Publikace ASEP
0556398 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Boušová, Kristýna - Zouharová, Monika - Heřman, P. - Vymětal, Jiří - Vetýšková, Veronika - Jirásková, Kateřina - Vondrášek, Jiří
TRPM5 Channel Binds Calcium-Binding Proteins Calmodulin and S100A1.
Biochemistry. Roč. 61, č. 6 (2022), s. 413-423. ISSN 0006-2960. E-ISSN 1520-4995
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ion channel * ryanodine receptor * N-terminus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.9, rok: 2022 ; AIS: 0.987, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.biochem.1c00647
Boušová, Kristýna
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0331043
0559020 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tretyachenko, V. - Vymětal, Jiří - Neuwirthova, T. - Vondrášek, Jiří - Fujishima, K. - Hlouchová, Klára
Modern and prebiotic amino acids support distinct structural profiles in proteins.
Open Biology. Roč. 12, č. 6 (2022), č. článku 220040. ISSN 2046-2441. E-ISSN 2046-2441
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: protein sequence space * protein structure * amino acid alphabet * genetic code evolution * random proteins
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022 ; AIS: 1.953, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1098/rsob.220040
Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0332442
0559713 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vymětal, Jiří - Mertová, Kateřina - Boušová, Kristýna - Šulc, Josef - Tripsianes, K. - Vondrášek, Jiří
Fusion of two unrelated protein domains in a chimera protein and its 3D prediction: Justification of the x-ray reference structures as a prediction benchmark.
Proteins-Structure, Function and Bioinformatics. Roč. 90, č. 12 (2022), s. 2067-2079. ISSN 0887-3585. E-ISSN 1097-0134
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA19-03488S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 3D structure prediction * fusion proteins * molecular simulations * X-ray crystallography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.9, rok: 2022 ; AIS: 1.02, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/prot.26398
Vondrášek, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0332921
0562066 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vymětal, Jiří - Vondrášek, Jiří
Iterative Landmark-Based Umbrella Sampling (ILBUS) Protocol for Sampling of Conformational Space of Biomolecules.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 62, č. 19 (2022), s. 4783-4798. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-03488S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Monte-carlo simulation * molecular dynamics * alanine dipeptidea
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022 ; AIS: 1.278, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.2c00370
Vondrášek, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0334483