Publikace ASEP
0605575 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lemmens, Toon - Šponer, Jiří - Krepl, Miroslav
How Binding Site Flexibility Promotes RNA Scanning by TbRGG2 RRM: A Molecular Dynamics Simulation Study.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 65, č. 2 (2025), s. 896-907. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA23-05639S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: pre-ribosomal-rna * recognition motifs * structural basis * cap analog * parameters * proteins * sequence * nmr
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 1.526, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.4c01954
Krepl, Miroslav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368169
0643799 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lemmens, Toon - Mlýnský, Vojtech - Šponer, Jiří - Pykal, M. - Banáš, P. - Otyepka, M. - Krepl, Miroslav
The Kink-Turn 7 Motif: An Additional Test for RNA Force Field Performance.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 21, č. 24 (2025), s. 12796-12809. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * large ribosomal-subunit * tertiary interactions * crystal-structure * monovalent ions * parameters
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.5, rok: 2024 ; AIS: 1.52, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.5c00776
Krepl, Miroslav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374118