitro and in Cells.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 24, č. 5 (2023), č. článku 4720. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: metallohydrolase * histone deacetylase * inhibitor profiling * tubulin * histone acetylation * nanoBRET
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2023 ; AIS: 1.055, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/24/5/4720
Bařinka, Cyril
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342903
0568134 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tsai, J. - Gori, S. - Alt, J. - Tiwari, S. - Iyer, J. - Talwar, R. - Hinsu, D. - Ahirwar, K. - Mohanty, S. - Khunt, C. - Sutariya, B. - Jani, K. - Venkatasubbaiah, V. - Patel, A. - Meghapara, J. - Joshi, K. - Sahu, R. - Rana, V. - Nigade, P. - Talluri, R. S. - Murty, K. V. S. N. - Joshi, K. - Ramanathan, V. - Li, A. - Islam, N. - Šnajdr, Ivan - Majer, Pavel - Rais, R. - Slusher, B. S. - Garza, L. A.
Topical SCD-153, a 4-methyl itaconate prodrug, for the treatment of alopecia areata.
PNAS Nexus. Roč. 2, č. 1 (2023), č. článku pgac297. E-ISSN 2752-6542
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: alopecia areata * hair growth * topical * itaconate * prodrug * inflammation * immunosuppression * cytokine * interleukin * interferon * double-stranded RNA * polyinosinic–polycytidylic acid * hair cycle * anagen * telogen * keratinocyte * stability * pharmacokinetics * cytotoxicity
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 3, rok: 2023 ; AIS: 1.115, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/pnasnexus/pgac297
Rais, R.
- Slusher, B. S.
- Garza, L. A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0339488
0564793 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tůmová, Šárka - Miláček, Matěj - Šnajdr, Ivan - Muthu, Magesh - Tůma, R. - Řeha, D. - Jedlička, Pavel - Bittová, Lenka - Novotná, Adéla - Majer, Pavel - Sedlák, David - Jindra, Marek
Unique peptidic agonists of a juvenile hormone receptor with species-specific effects on insect development and reproduction.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 119, č. 48 (2022), č. článku e2215541119. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-05151X; GA MŠMT(CZ) LM2018130
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: hormone receptor * juvenile hormone * ligand-binding pocket
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X); Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 11.1, rok: 2022 ; AIS: 4.488, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.pnas.org/doi/epdf/10.1073/pnas.2215541119
Jindra, Marek
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336446