Publikace ASEP
0569955 - BTÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Arbon, D. - Zeniskova, K. - Subrtova, K. - Mach, J. - Štursa, Jan - Machado, M. - Zahedifard, F. - Leštinová, T. - Hierro Yap, Carolina - Neužil, Jiří - Volf, P. - Ganter, M. - Zoltner, M. - Zíková, Alena - Werner, Lukáš - Suták, R.
Repurposing of MitoTam: Novel Anti-Cancer Drug Candidate Exhibits Potent Activity against Major Protozoan and Fungal Pathogens.
Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Roč. 66, č. 8 (2022). ISSN 0066-4804. E-ISSN 1098-6596
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-14409S; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA ČR(CZ) GA20-14409S
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Candida * Cryptococcus * drug * Leishmania
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy; Cell biology (BC-A)
Impakt faktor: 4.9, rok: 2022 ; AIS: 1.277, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/aac.00727-22
Zíková, Alena
- Werner, Lukáš
- Suták, R.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0341283
0563704 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gahura, Ondřej - Muhleip, A. - Hierro Yap, Carolina - Panicucci, Brian - Jain, Minal - Hollaus, D. - Slapničková, Martina - Zíková, Alena - Amunts, A.
An ancestral interaction module promotes oligomerization in divergent mitochondrial ATP synthases.
Nature Communications. Roč. 13, č. 1 (2022), č. článku 5989. ISSN 2041-1723. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-17529S; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Mitochondrial * synthase * lineage
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022 ; AIS: 5.767, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-022-33588-z
Zíková, Alena
- Amunts, A.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0339020
0567779 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Gahura, Ondřej - Chauhan, Prashant - Zíková, Alena
Mechanisms and players of mitoribosomal biogenesis revealed in trypanosomatids.
Trends in Parasitology. Roč. 38, č. 12 (2022), s. 1053-1067. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: assembly factor * biogenesis * mitochondrial ribosomes * mitoribosomes * Trypanosoma
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 9.6, rok: 2022 ; AIS: 2.593, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471492222001878?via%3Dihub
Gahura, Ondřej
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0339044
0638365 - BC 2026 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Janowicz, N. - Dohnalek, V. - Zitek, J. - Pena-Diaz, P. - Pyrihová, E. - King, M.S. - Husová, Michaela - Žárský, V. - Kunji, E. - Zíková, Alena - Hampl, V. - Doležal, P.
Selective loss of ATP carriers in favour of SLC25A43 orthologues in metamonad mitochondria adapted to anaerobiosis.
Open Biology. Roč. 15, č. 8 (2025), č. článku 240202. ISSN 2046-2441. E-ISSN 2046-2441
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA MŠMT(CZ) LM2023050
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: adp/atp carrier * functional-characterization * protein * transport * membrane * expression * family * identification * organelles * origin * Metamonada * mitochondrial carrier protein * ADP/ATP carrier * mitochondrion-related organelle * mitochondrial evolution
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 3.6, rok: 2024 ; AIS: 1.971, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1098/rsob.240202
Doležal, P.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0369435
0585825 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Keough, D. T. - Petrová, Magdalena - King, G. - Kratochvíl, Michal - Pohl, Radek - Doleželová, Eva - Zíková, Alena - Guddat, L. W. - Rejman, Dominik
Development of Prolinol Containing Inhibitors of Hypoxanthine-Guanine-Xanthine Phosphoribosyltransferase: Rational Structure-Based Drug Design.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 67, č. 9 (2024), s. 7158-7175. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: trypanosomiasis * HXGPRT * prolinol nucleoside bisphosphonate
Obor OECD: Organic chemistry; Virology (BC-A)
Impakt faktor: 6.8, rok: 2024 ; AIS: 1.585, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c00021
Guddat, L. W.
- Rejman, Dominik
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0353500
0556761 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Klejch, Tomáš - Keough, D. T. - King, G. - Doleželová, Eva - Česnek, Michal - Buděšínský, Miloš - Zíková, Alena - Janeba, Zlatko - Guddat, L. W. - Hocková, Dana
Stereo-Defined Acyclic Nucleoside Phosphonates are Selective and Potent Inhibitors of Parasite 6-Oxopurine Phosphoribosyltransferases.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 65, č. 5 (2022), s. 4030-4057. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-07707S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: hypoxanthine-guanine phosporibosyltransferase * Plasmodium falciparum * Helicobacter pylori
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022 ; AIS: 1.587, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.1c01881
Janeba, Zlatko
- Guddat, L. W.
Trvalý odkaz:
http://hdl.handle.net/11104/0330950
0604791 - BC 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kovářová, Julie - Moos, Martin - Barrett, M. P. - Horn, D. - Zíková, Alena
The bloodstream form of Trypanosoma brucei displays non-canonical gluconeogenesis.
PLoS Neglected Tropical Diseases. Roč. 18, č. 2 (2024), č. článku e0012007. ISSN 1935-2735. E-ISSN 1935-2735
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575; GA ČR(CZ) GA20-14409S; GA MŠMT(CZ) EF19_074/0016248
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: phosphofructokinase * glycolysis * enzyme * tool
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.4, rok: 2024 ; AIS: 1.101, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0012007
Kovářová, Julie
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362297
0561246 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Lemke, C. - Jílková, Adéla - Ferber, D. - Braune, A. - On, A. - Johe, P. - Zíková, Alena - Schirmeister, T. - Mareš, Michael - Horn, Martin - Gütschow, M.
Two Tags in One Probe: Combining Fluorescence- and Biotin-based Detection of the Trypanosomal Cysteine Protease Rhodesain.
Chemistry - A European Journal. Roč. 28, č. 62 (2022), č. článku e202201636. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: activity-based probes * affinity chromatography * cysteine proteases * imaging agents * peptidomimetics * rhodesain * size exclusion chromatography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2022 ; AIS: 0.918, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/chem.202201636
Horn, Martin
- Gütschow, M.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0333931
0579778 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Lukeš, Julius - Speijer, D. - Zíková, Alena - Alfonzo, J. D. - Hashimi, Hassan - Field, Mark Christian
Trypanosomes as a magnifying glass for cell and molecular biology.
Trends in Parasitology. Roč. 39, č. 11 (2023), s. 902-912. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07674S; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA20-14409S
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal; Wellcome Trust(GB) 204697/Z/16/Z
Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: variant surface glycoprotein * double-stranded-rna * alternative oxidase * sleeping sickness * brucei * mitochondria * import * localization * degradation * peroxisomes
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 7, rok: 2023 ; AIS: 2.68, rok: 2023
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471492223001952?via%3Dihub
Lukeš, Julius
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0348589
0637251 - MBÚ 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stodůlková, Eva - Lovás, Dominik - Flieger, Miroslav - Zíková, Alena - Zápal, Jakub - Štícha, M. - Císařová, I. - Černý, J. - Grobarová, V. - Slapničková, Martina - Vomastek, Tomáš - Klímová, Zuzana - Kuzma, Marek - Semerád, Jaroslav - Cajthaml, Tomáš - Cséfalvay, Eva - Cherotich Maritim, W. - Wennrich, Adéla - Stadler, M. - Ježková, Tereza - Jašica, Andrej - Kolařík, Miroslav
Gunacins: Novel Benzo[g] chromene Derivatives from the Fungus Exobasidium sp. and Their Potent Anti-Leishmania and Trypanosoma Activities.
ACS Omega. Roč. 10, č. 22 (2025), s. 23222-23234. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-29971S; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004597; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 101008129 - MYCOBIOMICS; European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
AV ČR(CZ) StrategieAV21/33; AV ČR(CZ) JFS20ST-127
StrategieAV; SEA-Europe JFS
Výzkumná infrastruktura: EATRIS-CZ IV - 90253
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: naphthoquinones * constituents * cultivation * alpha
Obor OECD: Microbiology; Biochemistry and molecular biology (BC-A)
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 0.673, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.5c01325
Kolařík, Miroslav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0368168
0563879 - MBÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Štěpánek, O. - Čmoková, Adéla - Procházková, Eliška - Grobárová, V. - Černý, J. - Slapničková, Martina - Zíková, Alena - Kolařík, Miroslav - Baszczyňski, O.
Piperazine-Modified Ketoconazole Derivatives Show Increased Activity against Fungal and Trypanosomatid Pathogens.
ChemMedChem. Roč. 17, č. 21 (2022), č. článku e202200385. ISSN 1860-7179. E-ISSN 1860-7187
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-07707S; GA MZd(CZ) NU21-05-00681; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
AV ČR JFS20ST-127; AV ČR JFS20ST-127
SEA-Europe JFS; SEA-Europe JFS
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: Ketoconazole * Antifungal agents * Aspergillus * Trypanosoma
Obor OECD: Microbiology; Analytical chemistry (UOCHB-X); Organic chemistry (BC-A)
Impakt faktor: 3.4, rok: 2022 ; AIS: 0.647, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://chemistry-europe.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cmdc.202200385
Kolařík, Miroslav
- Baszczyňski, O.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0335666
0580603 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Taleva, Gergana - Husová, Michaela - Panicucci, Brian - Hierro-Yap, Carolina - Pineda, E. - Biran, M. - Moos, Martin - Šimek, Petr - Butter, F. - Bringaud, F. - Zíková, Alena
Mitochondrion of the Trypanosoma brucei long slender bloodstream form is capable of ATP production by substrate-level phosphorylation.
PLoS Pathogens. Roč. 19, č. 10 (2023), č. článku e1011699. ISSN 1553-7366. E-ISSN 1553-7374
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14409S
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: inducible expression system * succinate coa-transferase * trypanocidal action * lipid biosynthesis * acetate * fractionation * complex
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.5, rok: 2023 ; AIS: 1.852, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1011699
Zíková, Alena
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0349377
0574463 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Benz, Corinna - Aguilar, L.C. - Gahura, Ondřej - Faktorová, Drahomíra - Zíková, Alena - Oeffinger, M. - Burger, G. - Gray, M.W. - Lukeš, Julius
Miniature RNAs are embedded in an exceptionally protein-rich mitoribosome via an elaborate assembly pathway.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 12 (2023), s. 6443-6460. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: RNAs * protein-rich mitoribosome
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 16.7, rok: 2023 ; AIS: 5.863, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/51/12/6443/7173778?login=true
Valach, M. Benz, Corinna
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344803
0559133 - ÚOCHB 2023 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková, Karolína - Doleželová, Eva - Tloušťová, Eva - Hocková, Dana - Zíková, Alena - Janeba, Zlatko
Synthesis and anti-trypanosomal evaluation of novel N-branched acyclic nucleoside phosphonates bearing 7-aryl-7-deazapurine nucleobase.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 239, September (2022), č. článku 114559. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-07707S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: acyclic nucleoside phosphonates * nucleotides * Suzuki reaction * Trypanosoma * tubercidin
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 6.7, rok: 2022 ; AIS: 0.965, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2022.114559
Zíková, Alena
- Janeba, Zlatko
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0332552
0574448 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wong, Jonathan - Zíková, Alena - Gahura, Ondřej
The Ancestral Shape of the Access Proton Path of Mitochondrial ATP Synthases Revealed by a Split Subunit-a.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 40, č. 6 (2023), č. článku msad146. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: subunit-a * proton translocation * gene fragmentation * proton path * Trypanosoma brucei * mitochondrial ATP synthase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11, rok: 2023 ; AIS: 5.284, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/40/6/msad146/7203835?login=true
Gahura, Ondřej
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0344809
0640567 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zgadzay, Y. - Mirabello, C. - Wanes, G. - Pánek, T. - Chauhan, Prashant - Nystedt, B. - Zíková, Alena - Whitford, P.C. - Gahura, Ondřej - Amunts, A.
Mettl15-Mettl17 modulates the transition from early to late pre-mitoribosome.
Structure. Roč. 33, č. 10 (2025), s. 1904-1915. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-04150Y; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 101044951 - MitoSignal
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: biogenesis * cryo-EM * methyltransferase * mitochondria * mitoribosome * molecular dynamics * ribosome assembly * translation * Trypanosoma
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.3, rok: 2024 ; AIS: 1.974, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
10.1016/j.str.2025.08.002
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0370930
0564728 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zíková, Alena
Mitochondrial adaptations throughout the Trypanosoma brucei life cycle.
Journal of Eukaryotic Microbiology. Roč. 69, č. 6 (2022), č. článku e12911. ISSN 1066-5234. E-ISSN 1550-7408
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-14409S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-34480S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: differentiation * metabolism * mitochondria * signaling * Trypanosoma
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022 ; AIS: 0.632, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jeu.12911
Zíková, Alena
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340561