Nápověda

Řezáč Jan

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 16

0637596 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Arantes, G. M. - Řezáč, Jan
Benchmark of Approximate Quantum Chemical and Machine Learning Potentials for Biochemical Proton Transfer Reactions.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 14 (2025), s. 7149-7159. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: semiempirical methods * NDDO approximations * force-fields
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5c00690
Arantes, G. M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368423

0587259 - ÚOCHB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Bach, Kathrin - Dohnálek, Jan - Škerlová, Jana - Kuzmík, Ján - Poláchová, Edita - Stanchev, Stancho - Majer, Pavel - Fanfrlík, Jindřich - Pecina, Adam - Řezáč, Jan - Lepšík, Martin - Borshchevskiy, V. - Polovinkin, V. - Stříšovský, Kvido
Extensive targeting of chemical space at the prime side of ketoamide inhibitors of rhomboid proteases by branched substituents empowers their selectivity and potency.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 275, September (2024), č. článku 116606. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-24456S; GA MŠMT(CZ) LUC23180; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Escherichia coli * family protease * defines
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.9, rok: 2024 ; AIS: 0.998, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2024.116606
Stříšovský, Kvido
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354501

0579582 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Beran, G. J. O. - Greenwell, C. - Cook, C. - Řezáč, Jan
Improved Description of Intra- and Intermolecular Interactions through Dispersion-Corrected Second-Order Møller-Plesset Perturbation Theory.
Accounts of Chemical Research. Roč. 56, č. 23 (2023), s. 3525-3534. ISSN 0001-4842. E-ISSN 1520-4898
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: density functional theory * crystal structure prediction * noncovalent interactions
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.399, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.accounts.3c00578
Beran, G. J. O.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0348393

0602999 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fanfrlík, Jindřich - Řezáč, Jan - Hnyk, Drahomír - Holub, Josef
Heats of formation on the way from B2H6 to B20H16: thermochemical consequences of multicenter bonding in ab initio and DFT methods.
Dalton Transactions. Roč. 54, č. 1 (2025), s. 239-246. ISSN 1477-9226. E-ISSN 1477-9234
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05083S; GA ČR(CZ) GA22-17063S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388980
Klíčová slova: NDDO approximations * boron hydride * basis-sets
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2024 ; AIS: 0.477, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D4DT02589J
Fanfrlík, Jindřich
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360274

0553647 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Greenwell, C. - Řezáč, Jan - Beran, G. J. O.
Spin-component-scaled and dispersion-corrected second-order Møller–Plesset perturbation theory: a path toward chemical accuracy.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 24, č. 6 (2022), s. 3695-3712. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13905S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: interaction energies * density functionals * organic molecules
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.681, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D1CP04922D
Beran, G. J. O.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0328395

0637964 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jalaie, M. - Fanfrlík, Jindřich - Pecina, Adam - Lepšík, Martin - Řezáč, Jan
Comparative Analysis of Quantum-Mechanical and Standard Single-Structure Protein-Ligand Scoring Functions with MD-Based Free Energy Calculations.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 65, č. 15 (2025), s. 8127-8136. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: binding affinity prediction * accurate * docking
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 1.526, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c00604
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368737

0619186 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kryštůfek, Robin - Verner, Václav - Šácha, Pavel - Hadzima, Martin - Trajhan, Filip - Starková, Jana - Tloušťová, Eva - Dvořáková, Alexandra - Pecina, Adam - Brynda, Jiří - Chalupský, Karel - Hájek, Miroslav - Boucher, M. J. - Majer, Pavel - Řezáč, Jan - Madhani, H. D. - Craik, C. S. - Konvalinka, Jan
On-Resin Assembly of Macrocyclic Inhibitors of Cryptococcus neoformans May1: A Pathway to Potent Antifungal Agents.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 68, č. 9 (2025), s. 9623-9637. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA24-10814S; GA MZd(CZ) NU22-03-00318; GA MŠMT LX22NPO5102
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: regulated aminopeptidase IRAP * assay * guidelines
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c00396
Konvalinka, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365923

0558517 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kříž, Kristian - Řezáč, Jan
Non-covalent interactions atlas benchmark data sets 4: σ-hole interactions.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 24, č. 24 (2022), s. 14794-14804. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13905S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: consistent basis sets * density-functional thermochemistry * generalized gradient approximation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.681, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2CP01600A
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0332153

0605249 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nováček, Martin - Řezáč, Jan
PM6-ML: The Synergy of Semiempirical Quantum Chemistry and Machine Learning Transformed into a Practical Computational Method.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 2 (2025), s. 678-690. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17063S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NDDO approximations * mechanical methods * bonding correction
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.4c01330
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0362873

0582928 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Adam - Fanfrlík, Jindřich - Lepšík, Martin - Řezáč, Jan
SQM2.20: Semiempirical quantum-mechanical scoring function yields DFT-quality protein-ligand binding affinity predictions in minutes.
Nature Communications. Roč. 15, February (2024), č. článku 1127. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NDDO approximations * free energies * docking
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41467-024-45431-8
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350971

0568443 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Stewart, J. J. P.
How well do semiempirical QM methods describe the structure of proteins?
Journal of Chemical Physics. Roč. 158, č. 4 (2023), č. článku 044118. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17063S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: quantum-mechanical methods * scoring function * NDDO approximations
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.1, rok: 2023 ; AIS: 0.908, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1063/5.0135091
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339758

0558510 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan
Non-Covalent Interactions Atlas benchmark data sets 5: London dispersion in an extended chemical space.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 24, č. 24 (2022), s. 14780-14793. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13905S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: consistent basis-sets * plesset perturbation theory * generalized gradient approximation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.681, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D2CP01602H
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0332147

0574076 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - de la Lande, A.
On the Role of Charge Transfer in Many-Body Non-Covalent Interactions.
ChemPhysChem. Roč. 24, č. 18 (2023), č. článku e202300329. ISSN 1439-4235. E-ISSN 1439-7641
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) 8J20FR003
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: charge transfer * density functional theory * interaction energy decomposition * many-body interactions * non-covalent interactions
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.3, rok: 2023 ; AIS: 0.603, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cphc.202300329
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344440

0586410 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Kontkanen, Outi Vilhelmiina - Nováček, Martin
Working with benchmark datasets in the Cuby framework.
Journal of Chemical Physics. Roč. 160, č. 20 (2024), č. článku 202501. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17063S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: main-group thermochemistry * noncovalent interactions * interaction energies
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.907, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1063/5.0203372
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353946

0643900 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šinkevičiūtė, Ugnė - Šímová, Magdalena - Staník, Radek - Poštová Slavětínská, Lenka - Blažková, Kristýna - Šácha, Pavel - Lepšík, Martin - Řezáč, Jan - Konvalinka, Jan - Ormsby, Tereza - Tichý, Michal - Hocek, Michal
Potent Competitive Inhibitors of Ecto-5′-nucleotidase (CD73) based on 6-(Het)aryl-7-deazapurine Ribonucleoside 5′-O-Bisphosphonates.
ACS Pharmacology & Translational Science. Roč. 9, č. 1 (2026), s. 191-213. E-ISSN 2575-9108
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MZd(CZ) NU22-03-00318; GA ČR(CZ) GA24-10814S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleotides * nucleoside bisphosphonates * pyrrolopyrimidines * CD73 inhibitors * cancer immunotherapy
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.164, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsptsci.5c00707
Ormsby, Tereza
- Tichý, Michal
- Hocek, Michal
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373736

0635637 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Yurenko, Yevgen - Muždalo, Anja - Černeková, Michaela - Pecina, Adam - Řezáč, Jan - Fanfrlík, Jindřich - Žáková, Lenka - Jiráček, Jiří - Lepšík, Martin
Multiscale Computational Protocols for Accurate Residue Interactions at the Flexible Insulin-Receptor Interface.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 65, č. 11 (2025), s. 5690-5705. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-17978S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5104
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: generalized born model * binding free energies * protein
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 1.526, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c00772
Lepšík, Martin
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366668