Nápověda

Machara Aleš

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 15

0600635 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Banerjee, Swati - Sýs, Jakub - Machara, Aleš - Junková, Petra - Hubálek, Martin
DSSBU: A novel mass spectrometry-cleavable analogue of the BS3 cross-linker.
Journal of Proteomics. Roč. 310, January (2025), č. článku 105330. ISSN 1874-3919. E-ISSN 1876-7737
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-19250S
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR CZ III - 90255
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: chemical cross-linking * new MS-cleavable cross-linker * mass spectrometry * water-soluble cross-linker * protein conformation * protein interactions
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.645, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.jprot.2024.105330
Hubálek, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357943

0570636 - ÚOCHB 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Cudlman, Lukáš - Machara, Aleš - Vrkoslav, Vladimír - Polášek, Miroslav - Bosáková, Z. - Blanksby, S. J. - Cvačka, Josef
Characterization of Triacylglycerol Estolide Isomers Using High-Resolution Tandem Mass Spectrometry with Nanoelectrospray Ionization.
Biomolecules. Roč. 13, č. 3 (2023), č. článku 475. ISSN 2218-273X. E-ISSN 2218-273X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) EF18_053/0016940; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: triacylglycerol estolides * glycerol sn-regioisomers * estolide-branching isomers * collision-induced dissociation * higher-energy collisional dissociation * ozone-induced dissociation * high-resolution mass spectrometry
Obor OECD: Analytical chemistry; Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 4.8, rok: 2023 ; AIS: 1.047, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/biom13030475
Cvačka, Josef
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0341945

0603191 - ÚOCHB 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Čermáková, Kateřina - Gregor, Jiří - Král, Michal - Karlukova, Elena - Navrátil, Václav - Reiberger, Róbert - Berenguer Albiñana, Carlos - Bechynský, Vít - Majer, Pavel - Konvalinka, Jan - Machara, Aleš - Kožíšek, Milan
The evaluation of DNA-linked inhibitor antibody and AlphaScreen assays for high-throughput screening of compounds targeting the cap-binding domain in influenza a polymerase.
European Journal of Pharmaceutical Sciences. Roč. 205, February (2025), č. článku 106990. ISSN 0928-0987. E-ISSN 1879-0720
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: influenza A polymerase * pimodivir * DNA-linked inhibitor antibody assay * AlphaScreen * cap snatching * inhibitor
Obor OECD: Biochemical research methods
Impakt faktor: 4.7, rok: 2024 ; AIS: 0.718, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejps.2024.106990
Machara, Aleš
- Kožíšek, Milan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360433

0638248 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Diallo, Souleymane - Kašparová, Kateřina - Šulc, Josef - Johny, J. - Křivánek, Jan - Nebesářová, Jana - Sillam-Dussès, D. - Kyjaková, Pavlína - Vondrášek, Jiří - Machara, Aleš - Lukšan, Ondřej - Grosse-Wilde, E. - Hanus, Robert
Identification of the trail-following pheromone receptor in termites.
eLife. Roč. 13, August (2025), č. článku RP101814. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17194S; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: termites * pheromones * odorant receptors * deorphanization * trail-following pheromone
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: nepřidělen/n.a., rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.7554/eLife.101814
Lukšan, Ondřej
- Hanus, Robert
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368972

0583087 - ÚOCHB 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Jacob, V. - Ramiaranjatovo, G. - Persyn, E. - Machara, Aleš - Kyjaková, Pavlína - Atiama-Nurbel, T. - Pompeiano, A. - Benelli, G. - De Meyer, M. - Vaníčková, L.
Female melon fruit flies, Zeugodacus cucurbitae, are attracted to a synthetic chemical blend based on male epicuticular components.
Journal of Pest Science. Roč. 97, č. 3 (2024), s. 1395-1415. ISSN 1612-4758. E-ISSN 1612-4766
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: behaviour-based control * cuticular hydrocarbons * pheromones * age-dependent production * GC x GC-TOFMS * GC-EAD * GC-EPD * Tephritidae
Obor OECD: Entomology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 1.006, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s10340-023-01707-4
Pompeiano, A.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351086

0600731 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Král, Michal - Kotačka, Tomáš - Reiberger, Róbert - Panýrková, Gabriela - Radilová, Kateřina - Osifová, Zuzana - Flieger, Miroslav - Konvalinka, Jan - Majer, Pavel - Kožíšek, Milan - Machara, Aleš
3’-Dehydroxypurpurogallin-4-Carboxamides as Influenza A Endonuclease Inhibitors: Synthesis, Structure-Activity Relationship Analysis, and Structural Characterization of Protein Complex.
ChemMedChem. Roč. 20, č. 3 (2025), č. článku e202400577. ISSN 1860-7179. E-ISSN 1860-7187
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: chemical synthesis * endonuclease * enzyme inhibition * influenza * metalloenzymes * purpurogallin * influenza polymerase
Obor OECD: Medicinal chemistry; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 0.626, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cmdc.202400577
Kožíšek, Milan
- Machara, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358023

0571248 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Macháček, Stanislav - Tupec, Michal - Horáček, Natan - Halmová, Martina - Roy, A. - Machara, Aleš - Kyjaková, Pavlína - Lukšan, Ondřej - Pichová, Iva - Hanus, Robert
Evolution of Linoleic Acid Biosynthesis Paved the Way for Ecological Success of Termites.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 40, č. 4 (2023), č. článku msad087. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-17194S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: fatty acyl desaturases * linoleic acid * biosynthesis * termites * Isoptera * Blattodea
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 11, rok: 2023 ; AIS: 5.284, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/molbev/msad087
Hanus, Robert
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0342521

0559677 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Osifová, Zuzana - Reiberger, Róbert - Císařová, I. - Machara, Aleš - Dračínský, Martin
Diketo–ketoenol tautomers in curcuminoids: synthesis, separation of tautomers, and kinetic and structural studies.
Journal of Organic Chemistry. Roč. 87, č. 15 (2022), s. 10309-10318. ISSN 0022-3263. E-ISSN 1520-6904
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-15374S; GA ČR(CZ) GA22-16389S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NF-κB * enol tautomerism * NMR spectroscopy
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 3.6, rok: 2022 ; AIS: 0.683, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.joc.2c01357
Machara, Aleš
- Dračínský, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0332881

0563164 - ÚOCHB 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Radilová, Kateřina - Zima, Václav - Král, Michal - Machara, Aleš - Majer, Pavel - Hodek, Jan - Weber, Jan - Brynda, Jiří - Strmeň, Timotej - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan
Thermodynamic and structural characterization of an optimized peptide-based inhibitor of the influenza polymerase PA-PB1 subunit interaction.
Antiviral Research. Roč. 208, December (2022), č. článku 105449. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antiviral peptides * influenza A polymerase * protein-protein interaction * AlphaScreen * isothermal titration calorimetry
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.6, rok: 2022 ; AIS: 1.345, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2022.105449
Machara, Aleš
- Kožíšek, Milan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335206

0619343 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Reiberger, Róbert - Král, Michal - Radilová, Kateřina - Kotačka, Tomáš - Dračínský, Martin - Tsalyy, Artem - Brynda, Jiří - Majer, Pavel - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan - Machara, Aleš
Beyond natural flavonoids: exploring bioisosterism in design and synthesis of influenza endonuclease inhibitors.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 16, č. 7 (2025), s. 3030-3048. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) LM2023053
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: flavonoids * influenza endonuclease * inhibitor
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D5MD00071H
Kožíšek, Milan
- Machara, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366083

0605329 - ÚOCHB 2026 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Sedláček, Jindřich - Šmahelová, Zuzana - Adámek, Michael - Šubová, Dominika - Svobodová, Lucie - Kadlecová, A. - Majer, Pavel - Machara, Aleš - Grantz Šašková, Klára
Small-molecule activators of NRF1 transcriptional activity prevent protein aggregation.
Biomedicine & Pharmacotherapy. Roč. 183, February (2025), č. článku 117864. ISSN 0753-3322. E-ISSN 1950-6007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16389S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: proteasome * NRF1 (NFE2L1) * DDI2 * NGLY1 * protein aggregates * small molecules * neurodegenerative diseases
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 7.5, rok: 2024 ; AIS: 1.325, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.biopha.2025.117864
Machara, Aleš
- Grantz Šašková, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363012

0639819 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Svobodová, Lucie - Sedláček, Jindřich - Šmahelová, Zuzana - Majer, Pavel - Machara, Aleš - Grantz Šašková, Klára
Targeting NFE2L1 signalling with small molecules to protect against Ferroptosis.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 130, January (2026), č. článku 130425. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA22-16389S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NRF1 (NFE2L1) * ferroptosis * oxytosis * protective effect
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2025.130425
Machara, Aleš
- Grantz Šašková, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370263

0641439 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šmahelová, Zuzana - Svobodová, Lucie - Sedláček, Jindřich - Adámek, Michael - Pimková Polidarová, Markéta - Majer, Pavel - Machara, Aleš - Grantz Šašková, Klára
Investigating NFE2L1 activators for targeted protein aggregate clearance: a follow-up study.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 16, č. 12 (2025), s. 6397-6411. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA22-16389S
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: transcription factor Nrf1 * proteasome activity * disease
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.861, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D5MD00584A
Machara, Aleš
- Grantz Šašková, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0371588

0618038 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tsalyy, Artem - Král, Michal - Reiberger, Róbert - Majer, Pavel - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan - Machara, Aleš
Design, synthesis, and activity evaluation of C-8 arylated luteolin derivatives as influenza endonuclease inhibitors.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 121, June (2025), č. článku 130178. ISSN 0960-894X. E-ISSN 1464-3405
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
AV ČR(CZ) StrategieAV21/25
StrategieAV
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: influenza * endonuclease * flavonoid * inhibitors * RNA polymerase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2024 ; AIS: 0.412, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.bmcl.2025.130178
Kožíšek, Milan
- Machara, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364870

0556929 - ÚOCHB 2023 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Tupec, Michal - Culka, Martin - Machara, Aleš - Macháček, Stanislav - Bím, Daniel - Svatoš, Aleš - Rulíšek, Lubomír - Pichová, Iva
Understanding desaturation/hydroxylation activity of castor stearoyl Δ9-Desaturase through rational mutagenesis.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 20, March (2022), s. 1378-1388. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19148; GA MŠMT(CZ) LM2015064; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Δ9 desaturase * methane monooxygenase * reaction mechanism * proton transfer * desaturation * hydroxylation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6, rok: 2022 ; AIS: 1.411, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.03.010
Rulíšek, Lubomír
- Pichová, Iva
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331046