Publikace ASEP
0643356 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Alpizar-Sosa, E. A. - Saura, A. - Fajkus, Petr - Polakova, E. - Havlová, Kateřina - Albanaz, A.T.S. - Fajkus, Jiří - Yurchenko, V.
Leishmania mexicana telomeres at high resolution: Ku80, TERT, and alternative lengthening mechanisms.
BMC Genomics. Roč. 26, č. 1 (2025), č. článku 955. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04769S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: terminal transferase * yeast ku * maintenance * protein * chromosomes * expression * pathways
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.031, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1186/s12864-025-12154-z?utm_source=getftr&utm_medium=getftr&utm_campaign=getftr_pilot&getft_integrator=clarivate
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374151
0582767 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Bozdechova, L. - Havlová, K. - Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
Analysis of Telomerase RNA Structure in Physcomitrium patens Indicates Functionally Relevant Transitions Between OPEN and CLOSED Conformations.
Journal of Molecular Biology. Roč. 436, č. 4 (2024), č. článku 168417. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: shape * architecture * template * models * yeast * core * map * telomerase RNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002228362300534X?via%3Dihub
Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0352992
0605506 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
Telomerase RNA evolution: a journey from plant telomeres to broader eukaryotic diversity.
Biochemical Journal. Roč. 483, č. 3 (2025). ISSN 0264-6021. E-ISSN 1470-8728
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04769S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Telomeres * Telomerase RNA * Evolution * TR identification * non-coding RNA
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.436, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39889303/
Fajkus, Petr Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0363232
0582139 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fajkus, Petr - Adámik, Matěj - Nelson, A. D. L. - Kilar, A. - Franek, M. - Bubenik, M. - Čapková Frydrychová, Radmila - Votavová, A. - Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří - Peška, Vratislav
Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 1 (2023), s. 420-433. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:60077344
Klíčová slova: template-boundary definition * pseudoknot * sequence * identification * mechanisms * promoter * element * repeats * gene
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/1/420/6956357?login=true
Fajkus, Petr Fajkus, Jiří
- Peška, Vratislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0350217
0604134 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kilar, A. - Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
GERONIMO: A tool for systematic retrieval of structural RNAs in a broad evolutionary context.
GigaScience. Roč. 12, September (2023). ISSN 2047-217X. E-ISSN 2047-217X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: noncoding rnas * trnascan-se * rfam * sequence homology searches * evolution * high-throughput pipeline * Snakemake
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.8, rok: 2023 ; AIS: 4.079, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giad080/7319579?login=true
Kilar, A. Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361482
0600734 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lyčka, M. - Bubenik, M. - Zavodnik, M. - Peška, Vratislav - Fajkus, Petr - Demko, M. - Fajkus, Jiří - Fojtová, M.
TeloBase: a community-curated database of telomere sequences across the tree of life.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. D1 (2024), D311-D321. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: aspergillus-oryzae * plant * evolution * repeats * identification * localization * conservation * chromosomes * arabidopsis * diversity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/52/D1/D311/7246534?login=true
Lyčka, M. Peška, Vratislav
- Fojtová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0358028
0586445 - BFÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Štefanovie, B. - Jenner, Leon - Bozdechova, L. - Fajkus, Petr - Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří - Paleček, J.
Characterisation of the Arabidopsis thaliana telomerase TERT-TR complex.
Plant Molecular Biology. Roč. 114, č. 3 (2024), č. článku 56. ISSN 0167-4412. E-ISSN 1573-5028
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: protein interactions * structural basis * rna * subunit * shelterin * system * domain
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.888, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s11103-024-01461-w
Fajkus, Jiří
- Paleček, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355243
0583724 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zavodnik, M. - Fajkus, Petr - Franek, M. - Kopecký, David - Garcia, S. - Dodsworth, S. - Orejuela, A. - Kilar, A. - Ptáček, J. - Mátl, Martin - Hyskova, A. - Fajkus, Jiří - Peška, Vratislav
Telomerase RNA gene paralogs in plants the usual pathway to unusual telomeres.
New Phytologist. Roč. 239, č. 6 (2023), s. 2353-2366. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06643S; GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: syntenic regions * evolution * centromere * diversity * evolution * land plants * mechanism of telomere transitions * telomerase RNA paralogs * unusual telomere DNA
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 8.3, rok: 2023 ; AIS: 2.706, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.19110
Fajkus, Petr
- Fajkus, Jiří
- Peška, Vratislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351722