Publikace ASEP
0603217 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Horváth, J. - Jedlička, Pavel - Krátká, Marie - Kubát, Zdeněk - Kejnovský, Eduard - Lexa, M.
Detection and classification of long terminal repeat sequences in plant LTR-retrotransposons and their analysis using explainable machine learning.
BioData Mining. Roč. 17, č. 1 (2024), č. článku 57. ISSN 1756-0381. E-ISSN 1756-0381
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S; GA ČR(CZ) GA22-00364S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581; GA ČR(CZ) GA24-11400S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: genome-wide analysis * transposable elements * transcription * evolution * transposition * specificity * pathway
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.1, rok: 2024 ; AIS: 1.274, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://biodatamining.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13040-024-00410-z
Horváth, J. Lexa, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0360634
0603495 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mata-Sucre, Y. - Krátká, Marie - Oliveira, Ludmila - Neumann, Pavel - Macas, Jiří - Schubert, V. - Huettel, B. - Kejnovský, Eduard - Houben, A. - Pedrosa-Harand, A. - Souza, G. - Marques, A.
Repeat-based holocentromeres of the woodrush Luzula sylvatica reveal insights into the evolutionary transition to holocentricity.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 9565. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA ČR(CZ) GA24-11400S; GA ČR(CZ) GA21-00580S; GA ČR(CZ) GA20-25440S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:60077344
Klíčová slova: genome size variation * read alignment * centromere * chromosome * dna * visualization * rhynchospora * organization * juncaceae * histone
Obor OECD: Cell biology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 15.7, rok: 2024 ; AIS: 5.611, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-024-53944-5
Marques, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0360827