Nápověda

Kovařík Aleš

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit všechny roky / Zrušit označení

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 15

0561249 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bartha, L. - Mandáková, T. - Kovařík, Aleš - Bulzu, Paul-Adrian - Rodde, N. - Mahelka, Václav - Lysák, M. A. - Fustier, M.-A. - Šafář, Jan - Cápal, Petr - Keresztes, L. - Banciu, H.L.
Intact ribosomal DNA arrays of Potentilla origin detected in Erythronium nucleus suggest recent eudicot-to-monocot horizontal transfer.
New Phytologist. Roč. 235, č. 3 (2022), s. 1246-1259. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA22-16826S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:60077344 ; RVO:67985939 ; RVO:61389030
Klíčová slova: Erythronium * horizontal gene transfer * internal transcribed spacer * lateral gene transfer
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (BC-A); Plant sciences, botany (BU-J); Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 9.4, rok: 2022 ; AIS: 2.587, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/nph.18171
Bartha, L.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0333946

0585450 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Garcia, S. - Kovařík, Aleš - Maiwald, S. - Mann, L. - Schmidt, N. - Pascual-Diaz, J.P. - Vitales, D. - Weber, B. - Heitkam, T.
The Dynamic Interplay Between Ribosomal DNA and Transposable Elements: A Perspective From Genomics and Cytogenetics.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 41, č. 3 (2024), č. článku msae025. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16826S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: murine leukemia-virus * nuclear-localization signal * saccharomyces-cerevisiae * sequence alignment * ty1 integrase * phylogenetic analysis * genetic transmission * budding yeast
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 4.312, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/41/3/msae025/7597089?login=true

Garcia, S. Heitkam, T.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0360712

0637716 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Herklotz, V. - Zhang, M. - Nascimento, T. - Kalfusová, Radka - Lunerová Bedřichová, Jana - Fuchs, J. - Harpke, A. - Huettel, B. - Pfordt, U. - Wissemann, V. - Kovařík, Aleš - Marques, A. - Ritz, C. M.
Bimodal centromeres in pentaploid dogroses shed light on their unique meiosis.
Nature. Roč. 643, č. 8070 (2025). ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: genus rosa * evolutionary significance * phylogenetic analysis * microsatellite dna * molecular-biology * read alignment * hybridization * inheritance * origin * chromosomes
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 48.5, rok: 2024 ; AIS: 23.37, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41586-025-09171-z
Kovařík, Aleš
- Marques, A.
- Ritz, C. M.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0368857

0583636 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kalfusová, Radka - Herklotz, V. - Kumke, K. - Houben, A. - Kovařík, Aleš - Ritz, Ch.M. - Lunerová Bedřichová, Jana
Epigenetic histone H3 phosphorylation marks discriminate between univalent- and bivalent-forming chromosomes during canina asymmetrical meiosis.
Annals of Botany. Roč. 2023, DEC 21 2023 (2023). ISSN 0305-7364. E-ISSN 1095-8290
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC20-14133J
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: sect. caninae * genus rosa * evolutionary significance * chromatin modification * microsatellite dna * serine 10 * condensation * pattern
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.6, rok: 2023 ; AIS: 1.017, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/aob/advance-article/doi/10.1093/aob/mcad198/7486368?login=true
Lunerová Bedřichová, Jana
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351656

0574513 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kovaříková, Alena - Stixová, Lenka - Kovařík, Aleš - Bártová, Eva
PARP-dependent and NAT10-independent acetylation of N4-cytidine in RNA appears in UV-damaged chromatin.
Epigenetics & Chromatin. Roč. 16, č. 1 (2023), č. článku 26. ISSN 1756-8935. E-ISSN 1756-8935
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: RNA acetylation * RNA methylation * nat10 * DNA repair * parp
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.2, rok: 2023 ; AIS: 2.067, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://epigeneticsandchromatin.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13072-023-00501-x
Bártová, Eva
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0350059

0601706 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mandáková, T. - Krumpolcová, Alice - Matyášek, Roman - Volkov, R. - Lysák, M. - Kovařík, Aleš
Uniparental silencing of 5S rRNA genes in plant allopolyploids insights from Cardamine (Brassicaceae).
Plant Journal. Roč. 119, č. 3 (2024), s. 1313-1326. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16826S; GA ČR(CZ) GA20-28029S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: arabidopsis-thaliana * secondary structures * rdna * evolution * dna * methylation * 45s * homogenization * diploidization * hybridization * rRNA genes * 5S rDNA
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.16850
Kovařík, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0359022

0618134 - BFÚ 2025 RIV RU eng J - Článek v odborném periodiku
Manoharlal, R. - Saiprasad, G. V. S. - Kovařík, Aleš
In Planta Reporter Assay Demonstrated the Inherent Potential of Turmeric as a Natural Hypo-Methylating Agent in Cultivated Tobacco (Nicotiana tabacum L.).
Russian Journal of Plant Physiology. Roč. 71, č. 6 (2024), č. článku 198. ISSN 1021-4437. E-ISSN 1608-3407
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-28029S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna methylation * demethylation * expression * genes * turmeric
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 1.1, rok: 2024 ; AIS: 0.171, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1134/S1021443724608279
Manoharlal, R.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0364981

0588227 - BFÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Matyášek, Roman - Kalfusová, Radka - Kuderová, Alena - Řehůřková, Kateřina - Sochorová, Jana - Kovařík, Aleš
Transcriptional Silencing of 35S rDNA in Tragopogon porrifolius Correlates with Cytosine Methylation in Sequence-Specific Manner.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 25, č. 14 (2024), č. článku 7540. ISSN 1661-6596. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-28029S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: polymerase-i transcription * ribosomal-rna genes * arabidopsis-thaliana lines * directed dna methylation * nucleolar dominance * l. asteraceae * 45s rdna * concerted evolution * intergenic spacers * cpg methylation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.9, rok: 2024 ; AIS: 1.121, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/14/7540
Matyášek, Roman
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0355470

0644597 - BFÚ 2026 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Sochorová, Jana - Lukášová, Emilie - Polanská, Eva - Řehůřková, Kateřina - Kovařík, Aleš
Fragmentation of nucleoli in senescent cancer cells is associated with increased levels of polyadenylated transcripts derived from noncoding regions of rDNA units.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters. Roč. 54, č. 8 (2025), s. 613-623. ISSN 0175-7571. E-ISSN 1432-1017
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: ribosomal-rna * gene-expression * stress * dna * repair * Irradiation
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.4, rok: 2024 ; AIS: 0.567, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12678568/
Kovařík, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0374439

0576584 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Šponer, Jiří - Výravský, J. - Matyášek, Roman - Kovařík, Aleš - Dudziak, W. - Slepokura, K.
Crystallization as a selection force at the polymerization of nucleotides in a prebiotic context.
iScience. Roč. 26, č. 9 (2023), č. článku 107600. E-ISSN 2589-0042
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-25057S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: 3′,5′cGMP * 3′,5′cCMP (free acid) readily crystallize from nucleotide mixtures * Crystallization could sequester 3′,5′cGMP * 3′,5′cCMP from the prebiotic soup * 3′,5′cCMP and 3′,5′cGMP phase-separate upon dry-wet cycling
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 4.6, rok: 2023 ; AIS: 1.5, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223016772?via%3Dihub

Šponer, Judit E. Slepokura, K.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0349241

0577299 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Kloužek, Jaroslav - Výravský, J. - Wunnava, S. - Scheu, B. - Braun, N. - Mojzsis, Stephen J. - Palacký, Jan - Vorlíčková, Michaela - Šponer, Jiří - Matyášek, Roman - Kovařík, Aleš
Influence of Silicate Rock Glass Compositions on the Efficacy of Prebiotic RNA Polymerization Reactions: The Case of 3',5' Cyclic Guanosine Monophosphate.
CHEMSYSTEMSCHEM. Roč. 5, č. 5 (2023). E-ISSN 2570-4206
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-25057S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:67985891
Klíčová slova: oligomerization * prebiotic chemistry * oligonucleotides * rock glasses * basicity
Obor OECD: Analytical chemistry; Analytical chemistry (USMH-B)
Impakt faktor: 3.1, rok: 2023 ; AIS: 1.028, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/syst.202300016

Šponer, Judit E. Kovařík, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0346507

0600302 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Trunova, D. - Borowska-Zuchowska, N. - Mykhailyk, S. - Xia, K. - Zhu, Y. - Sancho, R. - Rojek-Jelonek, M. - Garcia, S. - Wang, K. - Catalan, P. - Kovařík, Aleš - Hasterok, R. - Kolano, B.
Does time matter? Intraspecific diversity of ribosomal RNA genes in lineages of the allopolyploid model grass Brachypodium hybridum with different evolutionary ages.
BMC Plant Biology. Roč. 24, č. 1 (2024), č. článku 981. ISSN 1471-2229. E-ISSN 1471-2229
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16826S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: genome evolution * rdna loci * 5s rdna * concerted evolution * cytogenetic evidence * chenopodium-quinoa * dna * sequence * 35s * homogenization * rDNA loci * Brachypodium hybridum * 5S rDNA NTS * nrITS * 35S rDNA IGS * fish
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.899, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://bmcplantbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12870-024-05658-5
Kolano, B.
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0357994

0558708 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tulpová, Zuzana - Kovařík, Aleš - Toegelová, Helena - Navrátilová, Pavla - Kapustová, Veronika - Hřibová, Eva - Vrána, Jan - Macas, Jiří - Doležel, Jaroslav - Šimková, Hana
Fine structure and transcription dynamics of bread wheat ribosomal DNA loci deciphered by a multi-omics approach.
Plant Genome. Roč. 15, č. 1 (2022), č. článku e20191. ISSN 1940-3372. E-ISSN 1940-3372
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-17564S; GA ČR(CZ) GA19-03442S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68081707 ; RVO:60077344
Klíčová slova: RNA GENES * CYTOSINE METHYLATION * GENOME
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022 ; AIS: 0.903, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1002/tpg2.20191
Šimková, Hana
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0332273

0563711 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vozárová, Radka - Wang, W. - Lunerová Bedřichová, Jana - Shao, F.Q. - Pellicer, J. - Leitch, I. J. - Leitch, A. R. - Kovařík, Aleš
Mega-sized pericentromeric blocks of simple telomeric repeats and their variants reveal patterns of chromosome evolution in ancient Cycadales genomes.
Plant Journal. Roč. 112, č. 3 (2022), s. 646-663. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16826S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeres * genome evolution * chromosome rearrangements * Cycadaceae * gymnosperms
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 7.2, rok: 2022 ; AIS: 1.794, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.15969
Kovařík, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0340549

0583882 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Wang, W. - Zhang, X. - Garcia, S. - Leitch, A. R. - Kovařík, Aleš
Intragenomic rDNA variation-the product of concerted evolution, mutation, or something in between?
Heredity. Roč. 131, č. 3 (2023), s. 179-188. ISSN 0018-067X. E-ISSN 1365-2540
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16826S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: nuclear ribosomal dna * internal transcribed spacer * rna genes * sequence variation * arabidopsis-thaliana * nicotiana-tabacum * parental rdna * copy number * 5s rdna * genome
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2023 ; AIS: 1.019, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41437-023-00634-5
Kovařík, Aleš
Trvalý odkaz: https://hdl.handle.net/11104/0351875