Nápověda

Bouřa Evžen

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 43

0570610 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Almaliti, J. - Fajtová, Pavla - Calla, J. - LaMonte, G. M. - Feng, M. - Rocamora, F. - Ottilie, S. - Glukhov, E. - Bouřa, Evžen - Suhandynata, R. T. - Momper, J. D. - Gilson, M. K. - Winzeler, E. A. - Gerwick, W. H. - O'Donoghue, A. J.
Development of Potent and Highly Selective Epoxyketone-Based Plasmodium Proteasome Inhibitors.
Chemistry - A European Journal. Roč. 29, č. 20 (2023), č. článku e202203958. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
GRANT EU: European Commission(XE) 846688 - ProTeCT
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: epoxyketone * inhibition * malaria * plasmodium * proteasome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2023 ; AIS: 0.89, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202203958

Almaliti, J. O'Donoghue, A. J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0341912

0602136 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Balleková, Alena - Eisenreichová, Andrea - Różycki, B. - Bouřa, Evžen - Humpolíčková, Jana
Coordination of transporter, cargo, and membrane properties during non-vesicular lipid transport.
Communications Biology. Roč. 7, November (2024), č. článku 1585. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-27735K; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004607
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: oxysterol-binding protein-related proteins * Osh6 * phosphatidylinositol 4-phosphate * phosphatidyl serine * large unilamellar vesicles * lipid transport
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-024-07301-3

Balleková, Alena Humpolíčková, Jana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359346

0580809 - ÚOCHB 2024 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Bouřa, Evžen
Strukturní biologie v antivirovém výzkumu na příbězích kinas lipidů, proteinu STING a virových methyltransferas.
[Structural Biology in Antiviral Research – A Story Illustrated by the Tales of Lipid Kinases, STING and Viral Methyltransferases.]
Chemické listy. Roč. 117, č. 12 (2023), s. 755-763. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antivirals * lipid kinase * STING * methyltransferase * virus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 0.6, rok: 2023 ; AIS: 0.019, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.54779/chl20230755
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349574

0559980 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dejmek, Milan - Šála, Michal - Brázdová, Andrea - Vaneková, Lenka - Smola, Miroslav - Klíma, Martin - Břehová, Petra - Buděšínský, Miloš - Dračínský, Martin - Procházková, Eliška - Zavřel, Martin - Šimák, Ondřej - Páv, Ondřej - Bouřa, Evžen - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim
Discovery of isonucleotidic CDNs as potent STING agonists with immunomodulatory potential.
Structure. Roč. 30, č. 8 (2022), s. 1146-1156. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic dinucleotides * prodrugs * STING agonists * isonucleosides * cytokines * cancer
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.7, rok: 2022 ; AIS: 2.249, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2022.05.012
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333087

0574383 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dejmek, Milan - Brázdová, Andrea - Otava, Tomáš - Pimková Polidarová, Markéta - Klíma, Martin - Smola, Miroslav - Vavřina, Zdeněk - Buděšínský, Miloš - Dračínský, Martin - Liboska, Radek - Bouřa, Evžen - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim
Vinylphosphonate-based cyclic dinucleotides enhance STING-mediated cancer immunotherapy.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 259, November (2023), č. článku 115685. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Výzkumná infrastruktura: CCP II - 90126
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic dinucleotides * STING * cancer * intratumoral administration * immunotherapy
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6, rok: 2023 ; AIS: 0.979, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2023.115685
Birkuš, Gabriel
- Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344716

0573932 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Duchoslav, Vojtěch - Bouřa, Evžen
Structure of monkeypox virus poxin: implications for drug design.
Archives of Virology. Roč. 168, č. 7 (2023), č. článku 192. ISSN 0304-8608. E-ISSN 1432-8798
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: virus * poxin * nuclease * crystal structure
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2023 ; AIS: 0.445, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00705-023-05824-4
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344320

0574877 - ÚOCHB 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Eisenreichová, Andrea - Klíma, Martin - Anila, M. M. - Koukalová, Alena - Humpolíčková, Jana - Rozycki, B. - Bouřa, Evžen
Crystal Structure of the ORP8 Lipid Transport ORD Domain: Model of Lipid Transport.
Cells. Roč. 12, č. 15 (2023), č. článku 1974. ISSN 2073-4409. E-ISSN 2073-4409
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-27735K
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: lipid transport * ORD * ORP8 * PS * PI4P * plasma membrane * ER
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2023 ; AIS: 1.34, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/cells12151974
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344801

0575761 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Eisenreichová, Andrea - Humpolíčková, Jana - Różycki, B. - Bouřa, Evžen - Koukalová, Alena
Effects of biophysical membrane properties on recognition of phosphatidylserine, or phosphatidylinositol 4-phosphate by lipid biosensors LactC2, or P4M.
Biochimie. Roč. 215, December (2023), s. 42-49. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-27735K
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: lipid biosensors * LactC2 * P4M * membrane properties * negatively charged lipids * membrane fluidity * phosphatidylinositol 4-phosphate * phosphatidylserine * LUVs
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.3, rok: 2023 ; AIS: 0.726, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.biochi.2023.09.003
Koukalová, Alena
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345489

0559451 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Eisenreichová, Andrea - Bouřa, Evžen
Structural basis for SARS-CoV-2 nucleocapsid (N) protein recognition by 14-3-3 proteins.
Journal of Structural Biology. Roč. 214, č. 3 (2022), č. článku 107879. ISSN 1047-8477. E-ISSN 1095-8657
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: binding * motif
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3, rok: 2022 ; AIS: 1.724, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.jsb.2022.107879
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0332747

0602601 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fajtová, Pavla - Hurysz, B. M. - Miyamoto, Y. - Serafim, M. S. M. - Jiang, Z. - Vazquez, J. M. - Trujillo, D. F. - Liu, L. J. - Somani, U. - Almaliti, J. - Myers, S. A. - Caffrey, C. R. - Gerwick, W. H. - McMinn, D. L. - Kirk, C. J. - Bouřa, Evžen - Eckmann, L. - O'Donoghue, A. J.
Distinct substrate specificities of the three catalytic subunits of the Trichomonas vaginalis proteasome.
Protein Science. Roč. 33, č. 12 (2024), č. článku e5225. ISSN 0961-8368. E-ISSN 1469-896X
GRANT EU: European Commission(XE) 846688 - ProTeCT
AV ČR(CZ) MSM200551901
Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: drug discovery * drug screening * parasite * protease inhibitor * proteasome * substrate specificity * trichomonas
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2024 ; AIS: 3.697, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/pro.5225
O'Donoghue, A. J.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359815

0639711 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Havlíková, Jana - Dejmek, Milan - Hušková, Andrea - Allan, A. - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim - Šilhán, Jan
Mechanistic insights into alcohol-induced DNA crosslink repair by Slx4-Xpf-Ercc1 nuclease complex in the Fanconi anaemia pathway.
Communications Biology. Roč. 8, September (2025), č. článku 1374. E-ISSN 2399-3642
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-12306S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: endogenous aldehydes * replication * acetaldehyde
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-025-08769-3
Šilhán, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370157

0557410 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Holoubek, Jiří - Bednářová, Klára - Haviernik, Jan - Huvarová, I. - Dvořáková, Zuzana - Černý, J. - Outlá, Martina - Salát, Jiří - Konkoľová, Eva - Bouřa, Evžen - Růžek, Daniel - Vorlíčková, Michaela - Eyer, Luděk - Renčiuk, Daniel
Guanine quadruplexes in the RNA genome of the tick-borne encephalitis virus: their role as a new antiviral target and in virus biology.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 8 (2022), s. 4574-4600. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-20229S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: intercalator displacement assay * forming sequences * small-molecule * binding * dna * fluorescence * zika * identification * pyridostatin * inactivation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (BFU-R); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/50/8/4574/6568495?login=true
Eyer, Luděk
- Renčiuk, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339132

0561949 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hušková, Andrea - Dinesh, Dhurvas Chandrasekaran - Srb, Pavel - Bouřa, Evžen - Veverka, Václav - Šilhán, Jan
Model of abasic site DNA cross-link repair, from the architecture of NEIL3 DNA binding domains to the X-structure model.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 18 (2022), s. 10436-10448. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: covalent structure * crystal-structure * fanconis anemia
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkac793
Šilhán, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0334376

0556771 - ÚOCHB 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hušková, Andrea - Landová, Barbora - Bouřa, Evžen - Šilhán, Jan
The rate of formation and stability of abasic site interstrand crosslinks in the DNA duplex.
Dna Repair. Roč. 113, May (2022), č. článku 103300. ISSN 1568-7864. E-ISSN 1568-7856
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ17-21649Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA damage * interstrand crosslink * abasic site * non-enzyme kinetics * DNA repair
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022 ; AIS: 1.349, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.dnarep.2022.103300
Šilhán, Jan
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330959

0603499 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ivancová, Ivana - Sánchez Quirante, Tania - Ondruš, Marek - Pohl, Radek - Vlková, Marta - Žilecká, Eva - Bouřa, Evžen - Hocek, Michal
Enzymatic synthesis of reactive RNA probes containing squaramate-linked cytidine or adenosine for bioconjugations and cross-linking with lysine-containing peptides and proteins.
Communications Chemistry. Roč. 8, January (2025), č. článku 1. ISSN 2399-3669. E-ISSN 2399-3669
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-00885X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: binding sites * DNA * identification
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.2, rok: 2024 ; AIS: 1.568, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42004-024-01399-6
Hocek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360822

0585631 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kim, Y. J. - Pemberton, J. G. - Eisenreichová, Andrea - Mandal, A. - Koukalova, A. - Rohilla, P. - Sohn, M. - Konradi, A. W. - Tang, T. T. - Bouřa, Evžen - Balla, T.
Non-vesicular phosphatidylinositol transfer plays critical roles in defining organelle lipid composition.
EMBO Journal. Roč. 43, č. 10 (2024), s. 2035-2061. ISSN 0261-4189. E-ISSN 1460-2075
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phosphatidylinositol * non-vesicular lipid transport * membrane contact sites * phospholipase C * Golgi complex
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8.3, rok: 2024 ; AIS: 4.436, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s44318-024-00096-3
Balla, T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353312

0560340 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klíma, Martin - Yazdi, A. K. - Li, F. - Chau, I. - Hajian, T. - Bolotokova, A. - Kaniskan, H. U. - Han, Y. - Wang, K. - Li, D. - Luo, M. - Jin, J. - Bouřa, Evžen - Vedadi, M.
Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 in complex with small molecule inhibitors, SS148 and WZ16.
Protein Science. Roč. 31, č. 9 (2022), č. článku e4395. ISSN 0961-8368. E-ISSN 1469-896X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: covid-19 * nsp10 * nsp16 * SARS-CoV-2 * SS148 * WZ16
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 8, rok: 2022 ; AIS: 3.623, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/pro.4395
Bouřa, Evžen
- Vedadi, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333355

0583190 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klíma, Martin - Dejmek, Milan - Duchoslav, Vojtěch - Eisenreichová, Andrea - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Chalupská, Dominika - Novotná, Barbora - Birkuš, Gabriel - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Fluorinated cGAMP analogs, which act as STING agonists and are not cleavable by poxins: Structural basis of their function.
Structure. Roč. 32, č. 4 (2024), s. 433-439. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cyclic GMP-AMP * binding * design
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.01.008
Nencka, Radim
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351191

0598137 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Dvořáková, Alexandra - Zgarbová, Michala - Šála, Michal - Chalupský, Karel - Krafčíková, Petra - Otava, Tomáš - Drexler, Matúš - Procházková, Eliška - Klepetářová, Blanka - Štefek, Milan - Kozic, Ján - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Bouřa, Evžen - Weber, Jan - Nencka, Radim
Discovery of highly potent SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase inhibitors based on adenosine 5′-carboxamides.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 15, č. 10 (2024), s. 3469-3476. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: system * RNA
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4MD00422A
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355869

0556963 - ÚOCHB 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Konkoľová, Eva - Krejčová, Kateřina - Eyer, L. - Hodek, Jan - Zgarbová, Michala - Fořtová, A. - Jirásek, Michael - Teplý, Filip - Reyes Gutierrez, Paul Eduardo - Růžek, Daniel - Weber, Jan - Bouřa, Evžen
A Helquat-like Compound as a Potent Inhibitor of Flaviviral and Coronaviral Polymerases.
Molecules. Roč. 27, č. 6 (2022), č. článku 1894. ISSN 1420-3049. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-25280S; GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LTAUSA18016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: helquat-like compound * RNA-dependent RNA-polymerase * SARS-CoV-2 * flaviruses * antiviral agents
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022 ; AIS: 0.66, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/molecules27061894
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331081

0574116 - ÚEM 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kortus, Štěpán - Řeháková, Kristýna - Klíma, Martin - Kolcheva, Marharyta - Ladislav, Marek - Langore, Emily - Zahumenská, Petra - Netolický, Jakub - Misiachna, Anna - Hemelíková, Katarína - Humpolíčková, Jana - Chalupská, Dominika - Šilhán, Jan - Kaniaková, Martina - Hrčka Krausová, Barbora - Bouřa, Evžen - Zápotocký, Martin - Horák, Martin
Subunit-Dependent Surface Mobility and Localization of NMDA Receptors in Hippocampal Neurons Measured Using Nanobody Probes.
Journal of Neuroscience. Roč. 43, č. 26 (2023), s. 4755-4774. ISSN 0270-6474. E-ISSN 1529-2401
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-12420S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5107
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250; Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:68378041 ; RVO:61388963 ; RVO:67985823
Klíčová slova: GluN subunit * excitatory synapse * glutamate receptor * lateral diffusion * live microscopy * mammalian neuron
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X); Biochemistry and molecular biology (FGU-C)
Impakt faktor: 4.4, rok: 2023 ; AIS: 2.225, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.jneurosci.org/content/43/26/4755

Kortus, Štěpán Horák, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344475

0586989 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Krejčová, Kateřina - Krafčíková, Petra - Klíma, Martin - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Žilecká, Eva - Bouřa, Evžen
Structural and functional insights in flavivirus NS5 proteins gained by the structure of Ntaya virus polymerase and methyltransferase.
Structure. Roč. 32, č. 8 (2024), s. 1099-1109. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-25280S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: crystal structure * RNA polymerase * sequence
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.04.020
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354315

0617709 - ÚOCHB 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Krejčová, Kateřina - Bouřa, Evžen
Structural basis for broad-spectrum binding of AT-9010 to flaviviral methyltransferases.
Archives of Virology. Roč. 170, č. 3 (2025), č. článku 61. ISSN 0304-8608. E-ISSN 1432-8798
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: crystal structure * Zika virus * RNA
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2024 ; AIS: 0.481, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00705-025-06227-3
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364573

0569149 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Li, F. - Ghiabi, P. - Hajian, T. - Klíma, Martin - Li, A. S. M. - Yazdi, A. K. - Chau, I. - Loppnau, P. - Kutera, M. - Seitova, A. - Bolotokova, A. - Hutchinson, A. - Perveen, S. - Bouřa, Evžen - Vedadi, M.
SS148 and WZ16 inhibit the activities of nsp10-nsp16 complexes from all seven human pathogenic coronaviruses.
Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. Roč. 1867, č. 4 (2023), č. článku 130319. ISSN 0304-4165. E-ISSN 1872-8006
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: RNA methyltransferase * viral protein * enzyme purification * enzyme kinetics * RNA virus * nsp10-nsp16 complex * coronavirus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2023 ; AIS: 0.704, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bbagen.2023.130319
Vedadi, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340473

0579447 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Šála, Michal - Matoušová, Marika - Hercík, Kamil - Kocek, Hugo - Chalupská, Dominika - Chaloupecká, Ema - Hájek, Miroslav - Bouřa, Evžen - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Design, synthesis and evaluation of novel thieno[2,3d]pyrimidine derivatives as potent and specific RIPK2 inhibitors.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 97, January (2024), č. článku 129567. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: kinase inhibitor * thieno [2,3d] pyrimidine derivative * receptor-interacting protein kinase 2 * RIPK2 * NOD
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2023.129567
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348249

0574898 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Matoušová, Marika - Dvořáková, Alexandra - Hercík, Kamil - Škach, Kryštof - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Hájek, Miroslav - Bouřa, Evžen - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Nencka, Radim
Exploring positions 6 and 7 of a quinazoline-based scaffold leads to changes in selectivity and potency towards RIPK2/3 kinases.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 260, November (2023), č. článku 115717. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: kinase inhibitor * quinazoline derivatives * RIPK2 * NOD * inflammation * RIPK3
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 6, rok: 2023 ; AIS: 0.979, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2023.115717
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344824

0562658 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Misehe, Mbilo - Klíma, Martin - Matoušová, Marika - Chalupská, Dominika - Dejmek, Milan - Šála, Michal - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Structure-based design and modular synthesis of novel PI4K class II inhibitors bearing a 4-aminoquinazoline scaffold.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 76, November (2022), č. článku 129010. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MZd(CZ) NU20-05-00472
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phosphatidylinositol 4-kinase class II * PI4K2A inhibitor * quinazoline derivative * SAR investigation * ATP-binding site
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2022 ; AIS: 0.437, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2022.129010
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0334914

0555984 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nencka, Radim - Šilhán, Jan - Klíma, Martin - Otava, Tomáš - Kocek, Hugo - Krafčíková, Petra - Bouřa, Evžen
Coronaviral RNA-methyltransferases: function, structure and inhibition.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 2 (2022), s. 635-650. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-25280S; GA MZd(CZ) NU20-05-00472; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: structure guided design * SARS coronavirus * SARS-CoV-2 replication
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkab1279

Nencka, Radim Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330958

0586496 - ÚOCHB 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nigam, A. - Hurley, M. F. D. - Li, F. - Konkoľová, Eva - Klíma, Martin - Trylčová, Jana - Pollice, R. - Cinaroglu, S. S. - Levin-Konigsberg, R. - Handjaya, J. - Schapira, M. - Chau, I. - Perveen, S. - Ng, H.-L. - Kaniskan, H. U. - Han, Y. - Singh, S. - Gorgulla, C. - Kundaje, A. - Jin, J. - Voelz, V. A. - Weber, Jan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen - Vedadi, M. - Aspuru-Guzik, A.
Application of established computational techniques to identify potential SARS-CoV-2 Nsp14-MTase inhibitors in low data regimes.
Digital Discovery. Roč. 3, č. 7 (2024), s. 1327-1341. E-ISSN 2635-098X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: docking * accuracy
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2024 ; AIS: 1.478, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4DD00006D
Vedadi, M.
- Aspuru-Guzik, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353965

0643069 - ÚOCHB 2027 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Otava, Tomáš - Drexler, Matúš - Krafčíková, Petra - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Veverka, Václav - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Exploring advanced methodologies for NS5 methyltransferase targeted drug discovery.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 303, February (2026), č. článku 118388. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 0.998, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2025.118388
Veverka, Václav
- Bouřa, Evžen
- Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372936

0601793 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Robbertse, Luise - Fajtová, Pavla - Šnebergerová, Pavla - Jalovecká, Marie - Levytska, Viktoriya - da Silva, E. B. - Sharma, V. - Pachl, Petr - Almaliti, J. - Al-Hindy, M. - Gerwick, W. H. - Bouřa, Evžen - O'Donoghue, A. J. - Sojka, Daniel
Evaluating Antimalarial Proteasome Inhibitors for Efficacy in Babesia Blood Stage Cultures.
ACS Omega. Roč. 9, č. 45 (2024), s. 44989-44999. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07850S; GA ČR(CZ) GA21-11299S
GRANT EU: European Commission(XE) 846688 - ProTeCT; European Commission(XE) 1232108
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388963
Klíčová slova: microti * design * potent * ticks
Obor OECD: Microbiology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsomega.4c04564
O'Donoghue, A. J.
- Sojka, Daniel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359193

0559093 - ÚOCHB 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Różycki, B. - Bouřa, Evžen
Conformational ensemble of the full-length SARS-CoV-2 nucleocapsid (N) protein based on molecular simulations and SAXS data.
Biophysical Chemistry. Roč. 288, September (2022), č. článku 106843. ISSN 0301-4622. E-ISSN 1873-4200
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SAXS * nucleocapsid * SARS-CoV-2 * EROS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022 ; AIS: 0.507, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.bpc.2022.106843

Różycki, B. Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0332514

0557947 - ÚOCHB 2023 RIV AE eng J - Článek v odborném periodiku
Selvaraj, C. - Dinesh, Dhurvas Chandrasekaran - Krafčíková, Petra - Bouřa, Evžen - Aarthy, M. - Pravin, M. A. - Singh, S. K.
Structural Understanding of SARS-CoV-2 Drug Targets, Active Site Contour Map Analysis and COVID-19 Therapeutics.
Current Molecular Pharmacology. Roč. 15, č. 2 (2022), s. 418-433. ISSN 1874-4672. E-ISSN 1874-4702
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * COVID-19 * repurposing * FDA * drug targets * antivirales * active site * contour maps * medicinal plants * phytochemicals * TCM * natural products
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2022 ; AIS: 0.569, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.2174/1874467214666210906125959

Selvaraj, C. Singh, S. K.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331831

0557951 - ÚOCHB 2023 RIV AE eng J - Článek v odborném periodiku
Sikdar, Arunima - Gupta, R. - Bouřa, Evžen
Reviewing Antiviral Research against Viruses Causing Human Diseases - a Structure-Guided Approach.
Current Molecular Pharmacology. Roč. 15, č. 2 (2022), s. 306-337. ISSN 1874-4672. E-ISSN 1874-4702
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antivirals * virus * cancer * drug design * COVID-19 * structural biology * X-ray crystallography * cryo-EM
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2022 ; AIS: 0.569, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.2174/1874467214666210804152836
Sikdar, Arunima
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331833

0605408 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Sülzen, Hagen - Klíma, Martin - Duchoslav, Vojtěch - Bouřa, Evžen
SPR is a fast and straightforward method to estimate the binding constants of cyclic dinucleotides to their binding partners, such as STING or poxin.
Biophysical Chemistry. Roč. 319, April (2025), č. článku 107392. ISSN 0301-4622. E-ISSN 1873-4200
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: SPR * ITC * STING * poxin * cyclic dinucleotide
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.548, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bpc.2025.107392
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363124

0618755 - ÚOCHB 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Sülzen, Hagen - Fajtová, Pavla - O'Donoghue, A. J. - Šilhán, Jan - Bouřa, Evžen
Structural Insights into Salinosporamide a Mediated Inhibition of the Human 20S Proteasome.
Molecules. Roč. 30, č. 6 (2025), č. článku 1386. ISSN 1420-3049. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
GRANT EU: European Commission(XE) 846688 - ProTeCT
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 20S * proteasome * marizomib * MZB * cryo-EM
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2024 ; AIS: 0.74, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/molecules30061386
Šilhán, Jan
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365580

0571446 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šilhán, Jan - Klíma, Martin - Otava, Tomáš - Škvára, Petr - Chalupská, Dominika - Chalupský, Karel - Kozic, Ján - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Discovery and structural characterization of monkeypox virus methyltransferase VP39 inhibitors reveal similarities to SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase.
Nature Communications. Roč. 14, April (2023), č. článku 2259. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: messenger RNA * recognition * binding
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 14.7, rok: 2023 ; AIS: 5.66, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-023-38019-1
Nencka, Radim
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342665

0599208 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šilhán, Jan - Fajtová, Pavla - Bartošová, Jitka - Hurysz, B. M. - Almaliti, J. - Miyamoto, Y. - Eckmann, L. - Gerwick, W. H. - O'Donoghue, A. J. - Bouřa, Evžen
Structural elucidation of recombinant Trichomonas vaginalis 20S proteasome bound to covalent inhibitors.
Nature Communications. Roč. 15, October (2024), č. článku 8621. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
GRANT EU: European Commission(XE) 846688 - ProTeCT
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: salinosporamide A * pathway * disease
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-024-53022-w
Fajtová, Pavla
- O'Donoghue, A. J.
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356731

0574061 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Škvára, Petr - Chalupská, Dominika - Klíma, Martin - Kozic, Ján - Šilhán, Jan - Bouřa, Evžen
Structural basis for RNA-cap recognition and methylation by the mpox methyltransferase VP39.
Antiviral Research. Roč. 216, August (2023), č. článku 105663. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: messenger-RNA * virus methyltransferase
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.276, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2023.105663
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344428

0586203 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tóth, Luca Julianna - Krejčová, Kateřina - Dejmek, Milan - Žilecká, Eva - Klepetářová, Blanka - Poštová Slavětínská, Lenka - Bouřa, Evžen - Nencka, Radim
Novel analogues of a nonnucleoside SARS-CoV-2 RdRp inhibitor as potential antivirotics.
Beilstein Journal of Organic Chemistry. Roč. 20, May (2024), s. 1029-1036. ISSN 1860-5397. E-ISSN 1860-5397
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antivirotics * nonnucleotide inhibitor * RNA-dependent RNA polymerase * SARS-CoV-2
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 2.1, rok: 2024 ; AIS: 0.432, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3762/bjoc.20.91
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353790

0563157 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vavřina, Zdeněk - Perlíková, Pavla - Milisavljevič, Nemanja - Chevrier, Florian - Smola, Miroslav - Smith, Joshua - Dejmek, Milan - Havlíček, Vojtěch - Buděšínský, Miloš - Liboska, Radek - Vaneková, Lenka - Brynda, Jiří - Bouřa, Evžen - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal - Birkuš, Gabriel
Design, Synthesis, and Biochemical and Biological Evaluation of Novel 7-Deazapurine Cyclic Dinucleotide Analogues as STING Receptor Agonists.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 65, č. 20 (2022), s. 14082-14103. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: GMP-AMP synthase * interferon genes * adapter protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022 ; AIS: 1.587, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c01305
Perlíková, Pavla
- Birkuš, Gabriel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335201

0576080 - ÚOCHB 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, Michala - Otava, Tomáš - Šilhán, Jan - Nencka, Radim - Weber, Jan - Bouřa, Evžen
Inhibitors of mpox VP39 2′-O methyltransferase efficiently inhibit the monkeypox virus.
Antiviral Research. Roč. 218, October (2023), č. článku 105714. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: structural basis
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2023 ; AIS: 1.276, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2023.105714
Weber, Jan
- Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345703

0588104 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Žilecká, Eva - Klíma, Martin - Štefek, Milan - Dejmek, Milan - Nencka, Radim - Bouřa, Evžen
Structure of SARS-CoV-2 MTase nsp14 with the inhibitor STM957 reveals inhibition mechanism that is shared with a poxviral MTase VP39.
Journal of Structural Biology: X. Roč. 10, December (2024), č. článku 100109. ISSN 2590-1524. E-ISSN 2590-1524
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: methyltransferase * inhibitor * crystal structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.25, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2024.100109
Bouřa, Evžen
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355136