Publikace ASEP
0616641 - ÚFP 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ctibor, Pavel - Sedláček, J. - Sychrovský, Vladimír
Dielectric properties of polymer mixtures with CaTiO3 perovskite: conventional and plasma-treated ceramic powders.
International Journal of Sustainable Engineering. Roč. 17, č. 1 (2024), s. 1096-1107. ISSN 1939-7038. E-ISSN 1939-7046
GRANT EU: European Commission(BE) 101120555 - CliCAM
Institucionální podpora: RVO:61389021 ; RVO:61388963
Klíčová slova: calcium titanate * Ceramic-polymer composite * DC plasma torch * dielectric spectroscopy * hollow sphere powder * Lichtenecker-Rother mixing model
Obor OECD: Ceramics; Physical chemistry (UOCHB-X)
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.612, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/19397038.2024.2420627
Ctibor, Pavel
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0363622
0639973 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fukal, Jiří - Buděšínský, Miloš - Šebera, Jakub - Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Sychrovský, Vladimír
Deciphering Dickerson-Drew DNA Equilibrium beyond the BI/BII DNA Dichotomy by Interpretation of 31P NMR Parameters.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 19 (2025), s. 10006-10017. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA25-15726S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: spin coupling constants * analyzing ion distributions * phosphorus chemical shifts
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.5c01076
Sychrovský, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370410
0562866 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fukal, Jiří - Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír
Probabilistic Interpretation of NMR J-Couplings Determines BI-BII State Equilibria in DNA.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 18, č. 11 (2022), s. 6989-6999. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13436S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * phosphorus chemical shifts * nucleic acid backbone
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 5.5, rok: 2022 ; AIS: 1.448, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.2c00733
Sychrovský, Vladimír
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335048
0547591 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fukal, Jiří - Buděšínský, Miloš - Páv, Ondřej - Jurečka, P. - Zgarbová, M. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír
The Ad-MD method to calculate NMR shift including effects due to conformational dynamics: The 31P NMR shift in DNA.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 43, č. 2 (2022), s. 132-143. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-13436S
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 31P NMR shift * DNA phosphate * MD averaging
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3, rok: 2022 ; AIS: 0.763, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/jcc.26778
Sychrovský, Vladimír
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0323804
0558152 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Holovský, J. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír - Zemen, J. - De Wolf, S. - Ballif, C.
Quantitative Analysis of Nanorough Hydrogenated Si(111) Surfaces through Vibrational Spectral Assignment by Periodic DFT Calculations.
Journal of Physical Chemistry C. Roč. 126, č. 19 (2022), s. 8278-8286. ISSN 1932-7447. E-ISSN 1932-7455
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14990S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: H-terminated Si(111) * dissolved oxygen * infrared spectroscopy
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022 ; AIS: 0.827, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jpcc.1c09766
Holovský, J.
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0331950
0550069 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nešpůrek, S. - Kuberský, P. - Polanský, R. - Trchová, M. - Šebera, Jakub - Sychrovský, Vladimír
Raman spectroscopy and DFT calculations of PEDOT:PSS in a dipolar field.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 24, č. 1 (2022), s. 541-550. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14990S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Raman spectroscopy * DFT * PEDOT:PSS
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.3, rok: 2022 ; AIS: 0.681, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1039/D1CP03899K
Kuberský, P.
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0325920
0563907 - ÚOCHB 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Sebechlebská, T. - Kolivoška, V. - Šebera, Jakub - Fukal, Jiří - Řeha, D. - Buděšínský, Miloš - Rosenberg, Ivan - Bednárová, Lucie - Gasior, J. - Mészáros, G. - Hromadová, M. - Sychrovský, Vladimír
Additive transport in DNA molecular circuits.
Journal of Materials Chemistry C. Roč. 10, č. 33 (2022), s. 12022-12031. ISSN 2050-7526. E-ISSN 2050-7534
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-14990S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: photoinduced electron-transfer * HG-II-T * charge-transport
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 6.4, rok: 2022 ; AIS: 1.166, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1039/D2TC01219G
Hromadová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335690
0578599 - ÚOCHB 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Tanaka, Y. - Yamanaka, D. - Morioka, S. - Yamaguchi, T. - Morikawa, M. - Kodama, T. S. - Sychrovský, Vladimír - Kojima, C. - Hattori, Y.
Physicochemical Characterization of the Catalytic Unit of Hammerhead Ribozyme and Its Relationship with the Catalytic Activity.
Biophysica. Roč. 2, č. 3 (2022), s. 221-239. E-ISSN 2673-4125
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hammerhead ribozyme * mechanism * pKa * pH-titration * NMR spectroscopy * G12 * G10.1
Obor OECD: Biophysics
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/biophysica2030022
Tanaka, Y.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0347566
0637864 - ÚOCHB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Unno, M. - Morikawa, M. - Sychrovský, Vladimír - Koga, M. - Minowa, N. - Komuro, S. - Shimizu, M. - Fukuta, M. - Tsuyuguchi, F. - Mano, H. - Ochi, Y. - Nakashima, K. - Okamoto, Y. - Saio, T. - Hattori, Y. - Tanaka, Y.
Capturing a glycosylase reaction intermediate in DNA repair by freeze-trapping of a pH-responsive hOGG1 mutant.
Nucleic Acids Research. Roč. 53, č. 14 (2025), č. článku gkaf718. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA repair * hOGG1
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf718
Unno, M. Hattori, Y.
- Tanaka, Y.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368661