0553871 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Benýšek, Jakub - Buša, Michal - Rubešová, Petra - Fanfrlík, Jindřich - Lepšík, Martin - Brynda, Jiří - Matoušková, Zuzana - Bartz, U. - Horn, Martin - Gütschow, M. - Mareš, Michael
Highly potent inhibitors of cathepsin K with a differently positioned cyanohydrazide warhead: structural analysis of binding mode to mature and zymogen-like enzymes.
Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry. Roč. 37, č. 1 (2022), s. 515-526. ISSN 1475-6366. E-ISSN 1475-6374
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Cathepsin K * protease inhibitor * cyanohydrazide warhead * azadipeptide nitrile * crystal structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022 ; AIS: 0.667, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1080/14756366.2021.2024527
Mareš, Michael
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0328551

0567034 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fanfrlík, Jindřich - Brynda, Jiří - Kugler, Michael - Lepšík, Martin - Pospíšilová, Klára - Holub, Josef - Hnyk, Drahomír - Nekvinda, Jan - Grüner, Bohumír - Řezáčová, Pavlína
B-H⋯π and C-H⋯π interactions in protein-ligand complexes: carbonic anhydrase II inhibition by carborane sulfonamides.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 25, č. 3 (2023), s. 1728-1733. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102; GA ČR(CZ) GA21-14409S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388980
Klíčová slova: ⋯π * hydrogen bond * dispersion
Obor OECD: Physical chemistry; Inorganic and nuclear chemistry (UACH-T)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2023 ; AIS: 0.624, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2CP04673C

Fanfrlík, Jindřich Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0338302

0569100 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Marinovic, M. A. - Bekic, S. S. - Kugler, Michael - Brynda, Jiří - Škerlová, Jana - Skoric, D. D. - Řezáčová, Pavlína - Petri, E. T. - Celic, A. S.
X-ray structure of human aldo-keto reductase 1C3 in complex with a bile acid fused tetrazole inhibitor: experimental validation, molecular docking and structural analysis.
RSC Medicinal Chemistry. Roč. 14, č. 2 (2023), s. 341-355. E-ISSN 2632-8682
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: prostaglandin-F synthase * crystal structures * CCP4 suite
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.1, rok: 2023 ; AIS: 0.896, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2MD00387B
Celic, A. S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340422

0563164 - ÚOCHB 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Radilová, Kateřina - Zima, Václav - Král, Michal - Machara, Aleš - Majer, Pavel - Hodek, Jan - Weber, Jan - Brynda, Jiří - Strmeň, Timotej - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan
Thermodynamic and structural characterization of an optimized peptide-based inhibitor of the influenza polymerase PA-PB1 subunit interaction.
Antiviral Research. Roč. 208, December (2022), č. článku 105449. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antiviral peptides * influenza A polymerase * protein-protein interaction * AlphaScreen * isothermal titration calorimetry
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.6, rok: 2022 ; AIS: 1.345, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2022.105449
Machara, Aleš
- Kožíšek, Milan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335206

0572565 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Skácel, Jan - Djukic, Stefan - Baszczyňski, Ondřej - Kalčic, Filip - Bílek, Tadeáš - Chalupský, Karel - Kozák, Jaroslav - Dvořáková, Alexandra - Tloušťová, Eva - Kráľová, Zuzana - Šmídková, Markéta - Voldřich, Jan - Rumlová, M. - Pachl, Petr - Brynda, Jiří - Vučková, Tereza - Fábry, Milan - Snášel, Jan - Pichová, Iva - Řezáčová, Pavlína - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Janeba, Zlatko
Design, Synthesis, Biological Evaluation, and Crystallographic Study of Novel Purine Nucleoside Phosphorylase Inhibitors.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 66, č. 10 (2023), s. 6652-6681. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN01000013; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: multisubstrate analog inhibitors * transition-state analog * human erythrocytes
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.9, rok: 2023 ; AIS: 1.652, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c02097
Řezáčová, Pavlína
- Mertlíková-Kaiserová, Helena
- Janeba, Zlatko
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343213

0598163 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Škerlová, Jana - Brynda, Jiří - Šobotník, Jan - Zákopčaník, Marek - Novák, Petr - Bourguignon, T. - Sillam-Dussès, D. - Řezáčová, Pavlína
Crystal structure of blue laccase BP76, a unique termite suicidal defense weapon.
Structure. Roč. 32, č. 10 (2024), s. 1581-1585. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004624
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: Neocapritermes taracua * colony defence * autothysis * benzoquinone * X-ray crystallography * single-wavelength anomalous diffraction * laccase * insect glycosylation * protein stabilization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Ecology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2024.07.015
Řezáčová, Pavlína
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355900

0563157 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vavřina, Zdeněk - Perlíková, Pavla - Milisavljevič, Nemanja - Chevrier, Florian - Smola, Miroslav - Smith, Joshua - Dejmek, Milan - Havlíček, Vojtěch - Buděšínský, Miloš - Liboska, Radek - Vaneková, Lenka - Brynda, Jiří - Bouřa, Evžen - Řezáčová, Pavlína - Hocek, Michal - Birkuš, Gabriel
Design, Synthesis, and Biochemical and Biological Evaluation of Novel 7-Deazapurine Cyclic Dinucleotide Analogues as STING Receptor Agonists.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 65, č. 20 (2022), s. 14082-14103. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: GMP-AMP synthase * interferon genes * adapter protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022 ; AIS: 1.587, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c01305
Perlíková, Pavla
- Birkuš, Gabriel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0335201