Červený Jan

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 18

0579023 - ÚVGZ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Búzová, Diana - Fröhlich, J. - Zapletalová, D. - Raffaele, M. - Lo Re, O. - Tsoneva, D.K. - Štěrba, J. - Červený, Jan - Vinciguerra, M.
Detection of cell-free histones in the cerebrospinal fluid of pediatric central nervous system malignancies by imaging flow cytometry.
Frontiers in molecular biosciences. Roč. 10, NOV (2023), č. článku 1254699. E-ISSN 2296-889X
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU23-03-00318
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: childhood-cancer * liquid biopsy * brain-tumors * medulloblastoma * landscape * dna * histones * pediatric brain tumors * liquid biopsy * epigenetics * imaging
Obor OECD: Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)
Impakt faktor: 3.9, rok: 2023 ; AIS: 1.079, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmolb.2023.1254699/full
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0347897

0619104 - ÚVGZ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Búzová, Diana - Petrilli, L.L. - Frölich, J. - Tsoneva, D.K. - Bianco, S. D. - Braghini, M. R. - Alisi, A. - Mastronuzzi, A. - Červený, Jan - Mazza, T. - Vinci, M. - Vinciguerra, M.
Extracellular Histones Profiles of Pediatric H3K27-Altered Diffuse Midline Glioma.
Molecular Diagnosis & Therapy. Roč. 29, č. 1 (2025), s. 129-141. ISSN 1177-1062. E-ISSN 1179-2000
Grant CEP: GA MZd(CZ) NU23-03-00318
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: imaging cytometry * early diagnostics * brain tumor * children disase
Obor OECD: Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions (pharmacogenomics, gene-based therapeutics)
Impakt faktor: 4.4, rok: 2024 ; AIS: 1.118, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s40291-024-00754-6
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0365868

0567478 - ÚVGZ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Búzová, Diana - Braghini, M. R. - Bianco, S. D. - Lo Re, O. - Raffaele, M. - Fröhlich, J. - Kisheva, A. - Crudele, A. - Mosca, A. - Sartorelli, M. R. - Balsano, C. - Červený, Jan - Mazza, T. - Alisi, A. - Vinciguerra, M.
Profiling of cell-free DNA methylation and histone signatures in pediatric NAFLD: A pilot study.
Hepatology Communications. Roč. 6, č. 12 (2022), s. 3311-3323. E-ISSN 2471-254X
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: NONALCOHOLIC FATTY LIVER * DISEASE * STEATOHEPATITIS * DIAGNOSIS * VALIDATION * MACROH2A1 * BIOPSY
Obor OECD: Health-related biotechnology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2022 ; AIS: 1.591, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://aasldpubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/hep4.2082
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0338726

0580096 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Espinoza-Corral, R. - Iwai, M. - Zavřel, Tomáš - Lechno-Yossef, S. - Sutter, M. - Červený, Jan - Niyogi, K. K. - Kerfeld, C.A.
Phycobilisome protein ApcG interacts with PSII and regulates energy transfer in Synechocystis.
Plant Physiology. Roč. 194, č. 3 (2024), s. 1383-1396. ISSN 0032-0889. E-ISSN 1532-2548
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: sp pcc 6803 * state transition * excitation-energy * light * chlorophyll * expression * model * photosynthesis * fluorescence * ultrastructure
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.9, rok: 2024 ; AIS: 1.895, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/plphys/advance-article/doi/10.1093/plphys/kiad615/7424862?login=true
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353074

0638013 - ÚVGZ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Espinoza-Corral, R. - Zavřel, Tomáš - Sutter, M. - Leslie, C.H. - Yang, K. - Beck, W.F. - Červený, Jan - Kerfeld, C.A.
The linker protein ApcI regulates light harvesting under red light in Synechocystis sp. PCC 6803.
Plant Cell. Roč. 37, č. 7 (2025). ISSN 1040-4651. E-ISSN 1532-298X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018123; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: phycobilisomes * photosystem * synechocystis * light harvesting
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.6, rok: 2024 ; AIS: 3.7, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/40479507/
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368780

0586974 - ÚVGZ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Literáková, Petra - Zavřel, Tomáš - Búzová, Diana - Kaštánek, P. - Červený, Jan
Marine microalgae Schizochytrium demonstrates strong production of essential fatty acids in various cultivation conditions, advancing dietary self-sufficiency.
Frontiers in Nutrition. Roč. 11, MAY (2024), č. článku 1290701. ISSN 2296-861X. E-ISSN 2296-861X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA TA ČR(CZ) TN02000044
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: docosahexaenoic acid * limacinum * glycerol * omega-3 * model * water * dha * docosahexaenoic acid * unicellular eukaryote * growth * optimization * health supplements * bioreactors * process automation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 1.026, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fnut.2024.1290701/full
Červený, Jan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0354330

0599278 - ÚVGZ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Patil, A. M. - Pawar, B. D. - Wagh, Sopan - Shinde, H. - Shelake, R. M. - Markad, N. R. - Bhute, N. K. - Červený, Jan - Wagh, R. S.
Abiotic Stress in Cotton: Insights into Plant Responses and Biotechnological Solutions.
Agriculture-Basel. Roč. 14, č. 9 (2024), č. článku 1638. E-ISSN 2077-0472
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000044
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: gossypium-hirsutum l. * wrky transcription factors * heavy-metal stress * salt-stress * drought tolerance * fiber quality * water-stress * improves drought * salinity stress * gene family * abiotic stress tolerance * CRISPR/Cas9 * drought * heat * salinity * stress physiology
Obor OECD: Agronomy, plant breeding and plant protection
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.534, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2077-0472/14/9/1638
Wagh, Sopan
- Shinde, H.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356770

0599397 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pfennig, T. - Kullmann, E. - Zavřel, Tomáš - Nakielski, A. - Ebenhoeh, O. - Červený, Jan - Bernát, G. - Matuszynska, A. B.
Shedding light on blue-green photosynthesis: A wavelength-dependent mathematical model of photosynthesis in Synechocystis sp. PCC 6803.
PLoS Computational Biology. Roč. 20, č. 9 (2024), č. článku e1012445. ISSN 1553-734X. E-ISSN 1553-7358
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018123; GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA MŠMT(CZ) LUAUS24149
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: orange carotenoid protein * electron-transport * cyanobacteria * quality * energy * transitions * pathways * pcc-6803 * co2
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.741, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1012445
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356867

0572629 - ÚVGZ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rebej, M. - Juřena, T. - Vondál, J. - Fuente Herraiz, D. - Červený, Jan - Jegla, Z.
Numerical simulations and validation of single- and two-phase flow in a stirred lab-scale photobioreactor.
Biosystems Engineering. Roč. 230, JUN (2023), s. 35-50. ISSN 1537-5110. E-ISSN 1537-5129
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: cfd * multiphase flow * photobioreactor * PIV validation * shear stress * agitation
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 4.4, rok: 2023 ; AIS: 0.833, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S153751102300079X?via%3Dihub
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0343262

0572613 - MBÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Rodrigues, J. S. - Kovács, L. - Lukeš, Martin - Hoper, R. - Steuer, R. - Červený, Jan - Lindberg, P. - Zavřel, Tomáš
Characterizing isoprene production in cyanobacteria-Insights into the effects of light, temperature, and isoprene on Synechocystis sp. PCC 6803.
Bioresource Technology. Roč. 380, JUL 2023 (2023), č. článku 129068. ISSN 0960-8524. E-ISSN 1873-2976
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652079
Klíčová slova: Biofuels * Cultivation conditions * Optimization * Thermotolerance * Flux Balance Analysis
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UEK-B)
Impakt faktor: 9.7, rok: 2023 ; AIS: 1.335, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960852423004947?via%3Dihub
Zavřel, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0347180

0585950 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sándor, Roman - Wagh, Sopan - Kelterborn, S. - Grosskinsky, D. K. - Novák, Ondřej - Olsen, N. - Paul, B. - Petřík, Ivan - Wu, S. - Hegemann, P. - Strnad, Miroslav - Červený, Jan - Roitsch, Thomas
Cytokinin-deficient Chlamydomonas reinhardtii CRISPR-Cas9 mutants show reduced ability to prime resistance of tobacco against bacterial infection.
Physiologia Plantarum. Roč. 176, č. 3 (2024), č. článku e14311. ISSN 0031-9317. E-ISSN 1399-3054
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-07661S; GA TA ČR(CZ) TN02000044; GA ČR(CZ) GA18-24397S
Institucionální podpora: RVO:86652079 ; RVO:61389030
Klíčová slova: plant-growth * pseudomonas-syringae * endogenous cytokinins * chlorella-fusca * abscisic-acid * cyanobacteria * biosynthesis * auxin * microalgae * immunity
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.895, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ppl.14311
Roitsch, Thomas
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0353585

0597779 - ÚVGZ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Shelake, R. M. - Wagh, Sopan - Patil, A. M. - Červený, Jan - Waghunde, R. R. - Kim, J.
Heat Stress and Plant-Biotic Interactions: Advances and Perspectives.
Plants. Roč. 13, č. 15 (2024), č. článku 2022. ISSN 2223-7747. E-ISSN 2223-7747
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN02000044
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: induced systemic resistance * root-knot nematodes * high-temperature * stripe rust * climate-change * induced susceptibility * molecular-mechanisms * magnaporthe-oryzae * stable resistance * abiotic stresses * biotic stress * climate change * climate-resilient crops * heat stress * microbiome * plant immunity * plant stress * plant-biotic interactions
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.1, rok: 2024 ; AIS: 0.665, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2223-7747/13/15/2022
Wagh, Sopan
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355598

0619551 - ÚVGZ 2026 RIV eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Schreiber, Igor - Červený, Jan
Reaction Network Based Model for Carbon-Nitrogen Metabolism and Ultradian Rhythms in Cyanobacteria.
Mathematical Analysis and Applications in Biological Phenomena through Modelling, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics. Singapore: Springer Nature, 2025 - (Priti Kumar, R.; Xianbing, C.; Arindam, B.), s. 227-237. ISBN 978-981-97-9193-4. ISSN 2194-1009.
[Mathematical Analysis and Applications in Biological Phenomena through Modelling, Springer Proceedings in Mathematics & Statistics. Kolkata (IN), 09.10.2023-11.10.2023]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-24397S
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: nonlinear dynamical system * reaction networks * cn-metabolism in cyanobacteria * ultradian cycles * kinetic parameter estimation
Obor OECD: Pure mathematics
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0366217

0639895 - ÚVGZ 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tsoneva, D.K. - Búzová, Diana - Bianco, S. D. - Kisheva, A. - Rushid, M. - Ivanova, T. - Yotov, Y. - Červený, Jan - Mazza, T. - Vinciguerra, M.
Histone H2A: a promising diagnostic marker in heart failure with reduced versus preserved ejection fraction.
Molecular and Cellular Biochemistry. Roč. 480, č. 7 (2025). ISSN 0300-8177. E-ISSN 1573-4919
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: Heart failure * Reduced ejection fraction * Preserved ejection fraction * Liquid biopsy * Histones * Plasma
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 0.723, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007/s11010-025-05254-7
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0370370

0644785 - ÚVGZ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tsoneva, Desislava K. - Búzová, Diana - Bianco, S. D. - Mazza, T. - Červený, Jan - Yotov, Y. - Kisheva, A. - Vinciguerra, M.
Circulating Histone Profiles Discriminate Heart Failure Patients With Preserved Versus Reduced Ejection Fraction.
JOURNAL OF CARDIAC FAILURE. Roč. 31, č. 1 (2025), s. 331-332. ISSN 1071-9164. E-ISSN 1532-8414
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: heart failure * circulating histones * liquid biopsy
Obor OECD: Cardiac and Cardiovascular systems
Impakt faktor: 8.2, rok: 2024 ; AIS: 2.699, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S107191642400808X
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374666

0642521 - ÚVGZ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tsoneva, Desislava K. - Búzová, Diana - Bianco, S. D. - Micheva, I. - Efraim, M. - Daskalova, N. - Resnick, I. - Teneva, M. - Chervenkov, T. - Conev, N. V. - Manev, R. - Stoyanov, D. S. - Červený, Jan - Mazza, T. - Vinciguerra, M.
Histone-based liquid biopsy discriminates between myelodysplastic syndrome and solid malignancies.
Clinical Epigenetics. Roč. 17, č. 1 (2025). ISSN 1868-7075. E-ISSN 1868-7083
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: cell-free dna * diagnostic-value * lung * nucleosome * expression * macroh2a1 * variants * sarcoma * breast * serum * Solid tumor malignancies * mds * Liquid biopsy * Histone * Nucleosomes
Obor OECD: Oncology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2024 ; AIS: 1.645, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1186/s13148-025-01995-w
Vinciguerra, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0372428

0616559 - ÚVGZ 2025 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Wagh, Sopan - Shelake, R. M. - Patil, A. M. - Sumeet, M. - Červený, Jan
Microbes Enhance Climate-Ready Crops for Sustainable Agriculture.
Rhizospheric Interactions for Abiotic Stress Mitigation. Lonon: Cambridge Scholar Publishing, 2024 - (Rai, A.; Chandra, P.; Basak, N.; Sundha, P.; Yadav, R.), s. 100-122. ISBN 978-1-0364-1512-9
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: Climate change * Abiotic stress * Biotic stress * Microbiome * Resilient crops
Obor OECD: Agricultural biotechnology and food biotechnology
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0363550

0617157 - ÚVGZ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zavřel, Tomáš - Segečová, Anna - Kovacs, L. - Lukeš, Martin - Novák, Z. - Pohland, A. - Szabó, A. - Somogyi, B. - Prášil, Ondřej - Červený, Jan - Bernát, G.
A Comprehensive Study of Light Quality Acclimation in Synechocystis Sp. PCC 6803.
Plant and Cell Physiology. Roč. 65, č. 8 (2024), s. 1285-1297. ISSN 0032-0781. E-ISSN 1471-9053
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_026/0008413; GA MŠMT(CZ) LM2018123
Institucionální podpora: RVO:86652079 ; RVO:61388971
Klíčová slova: photosystem-ii * chromatic acclimation * growth * cyanobacteria * carbon * stress * cells * gene * Cyanobacteria * Light harvesting * Light quality * Photomorphogenesis * Photosynthesis * State transitions
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (MBU-M)
Impakt faktor: 4, rok: 2024 ; AIS: 1.071, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/pcp/article/65/8/1285/7697223?login=false
Zavřel, Tomáš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364111