Publikace ASEP
0603883 - BC 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Bílková, P. - Vlček, J. - Cvetković, Tijana - Štefka, Jan - Sedláček, F.
Odour preferred males led to a higher offspring number in the common vole.
Mammalian Biology. Roč. 104, č. 3 (2024), s. 287-298. ISSN 1616-5047. E-ISSN 1618-1476
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: major histocompatibility complex * reproductive success * mating preferences * estrous-cycle * mate choice * mouse * ovulation * estrus * mice * mhc * Microtus arvalis * T-maze * Odour preference * MHC Class II DRB * Sorensen-Dice index * Offspring number
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 2.3, rok: 2024 ; AIS: 0.576, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s42991-024-00406-6
Sedláček, F.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361183
0617919 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Damnjanovic, Dragomir - Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Pavel, V. - Chutný, B. - Johnsen, A. - Nováková, Milena - Štefka, Jan
Expanding the known haemosporidian parasite diversity in Eurasian bluethroat (Luscinia svecica) subspecies through amplicon sequencing.
International Journal for Parasitology. Roč. 55, č. 3-4 (2025), s. 137-150. ISSN 0020-7519. E-ISSN 1879-0135
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: avian malaria parasites * plasmodium-relictum * species delimitation * blood parasites * prevalence * infection * dynamics * haemoproteus * population * discovery * Bluethroat * Species delimitation * Phylogeny * Species diversity * Plasmodium * Leucocytozoon * Luscinia svecica * Extinction
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 1.011, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2024.11.007
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0365059
0639443 - BC 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Damnjanovic, Dragomir - Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Nováková, Milena - Linh, N.V. - Tolstenkov, O. - Kerimov, A. - Bushuev, A. - Štefka, Jan
Hidden Plasmodium diversity revealed in southeastern Asian passerines using next-generation amplicon sequencing.
Current Research in Parasitology and Vector-Borne Diseases. Roč. 8, SEP 2025 (2025), č. článku 100319. ISSN 2667-114X. E-ISSN 2667-114X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: avian malaria parasites * spiderhunter arachnothera-longirostra * cytochrome-b lineages * haemosporidian parasites * host-specificity * blood parasites * species delimitation * genetic diversity * prevalence * dna * Malaria * Species delimitation * Plasmodium * Alpha and beta diversity * Passerines
Obor OECD: Parasitology
Impakt faktor: 3.1, rok: 2024 ; AIS: 0.926, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.crpvbd.2025.100319
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370249
0597863 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Damnjanovic, Dragomir - Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Wisniewska, Monika Magdalena - Pavel, V. - Chutný, B. - Johnsen, A. - Nováková, Milena - Štefka, Jan
Limited genetic depletion despite extinction risk: genomic diversity of a peripheral population of red-spotted bluethroats in Central Europe.
Zoological Journal of the Linnean Society. Roč. 201, č. 4 (2024), č. článku zlae094. ISSN 0024-4082. E-ISSN 1096-3642
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: luscinia-svecica * mitochondrial-dna * phylogeographic patterns * migration * conservation * sequences * dynamics * history * protein * region * Luscinia svecica * peripheral populations * genome-wide SNPs diversity * runs of homozygosity * demographic history
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 0.869, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/zoolinnean/zlae094
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0357694
0643354 - BC 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dedecius, D. - Kolár, J. - Martinů, J. - Štefka, Jan - Nováková, Eva - Hypša, Václav
Generalist vs specialist strategy shapes microbiomes in blood feeding parasite Polyplax serrata.
Frontiers in Microbiology. Roč. 16, NOV 2025 (2025), č. článku 1720127. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genetic-structure * host-specificity * genome * diversity * format * mice * tool * microbiome * beta diversity * lice * generalist and specialist * insect symbionts
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2024 ; AIS: 1.071, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fmicb.2025.1720127
Hypša, Václav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373371
0604077 - BC 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Drábková, M. - Štefka, Jan
Dicyema moschatum.
Trends in Parasitology. Roč. 40, č. 9 (2024), s. 858-859. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28399X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Dicyema moschatum
Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impakt faktor: 6.6, rok: 2024 ; AIS: 2.602, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.pt.2024.06.015
Drábková, M. Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0361415
0565103 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Drábková, Marie - Kocot, K.M. - Halanych, K.M. - Oakley, T.H. - Moroz, L.L. - Cannon, J.T. - Kuris, A. M. - Garcia-Vedrenne, A.E. - Pankey, M.S. - Ellis, E.A. - Varney, R. - Štefka, Jan - Zrzavý, J.
Different phylogenomic methods support monophyly of enigmatic 'Mesozoa' (Dicyemida plus Orthonectida, Lophotrochozoa).
Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences. Roč. 289, č. 1978 (2022), č. článku 20220683. ISSN 0962-8452. E-ISSN 1471-2954
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28399X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Mesozoa * phylogenomics * Orthonectida * Dicyemida * Lophotrochozoa * lba
Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impakt faktor: 4.7, rok: 2022 ; AIS: 1.806, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rspb.2022.0683
Drábková, Marie
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0338672
0619443 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kralová-Hromadová, I. - Bazsalovicsová, E. - Radačovská, A. - Šoltys, K. - Juhasova, L. - Minárik, G. - Kuchta, Roman - Skirnisson, K. - Karlsbakk, E. - Štefka, Jan
Genetic diversity and intercontinental dispersal of temperate and subarctic populations of Dibothriocephalus dendriticus (Cestoda, Diphyllobothriidea), a causative agent of dibothriocephalosis.
International Journal for Parasitology. Roč. 55, č. 6 (2025), s. 281-298. ISSN 0020-7519. E-ISSN 1879-0135
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: salvelinus-alpinus * ditremum creplin * imported diphyllobothriasis * broad tapeworms * alopex-lagopus * salmo-trutta * brown trout * parasites * fishes * plerocercoids * Broad tapeworm * Fish-borne zoonosis * Diphyllobothriosis * Diphyllobothrium dendriticum * Mitochondrial DNA * Cox 1 * Microsatellite loci * Migratory routes
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 1.011, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2025.01.002
Kralová-Hromadová, I.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0369457
0605151 - BC 2026 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Martinů, J. - Štefka, Jan - Vrankova, K. - Hypša, Václav
Different life strategies of closely related louse species in sympatry: specialist and generalist lineages of Polyplax serrata
International Journal for Parasitology. Roč. 55, č. 1 (2025), s. 27-34. ISSN 0020-7519. E-ISSN 1879-0135
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: host-specificity * apodemus-sylvaticus * genetic-structure * competition * mice * flavicollis * diversity * lice * Specialist vs generalist * Sucking lice * Interspecific competition * Hybrid fitness * Prevalence
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2024 ; AIS: 1.011, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ijpara.2024.10.003
Hypša, Václav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362709
0585254 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Martinů, J. - Tarabai, H. - Štefka, Jan - Hypša, Václav
Highly Resolved Genomes of Two Closely Related Lineages of the Rodent Louse Polyplax serrata with Different Host Specificities.
Genome Biology and Evolution. Roč. 16, č. 3 (2024), č. článku evae045. ISSN 1759-6653. E-ISSN 1759-6653
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: sequence * gene * endosymbiont * prediction * alignment * symbiont * platform * tools * mice * kegg * sucking lice * Anoplura * genomics * symbiosis
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2024 ; AIS: 1.197, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/gbe/evae045
Hypša, Václav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362064
0561625 - BC 2023 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Peterka, Jiří - Kubečka, Jan - Vašek, Mojmír - Jůza, Tomáš - de Moraes, Karlos Ribeiro - Čech, Martin - Holubová, Michaela - Souza, Allan T. - Blabolil, Petr - Muška, Milan - Tsering, Lobsang - Bartoň, Daniel - Říha, Milan - Šmejkal, Marek - Tušer, Michal - Vejřík, Lukáš - Frouzová, Jaroslava - Jaric, Ivan - Prchalová, Marie - Vejříková, Ivana - Štefka, Jan
Different hosts in different lakes: prevalence and population genetic structure of plerocercoids of Ligula intestinalis (Cestoda) in Czech water bodies.
Folia Parasitologica. Roč. 69, SEP (2022), č. článku 018. ISSN 0015-5683. E-ISSN 1803-6465
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-04676S
GA MŠk(CZ) LM2015042
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: tapeworm * Czech Republic * host specificity * freshwater * fish parasite
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 1.6, rok: 2022 ; AIS: 0.395, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://folia.paru.cas.cz/artkey/fol-202201-0018_different_hosts_in_different_lakes_prevalence_and_population_genetic_structure_of_plerocercoids_of_ligula_inte.php
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340161
0582763 - BC 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Nováková, Milena - Drábková, M. - Catchen, J. - Olson, P. D. - Štefka, Jan
Highly resolved genome assembly and comparative transcriptome profiling reveal genes related to developmental stages of tapeworm Ligula intestinalis.
Proceedings of the Royal Society B-Biological Sciences. Roč. 291, č. 2015 (2024), č. článku 20232563. ISSN 0962-8452. E-ISSN 1471-2954
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-04676S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: host-specificity * life-cycle * cestoda * evolution * diphyllobothriidea * vitellogenesis * duplication * parasite * database * package * Cestoda * reference genome * transcriptome * life cycle * parasite
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.5, rok: 2024 ; AIS: 1.618, rok: 2024
Způsob publikování: Omezený přístup
https://royalsocietypublishing.org/doi/10.1098/rspb.2023.2563
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0351363
0569302 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Nováková, Milena - Loot, G. - Gabagambi, N.P. - Fatemizadeh, F. - Osano, O. - Presswell, B. - Poulin, R. - Vital, Z. - Scholz, Tomáš - Halajian, A. - Trucchi, E. - Kočová, P. - Štefka, Jan
Historical dispersal and host-switching formed the evolutionary history of a globally distributed multi-host parasite The Ligula intestinalis species complex.
Molecular Phylogenetics and Evolution. Roč. 180, MAR (2023), č. článku 107677. ISSN 1055-7903. E-ISSN 1095-9513
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-04676S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Historical biogeography * Dated phylogeny * Demographic history * Host specificity * Host switching
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2023 ; AIS: 1.131, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1055790322002901?via%3Dihub
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344193
0637873 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Nováková, Milena - Vlček, Jakub - Štefka, Jan
Host-Associated Genetic Differentiation in the Face of Ongoing Gene Flow: Ecological Speciation in a Pathogenic Parasite of Freshwater Fish.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 42, č. 7 (2025), č. článku msaf163. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-04676S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ligula-intestinalis cestoda * sympatric speciation * genome scans * r-package * selection * specificity * divergence * signatures * diversity * inference * host-associated genetic differentiation * gene flow * ecological speciation * differential gene expression * sympatric evolution
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 5.3, rok: 2024 ; AIS: 4.312, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/molbev/msaf163
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370279
0556514 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nazarizadeh Dehkordi, Masoud - Martinů, Jana - Nováková, Milena - Stanko, M. - Štefka, Jan
Phylogeography of the parasitic mite Laelaps agilis in Western Palearctic shows lineages lacking host specificity but possessing different demographic histories.
BMC Zoology. Roč. 7, č. 1 (2022), č. článku 15. E-ISSN 2056-3132
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: genetic-structure * small mammals * apodemus-flavicollis * population-growth * climate-change * acari * mesostigmata * rodentia * mouse * louse * Laelaps agilis * Phylogenetic relationship * Demographic history * Host specificity
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 1.6, rok: 2022 ; AIS: 0.464, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://adc.bmj.com/content/51/9/680
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340156
0569214 - BC 2023 RIV US eng M - Část monografie knihy
Quijano, F.R. - Debora, G.R. - Štefka, Jan - Kowalewski, M.M.
Lice in Howler Monkeys and the Ancient Americas: Exploring the Potential Cost of Being Past Pets or Hunting Games.
World Archaeoprimatology. Vol. 101017/9781108766500. Cambridge: Cambridge University Press, 2022 - (Urbani, B.; Youlatos, D.; Antczak, A.), s. 183-198. Cambridge Studies in Biological and Evolutionary Anthropology, Part I - The Americas. ISBN 9781108766500
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Lice * Monkeys * Potential
Obor OECD: Parasitology
https://www.cambridge.org/core/books/abs/world-archaeoprimatology/lice-in-howler-monkeys-and-the-ancient-americas/97505D05EC1C7977694387830D64EE3E
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340594
0558635 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Radačovská, A. - Bazsalovicsová, E. - Šoltys, K. - Štefka, Jan - Minárik, G. - Gustinelli, A. - Chugunova, J. - Kraľová-Hromadová, I.
Unique genetic structure of the human tapeworm Dibothriocephalus latus from the Alpine lakes region a successful adaptation?
Parasitology. Roč. 149, č. 8 (2022), s. 1106-1118. ISSN 0031-1820. E-ISSN 1469-8161
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: perch perca-fluviatilis * diphyllobothrium-latum * fish tapeworm * european perch * cestoda diphyllobothriidea * population-structure * species richness * diversity * microsatellite * dna * Asexual population * Diphyllobothriosis * fish-borne zoonosis * haplotypes * microsatellites * mitochondrial DNA * parthenogenesis * triploid tapeworms
Obor OECD: Parasitology
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022 ; AIS: 0.656, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.cambridge.org/core/journals/parasitology/article/abs/unique-genetic-structure-of-the-human-tapeworm-dibothriocephalus-latus-from-the-alpine-lakes-region-a-successful-adaptation/FFBAE28A0916196BE62537759BD17CD5
Kraľová-Hromadová, I.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340214
0562967 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Štefka, Jan - Votýpka, Jan - Lukeš, Julius - Balvín, O.
Cimex lectularius and Cimex hemipterus (bed bugs).
Trends in Parasitology. Roč. 38, č. 10 (2022), s. 919-920. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18032; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Cimex * lectularius * hemipterus
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.6, rok: 2022 ; AIS: 2.593, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471492222001027?via%3Dihub
Balvín, O.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340398
0567728 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vlček, Jakub - Miláček, Matěj - Vinkler, M. - Štefka, Jan
Effect of population size and selection on Toll-like receptor diversity in populations of Galapagos mockingbirds.
Journal of Evolutionary Biology. Roč. 36, č. 1 (2023), s. 109-120. ISSN 1010-061X. E-ISSN 1420-9101
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: conservation genetics * innate immunity * island birds * molecular phenotype * purifying selection
Obor OECD: Veterinary science
Impakt faktor: 2.1, rok: 2023 ; AIS: 0.782, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jeb.14121
Vlček, Jakub Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340931
0617668 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vlček, Jakub - Espinoza-Ulloa, S. - Cowles, S.A. - Ortiz-Catedral, L. - Coutu, C. - Chaves, J.A. - Andres, J. - Štefka, Jan
Genomes of Galápagos Mockingbirds Reveal the Impact of Island Size and Past Demography on Inbreeding and Genetic Load in Contemporary Populations.
Molecular Ecology. Roč. 34, č. 5 (2025), č. článku e17665. ISSN 0962-1083. E-ISSN 1365-294X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: galapagos mockingbird * depression * extinction * history * floreana * mutation * differentiation * homozygosity * diversity * framework * conservation genetics * demographic inference * genetic diversity * genetic load
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2024 ; AIS: 1.536, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/mec.17665
Štefka, Jan
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0364862