Publikace ASEP
0643356 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Alpizar-Sosa, E. A. - Saura, A. - Fajkus, Petr - Polakova, E. - Havlová, Kateřina - Albanaz, A.T.S. - Fajkus, Jiří - Yurchenko, V.
Leishmania mexicana telomeres at high resolution: Ku80, TERT, and alternative lengthening mechanisms.
BMC Genomics. Roč. 26, č. 1 (2025), č. článku 955. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04769S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: terminal transferase * yeast ku * maintenance * protein * chromosomes * expression * pathways
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.7, rok: 2024 ; AIS: 1.031, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1186/s12864-025-12154-z?utm_source=getftr&utm_medium=getftr&utm_campaign=getftr_pilot&getft_integrator=clarivate
Yurchenko, V.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0374151
0582767 - BFÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Bozdechova, L. - Havlová, K. - Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
Analysis of Telomerase RNA Structure in Physcomitrium patens Indicates Functionally Relevant Transitions Between OPEN and CLOSED Conformations.
Journal of Molecular Biology. Roč. 436, č. 4 (2024), č. článku 168417. ISSN 0022-2836. E-ISSN 1089-8638
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: shape * architecture * template * models * yeast * core * map * telomerase RNA
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.896, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S002228362300534X?via%3Dihub
Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0352992
0605506 - BFÚ 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
Telomerase RNA evolution: a journey from plant telomeres to broader eukaryotic diversity.
Biochemical Journal. Roč. 483, č. 3 (2025). ISSN 0264-6021. E-ISSN 1470-8728
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-04769S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Telomeres * Telomerase RNA * Evolution * TR identification * non-coding RNA
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.436, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39889303/
Fajkus, Petr Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0363232
0582139 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fajkus, Petr - Adámik, Matěj - Nelson, A. D. L. - Kilar, A. - Franek, M. - Bubenik, M. - Čapková Frydrychová, Radmila - Votavová, A. - Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří - Peška, Vratislav
Telomerase RNA in Hymenoptera (Insecta) switched to plant/ciliate-like biogenesis.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 1 (2023), s. 420-433. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:60077344
Klíčová slova: template-boundary definition * pseudoknot * sequence * identification * mechanisms * promoter * element * repeats * gene
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/1/420/6956357?login=true
Fajkus, Petr Fajkus, Jiří
- Peška, Vratislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0350217
0617435 - BFÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Helia, O. - Matusova, B. - Havlová, Kateřina - Hyskova, A. - Lycka, M. - Beying, N. - Puchta, H. - Fajkus, Jiří - Fojtová, M.
Chromosome engineering points to the cis-acting mechanism of chromosome arm-specific telomere length setting and robustness of plant phenotype, chromatin structure and gene expression.
Plant Journal. Roč. 121, č. 4 (2025), č. článku e70024. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: double-strand breaks * homologous recombination * arabidopsis-thaliana * evolution * inversion * sequences * alignment *
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.70024
Fojtová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368366
0604134 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kilar, A. - Fajkus, Petr - Fajkus, Jiří
GERONIMO: A tool for systematic retrieval of structural RNAs in a broad evolutionary context.
GigaScience. Roč. 12, September (2023). ISSN 2047-217X. E-ISSN 2047-217X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: noncoding rnas * trnascan-se * rfam * sequence homology searches * evolution * high-throughput pipeline * Snakemake
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.8, rok: 2023 ; AIS: 4.079, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/gigascience/article/doi/10.1093/gigascience/giad080/7319579?login=true
Kilar, A. Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361482
0562612 - BFÚ 2023 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Konečná, Klára - Kilar, A. - Kovacikova, P. - Fajkus, Jiří - Sýkorová, Eva - Fojtová, M.
Compromised function of ARM, the interactor of Arabidopsis telomerase, suggests its role in stress responses.
Plant Science. Roč. 325, DEC 2022 (2022), č. článku 111453. ISSN 0168-9452. E-ISSN 1873-2259
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-28265S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: arm * Arabidopsis thaliana * Armadillo * ?-catenin-like repeat * RNAseq * Stress response * Telomerase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022 ; AIS: 0.944, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168945222002783?via%3Dihub
Fojtová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0339370
0565733 - ÚIACH 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Lyčka, M. - Barták, M. - Helia, O. - Kopriva, S. - Moravcová, Dana - Hájek, J. - Fojt, Lukáš - Čmelík, Richard - Fajkus, Jiří - Fojtová, M.
Sulfate supplementation affects nutrient and photosynthetic status of Arabidopsis thaliana and Nicotiana tabacum differently under prolonged exposure to cadmium.
Journal of Hazardous Materials. Roč. 445, March (2023), č. článku 130527. ISSN 0304-3894. E-ISSN 1873-3336
Grant CEP: GA MŠMT EF16_026/0008446
Institucionální podpora: RVO:68081715 ; RVO:68081707
Klíčová slova: cadmium * sulfate * heavy metal stress * Arabidopsis thaliana * Nicotiana tabacum
Obor OECD: Analytical chemistry; Cell biology (BFU-R)
Impakt faktor: 12.2, rok: 2023 ; AIS: 1.947, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0304389422023214?via%3Dihub
Lyčka, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0337248
0600734 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lyčka, M. - Bubenik, M. - Zavodnik, M. - Peška, Vratislav - Fajkus, Petr - Demko, M. - Fajkus, Jiří - Fojtová, M.
TeloBase: a community-curated database of telomere sequences across the tree of life.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, č. D1 (2024), D311-D321. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: aspergillus-oryzae * plant * evolution * repeats * identification * localization * conservation * chromosomes * arabidopsis * diversity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.1, rok: 2024 ; AIS: 5.99, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/52/D1/D311/7246534?login=true
Lyčka, M. Peška, Vratislav
- Fojtová, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0358028
0604045 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rudolf, Jiří - Tomovičová, L. - Panzarová, K. - Fajkus, Jiří - Hejátko, J. - Skalák, J.
Epigenetics and plant hormone dynamics: a functional and methodological perspective.
Journal of Experimental Botany. Roč. 75, č. 17 (2024), s. 5267-5294. ISSN 0022-0957. E-ISSN 1460-2431
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: chromatin-remodeling factor * ethylene response pathway * transfer-rna modification * shoot apical meristem * abscisic-acid * arabidopsis-thaliana * dna methylation * histone acetylation * auxin biosynthesis * salt stress * Abscisic acid * auxin * cytokinins * epigenetics * ethylene * gibberellins * histone modifications
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.479, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/jxb/article/75/17/5267/7610782?login=true
Hejátko, J.
- Skalák, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361375
0586445 - BFÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Štefanovie, B. - Jenner, Leon - Bozdechova, L. - Fajkus, Petr - Sýkorová, Eva - Fajkus, Jiří - Paleček, J.
Characterisation of the Arabidopsis thaliana telomerase TERT-TR complex.
Plant Molecular Biology. Roč. 114, č. 3 (2024), č. článku 56. ISSN 0167-4412. E-ISSN 1573-5028
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004581
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: protein interactions * structural basis * rna * subunit * shelterin * system * domain
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.8, rok: 2024 ; AIS: 0.888, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s11103-024-01461-w
Fajkus, Jiří
- Paleček, J.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0355243
0571955 - ÚEB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomaštíková, Eva - Yang, Fen - Mlynárová, L. - Hafidh, Said - Schořová, Š. - Kusová, A. - Pernisová, M. - Přerovská, T. - Klodová, Božena - Honys, David - Fajkus, Jiří - Pečinka, Aleš - Schrumpfová, P.
RUVBL proteins are involved in plant gametophyte development.
Plant Journal. Roč. 114, č. 2 (2023), s. 325-337. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-15841S; GA ČR(CZ) GX20-01331X; GA ČR(CZ) GA22-00871S; GA ČR(CZ) GA22-29717S; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68081707
Klíčová slova: MULTIPLE SEQUENCE ALIGNMENT * TELOMERE-BINDING-PROTEIN * ARABIDOPSIS
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.2, rok: 2023 ; AIS: 1.733, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/tpj.16136
Schrumpfová, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0342810
0583724 - BFÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zavodnik, M. - Fajkus, Petr - Franek, M. - Kopecký, David - Garcia, S. - Dodsworth, S. - Orejuela, A. - Kilar, A. - Ptáček, J. - Mátl, Martin - Hyskova, A. - Fajkus, Jiří - Peška, Vratislav
Telomerase RNA gene paralogs in plants the usual pathway to unusual telomeres.
New Phytologist. Roč. 239, č. 6 (2023), s. 2353-2366. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06643S; GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: syntenic regions * evolution * centromere * diversity * evolution * land plants * mechanism of telomere transitions * telomerase RNA paralogs * unusual telomere DNA
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 8.3, rok: 2023 ; AIS: 2.706, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.19110
Fajkus, Petr
- Fajkus, Jiří
- Peška, Vratislav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351722
0601712 - BFÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Závodník, Michal - Pavlistova, V. - Machelova, A. - Lycka, M. - Mozgová, Iva - Caklova, K. - Dvořáčková, M. - Fajkus, Jiří
KU70 and CAF-1 in Arabidopsis: Divergent roles in rDNA stability and telomere homeostasis.
Plant Journal. Roč. 118, č. 6 (2024), s. 1922-1936. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06643S; GA ČR(CZ) GX20-01331X
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:60077344
Klíčová slova: FAS1 * KU70 * telomeres * dna-damage
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (BC-A)
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.16718
Dvořáčková, M.
- Fajkus, Jiří
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0359029