Hlouchová Klára

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 11

0585603 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Aubel, M. - Buchel, F. - Heames, B. - Jones, A. - Honc, O. - Bornberg-Bauer, E. - Hlouchová, Klára
High-throughput Selection of Human de novo-emerged sORFs with High Folding Potential.
Genome Biology and Evolution. Roč. 16, č. 4 (2024), č. článku evae069. ISSN 1759-6653. E-ISSN 1759-6653
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: evolution * origin * genes
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 1.197, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/gbe/evae069
Bornberg-Bauer, E.
- Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353293

0599277 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Codispoti, S. - Yamaguchi, T. - Makarov, M. - Giacobelli, V. G. - Mašek, M. - Kolář, M. H. - Sanchez Rocha, A. C. - Fujishima, K. - Zanchetta, G. - Hlouchová, Klára
The interplay between peptides and RNA is critical for protoribosome compartmentalization and stability.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. 20 (2024), s. 12689-12700. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; Czech-BioImaging III - 90250; e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: origin * parameters * proteins
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae823
Fujishima, K.
- Zanchetta, G.
- Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356769

0556704 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fried, S. D. - Fujishima, K. - Makarov, M. - Cherepashuk, I. - Hlouchová, Klára
Peptides before and during the nucleotide world: An origins story emphasizing cooperation between proteins and nucleic acids.
Journal of the Royal Society Interface. Roč. 19, č. 187 (2022), č. článku 20210641. ISSN 1742-5689. E-ISSN 1742-5662
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: origins of life * protein evolution * prebiotic polymers * early peptides
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 1.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1098/rsif.2021.0641

Fried, S. D. Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330849

0556783 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Giacobelli, V. G. - Fujishima, K. - Lepšík, Martin - Tretyachenko, V. - Kadavá, T. - Makarov, M. - Bednárová, Lucie - Novák, Petr - Hlouchová, Klára
In Vitro Evolution Reveals Noncationic Protein-RNA Interaction Mediated by Metal Ions.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 39, č. 3 (2022), č. článku msac032. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: RNA-protein interaction * genetic code evolution * protein evolution * mRNA-display
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 10.7, rok: 2022 ; AIS: 5.074, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/molbev/msac032
Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0330979

0571666 - MBÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Heames, B. - Buchel, F. - Aubel, M. - Tretyachenko, V. - Loginov, Dmitry Sergej - Novák, Petr - Lange, A. - Bornberg-Bauer, E. - Hlouchová, Klára
Experimental characterization of de novo proteins and their unevolved random-sequence counterparts.
Nature Ecology & Evolution. Roč. 7, č. 4 (2023), s. 570-580. ISSN 2397-334X. E-ISSN 2397-334X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: genetic selection * aggregation * prediction * evolution * signal
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 14.1, rok: 2023 ; AIS: 7.062, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02010-2
Bornberg-Bauer, E.
- Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343064

0587972 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hlouchová, Klára
Peptides En Route from Prebiotic to Biotic Catalysis.
Accounts of Chemical Research. Roč. 57, č. 15 (2024), s. 2027-2037. ISSN 0001-4842. E-ISSN 1520-4898
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: amino acids * polypeptides * emergence
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 17.7, rok: 2024 ; AIS: 4.887, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.accounts.4c00137
Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355044

0579061 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hlouchová, Klára
Toxin rescue by a random sequence.
Nature Ecology & Evolution. Roč. 7, č. 12 (2023), s. 1963-1964. ISSN 2397-334X. E-ISSN 2397-334X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: random sequences * protein evolution * de novo proteins
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.1, rok: 2023 ; AIS: 7.062, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1038/s41559-023-02252-0
Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0347937

0637316 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kolář, M. H. - Hlouchová, Klára
Evolution of protein-RNA interactions.
Current Opinion in Structural Biology. Roč. 94, October (2025), č. článku 103109. ISSN 0959-440X. E-ISSN 1879-033X
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: structural stability * ribosomal proteins * amino acids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7, rok: 2024 ; AIS: 2.692, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.sbi.2025.103109
Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368225

0569403 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Makarov, M. - Sanchez Rocha, A. C. - Kryštůfek, Robin - Cherepashuk, I. - Dzmitruk, Volha - Charnavets, Tatsiana - Faustino, A. M. - Lebl, Michal - Fujishima, K. - Fried, S. D. - Hlouchová, Klára
Early Selection of the Amino Acid Alphabet Was Adaptively Shaped by Biophysical Constraints of Foldability.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 145, č. 9 (2023), s. 5320-5329. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: intramolecular aminolysis * peptides * protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.5, rok: 2023 ; AIS: 3.859, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/jacs.2c12987
Fried, S. D.
- Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340722

0643382 - ÚOCHB 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rocha, A. C. S. - Makarov, M. - Pravda, L. - Novotný, M. - Hlouchová, Klára
Coenzyme-protein interactions since early life.
eLife. Roč. 13, December (2025), č. článku RP94174. ISSN 2050-084X. E-ISSN 2050-084X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: prebiotic synthesis * amino acids * evolutionary conservation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: nepřidělen/n.a., rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.7554/eLife.94174
Novotný, M.
- Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0373415

0559020 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tretyachenko, V. - Vymětal, Jiří - Neuwirthova, T. - Vondrášek, Jiří - Fujishima, K. - Hlouchová, Klára
Modern and prebiotic amino acids support distinct structural profiles in proteins.
Open Biology. Roč. 12, č. 6 (2022), č. článku 220040. ISSN 2046-2441. E-ISSN 2046-2441
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: protein sequence space * protein structure * amino acid alphabet * genetic code evolution * random proteins
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022 ; AIS: 1.953, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1098/rsob.220040
Hlouchová, Klára
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0332442