Jedlička Pavel

0599224 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hobza, Roman - Bačovský, Václav - Čegan, Radim - Horáková, Lucie - Hubinský, Marcel - Janíček, Tomáš - Janoušek, Bohuslav - Jedlička, Pavel - Kružlicová, Jana - Kubát, Zdeněk - Lorenzo, Jose Luis Rodriguez - Novotná, Pavla - Hudzieczek, Vojtěch
Sexy ways: approaches to studying plant sex chromosomes.
Journal of Experimental Botany. Roč. 75, č. 17 (2024), s. 5204-5219. ISSN 0022-0957. E-ISSN 1460-2431
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-00301S; GA ČR(CZ) GA22-00364S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: latifolia y-chromosome * silene-latifolia * dioecious plant * white campion * transposable elements * repetitive sequences * female flowers * early events * evolution
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.479, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/jxb/article/75/17/5204/7656702
Hobza, Roman
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0356739

0638532 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Horáková, Lucie - Jedlička, Pavel - Čegan, Radim - Navrátilová, Pavla - Tanaka, H. - Toyoda, A. - Itoh, T. - Akagi, T. - Ono, E. - Hudzieczek, Vojtěch - Patzak, J. - Šafář, Jan - Hobza, Roman - Bačovský, Václav
Dynamic patterns of repeats and retrotransposons in the centromeres of Humulus lupulus L.
New Phytologist. Roč. 247, č. 6 (2025), s. 2766-2780. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-00301S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: chromosome instability * evolution * genome * cenh3 * divergence * dna * asymmetric cell division
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 8.1, rok: 2024 ; AIS: 2.744, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.70380
Hobza, Roman
- Bačovský, Václav
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374190

0603217 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Horváth, J. - Jedlička, Pavel - Krátká, Marie - Kubát, Zdeněk - Kejnovský, Eduard - Lexa, M.
Detection and classification of long terminal repeat sequences in plant LTR-retrotransposons and their analysis using explainable machine learning.
BioData Mining. Roč. 17, č. 1 (2024), č. článku 57. ISSN 1756-0381. E-ISSN 1756-0381
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S; GA ČR(CZ) GA22-00364S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581; GA ČR(CZ) GA24-11400S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: genome-wide analysis * transposable elements * transcription * evolution * transposition * specificity * pathway
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.1, rok: 2024 ; AIS: 1.274, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://biodatamining.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13040-024-00410-z

Horváth, J. Lexa, M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360634

0571529 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jedlička, Pavel - Tokan, Viktor - Kejnovská, Iva - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
Telomeric retrotransposons show propensity to form G-quadruplexes in various eukaryotic species.
Mobile DNA. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 3. ISSN 1759-8753. E-ISSN 1759-8753
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Telomere * G-quadruplex * Retrotransposon * Drosophila * Het-A * tart * tahre
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.7, rok: 2023 ; AIS: 2.1, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://mobilednajournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13100-023-00291-9
Tokan, Viktor
- Kejnovský, Eduard
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0345689

0572389 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jedličková, V. - Hejret, V. - Demko, M. - Jedlička, Pavel - Stefkova, M. - Robert, H.S.
Transcriptome analysis of thermomorphogenesis in ovules and during early seed development in Brassica napus.
BMC Genomics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 236. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Brassica napus * Thermomorphogenesis * Ovule * Seed * Embryo * Transcriptomics
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.5, rok: 2023 ; AIS: 1.116, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09316-2
Robert, H.S.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350037

0644639 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovský, Eduard - Jedlička, Pavel - Lexa, M. - Kubát, Zdeněk
Factors determining chromosomal localization of transposable elements in plants.
Plant Biology. Roč. 27, č. 6 (2025), s. 975-989. ISSN 1435-8603. E-ISSN 1438-8677
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: inverted-repeat elements * penelope-like elements * dna methylation * repetitive sequences * ltr-retrotransposons * arabidopsis-thaliana * binding sites * evolution * genome * family * Centromere * chromosomes * plant genome * recombination * transcription factor * transposable elements
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 0.849, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/plb.70057?utm_source=clarivate&getft_integrator=clarivate

Kejnovský, Eduard Kubát, Zdeněk
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374487

0569371 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovský, Eduard - Jedlička, Pavel
Nucleic acids movement and its relation to genome dynamics of repetitive DNA Is cellular and intercellular movement of DNA and RNA molecules related to the evolutionary dynamic genome components?
BioEssays. Roč. 44, č. 4 (2022), č. článku e2100242. ISSN 0265-9247. E-ISSN 1521-1878
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S; GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * genome dynamics * horizontal gene transfer * migration * movement * small RNA * transposable elements
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022 ; AIS: 1.427, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/bies.202100242

Kejnovský, Eduard Jedlička, Pavel
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340689

0560041 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, Matej - Čechová, M. - Nguyen, S. H. - Jedlička, Pavel - Tokan, Viktor - Kubát, Zdeněk - Hobza, Roman - Kejnovský, Eduard
HiC-TE: a computational pipeline for Hi-C data analysis to study the role of repeat family interactions in the genome 3D organization.
Bioinformatics. Roč. 38, č. 16 (2022), s. 4030-4032. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1367-4811
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: TRANSPOSABLE ELEMENTS * SEQUENCE
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022 ; AIS: 3.01, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/16/4030/6628581?login=true

Lexa, Matej Kejnovský, Eduard
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340534

0636859 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Moraga, C. - Branco, C. - Rougemont, Q. - Jedlička, Pavel - Mendoza-Galindo, E. - Veltsos, P. - Hanique, M. - Rodriguez de la Vega, Ricardo C. - Tannier, E. - Liu, X. - Lemaitre-Guillier, C. - Fields, P. D. - Cruaud, C. - Labadie, K. - Belser, C. - Briolay, J. - Santoni, S. - Čegan, Radim - Linheiro, R. - Adam, G. - El Filali, A. - Mossion, V. - Boualem, A. - Tavares, R. - Chebbi, A. - Cordaux, R. - Fruchard, C. - Prentout, D. - Velt, A. - Spataro, B. - Delmotte, S. - Weingartner, L. - Toegelová, Helena - Tulpová, Zuzana - Cápal, Petr - Šimková, Hana - Štorchová, Helena - Krüger, Manuela - Abeyawardana, Oushadee A.J. - Taylor, D.R. - Olson, M. - Sloan, D.B. - Karrenberg, S. - Delph, L.F. - Charlesworth, D. - Muyle, A. - Giraud, T. - Bendahmane, A. - Di Genova, A. - Madoui, M.-A. - Hobza, Roman - Marais, G.A.B.
The Silene latifolia genome and its giant Y chromosome.
Science. Roč. 387, č. 6734 (2025), s. 630-636. ISSN 0036-8075. E-ISSN 1095-9203
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-00580S; GA ČR(CZ) GA22-00364S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: sex-chromosomes * evolutionary history * dosage compensation * white campion * model * degeneration * dimorphism * reveals * gene
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 45.8, rok: 2024 ; AIS: 20.329, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adj7430
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0367814