Nápověda

Bohalova Natalia

Publikace ASEP

Další varianty jména: Valková, Natalia
Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 14

0604124 - BFÚ 2025 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Cerven, J. - Valková, Natalia - Volna, A. - Dobrovolná, Michaela - Šislerová, Lucie - Baldvinsson, H. - Pečinka, P. - Brázda, Václav
RNA analysis of the longest living vertebrate Greenland shark revealed an abundance of LINE-like elements in its transcriptome.
Czech Polar Reports. Roč. 13, č. 2 (2023), s. 210-227. ISSN 1805-0689. E-ISSN 1805-0697
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: somniosus-microcephalus * reverse-transcriptase * protein * cancer * prediction * alignment * accurate * database * search * Greenland shark * transcriptome * bioinformatics * line1 * longevity research * Somniosus microcephalus
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 0.5, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.muni.cz/CPR/article/view/38141

Bartas, M. Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0361474

0557781 - BFÚ 2023 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Bohalova, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Brázda, Václav - Bidula, S.
Conservation and over-representation of G-quadruplex sequences in regulatory regions of mitochondrial DNA across distinct taxonomic sub-groups.
Biochimie. Roč. 194, MAR 2022 (2022), s. 28-34. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: r-loops * rna * sites * Mitochondria * Genome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022 ; AIS: 0.757, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908421002947?via%3Dihub
Bidula, S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0339565

0558371 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bowater, R. - Bohalova, Natalia - Brázda, Václav
Interaction of Proteins with Inverted Repeats and Cruciform Structures in Nucleic Acids.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 11 (2022), č. článku 6171. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: non-b dna * holliday junction * escherichia-coli * preferential binding * genetic instability * superhelical dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022 ; AIS: 1.03, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/11/6171
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340691

0582377 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Valková, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Mergny, Jean-Louis
Abundance of G-Quadruplex Forming Sequences in the Hepatitis Delta Virus Genomes.
ACS Omega. Roč. 9, č. 3 (2024), s. 4096-4101. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna g-quadruplex * dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.3c09288
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0352960

0574515 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Dobrovolná, Michaela - Bohalova, Natalia - Mergny, Jean-Louis
G-quadruplexes in the evolution of hepatitis B virus.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 14 (2023), s. 7198-7204. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: FORMING SEQUENCES * GENOME * TRANSCRIPTION
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/14/7198/7217046?login=true

Brázda, Václav Mergny, Jean-Louis
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350075

0551529 - BFÚ 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Bohalova, Natalia - Bowater, R. P.
New telomere to telomere assembly of human chromosome 8 reveals a previous underestimation of G-quadruplex forming sequences and inverted repeats.
Gene. Roč. 810, FEB 5 2022 (2022), č. článku 146058. ISSN 0378-1119. E-ISSN 1879-0038
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: messenger-rna * dna * G-quadruplex * Inverted repeat * Genome sequence of human chromosome 8 * Non-B DNA structures
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.5, rok: 2022 ; AIS: 0.579, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378111921006533?via%3Dihub

Brázda, Václav Bowater, R. P.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340615

0556798 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Cantara, Alessio - Luo, Y. - Dobrovolna, M. - Bohalova, Natalia - Fojta, Miroslav - Verga, D. - Guittat, L. - Cucchiarini, A. - Savrimoutou, S. - Haberli, C. - Guillon, J. - Keiser, J. - Brázda, Václav - Mergny, Jean-Louis
G-quadruplexes in helminth parasites.
Nucleic Acids Research. Roč. 50, č. 5 (2022), s. 2719-2735. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: antiprotozoal evaluation * small-molecule * g-quartet * dna * genome * stability
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022 ; AIS: 5.391, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/50/5/2719/6541030?login=true
Brázda, Václav
- Mergny, Jean-Louis
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340439

0560261 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dobrovolná, Michaela - Bohalova, Natalia - Peška, Vratislav - Wang, J. - Luo, Y. - Bartas, M. - Volna, A. - Mergny, Jean-Louis - Brázda, Václav
The Newly Sequenced Genome of Pisum sativum Is Replete with Potential G-Quadruplex-Forming Sequences-Implications for Evolution and Biological Regulation.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 15 (2022), č. článku 8482. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * G4 propensity * chloroplast DNA * sequence prediction
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022 ; AIS: 1.03, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/15/8482
Mergny, Jean-Louis
- Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340527

0574518 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ferret, L. - Alvarez-Valadez, K. - Riviere, J. - Muller, A. - Bohalova, Natalia - Yu, L. - Guittat, L. - Brázda, Václav - Kroemer, G. - Mergny, Jean-Louis - Djavaheri-Mergny, M.
G-quadruplex ligands as potent regulators of lysosomes.
Autophagy. Roč. 19, č. 7 (2023), s. 1901-1915. ISSN 1554-8627. E-ISSN 1554-8635
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Autophagy * guanine-quadruplex * lysosome membrane permeabilization * tfeb * transcriptional regulation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 14.6, rok: 2023 ; AIS: 4.347, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15548627.2023.2170071
Mergny, Jean-Louis
- Djavaheri-Mergny, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350465

0644606 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kratochvilová, Libuše - Dinová, Alessandra - Valková, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Sanchez-Murcia, Pedro A. - Brázda, Václav
Chromatin Immunoprecipitation Reveals p53 Binding to G-Quadruplex DNA Sequences in Myeloid Leukemia Cell Lines.
ACS Bio & Med Chem Au. Roč. 5, č. 2 (2025), s. 283-298. ISSN 2694-2437. E-ISSN 2694-2437
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: mutant p53 * tumor-suppressor * damage responses * cancer * modulation * mutations * requires * complex * model
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.129, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsbiomedchemau.4c00124
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374452

0583206 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kratochvilová, Libuše - Vojsovič, Matůš - Valková, Natalia - Šislerová, Lucie - El Rashed, Z. - Inga, A. - Monti, P. - Brázda, Václav
The presence of a G-quadruplex prone sequence upstream of a minimal promoter increases transcriptional activity in the yeast Saccharomyces cerevisiae.
Bioscience Reports. Roč. 43, č. 12 (2023), č. článku BSR20231348. ISSN 0144-8463. E-ISSN 1573-4935
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: small-molecule * thioflavin t * dna * p53 * transactivation * visualization * specificities * evolution * region
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2023 ; AIS: 0.676, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://portlandpress.com/bioscirep/article/43/12/BSR20231348/233764/The-presence-of-a-G-quadruplex-prone-sequence
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351205

0569309 - BFÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Pečinka, P. - Bohalova, Natalia - Volna, A. - Kundratova, K. - Brázda, Václav - Bartas, M.
Analysis of G-Quadruplex-Forming Sequences in Drought Stress-Responsive Genes, and Synthesis Genes of Phenolic Compounds in Arabidopsis thaliana.
Life. Roč. 13, č. 1 (2023), č. článku 199. E-ISSN 2075-1729
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * pqs * Arabidopsis thaliana * drought stress * phenolic compounds
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2023 ; AIS: 0.655, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2075-1729/13/1/199
Bartas, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0344341

0574524 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valková, Natalia - Kratochvilova, L. - Martinková, L. - Brázda, Václav
Dual mode of IFI16 binding to supercoiled and linear DNA: A closer insight.
Biochemical and Biophysical Research Communications. Roč. 667, JUL 30 2023 (2023), s. 89-94. ISSN 0006-291X. E-ISSN 1090-2104
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: ifi16 * Superhelicity * dna * afm * G-quadruplex * Inverted repeat
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.5, rok: 2023 ; AIS: 0.598, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006291X23006125?via%3Dihub
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349252

0600735 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vojsovič, Matůš - Kratochvilová, Libuše - Valková, Natalia - Šislerová, Lucie - El Rashed, Z. - Menichini, P. - Inga, A. - Monti, P. - Brázda, Václav
Transactivation by partial function P53 family mutants is increased by the presence of G-quadruplexes at a promoter site.
Biochimie. Roč. 216, JAN 2024 (2024), s. 14-23. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: tp63 mutations * binding-sites * dna * cancer * evolution * identification * reveal * p63 * Protein-DNA interactions
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3, rok: 2024 ; AIS: 0.729, rok: 2024
Způsob publikování: Open access s časovým embargem
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908423002535?via%3Dihub
Brázda, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0358030