Maloy Řezáčová Pavlína

0570585 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Buša, Michal - Matoušková, Zuzana - Bartošová-Sojková, Pavla - Pachl, Petr - Řezáčová, Pavlína - Eichenberger, R. M. - Deplazes, P. - Horn, Martin - Štefanić, S. - Mareš, Michael
An evolutionary molecular adaptation of an unusual stefin from the liver fluke Fasciola hepatica redefines the cystatin superfamily.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 299, č. 3 (2023), č. článku 102970. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA19-17269S; GA ČR(CZ) GA21-16565S; GA MŠMT(CZ) LTAUSA19109
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: cystatin * stefin * protease inhibitor * cysteine cathepsin * protein structure * protein evolution * helminth parasite
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2023 ; AIS: 1.471, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.jbc.2023.102970
Štefanić, S.
- Mareš, Michael
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0341888

0567034 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fanfrlík, Jindřich - Brynda, Jiří - Kugler, Michael - Lepšík, Martin - Pospíšilová, Klára - Holub, Josef - Hnyk, Drahomír - Nekvinda, Jan - Grüner, Bohumír - Řezáčová, Pavlína
B-H⋯π and C-H⋯π interactions in protein-ligand complexes: carbonic anhydrase II inhibition by carborane sulfonamides.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 25, č. 3 (2023), s. 1728-1733. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102; GA ČR(CZ) GA21-14409S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388980
Klíčová slova: ⋯π * hydrogen bond * dispersion
Obor OECD: Physical chemistry; Inorganic and nuclear chemistry (UACH-T)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2023 ; AIS: 0.624, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2CP04673C

Fanfrlík, Jindřich Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0338302

0599993 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Havlíčková, P. - Gavira, J. A. - Mesters, J. R. - Koutská, A. - Kaščáková, B. - Prudnikova, T. - Hilgenfeld, R. - Garcia-Ruiz, J. M. - Řezáčová, Pavlína - Kutá Smatanová, I.
Practical courses on advanced methods in macromolecular crystallization: 20 years of history and future perspectives.
Journal of Applied Crystallography. Roč. 57, č. 5 (2024), s. 1609-1617. ISSN 1600-5767. E-ISSN 1600-5767
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: crystallogenesis * teaching * hands-on exercises * Czech Republic * FEBS * crystallization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 1.246, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1107/S1600576724007106
Řezáčová, Pavlína
- Kutá Smatanová, I.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357366

0562052 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jorda, R. - Havlíček, Libor - Peřina, M. - Vojáčková, V. - Pospíšil, T. - Djukic, Stefan - Škerlová, Jana - Grúz, J. - Renešová, N. - Klener, P. - Řezáčová, Pavlína - Strnad, Miroslav - Kryštof, V.
3,5,7-Substituted Pyrazolo[4,3- d]Pyrimidine Inhibitors of Cyclin-Dependent Kinases and Cyclin K Degraders.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 65, č. 13 (2022), s. 8881-8896. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA20-25308S
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Antineoplastic Agents * Cell Line * Cyclin-Dependent Kinases
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022 ; AIS: 1.587, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c02184
Kryštof, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0334472

0571975 - ÚEB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kovalová, M. - Havlíček, Libor - Djukic, Stefan - Škerlová, Jana - Peřina, M. - Pospíšil, T. - Řezníčková, E. - Řezáčová, Pavlína - Jorda, R. - Kryštof, V.
Characterization of new highly selective pyrazolo[4,3-d]pyrimidine inhibitor of CDK7.
Biomedicine & Pharmacotherapy. Roč. 161, MAY (2023), č. článku 114492. ISSN 0753-3322. E-ISSN 1950-6007
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Cyclin-dependent kinase 7 * Inhibitor * pyrazolo[4,3-d]pyrimidine * Selectivity
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.141, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.biopha.2023.114492
Kryštof, V.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342824

0565749 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kugler, Michael - Hadzima, Martin - Dzijak, Rastislav - Rampmaier, Robert - Srb, Pavel - Vrzal, Lukáš - Voburka, Zdeněk - Majer, Pavel - Řezáčová, Pavlína - Vrábel, Milan
Identification of specific carbonic anhydrase inhibitors via in situ click chemistry, phage-display and synthetic peptide libraries: comparison of the methods and structural study.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 14, č. 1 (2023), s. 144-153. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
GRANT EU: European Commission(XE) 677465 - SWEETOOLS
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: fragment-based discovery * combinatorial libraries * generation
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.896, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2MD00330A
Řezáčová, Pavlína
- Vrábel, Milan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0337258

0569100 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Marinovic, M. A. - Bekic, S. S. - Kugler, Michael - Brynda, Jiří - Škerlová, Jana - Skoric, D. D. - Řezáčová, Pavlína - Petri, E. T. - Celic, A. S.
X-ray structure of human aldo-keto reductase 1C3 in complex with a bile acid fused tetrazole inhibitor: experimental validation, molecular docking and structural analysis.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 14, č. 2 (2023), s. 341-355. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: prostaglandin-F synthase * crystal structures * CCP4 suite
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.896, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2MD00387B
Celic, A. S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340422

0617508 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pachl, Petr - Coudray, L. - Vincent, R. - Nilles, L. - Scheer, H. - Ritzenthaler, C. - Fejfarová, Adéla - Řezáčová, Pavlína - Engilberge, S. - Sauter, C.
Protein crystallization and structure determination at room temperature in the CrystalChip.
FEBS Open Bio. Roč. 15, č. 4 (2025), s. 532-541. ISSN 2211-5463. E-ISSN 2211-5463
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) 8J23FR035
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: CrystalChip * crystallization * microcrystals * microfluidics * serial crystallography
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.3, rok: 2024 ; AIS: 0.568, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/2211-5463.13932
Sauter, C.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364398

0639306 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Plavša-Puž, J. J. - Brynda, Jiří - Ajduković, J. J. - Bekić, S. - Ćelić, A. - Řezáčová, Pavlína - Škerlová, Jana - Petri, E.
The structural basis of aldo-keto reductase 1C3 inhibition by 17α-picolyl and 17(E)-picolinylidene androstane derivatives.
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. Roč. 40, č. 1 (2025), č. článku 2551979. ISSN 1475-6366. E-ISSN 1475-6374
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: AKR1C3 * prostate cancer * molecular docking * CYP17 * protein X-ray crystallography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2024 ; AIS: 0.725, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/14756366.2025.2551979
Škerlová, Jana
- Petri, E.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369756

0644991 - ÚOCHB 2027 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Serianni, Valentina - Škerlová, Jana - Dubánková Knopp, Anna - Škríba, Anton - Šváchová, Hana - Vučková, Tereza - Filimoněnko, Anatolij - Fábry, Milan - Řezáčová, Pavlína - Kouba, Tomáš - Cahová, Hana
Molecular insight into 5′ RNA capping with NpnNs by bacterial RNA polymerase.
Nature Chemical Biology. (2026). ISSN 1552-4450. E-ISSN 1552-4469
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 101041374 - StressRNaction
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: start site selection * structural basis * cryo-em
Impakt faktor: 13.7, rok: 2024 ; AIS: 6.675, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41589-025-02134-5
Kouba, Tomáš
- Cahová, Hana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374836

0572565 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Skácel, Jan - Djukic, Stefan - Baszczyňski, Ondřej - Kalčic, Filip - Bílek, Tadeáš - Chalupský, Karel - Kozák, Jaroslav - Dvořáková, Alexandra - Tloušťová, Eva - Kráľová, Zuzana - Šmídková, Markéta - Voldřich, Jan - Rumlová, M. - Pachl, Petr - Brynda, Jiří - Vučková, Tereza - Fábry, Milan - Snášel, Jan - Pichová, Iva - Řezáčová, Pavlína - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Janeba, Zlatko
Design, Synthesis, Biological Evaluation, and Crystallographic Study of Novel Purine Nucleoside Phosphorylase Inhibitors.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 66, č. 10 (2023), s. 6652-6681. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN01000013; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: multisubstrate analog inhibitors * transition-state analog * human erythrocytes
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.652, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c02097
Řezáčová, Pavlína
- Mertlíková-Kaiserová, Helena
- Janeba, Zlatko
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343213

0587190 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Spampinato, Ambra - Leone, Denise Liu - Pohl, Radek - Tarábek, Ján - Šoltysová, Markéta - Polák, Marek - Kádek, Alan - Sýkorová, Veronika - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal
ABNOH-Linked Nucleotides and DNA for Bioconjugation and Cross-linking with Tryptophan-Containing Peptides and Proteins.
Chemistry - A European Journal. Roč. 30, č. 49 (2024), č. článku e202402151. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: bioconjugation * DNA * proteins * nucleotides * oligonucleotides * peptides * N-oxyl radicals
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 0.762, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202402151
Hocek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354457

0603987 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Škerlová, Jana - Krejčiříková, Veronika - Peřina, M. - Vojáčková, V. - Fábry, Milan - Kryštof, V. - Jorda, R. - Řezáčová, Pavlína
CDK2-based CDK7 mimic as a tool for structural analysis: Biochemical validation and crystal structure with SY5609.
International Journal of Biological Macromolecules. Roč. 294, March (2025), č. článku 139117. ISSN 0141-8130. E-ISSN 1879-0003
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclin-dependent kinase * inhibitor * SY5609 * selectivity * X-ray crystallography * structure-assisted inhibitor design
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.5, rok: 2024 ; AIS: 1.013, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.139117

Škerlová, Jana Jorda, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361309

0598163 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Škerlová, Jana - Brynda, Jiří - Šobotník, Jan - Zákopčaník, Marek - Novák, Petr - Bourguignon, T. - Sillam-Dussès, D. - Řezáčová, Pavlína
Crystal structure of blue laccase BP76, a unique termite suicidal defense weapon.
Structure. Roč. 32, č. 10 (2024), s. 1581-1585. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: Neocapritermes taracua * colony defence * autothysis * benzoquinone * X-ray crystallography * single-wavelength anomalous diffraction * laccase * insect glycosylation * protein stabilization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Ecology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.07.015
Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355900

0586786 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šoltysová, Markéta - Škerlová, Jana - Pachl, Petr - Škubník, K. - Fábry, Milan - Sieglová, Irena - Farolfi, Martina - Grishkovskaya, I. - Babiak, M. - Nováček, J. - Krásný, Libor - Řezáčová, Pavlína
Structural characterization of two prototypical repressors of SorC family reveals tetrameric assemblies on DNA and mechanism of function.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 12 (2024), s. 7305-7320. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA23-06295S
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: central glycolytic genes * effector-binding domain * subtilis RNA polymerase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae434
Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354179

0598140 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šoltysová, Markéta - Řezáčová, Pavlína
Structure and function of bacterial transcription regulators of the SorC family.
Transcription-Austin. Roč. 15, 3/5 (2024), s. 139-160. ISSN 2154-1264. E-ISSN 2154-1272
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SorC family * bacterial transcription regulation * carbohydrate metabolism * quorum sensing
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2024 ; AIS: 2.472, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/21541264.2024.2387895
Šoltysová, Markéta
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355870

0604332 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šoltysová, Markéta - Güixens-Gallardo, Pedro - Sieglová, Irena - Soldánová, Anna - Krejčiříková, Veronika - Fábry, Milan - Brynda, Jiří - Khoroshyy, Petro - Hocek, Michal - Řezáčová, Pavlína
Using environment-sensitive tetramethylated thiophene-BODIPY fluorophores in DNA probes for studying effector-induced conformational changes of protein–DNA complexes.
RSC Chemical Biology. Roč. 6, č. 3 (2025), s. 376-386. ISSN 2633-0679. E-ISSN 2633-0679
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Bacillus subtilis * transcription * repressor
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 1.139, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4CB00260A
Hocek, Michal
- Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361714

0563157 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vavřina, Zdeněk - Perlíková, Pavla - Milisavljevič, Nemanja - Chevrier, Florian - Smola, Miroslav - Smith, Joshua - Dejmek, Milan - Havlíček, Vojtěch - Buděšínský, Miloš - Liboska, Radek - Vaneková, Lenka - Brynda, Jiří - Bouřa, Evžen - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal - Birkuš, Gabriel
Design, Synthesis, and Biochemical and Biological Evaluation of Novel 7-Deazapurine Cyclic Dinucleotide Analogues as STING Receptor Agonists.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 65, č. 20 (2022), s. 14082-14103. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: GMP-AMP synthase * interferon genes * adapter protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022 ; AIS: 1.587, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c01305
Perlíková, Pavla
- Birkuš, Gabriel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335201

0638492 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zakšauskas, A. - Paketurytė-Latvė, V. - Janku̅naitė, A. - Čapkauskaitė, E. - Becart, Y. - Smirnov, A. - Pospíšilová, Klára - Leitans, J. - Brynda, Jiří - Kazaks, A. - Baranauskienė, L. - Manakova, E. - Gražulis, S. - Kairys, V. - Tars, K. - Řezáčová, Pavlína - Matulis, D.
Affinity and Selectivity of Protein-Ligand Recognition: A Minor Chemical Modification Changes Carbonic Anhydrase Binding Profile.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 68, č. 16 (2025), s. 17752-17773. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular force field * Gaussian basis sets * diuretic agents
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c01421
Matulis, D.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0369149