Publikace ASEP
0601796 - BÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Belyayev, Alexander - Quirós de la Peña, Begoña - Villanueva Corrales, Simon - Low, Shook Ling - Frejová, Barbora - Sejfová, Zuzana - Josefiová, Jiřina - Záveská, Eliška - Bertrand, Yann - Chrtek, Jindřich - Mráz, P.
Analysis of pericentromere composition and structure elucidated the history of the Hieracium alpinum L. genome, revealing waves of transposable elements insertions.
Mobile DNA. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 26. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR GA22-16651S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: sequence * evolution * retrotransposons * microinversions * centromeres * transposable elements
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 2.105, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s13100-024-00336-7
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362962
0602188 - BÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Cangren, P. - Bertrand, Yann - Braverman, J. M. - Gilfillan, G.D. - Hamilton, M. B. - Oxelman, B.
A dataset of 40 assembled and annotated transcriptomes from 34 species in Silene and related genera.
Data in Brief. Roč. 57, December (2024), č. článku 111094. ISSN 2352-3409. E-ISSN 2352-3409
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: Sileneae (original data) * genomics * phylogenetics * RNA-transcripts * nucleotide
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 1.4, rok: 2024 ; AIS: 0.23, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.dib.2024.111094
Cangren, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362970
0587208 - BÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
de Sousa, F. - Bertrand, Yann - Zizka, A. - Cangrén, P. - Oxelman, B. - Pfeil, B. E.
Chloroplast genome and nuclear loci data for 71 Medicago species.
Data in Brief. Roč. 54, June (2024), č. článku 110540. ISSN 2352-3409. E-ISSN 2352-3409
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: tree * sequence-capture * phylogenetics * genomics * Fabaceae
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 1.4, rok: 2024 ; AIS: 0.23, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.dib.2024.110540
de Sousa, F.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0356459
0561448 - BÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Fehrer, Judith - Bertrand, Yann - Hartmann, Matthias - Caklová, Petra - Josefiová, Jiřina - Bräutigam, S. - Chrtek, Jindřich
A Multigene Phylogeny of Native American Hawkweeds (Hieracium Subgen. Chionoracium, Cichorieae, Asteraceae): Origin, Speciation Patterns, and Migration Routes.
Plants. Roč. 11, č. 19 (2022), č. článku 2584. ISSN 2223-7747. E-ISSN 2223-7747
Grant CEP: GA ČR GA206/05/0657; GA ČR GAP506/10/1363; GA ČR(CZ) GA17-14620S; GA ČR GA22-16651S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: Chionoracium * multigene phylogeny * dating
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022 ; AIS: 0.623, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/plants11192584
Fehrer, Judith
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0338257
0601328 - BÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Holmudden, M. - Gustafsson, J. - Bertrand, Yann - Schliep, A. - Norberg, P.
Evolution shapes and conserves genomic signatures in viruses.
Communications Biology. Roč. 7, č. 1 (2024), č. článku 1412. E-ISSN 2399-3642
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: attenuated influenza-virus * synonymous codon usage * bias * classification * evolution pressure
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2024 ; AIS: 2.063, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s42003-024-07098-1
Norberg, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362966
0641858 - ÚEB 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kusová, A. - Holá, Marcela - Goffová Petrová, I. - Rudolf, J. - Zachová, D. - Skalák, J. - Hejátko, J. - Klodová, Božena - Přerovská, T. - Lyčka, M. - Sýkorová, Eva - Bertrand, Yann - Fajkus, J. - Honys, David - Procházková Schrumpfová, P.
TRB proteins in moss reveal their evolutionarily conserved roles in plant development and telomere maintenance.
Plant Journal. Roč. 124, č. 3 (2025), č. článku e70574. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA ČR(CZ) GA21-15841S; GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging III - 90250; e-INFRA CZ II - 90254
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68081707 ; RVO:67985939
Klíčová slova: physcomitrella-patens * arabidopsis-thaliana * gene family * 3d growth * attrb1 * localization * expression * insights * homolog * telomeres * gene regulation * protonema * mosses * plant evolution
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/tpj.70574
Procházková Schrumpfová, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0371870