Publikace ASEP
0637044 - BC 2026 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gruber, Ansgar - Vohnoutová, M. - McKay, C. - Rocap, G. - Oborník, Miroslav
ASAFind 2.0: multi-class protein targeting prediction for diatoms and algae with complex plastids.
Plant Journal. Roč. 122, č. 5 (2025), č. článku e70138. ISSN 0960-7412. E-ISSN 1365-313X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-26115S; GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: putative carbonic-anhydrases * fatty-acid-metabolism * 2 marine diatoms * phaeodactylum-tricornutum * secondary plastids * functional-characterization * signal peptides * in-silico * localization * evolution * diatoms * organelle * genome annotation * secretory pathway * chloroplast * mitochondria * periplastidic compartment * protein transport * evolution * gene transfer * technical advance
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2024 ; AIS: 1.647, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/tpj.70138
Gruber, Ansgar
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0369347
0580263 - BC 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Gruber, Ansgar - Medlin, L.K.
Complex Plastids and the Evolution of the Marine Phytoplankton.
Journal of Marine Science and Engineering. Roč. 11, č. 10 (2023), č. článku 1903. E-ISSN 2077-1312
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA ČR(CZ) GA21-26115S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: gene-transfer * oxygenic photosynthesis * primary endosymbiosis * phylogenomic evidence * secondary plastids * mass extinction * protein import * origin * organelles * genomes * endosymbiosis * plastid * organelle evolution * genome: proteome * phytoplankton
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 2.7, rok: 2023 ; AIS: 0.463, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2077-1312/11/10/1903
Medlin, L.K.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0349018
0604881 - BC 2025 RIV US eng M - Část monografie knihy
Gruber, Ansgar - Oborník, Miroslav
Evolution of Plastids and Mitochondria in Diatoms.
Diatom Photosynthesis. New York: Wiley Global Headquarters, 2024 - (Goessling, J.; Serôdio, J.; Lavaud, J.), s. 81-112. ISBN 9781119842088
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-26115S; GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Evolution * Plastids * Mitochondria
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
https://doi.org/10.1002/9781119842156
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362412
0604861 - BC 2025 RIV CH eng M - Část monografie knihy
Gruber, Ansgar - Kroth, P.G.
Translocation of Proteins into Four Membrane-Bound Complex Plastids of Red Algal Origin.
Endosymbiotic Organelle Acquisition. Cham: Springer Cham, 2024 - (Schwartzbach, S.; Kroth, P.; Oborník, M.), (2024), s. 433-463. Solutions to the Problem of Protein Localization and Membrane Passage. ISBN 978-3-031-57444-3
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-03224S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Algae * Chloroplast * Diatom * Endoplasmic reticulum * Endosymbiosis * Evolution * Membranes * Metabolism * Organelle * Protein import * Stramenopiles
Obor OECD: Cell biology
https://doi.org/10.1007/978-3-031-57446-7_15
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0362390
0618398 - BC 2026 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Yang, Shun-Min - Gruber, Ansgar - Jiroutová, Kateřina - Richtová, Jitka - Vancová, Marie - Tesařová, Martina - Masařová, Petra - Dorrell, R.G. - Oborník, Miroslav
Localization of heme biosynthesis in the diatom Phaeodactylum tricornutum and differential expression of multi-copy enzymes.
Frontiers in Plant Science. Roč. 16, MAR 2025 (2025), č. článku 1537037. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-06203S; GA ČR(CZ) GA21-26115S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) LM2023050; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protoporphyrinogen-ix-oxidase * thalassiosira-pseudonana * mitochondrial localization * subcellular-localization * evolutionary history * molecular phylogeny * ferrochelatase * transport * proteins * chlorophyll * chloroplast * tetrapyrrole * horizontal gene transfer * algae * organelle * evolution * endosymbiosis
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2024 ; AIS: 0.964, rok: 2024
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fpls.2025.1537037
Oborník, Miroslav
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0373471
0559180 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Yu, G. - Nakajima, K. - Gruber, Ansgar - Bártulos, C.R. - Schober, A.F. - Lepetit, B. - Yohannes, E. - Matsuda, Y. - Kroth, P.G.
Mitochondrial phosphoenolpyruvate carboxylase contributes to carbon fixation in the diatom Phaeodactylum tricornutum at low inorganic carbon concentrations.
New Phytologist. Roč. 235, č. 4 (2022), s. 1379-1393. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: C-4 photosynthesis * carbon concentrating mechanism (CCM) * diatoms * Phaeodactylum tricornutum * phosphoenolpyruvate carboxylases (PEPC) * reverse genetics * talen
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 9.4, rok: 2022 ; AIS: 2.587, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18268
Yu, G. Kroth, P.G.
Trvalý odkaz:
https://hdl.handle.net/11104/0340548