Publikace ASEP
0601796 - BÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Belyayev, Alexander - Quirós de la Peña, Begoña - Villanueva Corrales, Simon - Low, Shook Ling - Frejová, Barbora - Sejfová, Zuzana - Josefiová, Jiřina - Záveská, Eliška - Bertrand, Yann - Chrtek, Jindřich - Mráz, P.
Analysis of pericentromere composition and structure elucidated the history of the Hieracium alpinum L. genome, revealing waves of transposable elements insertions.
Mobile DNA. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 26. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR GA22-16651S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: sequence * evolution * retrotransposons * microinversions * centromeres * transposable elements
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 2.105, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s13100-024-00336-7
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362962
0576215 - BÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Belyayev, Alexander - Kalendar, R. - Josefiová, Jiřina - Paštová, Ladislava - Habibi, Farzaneh - Mahelka, Václav - Mandák, Bohumil - Krak, Karol
Telomere sequence variability in genotypes from natural plant populations: unusual block-organized double-monomer terminal telomeric arrays.
BMC Genomics. Roč. 24, September (2023), č. článku 572. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR GA20-20286S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: evolution * Oxford nanopore sequencing * telomere
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.5, rok: 2023 ; AIS: 1.116, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12864-023-09657-y
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348547
0556804 - BÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Belyayev, Alexander - Josefiová, Jiřina - Jandová, Michaela - Kalendar, R. - Mahelka, Václav - Mandák, Bohumil - Krak, Karol
The structural diversity of CACTA transposons in genomes of Chenopodium (Amaranthaceae, Caryophyllales) species: specific traits and comparison with the similar elements of angiosperms.
Mobile DNA. Roč. 13, č. 1 (2022), č. článku 8. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR GA20-20286S
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: japanese morning glory * gene * evolution * sequence * domain * mutation * identification * triticeae * family * plants * CACTA transposons * Chenopodium
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022 ; AIS: 1.736, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s13100-022-00265-3
Belyayev, Alexander
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0336027
0563717 - BÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Chumová, Zuzana - Belyayev, Alexander - Mandáková, T. - Zeisek, Vojtěch - Hodková, Eva - Šemberová, Kristýna - Euston-Brown, D. - Trávníček, Pavel
The relationship between transposable elements and ecological niches in the Greater Cape Floristic Region: A study on the genus Pteronia (Asteraceae).
Frontiers in Plant Science. Roč. 13, 29 September (2022), č. článku 982852. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR GA19-20049S; GA MŠMT EF16_027/0007852
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: genome size * Greater Cape Floristic Region (GCFR) * HybSeq * niche modelling * Pteronia * repeatome
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022 ; AIS: 1.076, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fpls.2022.982852
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0338917
0618158 - BÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jaggi, K. E. - Krak, Karol - Štorchová, Helena - Mandák, Bohumil - Marcheschi, A. - Belyayev, Alexander - Jellen, E.N. - Sproul, J. - Jarvis, D. - Maughan, P. J.
A pangenome reveals LTR repeat dynamics as a major driver of genome evolution in Chenopodium.
Plant Genome. Roč. 18, č. 1 (2025), č. článku e70010. ISSN 1940-3372. E-ISSN 1940-3372
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581; GA ČR GA20-20286S
Institucionální podpora: RVO:67985939 ; RVO:61389030
Klíčová slova: multiple sequence alignment * domesticated chenopod * chloroplast dna * quinoa * retrotransposons * improvements * assemblies * diversity
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.906, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/tpg2.70010
Maughan, P. J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0367649