Šebera Jakub

0562866 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fukal, Jiří - Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír
Probabilistic Interpretation of NMR J-Couplings Determines BI-BII State Equilibria in DNA.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 18, č. 11 (2022), s. 6989-6999. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13436S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * phosphorus chemical shifts * nucleic acid backbone
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 5.5, rok: 2022 ; AIS: 1.448, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.2c00733
Sychrovský, Vladimír
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335048

0547591 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fukal, Jiří - Buděšínský, Miloš - Páv, Ondřej - Jurečka, P. - Zgarbová, M. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír
The Ad-MD method to calculate NMR shift including effects due to conformational dynamics: The 31P NMR shift in DNA.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 43, č. 2 (2022), s. 132-143. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13436S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 31P NMR shift * DNA phosphate * MD averaging
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3, rok: 2022 ; AIS: 0.763, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/jcc.26778
Sychrovský, Vladimír
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0323804

0558152 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Holovský, J. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír - Zemen, J. - De Wolf, S. - Ballif, C.
Quantitative Analysis of Nanorough Hydrogenated Si(111) Surfaces through Vibrational Spectral Assignment by Periodic DFT Calculations.
Journal of Physical Chemistry C. Roč. 126, č. 19 (2022), s. 8278-8286. ISSN 1932-7447. E-ISSN 1932-7455
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14990S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: H-terminated Si(111) * dissolved oxygen * infrared spectroscopy
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022 ; AIS: 0.827, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.1c09766
Holovský, J.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0331950

0550069 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nešpůrek, S. - Kuberský, P. - Polanský, R. - Trchová, M. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír
Raman spectroscopy and DFT calculations of PEDOT:PSS in a dipolar field.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 24, č. 1 (2022), s. 541-550. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14990S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Raman spectroscopy * DFT * PEDOT:PSS
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.681, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D1CP03899K
Kuberský, P.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0325920

0563907 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Sebechlebská, T. - Kolivoška, V. - Šebera, Jakub - Fukal, Jiří - Řeha, D. - Buděšínský, Miloš - Rosenberg, Ivan - Bednárová, Lucie - Gasior, J. - Mészáros, G. - Hromadová, M. - Sychrovský, Vladimír
Additive transport in DNA molecular circuits.
Journal of Materials Chemistry C. Roč. 10, č. 33 (2022), s. 12022-12031. ISSN 2050-7526. E-ISSN 2050-7534
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14990S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: photoinduced electron-transfer * HG-II-T * charge-transport
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 6.4, rok: 2022 ; AIS: 1.166, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2TC01219G
Hromadová, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335690