Nápověda

Srb Pavel

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 11

0561949 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hušková, Andrea - Dinesh, Dhurvas Chandrasekaran - Srb, Pavel - Bouřa, Evžen - Veverka, Václav - Šilhán, Jan
Model of abasic site DNA cross-link repair, from the architecture of NEIL3 DNA binding domains to the X-structure model.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 18 (2022), s. 10436-10448. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: covalent structure * crystal-structure * fanconis anemia
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkac793
Šilhán, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0334376

0635728 - FGÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kohoutová, Klára - Srb, Pavel - Obšilová, Veronika - Veverka, Václav - Obšil, Tomáš
Structural plasticity of the FOXO-DBD:p53-TAD interaction.
Nature Communications. Roč. 16, 27 May (2025), č. článku 4907. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-02080S; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:61388963
Klíčová slova: forkhead transcription factors * p53 * cellular senescence * protein-protein interactions * NMR spectroscopy
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-025-59106-5
Obšilová, Veronika
- Obšil, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366760

0619174 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kormaník, Ján Michael - Herman, Daniel - Andris, Erik - Culka, Martin - Gutten, Ondrej - Kožíšek, Milan - Bednárová, Lucie - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Rulíšek, Lubomír
Design of Zn-Binding Peptide(s) from Protein Fragments.
Chembiochem. Roč. 26, č. 7 (2025), č. článku e202401014. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05940S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: zinc(II) * metal-binding peptide * computer design * isothermal calorimetry * NMR * QM modeling
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.765, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cbic.202401014
Rulíšek, Lubomír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365914

0575033 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Koutná, Eliška - Lux, Vanda - Kouba, Tomáš - Škerlová, Jana - Nováček, J. - Srb, Pavel - Hexnerová, Rozálie - Šváchová, Hana - Kukačka, Zdeněk - Novák, Petr - Fábry, Milan - Poepsel, S. - Veverka, Václav
Multivalency of nucleosome recognition by LEDGF.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 18 (2023), s. 10011-10025. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-03028S; GA ČR(CZ) GA22-27695S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LO1304
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127; CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: PWWP domain * recombinant histones * structural basis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkad674
Veverka, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344870

0565749 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kugler, Michael - Hadzima, Martin - Dzijak, Rastislav - Rampmaier, Robert - Srb, Pavel - Vrzal, Lukáš - Voburka, Zdeněk - Majer, Pavel - Řezáčová, Pavlína - Vrábel, Milan
Identification of specific carbonic anhydrase inhibitors via in situ click chemistry, phage-display and synthetic peptide libraries: comparison of the methods and structural study.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 14, č. 1 (2023), s. 144-153. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
GRANT EU: European Commission(XE) 677465 - SWEETOOLS
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: fragment-based discovery * combinatorial libraries * generation
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.896, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2MD00330A
Řezáčová, Pavlína
- Vrábel, Milan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0337258

0556576 - FGÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mandal, R. - Kohoutová, Klára - Petrvalská, Olivia - Horváth, M. - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Obšilová, Veronika - Obšil, Tomáš
FOXO4 interacts with p53 TAD and CRD and inhibits its binding to DNA.
Protein Science. Roč. 31, č. 5 (2022), č. článku e4287. ISSN 0961-8368. E-ISSN 1469-896X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-02080S
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:61388963
Klíčová slova: DNA binding * forkhead box O 4 * nuclear magnetic resonance * protein-protein interaction * senescence * transcription factor p53
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8, rok: 2022 ; AIS: 3.623, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/pro.4287
Obšilová, Veronika
- Obšil, Tomáš
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330737

0582851 - ÚOCHB 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Matoušková, Zuzana - Orsághová, Katarína - Srb, Pavel - Pytelková, Jana - Kukačka, Zdeněk - Buša, Michal - Hajdušek, Ondřej - Šíma, Radek - Fábry, Milan - Novák, Petr - Horn, Martin - Kopáček, Petr - Mareš, Michael
An Unusual Two-Domain Thyropin from Tick Saliva: NMR Solution Structure and Highly Selective Inhibition of Cysteine Cathepsins Modulated by Glycosaminoglycans.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 25, č. 4 (2024), č. článku 2240. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-08826S; GA ČR(CZ) GA22-27695S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-30920S; GA MŠMT(CZ) LUC23037
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: cathepsin * cysteine protease * tick * parasite * saliva * thyropin * protease inhibitor * protein structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.9, rok: 2024 ; AIS: 1.121, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms25042240
Mareš, Michael
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350903

0637921 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Raindlová, Veronika - Viktorinová, Klára - Tichý, Michal - Bednárová, Lucie - Srb, Pavel - Riopedre Fernández, Miguel - Hocek, Michal
Milligram-Scale Enzymatic Synthesis of Base-Modified DNA through Primer Extension: Polymerase Synthesis and NMR Structures of DNA Containing Phenyl-Substituted Nucleobases.
ChemistryEurope. Roč. 3, č. 6 (2025), č. článku e202500186. ISSN 2751-4765
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GX20-00885X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA polymerases * NMR spectroscopy * nucleoside triphosphates * nucleotides * oligonucleotides
Obor OECD: Organic chemistry
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/ceur.202500186
Hocek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368682

0598148 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Sgallová, Ráchel - Volek, Martin - Kurfürst, Jaroslav - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Curtis, Edward A.
NMR screen reveals the diverse structural landscape of a G-quadruplex library.
Chemistry - A European Journal. Roč. 30, č. 67 (2024), č. článku e202401437. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA * G-quadruplex * multimeric structures * NMR
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 0.762, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202401437
Curtis, Edward A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355878

0586924 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Volek, Martin - Kurfürst, Jaroslav - Kožíšek, Milan - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Curtis, Edward A.
Apollon: a deoxyribozyme that generates a yellow product.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 15 (2024), s. 9062-9075. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-11210S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: in vitro * secondary structure * nucleic acids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae490
Curtis, Edward A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354293

0586905 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Volek, Martin - Kurfürst, Jaroslav - Drexler, Matúš - Svoboda, Michal - Srb, Pavel - Veverka, Václav - Curtis, Edward A.
Aurora: a fluorescent deoxyribozyme for high-throughput screening.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 15 (2024), s. 9049-9061. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA24-11210S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: in vitro selection * DNA aptamer pair * allosteric ribozyme
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae467
Curtis, Edward A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354277